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Stata12.0 软件讲解. 张 超. 湖北医药学院附属太和医院循证医学 Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research Taihe Hospital, Hubei University of Medicine. 目 录. Stata 软件介绍 Stata 软件操作 Stata 软件图形编辑 实例演练. 软件介绍. Stata 软件历史 Stata 软件产品 Meta 程序包安装. Stata 软件历史. 最早于 20 世纪 80 年代推出 Stata 1.0 ,其基于 DOS 系统 - PowerPoint PPT Presentation
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张 超
湖北医药学院附属太和医院循证医学Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research
Taihe Hospital, Hubei University of Medicine
目 录1. Stata 软件介绍2. Stata 软件操作3. Stata 软件图形编辑4. 实例演练
软件介绍1. Stata 软件历史2. Stata 软件产品3. Meta 程序包安装
Stata软件历史1. 最早于 20 世纪 80 年代推出 Stata 1.0 ,其基于
DOS 系统2. 目前,最新版本为 Stata 13.0 ,其基于 Windows 、
Macs 及 Unix 。本次,讲解 Stata 12.0 ……
3. Stata 软件官网: http://www.stata.com
$2,090
Stata News Stata Journal Stata Bookstore Stata Blog << 应用 STATA 做 Meta 分析 >> …
Stata软件产品 :
Meta程序包安装 :
1. 安装 Meta 分析命令文件2. 加载 Meta 分析操作控件
安装命令文件 :
net from http://www.stata-press.com/data/mais
net install maisspinst_mais
注意: 1 、 profile.do 文件存放于 Stata 软件安装的根目录
文件夹中 2 、目前,无法安装诊断性 Meta 分析控件(.dlg)
安装操作控件 :
1. 安装窗口文件— dlg 文件 ssc install metadialog.pkg
2. 生成自动执行控件生成文件— profile.do
1. midas.ado 文件下载: http://sitemaker.umich.edu/metadiagnosis/resources
2. metandi.ado 文件下载: http://ideas.repec.org/c/boc/bocode/s456932.html
3. 上述,两个 ado 文件全部放入到 ado 文件夹中
诊断性Meta分析代码安装 :
执行文件关系图
结果
代码执行
图形编辑
图形
菜单执行
ado文件
hlp 文件
dta 文件
dlg 文件
pkg 文件
Stata软件操作1. 软件界面介绍2. 数据排列格式3. 软件菜单式及命令式操作
结果输出窗口
菜单栏快捷菜单栏
命令输入窗口
命令回顾窗口 变量显示窗口
变量属性窗口
软件界面简介
数据结构—基于四格表形式:
研究 暴露组 非暴露组 总数
试验组 aa bb a+b
对照组 cc dd c+d
注: a— 试验组暴露数, b— 试验组非暴露数, a+b— 试验组总数 c— 对照组暴露数, d— 对照组非暴露数, c+d— 对照组总数
计数资料
具体数据录入格式:authors year a b c d latitude allocation
Aronson 1948 4 119 11 128 44 1
Ferguson & Simes 1949 6 300 29 274 55 1
Rosenthal et al 1960 3 228 11 209 42 1
Hart & Sutherland 1977 62 13536 248 12619 52 1
Frimodt-Moller et al 1973 33 5036 47 5761 13 2
Stein & Aronson 1953 180 1361 372 1079 44 2
Vandiviere et al 1973 8 2537 10 619 19 1
TPT Madras 1980 505 87886 499 87892 13 1
Cpetzee & Berjak 1968 29 7470 45 7232 27 1
Rosenthal et al 1961 17 1699 65 1600 42 3
Comstock et al 1974 186 50448 141 27197 18 3
Comstock & Webster 1969 5 2493 3 2338 33 3
Comstock et al 1976 27 16886 29 17825 33 3
计数资料亚组依据
Stata 软件数据录入:
计数资料
Stata 软件运算操作:1
2 3计数数据
对应四格表
数据标签
模型,方法
