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Stata12.0 软件讲解

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Stata12.0 软件讲解. 张 超. 湖北医药学院附属太和医院循证医学 Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research Taihe Hospital, Hubei University of Medicine. 目 录. Stata 软件介绍 Stata 软件操作 Stata 软件图形编辑 实例演练. 软件介绍. Stata 软件历史 Stata 软件产品 Meta 程序包安装. Stata 软件历史. 最早于 20 世纪 80 年代推出 Stata 1.0 ,其基于 DOS 系统 - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Stata12.0  软件讲解

张 超

湖北医药学院附属太和医院循证医学Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research

Taihe Hospital, Hubei University of Medicine

Page 2: Stata12.0  软件讲解

目 录1. Stata 软件介绍2. Stata 软件操作3. Stata 软件图形编辑4. 实例演练

Page 3: Stata12.0  软件讲解

软件介绍1. Stata 软件历史2. Stata 软件产品3. Meta 程序包安装

Page 4: Stata12.0  软件讲解

Stata软件历史1. 最早于 20 世纪 80 年代推出 Stata 1.0 ,其基于

DOS 系统2. 目前,最新版本为 Stata 13.0 ,其基于 Windows 、

Macs 及 Unix 。本次,讲解 Stata 12.0 ……

3. Stata 软件官网: http://www.stata.com

$2,090

Page 5: Stata12.0  软件讲解

Stata News Stata Journal Stata Bookstore Stata Blog << 应用 STATA 做 Meta 分析 >> …

Stata软件产品 :

Page 6: Stata12.0  软件讲解

Meta程序包安装 :

1. 安装 Meta 分析命令文件2. 加载 Meta 分析操作控件

Page 7: Stata12.0  软件讲解

安装命令文件 :

net from http://www.stata-press.com/data/mais

net install maisspinst_mais

Page 8: Stata12.0  软件讲解

注意: 1 、 profile.do 文件存放于 Stata 软件安装的根目录

文件夹中 2 、目前,无法安装诊断性 Meta 分析控件(.dlg)

安装操作控件 :

1. 安装窗口文件— dlg 文件 ssc install metadialog.pkg

2. 生成自动执行控件生成文件— profile.do

Page 9: Stata12.0  软件讲解

1. midas.ado 文件下载: http://sitemaker.umich.edu/metadiagnosis/resources

2. metandi.ado 文件下载: http://ideas.repec.org/c/boc/bocode/s456932.html

3. 上述,两个 ado 文件全部放入到 ado 文件夹中

诊断性Meta分析代码安装 :

Page 10: Stata12.0  软件讲解

执行文件关系图

结果

代码执行

图形编辑

图形

菜单执行

ado文件

hlp 文件

dta 文件

dlg 文件

pkg 文件

Page 11: Stata12.0  软件讲解

Stata软件操作1. 软件界面介绍2. 数据排列格式3. 软件菜单式及命令式操作

Page 12: Stata12.0  软件讲解

结果输出窗口

菜单栏快捷菜单栏

命令输入窗口

命令回顾窗口 变量显示窗口

变量属性窗口

软件界面简介

Page 13: Stata12.0  软件讲解

数据结构—基于四格表形式:

研究 暴露组 非暴露组 总数

试验组 aa bb a+b

对照组 cc dd c+d

注: a— 试验组暴露数, b— 试验组非暴露数, a+b— 试验组总数 c— 对照组暴露数, d— 对照组非暴露数, c+d— 对照组总数

计数资料

Page 14: Stata12.0  软件讲解

具体数据录入格式:authors year a b c d latitude allocation

Aronson 1948 4 119 11 128 44 1

Ferguson & Simes 1949 6 300 29 274 55 1

Rosenthal et al 1960 3 228 11 209 42 1

Hart & Sutherland 1977 62 13536 248 12619 52 1

Frimodt-Moller et al 1973 33 5036 47 5761 13 2

Stein & Aronson 1953 180 1361 372 1079 44 2

Vandiviere et al 1973 8 2537 10 619 19 1

TPT Madras 1980 505 87886 499 87892 13 1

Cpetzee & Berjak 1968 29 7470 45 7232 27 1

Rosenthal et al 1961 17 1699 65 1600 42 3

Comstock et al 1974 186 50448 141 27197 18 3

Comstock & Webster 1969 5 2493 3 2338 33 3

Comstock et al 1976 27 16886 29 17825 33 3

计数资料亚组依据

Page 15: Stata12.0  软件讲解

Stata 软件数据录入:

