VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI … fileperpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, protein yang ditunjukkan

perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id

commit to user

i

VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI KANDUNGAN

PROTEIN BIJI EMPAT VARIETAS Cucurbita moschata Durch DI WILAYAH

PACITAN JAWA TIMUR

Skripsi

Untuk memenuhi sebagian persyaratan

guna memperoleh gelar Sarjana Sains

Disusun oleh:

Rebekca Cindy Yuswita

M0408112

JURUSAN BIOLOGI

FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS SEBELAS MARET

SURAKARTA

2014


commit to user

ii


commit to user

iii

PERNYATAAN

Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya

sendiri dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar

kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat

yang pernah ditulis atau diterbitkan orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu

dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.

Apabila dikemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka

gelar kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau kembali dan/atau dicabut.

Surakarta, Januari 2014

Rebekca Cindy Y

NIM. M0408112


commit to user

iv

Variasi morfologi, Pola Pita Protein, dan Uji Kandungan Protein Biji Empat

Varietas Cucurbita moschata Durch di Wilayah Pacitan Jawa Timur


Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,

Universitas Sebelas Maret, Surakarta.

ABSTRAK

Penelitian ini bertujuan mengetahui variasi pola pita protein dan uji

kandungan protein biji labu kuning. Metode yang digunakan untuk isolasi pola

pita protein adalah metode SDS – PAGE(Sodium Dodecyl Sulphate

Polyacrylamide Gel Electrophoresis) dengan tegangan 100 V selama 1 jam,

metode untuk analisis kandungan protein pada biji menggunakan metode Kjeldahl

yang terdiri atas tahap destruksi, destilasi, dan titrasi.

Penelitian ini menggunakan analisis kualitatif untuk melihat keragaman

pola pita protein berdasarkan nilai Rf (nilai relatif) yang diperoleh dari

perbandingan antara jarak migrasi protein terhadap migrasi loading dye. Hasil

penelitian menunjukkan bahwa semua biji labu memiliki perbedaan, komposisi

protein yang ditunjukkan dari tebal tipisnya pola pita protein. Kandungan protein

biji labu juga bervariasi, labu oval memiliki kandungan protein tertinggi yaiutu

(43,82%), kandungan protein yang terkecil (29,31%) ditemukan pada labu botol.

Kata kunci : Cucurbita moschata Durch, pola pita protein, SDS – PAGE,

elektroforesis, analisis kandungan protein, Rf


commit to user

v

Variations Morphology, in the Pattern of Protein Bands and the Protein

Content Test of Four Varieties of Seeds Cucurbita moschata Durch in the

Region Pacitan East Java


Biology Department, Faculty of Mathematics and Natural Sciences

Sebelas Maret University, Surakarta.

ABSTRACT

The aims of this study were to determine whether variations in pattern of

the seed protein bands and to examined the content of variation pumpkin seed

protein. Running of protein banding pattern was done by SDS-PAGE (Sodium

Dodecyl Sulphate polyacrylamide gel electrophoresis) with a voltage of 100 volt

for 1 hour. Meanwhile analysis of protein content in the seed, was done by

Kjeldahl method consists of stages destruction, distillation, and titration

respectivety.

The qualitative analysis of this experiment was done by detected the

presence of the protein banding patterns according to the Rf values (Retardation

factor) obtained from the comparison between the migration protein distance and

migration of loading dye. The results showed that all of pumpkin seeds have a

protein content differences which was indicated by thickness of banding patterns.

The protein content as recorded as the highest (43,82%), and this based on

percentage of protein the oval pumpkin, while the smallest percentage (29,31%)

was found at the bottle type.

Keywords: Cucurbita moschata Durch, the pattern of protein bands, SDS -

PAGE, electrophoresis, protein analysis, Rf


commit to user

vi

PERSEMBAHAN

Skripsi ini saya dedikasikan untuk :

Yesus Kristus, Juru selamat dan Penebusku

Papa Richard Hutabarat, Mama Rumondang

Hutabarat dan Rowena M D,

Serta keluarga besar, atas cinta dan doanya kepada saya

Teman-teman angkatan 2008,

Atas bantuan dan dukungannya

Almamater, Universitas Sebelas Maret


commit to user

vii

MOTTO

“Takut akan Tuhan adalah permulaan pengetahuan, tetapi orang bodoh

menghina hikmat dan didikan”.

