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tRNA の構造 それぞれのアミノ酸と結合 mRNA の codon を認識 mRNA の codon にしたがい対応する アミノ酸を結合させる アミノ酸 tRNA codon 分子細胞生物学Fig4-26 5' 3' mRNA ribosome は mRNA の 5'->3' の方向に進む anticodon 5' 3' 3' の A に アミノ酸を結合 5' 3' mRNA codon 結合は相補的で逆平行 complementary, antiparallel アミノ酸に対する codon 61種 4 3 -3=61 アミノ酸 20種 tRNA (細菌) 30~40種 tRNA (動植物) ~50種 1ヶのtRNAは複数の決まったcodonに結合 1ヶのアミノ酸は複数の決まったtRNAに結合

tRNA の構造 ★ それぞれのアミノ酸と結合 ★ mRNA …muraka-h/class/2015/biochem-11.pdf1ヶのアミノ酸は複数の決まったtRNAに結合 5' 3' D-loop T!CG-loop

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tRNA の構造★ それぞれのアミノ酸と結合★ mRNA の codon を認識 mRNA の codon にしたがい対応するアミノ酸を結合させる

アミノ酸

tRNA

codon

分子細胞生物学Fig4-26

5' 3'mRNA

ribosome は mRNA の 5'->3' の方向に進む

anticodon

5'

3'

3' の A にアミノ酸を結合

5'3'mRNAcodon

結合は相補的で逆平行complementary, antiparallel

アミノ酸に対するcodon 61種 43-3=61アミノ酸 20種

tRNA (細菌) 30~40種tRNA (動植物) ~50種

1ヶのtRNAは複数の決まったcodonに結合1ヶのアミノ酸は複数の決まったtRNAに結合

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5'3'

D-loop T!CG-loop

mRNA

5'3'

codon

acceptor stem

stem loop 構造( 幹  環 )

すべてのtRNAの3' 端の配列は CCA3' 端の A にアミノ酸を結合

L 字型

modified bases修飾塩基 (AGCU以外の塩基)

Watson-Crick型のbase pairing 立体構造を形成

D, I, mG, ! など

5' 3'anti-parallel

complementaryWatson-Crick 型ではないbase pairing

(-CH3)

DHU-loop

extra arm

Stryer30章p845-847

|-O-C-CH-NH3

O Rエステル結合

T!C-loop

hiro
図30-3
hiro
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modified bases修飾塩基 (AGCU以外の塩基)

D, I, mG, ! など

tRNAの前駆体がその遺伝子から転写された後、該当する位置の塩基が修飾を受けて変化する。

D I !

tRNA 遺伝子DNA

transcription

modificationtRNA 前駆体

tRNA

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アミノ酸に対応する mRNA の codon の種類 61種 ( 4x4x4-3=61 )tRNA の種類(anticodon の種類) 30-40種(細菌)、 ~50種(動物)

anticodon の方が少ないWatson-Crick 型の相補的結合(A=U, G=C)なら、必ず1対1で結合するはず。codon が 61種 なので、anticodon(tRNA)も 61種必要のはず?

-> ひとつの tRNA の anticodon が 複数の異なる codon と対合

...UUC......UUU...5' 3'

codon

anticodon

5'3'

5'3'

(61種)AAG

3' 5'

codon の3番目の塩基と anticodon の1番目の塩基の対合の時のみ、Watson-Crick 型ではない特別の対合pairingが起こりうる。

1 2 3 1 2 3

3 2 1

wobble pairing ゆらぎ対合

wobble positioncodonの第3塩基、anticodonの第1塩基

5'3'

Stryer30章p860

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tRNA の anticodon の第1塩基

mRNA の codon の第3塩基

tRNA の anticodon の第1塩基

mRNA の codon の第3塩基

wobble position の塩基の対合wobble pairing

wobble pairing により、1つの tRNA が複数の (mRNA の)codon と対合できる

I: inosine

分子細胞生物学第4版Fig4-27

tRNAのanticodonのwobble position のGはcodonのCとUに結合しうる。 -> codon table の 第3塩基がC, U は同一のアミノ酸(同じtRNAが結合)

hiro
Stryer p861
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aminoacyl tRNA synthetaseそれぞれのアミノ酸に専用の酵素が存在する(20種の酵素が存在)。tRNA の anticodon に対応したアミノ酸を正確に tRNA に結合させる。 -> DNA配列 → アミノ酸配列 への変換においてgenetic code (遺伝暗号)の通りにアミノ酸を配列結合させるのに重要な役割を担う。(厳密な認識及び校正機能)ATPのエネルギーをアミノ酸の -COOH とtRNA の 3' 端の CCA のAの -OH との間の結合に変換   high energy linkage を形成

★★

アミノ酸を認識する部位

tRNA を認識する部位

ATP

high energy linkage

codon に対し正確にanticodon が結合することで、tRNA に正確に結合した正しいアミノ酸が mRNA の配列の通りに配列する。

2段階の反応によりmRNAの塩基(AGCU)配列がアミノ酸の配列に変換される。

ATPのエネルギーを蓄える

hiro
essential 細胞生物学 図7-29
hiro
hiro
Stryer p847
hiro
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pyrophosphate

AMP

アミノ酸によっては 2'-OH に結合するものもある。

3'-OH に結合

Aminoacyl tRNA synthetase による tRNA への特異的なアミノ酸の付加

ピロリン酸 3'-OH

class I aminoacyl tRNA synthetase による反応

class II aminoacyl tRNA synthetase による反応3'-OHにアミノ酸をエステル結合させる。

tRNA3'末端

tRNAが誤ったアミノ酸を結合した場合には、加水分解する酵素も存在(aminoacyl tRNAsynthetase の校正機能)

hiro
Stryer p848