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BIOL 4368 – Sección 040
Dr. Carlos Ríos
Roger Torres Luvir Lugo
Cristina Hernández Omayra Ramírez
Lourdes Miguel Yaneska Seín
Luis Acevedo Xavier Albino
http://microgroup8.blogspot.com
Enfermedad Gen Cromosoma
Parkinson
PARK10 1
PARK3 2
PARK8 12
PARK11 2
PARK12 X
PARK16 1
PARK2 6
PARK7 1
PARK6 1
PARK4 4
PARK9 1
PRK1 11
Enfermedad Gen Cromosoma
Anemia Falciforme
HBB 11
Enfermedad Gen Cromosoma
Alzheimer
PSEN2 1
AD14 1
AD13 1
AD15 3
COL25A1 4
HF3 6
HFE 6
AD10 7
AD12 8
AD11 9
AD6 10
AD7 10
AB128931 11
AD5 12
PSEN1 14
BPPF 17
Enfermedad Gen Cromosoma
Alzheimer
AD9 19
AD2 19
AD8 20
APP 21
BG319612.1 21
AK295373.1 21
AK312336.1 21
DN995202.1 21
DN998302.1 21
Enfermedad Gen Cromosoma
Cystic Fibrosis
S100A8 1
HS489756 7
R00050.1 13
CFM1 19
a. Organismo del cual proviene la secuencia :•Rhodobacter sphaeroides
b. Número de genes presentes en la secuencia: •Hay 2 genes presentes en la secuencia: ccmF y ccmH.
c. Función sugerida de alguno de los genes:•ccmF – putatitive heme lyase•ccmH – putative c- tipe cytochrome disulfide oxidoreductase
d. Seleccione 20 nucleótidos de cualquier región de uno de los genes.
•ccmF – Comienza en la posición 725•MIVEFGHFAL VLSLAVAFVQ
e. Seleccione los amino ácidos que desee de una de las secuencias de proteínas presentes.
•mrlaalllaa llatpafavq pdeilpdpal earardisqg lrclvcrneniddsnaqlar
¿Cuáles fueron los tres primeros “hits” obtenidos?
Nucleótidos
Proteínas
Los primeros“hints” de secuencias de nucleótidos, como podemos ver corresponden a diferentes especies de bacterias.
El valor de ∆E value más bajo es de la bacteria Rhodobacter.
Este valor nos ayuda a comprobar que la identidad de la secuencia de nucleótidos que utilizamos le pertenece a esta especie de bacteria mencionada en la premisa anterior.
Los primero “hints” de secuencias de aminoácidos que podemos ver son componentes del citocromo c de la bacteria Rhodobacter sphaeroides .
Los “hints” que podemos observar nos ayudan a comprobar nuevamente la identidad de la bacteria ya antes mencionada, ya que poseen valores de ∆E valuemenores de 0.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Genome
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
http://expasy.cbr.nrc.ca/tools/scnpsit1.html