效应量分亚组
计数资料
结果
采用固定模型,效应量为RR
对应命令
采用固定模型,效应量为RR
森林图
采用随机模型—分亚组,效应量为RR
对应命令
分亚组
结果
采用随机模型—分亚组,效应量为RR
亚组 1
亚组 2
亚组 3
森林图
数据经对数转换代码: gen logrr=log(_ES)
_SS _ES _selogES _LCI _UCI _WT logrr
262 0.410939 0.5706 0.134302 1.257398 5.040297 -0.88931
609 0.204868 0.441114 0.086297 0.486352 6.350208 -1.58539
451 0.25974 0.64449 0.073443 0.918609 4.415995 -1.34807
26465 0.236561 0.141457 0.179281 0.312141 9.714516 -1.44155
10877 0.80449 0.226297 0.516293 1.253558 8.874237 -0.21755
2992 0.455611 0.0831 0.387132 0.536203 10.11686 -0.78612
3174 0.197721 0.472247 0.078357 0.498919 6.011108 -1.6209
176782 1.012024 0.062941 0.894572 1.144897 10.21188 0.011952
14776 0.625366 0.237559 0.392576 0.996196 8.747549 -0.46942
3381 0.253765 0.270231 0.149421 0.430976 8.368153 -1.37134
77972 0.712227 0.11141 0.572514 0.886035 9.943801 -0.33936
4839 1.561916 0.72973 0.373689 6.528374 3.80165 0.445913
34767 0.982835 0.267217 0.582137 1.659341 8.403747 -0.01731
漏斗图绘制所需数据: logrr 与 _selogES
漏斗图数据
1
3
2
对应代码: metafunnel logrr _selogES
分亚组
漏斗图操作
漏斗图
1
2
3
对应代码: metabias logrr _selogES, graph(begg) 或 graph(egger)
Begg 或 Egger检验法
Begg 或 Egger检验法
Begg检验法漏斗图
Egger检验法回归图
敏感性分析1
2
3
对应代码: metainf logrr _selogES, random id(authors) eform
敏感性分析
诊断性资料
诊断试验结果( T )金标准诊断( D)
合计病例( D+) 病例( D-)
阳性( T+) TP (真阳性) FP (假阳性) TP+FP
阴性( T-) FN (假阴性) TN (真阴性) FN+TN
合计 TP+FN FP+TN N
数据结构—其实质基于四格表形式:
注: TP :真阳性, FP :假阳性, FN :假阴性, TN :真阴性 TP+FP :诊断试验阳性数, FN+TN :诊断试验阴性数 TP+FN :真实病例总人数, FP+TN :真实健康总人数
诊断性资料author year tp fp fn tn
Tse 1992 4 0 3 3Adler1 1993 8 0 1 10Hoh 1993 6 0 3 5
Crowe 1994 9 0 1 10Avril 1996 19 1 5 26
… …Inoue 2004 21 2 14 44
Zornoza 2004 90 2 17 91Weir 2005 5 3 13 19
Gil-Rendo 2006 120 2 22 131Kumar 2006 16 2 20 40Stadnik 2006 4 0 1 5Chung 2006 25 0 17 18
Veronesi 2006 38 5 65 128
具体数据录入格式:
汇总结果
对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) res(all)
敏感度与特异度
对应代码: midas tp fp fn tn, es(x) table(dss)
敏感度森林图
对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)
特异度森林图
对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) id(author) year(year) for(dss)
Deek漏斗图
对应代码: midas tp fp fn tn , pubb
SROC曲线
对应代码: midas tp fp fn tn , es(x) plot sroc2
HSROC曲线
对应代码: metandi tp fp fn tn, plot nob noh
图形编辑
湖北医药学院附属太和医院循证医学中心Center for Evidence-Based Medicine and Clinical Research
Taihe Hospital, Hubei University of Medicine