20
Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Verschuere Annelies Stagementor: Sofie D’hondt Stagementor: Ineke van Gremberghe Promotor: Mieke Demeyere

Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE.

Verschuere AnneliesVerschuere Annelies

Stagementor: Sofie D’hondtStagementor: Ineke van GremberghePromotor: Mieke Demeyere

Page 2: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Project B-Blooms2

Project B-Blooms

Project B-Blooms2

Doelstellingen stage- Cyanobacteriën in Donkmeer- Planktothrix populatie in Donkmeer- Microcystis populatie in Westveldpark

Page 3: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Overzicht

CyanobacteriënMicrocystis & PlanktotrixDGGEResultaten

Page 4: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Cyanobacteriën

Naam kleur cyaan

Voorkomen:– Vooral in mariene omgevingen– Bloeien

Page 5: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Cyanobacteriën

Bloeien– Licht– Gasvacuolen– Fosfor en stikstof– Populatiestabiliteit– Temperatuur

Page 6: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 7: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Microcystis & Planktothrix

Microcystis– 1/3: toxines

Contact: huidirritatie Inname: gastro-intestinaal ongemak

Planktothrix

Page 8: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Microcystis & Planktothrix

ITS (‘Intergenic Transcribed spacer’)

Page 9: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

DGGE

DGGE = Denaturatie gradiënt gel electroforese

Prof Leonard Lerman

Gewone agarose:

Page 10: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

DGGE

Principe:

Page 11: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Westveldpark Microcystis (ITS)

- Diversiteit:

8 bandjes/staal

14 ≠ bandjes 14 ≠ genotypes

Culturen (Van Wichelen J.): 2 morfotypes M. viridis & M. aeruginosa

- Temporele dynamiek:

# bandjes: voorjaar > zomer > najaar

Page 12: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

M. aeruginosa M. viridis

Page 13: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 14: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Donkmeer – cyanobacteriën

- Diversiteit:

Gels: Planktothrix Anabaena of Aphanizomenon

- Temporele dynamiek:

#: najaar < zomer & voorjaar

zomer ~ voorjaar

Page 15: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:
Page 16: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

Donkmeer – Planktothrix

- Agarosegel:

Page 17: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

- DGGE-gel:

Page 18: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Resultaten

- Diversiteit:

7 genotypes per staal

8 ≠ genotypes

- Temporele dynamiek:

#: najaar > zomer

Page 19: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Conclusie

Diversiteit:

- 14 verschillende genotypes Microcystis

- 8 verschillende genotypes Planktothrix

Temporele dynamiek:

- voorjaar: Microcystis

- najaar: Planktothrix

Page 20: Verschuere Annelies Studie naar de diversiteit en temporele dynamiek van een Microcystis en Planktothrix populatie a.d.h.v. DGGE. Verschuere Annelies Stagementor:

Ik dank u voor uw aandacht.

Enkele vragen?

Annelies Verschuere