Oštećenja DNA i popravci

Izravni obrat oštećenja DNA

Spontano oštećenje

DNA

Oštećenja DNA

inducirana zračenjem i

kemijskim čimbenicima

Popravak

izrezivanjem

(ekscizijski

popravak)

Popravak sklon

pogreškama

• nasljedni karcinom debelog crijeva;

mutacije u genima koji su uključeni u

popravak krivo sparenih baza

• nasljedni karcinom dojke; defekti u genima

koji kodiraju proteine uključene u popravak

dvolančanih lomova (BRCA1 i BRCA2)

Veličina

genoma

različitih

skupina

organizama

• Genom: ukupna genetička informacija

pohranjena u svim kromosomima nekog

organizma

• Gen: dio DNA koji se eksprimira u vidu

funkcionalnog produkta (bilo u obliku RNA

ili u obliku polipeptida)

Gen je

izrgraĎen od

EGZONA i

INTRONA

• Introni ne odreĎuju sintezu nekog

staničnog proizvoda

• Igraju važnu ulogu u kontroli genske

ekspresije

• Prosječan humani gen sadržava cca 9

egzona, 8 introna rasporeĎen na oko 30

000 parova baza

• Više od 90% prosječnog humanog gena

čine introni

• Čine 25% ukupne genomske DNA

Alternativno prekrajanje

• Ponavljajući (repetitivni) sljedovi DNA –

satelitna DNA, od uzastopno ponovljenih

nizova nekoliko tisuća kopija kratkih

sljedova duljine od 1 do 500 nukleotida.

• U vinske mušice, česti slijed od ACAAACT

• Ponavljaju se milijunima puta u genomu

• Čine oko 10% DNA u većine viših

eukariota

• Ne prepisuju se i ne predstavljaju

funkcionalnu genetičku informaciju

• Genom E. coli sadržava 4000 gena, a oko

90% koristi se za kodiranje proteina

• Genom kvasca, oko 2,5 puta je veći od

genoma E.coli; samo 4% gena sadržava

introne, oko 70% kvaščeva genoma koristi

se za kodiranje proteina

• U C.elegans, 25% genoma čine sljedovi

za kodiranje proteina, a u vinske mušice

oko 13%

• Genomi viših životinja veći su oko 20-30

puta od onog u vinske mušice

• Ljudski genom ima oko 30 000-40 000

gena (dvostruki broj od onog u genomima

C.elegans i vinske mušice)

• 25% ljudskog genoma čine introni

• Više od 60% od različitih tipova repetitivne

DNA

• Samo 1-1,5% sadržava sljedove koji

kodiraju proteine!

Funkcije gena u cvjetnice Arabidopsis thaliana,

čiji genom sadrži 26 000 gena

• ZAKLJUČAK: Biološka složenost

organizma nije funkcija broja gena u

njegovom genomu!

Kromosom Telomere

Kromatin: kompleks

DNA i proteina, histona

Osnovna strukturna

jedinica kromatina je

NUKLEOSOM

Kromatinska

vlakna

• U interfaznoj jezgri većinu kromatina čini

EUKROMATIN; dekondenziran, geni se

prepisuju,a DNA se udvostručuje

• Oko 10% interfaznog kromatina čini

HETEROKROMATIN; kondenziran,

transkripcijski neaktivan, sadržava visoko

ponovljene sljedove DNA poput onih u

centromerama i telomerama

Struktura telomera

Telomere imaju značajnu ulogu u održavanju kromosoma

• u čovjeka i ostalih sisavaca slijed telomernih ponavljanja je AGGGTT