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tRNA の構造★ それぞれのアミノ酸と結合★ mRNA の codon を認識 mRNA の codon にしたがい対応するアミノ酸を結合させる
アミノ酸
tRNA
codon
分子細胞生物学Fig4-26
5' 3'mRNA
ribosome は mRNA の 5'->3' の方向に進む
anticodon
5'
3'
3' の A にアミノ酸を結合
5'3'mRNAcodon
結合は相補的で逆平行complementary, antiparallel
アミノ酸に対するcodon 61種 43-3=61アミノ酸 20種
tRNA (細菌) 30~40種tRNA (動植物) ~50種
1ヶのtRNAは複数の決まったcodonに結合1ヶのアミノ酸は複数の決まったtRNAに結合
5'3'
D-loop T!CG-loop
mRNA
5'3'
codon
acceptor stem
stem loop 構造( 幹 環 )
すべてのtRNAの3' 端の配列は CCA3' 端の A にアミノ酸を結合
L 字型
modified bases修飾塩基 (AGCU以外の塩基)
Watson-Crick型のbase pairing 立体構造を形成
D, I, mG, ! など
5' 3'anti-parallel
complementaryWatson-Crick 型ではないbase pairing
(-CH3)
DHU-loop
extra arm
Stryer30章p845-847
|-O-C-CH-NH3
O Rエステル結合
T!C-loop
modified bases修飾塩基 (AGCU以外の塩基)
D, I, mG, ! など
tRNAの前駆体がその遺伝子から転写された後、該当する位置の塩基が修飾を受けて変化する。
D I !
tRNA 遺伝子DNA
transcription
modificationtRNA 前駆体
tRNA
アミノ酸に対応する mRNA の codon の種類 61種 ( 4x4x4-3=61 )tRNA の種類(anticodon の種類) 30-40種(細菌)、 ~50種(動物)
anticodon の方が少ないWatson-Crick 型の相補的結合(A=U, G=C)なら、必ず1対1で結合するはず。codon が 61種 なので、anticodon(tRNA)も 61種必要のはず?
-> ひとつの tRNA の anticodon が 複数の異なる codon と対合
...UUC......UUU...5' 3'
codon
anticodon
5'3'
5'3'
(61種)AAG
3' 5'
codon の3番目の塩基と anticodon の1番目の塩基の対合の時のみ、Watson-Crick 型ではない特別の対合pairingが起こりうる。
1 2 3 1 2 3
3 2 1
wobble pairing ゆらぎ対合
wobble positioncodonの第3塩基、anticodonの第1塩基
5'3'
Stryer30章p860
tRNA の anticodon の第1塩基
mRNA の codon の第3塩基
tRNA の anticodon の第1塩基
mRNA の codon の第3塩基
wobble position の塩基の対合wobble pairing
wobble pairing により、1つの tRNA が複数の (mRNA の)codon と対合できる
I: inosine
分子細胞生物学第4版Fig4-27
tRNAのanticodonのwobble position のGはcodonのCとUに結合しうる。 -> codon table の 第3塩基がC, U は同一のアミノ酸(同じtRNAが結合)
aminoacyl tRNA synthetaseそれぞれのアミノ酸に専用の酵素が存在する(20種の酵素が存在)。tRNA の anticodon に対応したアミノ酸を正確に tRNA に結合させる。 -> DNA配列 → アミノ酸配列 への変換においてgenetic code (遺伝暗号)の通りにアミノ酸を配列結合させるのに重要な役割を担う。(厳密な認識及び校正機能)ATPのエネルギーをアミノ酸の -COOH とtRNA の 3' 端の CCA のAの -OH との間の結合に変換 high energy linkage を形成
★★
★
アミノ酸を認識する部位
tRNA を認識する部位
ATP
high energy linkage
codon に対し正確にanticodon が結合することで、tRNA に正確に結合した正しいアミノ酸が mRNA の配列の通りに配列する。
2段階の反応によりmRNAの塩基(AGCU)配列がアミノ酸の配列に変換される。
ATPのエネルギーを蓄える
pyrophosphate
AMP
アミノ酸によっては 2'-OH に結合するものもある。
3'-OH に結合
Aminoacyl tRNA synthetase による tRNA への特異的なアミノ酸の付加
ピロリン酸 3'-OH
class I aminoacyl tRNA synthetase による反応
class II aminoacyl tRNA synthetase による反応3'-OHにアミノ酸をエステル結合させる。
tRNA3'末端
tRNAが誤ったアミノ酸を結合した場合には、加水分解する酵素も存在(aminoacyl tRNAsynthetase の校正機能)