计数资料

Page 16: Stata12.0  软件讲解

Stata 软件运算操作:1

2 3计数数据

对应四格表

数据标签

模型,方法

效应量分亚组

计数资料

Page 17: Stata12.0  软件讲解

结果

采用固定模型,效应量为RR

对应命令

Page 18: Stata12.0  软件讲解

采用固定模型,效应量为RR

森林图

Page 19: Stata12.0  软件讲解

采用随机模型—分亚组,效应量为RR

对应命令

分亚组

结果

Page 20: Stata12.0  软件讲解

采用随机模型—分亚组,效应量为RR

亚组 1

亚组 2

亚组 3

森林图

Page 21: Stata12.0  软件讲解

数据经对数转换代码: gen logrr=log(_ES)

_SS _ES _selogES _LCI _UCI _WT logrr

262 0.410939 0.5706 0.134302 1.257398 5.040297 -0.88931

609 0.204868 0.441114 0.086297 0.486352 6.350208 -1.58539

451 0.25974 0.64449 0.073443 0.918609 4.415995 -1.34807

26465 0.236561 0.141457 0.179281 0.312141 9.714516 -1.44155

10877 0.80449 0.226297 0.516293 1.253558 8.874237 -0.21755

2992 0.455611 0.0831 0.387132 0.536203 10.11686 -0.78612

3174 0.197721 0.472247 0.078357 0.498919 6.011108 -1.6209

176782 1.012024 0.062941 0.894572 1.144897 10.21188 0.011952

14776 0.625366 0.237559 0.392576 0.996196 8.747549 -0.46942

3381 0.253765 0.270231 0.149421 0.430976 8.368153 -1.37134

77972 0.712227 0.11141 0.572514 0.886035 9.943801 -0.33936

4839 1.561916 0.72973 0.373689 6.528374 3.80165 0.445913

34767 0.982835 0.267217 0.582137 1.659341 8.403747 -0.01731

漏斗图绘制所需数据: logrr 与 _selogES

漏斗图数据

Page 22: Stata12.0  软件讲解

1

3

2

对应代码: metafunnel logrr _selogES

分亚组

漏斗图操作

Page 23: Stata12.0  软件讲解

漏斗图

Page 24: Stata12.0  软件讲解

1

2

3

对应代码: metabias logrr _selogES, graph(begg) 或 graph(egger)

Begg 或 Egger检验法

Page 25: Stata12.0  软件讲解

Begg 或 Egger检验法

Page 26: Stata12.0  软件讲解

Begg检验法漏斗图

Page 27: Stata12.0  软件讲解

Egger检验法回归图

Page 28: Stata12.0  软件讲解

敏感性分析1

2

3

对应代码: metainf logrr _selogES, random id(authors) eform

Page 29: Stata12.0  软件讲解

敏感性分析

Page 30: Stata12.0  软件讲解

诊断性资料

诊断试验结果( T )金标准诊断( D)

合计病例( D+) 病例( D-)

阳性( T+) TP (真阳性) FP (假阳性) TP+FP

阴性( T-) FN (假阴性) TN (真阴性) FN+TN

合计 TP+FN FP+TN N

数据结构—其实质基于四格表形式:

注: TP :真阳性, FP :假阳性, FN :假阴性, TN :真阴性 TP+FP :诊断试验阳性数, FN+TN :诊断试验阴性数 TP+FN :真实病例总人数, FP+TN :真实健康总人数

Page 31: Stata12.0  软件讲解

诊断性资料author year tp fp fn tn

Tse 1992 4 0 3 3Adler1 1993 8 0 1 10Hoh 1993 6 0 3 5

Crowe 1994 9 0 1 10Avril 1996 19 1 5 26

… …Inoue 2004 21 2 14 44

Zornoza 2004 90 2 17 91Weir 2005 5 3 13 19

Gil-Rendo 2006 120 2 22 131Kumar 2006 16 2 20 40Stadnik 2006 4 0 1 5Chung 2006 25 0 17 18

Veronesi 2006 38 5 65 128

具体数据录入格式:

Page 32: Stata12.0  软件讲解

汇总结果

对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) res(all)

Page 33: Stata12.0  软件讲解

敏感度与特异度

对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) table(dss)

Page 34: Stata12.0  软件讲解

敏感度森林图

对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)

Page 35: Stata12.0  软件讲解

特异度森林图

对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)

Page 36: Stata12.0  软件讲解

Deek漏斗图

对应代码: midas tp fp fn tn , pubb

Page 37: Stata12.0  软件讲解

SROC曲线

对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) plot sroc2

Page 38: Stata12.0  软件讲解

HSROC曲线

对应代码: metandi tp fp fn tn, plot nob noh

Page 39: Stata12.0  软件讲解

图形编辑

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