(Amsal 1:7)

“Setiap Orang Punya Jatah Gagal, Habiskan Jatah Gagalmu ketika Kamu Masih

Muda”.

(Dahlan Iskan)


commit to user

viii

KATA PENGANTAR

1. Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas berkat dan

rahmat-Nya yang berlimpah sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian

dan penyusunan skripsi dengan Judul Variasi Pola Pita Protein dan Uji

Kandungan Protein Empat Varietas Biji Cucurbita moschata Durch Di

Wilayah Pacitan Jawa Timur. Penyusunan skripsi ini merupakan salah satu

syarat untuk memperoleh gelar kesarjanaan Strata 1 (S1) di Jurusan Biologi,

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret,

Surakarta.

2. Penelitian dan penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari masukan dan

dukungan berbagai pihak yang sangat membantu dan bermanfaat kepada

penulis. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih kepada :

3. Dr. Agung Budiharjo, M.Si., selaku Ketua Jurusan Biologi, Fakultas

Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret,

Surakarta yang telah memberikan izin dan dukungan selama penelitian.

4. Prof. Drs.Suranto,M.Sc.Ph.D, selaku Dosen Pembimbing I yang telah

memberikan proyek penelitian, saran, bimbingan penelitian di laboratorium,

hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.

5. Dr. Ari Susilowati,M.Si., selaku Dosen Pembimbing II yang telah

memberikan saran, dan ilmu yang sangat berharga bagi penulis, serta

bimbingan dari awal penelitian hingga terselesaikannya penyusunan skripsi

ini.

6. Dr. Artini Pangastuti,M.Si., selaku Dosen Penelaah I yang telah memberikan,

saran, kritik, dukungan sehingga penulis mampu memahami materi dengan

baik.

7. Siti Lusi Arum Sari,M.Biotech., selaku Dosen Penelaah II yang telah

memberikan saran dan kritik hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.


commit to user

ix

8. Dr. Dra.Ratna Setyaningsih,M.Si selaku Kepala Laboratorium Jurusan Biologi

FMIPA, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin

penelitian beserta sarana dan prasarana selama penelitian.

9. Dosen-dosen di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan

Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah mendidik dan

memberikan dorongan moral sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi

ini. Staf dministrasi Jurusan Biologi, Mas Adenan, Mbak Atik,dan Mbak Nina

yang selalu memberikan doa dan semangat bagi penulis.

10. FajarRidwansyah yang selalu memberi semangat, doa, dan setia mendampingi

penulis sampai skripsi ini selesai. Christian Agung Nugraha, Lia Nandiar,

Syarafina Putri, Bania Aprilla, Larasati Senja, Odise L, dan Maria Ima F atas

dukungan bagi penulis dari awal penelitian hingga penyusunan skripsi.

Teman-teman Biologi khususnya angkatan 2008 yang selalu memberikan

motivasi dan dukungan kepada penulis.

11. Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga

penyusunan skripsi masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu, penulis sangat

mengharapkan adanya masukan yang bersifat membangun. Semoga skripsi

ini dapat bermanfaat.

Surakarta, Januari 2014

Penulis


commit to user

x

DAFTAR ISI

Halaman

HALAMAN JUDUL ........................................................................................ i

HALAMAN PERSETUJUAN ......................................................................... ii

PERNYATAAN ............................................................................................... iii

ABSTRAK ....................................................................................................... iv

ABSTRACT ..................................................................................................... v

HALAMAN PERSEMBAHAN....................................................................... vi

MOTTO............................................................................................................ vii

KATA PENGANTAR ..................................................................................... viii

DAFTAR ISI .................................................................................................... x

DAFTAR TABEL ............................................................................................ xiii

DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... xiv

DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xv

BAB I. PENDAHULUAN ............................................................................ 1

A. Latar Belakang Masalah ............................................................ 1

B. Perumusan Masalah ................................................................... 3

C. Tujuan Penelitian ....................................................................... 3

D. Manfaat Penelitian ..................................................................... 3

BAB II. LANDASAN TEORI ........................................................................ 4

A. Tinjauan Pustaka........................................................................ 4

1. Klasifikasi labu kuning ........................................................ 4

2. Morfologi labu kuning. ........................................................ 5

3. Kondisi geografis wilayah Pacitan . .................................... 11

4. Protein ............................ ..................................................... 12

5. Pola pita protein dan elektroforesis............................ ......... 13

6. SDS-PAGE............................ .............................................. 14

7. Analisis kandungan protein............................ ..................... 16

B. Kerangka Pemikiran .................................................................. 20


commit to user

xi

BAB III. METODE PENELITIAN.................................................................. 22

A. Waktu dan Tempat Penelitian ..................................................... 22

B. Alat dan Bahan Penelitian .......................................................... 23

C. Cara Kerja ................................................................................... 25

D. Analisis kandungan protein ......................................................... 29

E. Analisis Data ............................................................................... 30

BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................ 31

A. Morfologi biji labu kuning ........................................................ 31

B. Pita protein biji labu kuning ...................................................... 36

C. Kandungan protein biji labu kuning .......................................... 52

BAB V. KESIMPULAN DAN SARAN .......................................................... 57

A. Kesimpulan ................................................................................. 59

B. Saran ........................................................................................... 59

DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 60

LAMPIRAN ..................................................................................................... 64

DAFTAR RIWAYAT HIDUP......................................................................... 69


commit to user

xii

DAFTAR TABEL

Halaman

Tabel 1. Morfologi Labu Kuning dan Biji Labu Kuning .............................. ..... 32

Tabel 2. Ukuran dan berat biji dari empat varietas labu kuning .........................35

Tabel 3. Nilai biner Rf berdasarkan banyaknya pola pita

yangmuncul.......................................... ................................................. 41

Tabel 4. Perhitungan Rf dan Log BM markerprotein........... .............................. 43

Tabel 5. Hasil analisis SDS-PAGE berat molekul protein... ............................... 44

Tabel 6. Hasil perhitungan profil pola pita protein biji dari keempat varietas

labu kuning di wilayah Pacitan berdasarkan Tebal pita, Jarak migrasi, Rf,dan

Berat molekul.......................................................................... 49

Tabel 7. Kandungan protein biji dari empat varietas labu kuning ...................... 52


commit to user

xiii

DAFTAR GAMBAR

Halaman

Gambar 1. Labu kuning (Cucurbita moschata)………….................. 4

Gambar 2. Labu Kuning Varietas Bokor……………........................ 7

Gambar 3. Labu Kuning Varietas Botol…...…………...................... 8

Gambar 4. Labu Kuning Varietas Oval….…....................................... 8

Gambar 5. Labu Kuning Varietas Ular….............................................. 9

Gambar 6. Bagan Kerangka Pemikiran……………………………….. 21

Gambar 7. Hasil elektroforesis pola pita protein biji labu kuning…….. 37

Gambar 8. Redrawing elektroforesis pola pita protein biji labu kuning.. 38


commit to user

xiv

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

Lampiran 1. Kurva standar marker SDS-PAGE………………… 64

Lampiran 2. Bobot molekul pita protein keseluruhan…………… 64

Lampiran 3. Redrawing biji labu kuning varietas bulat………….. 67

Lampiran 4. Redrawing biji labu kuning varietas oval…………… 67

Lampiran 5. Redrawing biji labu kuning varietas ular……………. 68

Lampiran 6. Redrawing biji labu kuning varietas botol…………… 68


commit to user

xv

DAFTAR SINGKATAN

Singkatan Kepanjangan

APS

HCl

NaH2PO4

Na2HPO4

Rf

Var.

SDS

TEMED

Ammonium Persulphate

Asam klorida

Natrium dihidrogen-fosfat

Dinatrium hidogren-fosfat

Retardation factor

Varietas

Sodium Dodecyl sulfate

N’N’N’N’ tetramethyl-ethilenediamine

Documents

VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI … fileperpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, protein yang ditunjukkan