HERPESVIRIDAE HSV1 HSV2 VZV CMV EBV HHV6 Exanthema subitum (Roseola infantum) HHV7 Exanthema subitum HHV8 Kaposis sarcoma

PapovaridaePapilloma virus : 55 nm- HPV

Polyoma virus : 45 nm- virus sv 40- virus JC- virus BK

Orthomyxoviridae : 80 100 nmgenus : Influenzavirus type A,B,C

Paramyxoviridae : 150-250 nmgenus paramyxovirius : parainfluenza 1.3 Newcastle virus (NDV)genus Rubulavirus : paratitis, parainfluenza 2,4genus morbillivirus measles viruscanine distemper virusgenus pneumovirus : RSV

PICORNAVIRIDAEEnterovirus : Polio virus, Coxsackie virus A, Coxsackie virus B, ECHO virus, Enterovirus 68-71, Enterovirum 72 (HAV)RhinovirusAphthovirus : FMDVpenyebab : Foot and mouth disease pada Cattle, swine, sheep & goat.Hepatitis A virus = ENTEROVIRUS 72Cardiovirus : Encephalomyocarditis virus (EMC)host : various species, including humans.

ECHO = Enteric Cytopathogenic Human Orphan

ARBOVIRUSArthropod-borne virusVektor : arthropoda, nyamuk, lalat, sengkenit (tick)Arbovirus menyebabkan 2 tipe penyakit :1 Encepholitis2 Fever / Demam (sering dengan perdarahan)

ARBOVIRUSTogaviridae : Alphavirus :Eastern equine encephalitis Venezuelan equine enchepalitisWestern equine encephalitisSindbisRoss riverChikungunya O Nyong NyongSemliki ForestReoviridae : OrbivirusRhabdoviridae :1. VSV (virus stomatitisvesiculosa)2. Kerncanyon virus3. Hart-Park virus

FLAVIVIRIDAEMOSQUITO-BORNE VIRUS :St. Louis EncephalitisJapanesse encephalitisKunjinMurray valley enchephalitisilheusWest NileDengueYellow Fever

Tick-borne group :RSSEKyasanur ForestPowassanOmsk H FLouping ill encephalitis

FILOVIRIDAEMarburg hemorragic feverEbola hemorragic fever

1.1.1. Sejarah Virologi :

Asal mula ditemukan VirusDefinisi VirusPenyakit-penyakit VirusPerkembangan mutakhir VirologiEmerging viral disease :

Virus EBOLAHIVHANTAVIRUS Pulmonary diseaseVirus Influenza A H5N1Virus NIPAHVirus SARS

2.1.1. KOMPOSISI KIMIAWI VIRUS :

ASAM NUKLEAT VIRUSDNARNA

PROTEIN VIRUSGLIKOPROTEINHEMAGLUTININENZYM

LIPID ENVELOP VIRUS

STRUKTUR VIRUS :

KESIMETRIAN PARTIKEL VIRUS- IKOSAHEDRAL- HELIKALUKURAN VIRUSVIRIONKAPSIDNUKLEOKAPSIDCORE/GENOMKAPSOMERPROTEIN SPIKEENVELOP / PEPLOS VIRUS DEFEKTIK

VIRUS TANPA PEPLOS ( GENOM+KAPSID) AKAN TAHAN JAUH LEBIH LAMA.

PADA SUASANA LUAR VIRUS BERENVELOP HANYA AKAN HIDUP BEBERAPA SAAT SAJA KARENA MEREKA AKAN SEGERA DI NON AKTIFKAN OLEH 2 FAKTOR :- TEMPERATUR: MESKIPUN TEMPERATUR BIASA- DESSICASI (PENGERINGAN)

VIRUS DENGAN STRUKTUR KOMPLEKS DAN TAK TERJELASKAN : POXVIRUS, UKURAN BESAR MENGANDUNG NUKLEOKAPSID KEMUNGKINAN HELICOIDAL.

VIRION : PARTIKEL VIRUS YANG LENGKAP ATAU BADAN ELEMENTER YANG MERUPAKAN SISTIM PARTIKEL VIRUS YANG INFEKTIF.

CAPSID / KAPSID : LAPISAN PROTEIN YANG MELIPUTI BAHAN GENETIK.

CAPSOMER : UNIT YANG MEMBENTUK CAPSID, UNIT MOLEKUL PROTEIN YANG MEMBENTUK CAPSOMER DISEBUT UNIT STRUKTURAL

GENOM (CORE) : INTI, BAHAN GENETIK, TERDIRI DARI ASAM NUKLEAT SEBAGAI DNA ATAU RNA.

NUKLEOKAPSID : KAPSID BERSAMA GENOM

ENVELOP / PEPLOS / PEMBUNGKUS : SELUBUNG YANG MELIPUTI KAPSID.

Herpes SimplexAdeno VirusAIDS HIV

Rhino VirusMumps Virus

Polio VirusVaccinia Virus

2.2.1. Perbedaan Virus dengan bakteri Rickettsia, Chlamydia dan Mycoplasma :

Pertumbuhan pada medium matiDNA & RNA Pembelahan linerRibosomKepekaan terhadap antibiotika & interferon

3.1.1. Klasifikasi Virus

FAMILISUBFAMILIGENUSMEMBERHOST VIRUSSIMPTOM PADA MANUSIA

Sifat sifat umum dari virusPoxviridaeIridoviridaeHerpesviridaeAdenoviridaePapovaviridaeParvoviridaeVIRUS ADN

ParamyxoviridaeOrthomyxoviridaeCoronaviridaeArenaviridaeRetroviridaeReoviridaePicornaviridaeRhabdoviridaeTogaviridaeOrbivirusBunyaviridaeArbovirusesVIRUS ARN

4.1.1. CONTOH-CONTOH :

VIRUS IKOSAHEDRAL TIDAK BERENVELOP

VIRUS IKOSAHEDRAL BERENVELOP

VIRUS HELIKAL TIDAK BERENVELOP

VIRUS HELIKAL BERENVELOP

VIRUS KOMPLEKS

5.1.1. Inaktivasi Virus :

Enzym : Nukleat,Proteinase,phospholipase

Reagen Kimia : Detergen, Protein Solven, Formaldehida, PH, Eter, Oksidans, Surfaktan

Physical Agent : - Pemanasan- Radiasi- Inaktifasi Fotodinamik

Stabilisasi Virus : - Pendinginan- PH- Garam- Liofilisasi

6.2. * TAHAPAN UMUM REPLIKASI VIRUS: Perlekatan, Penetrasi, Uncoating, Transkripsi,Translasi,Replikasi Genom, Assembling, Perlepasan. * Perkiraan lamanya periode Replikasi * Fase Eklips * Replikasi Virus DNA * Replikasi Virus RNAVirus RNA dengan MessengerVirus RNA tanpa MessengerVirus RNA dengan REVERSE TRANSKRIPTASE

7.2. PORT ENTRY VIRUS

PENYEBARAN VIRUS DAN TROPISME SELMEKANISME INFEKSI VIRUS PADA SALURAN NAFAS, PENCERNAAN, KULIT, SUSUNAN SARAF, KONGENITALHOST IMUN RESPONSINFEKSI AKUTINFEKSI PERSISTEN : KRONIK DAN LATENINFEKSI INAPPARENTEKSKRESI VIRUSPENCEGAHAN DAN PENGOBATAN INFEKSI VIRUSVAKSIN : KILLED, ATTENUATED, REKOMBINANT VAKSINOBAT ANTI VIRUSINTERFERON

PATOGENESIS INFEKSI VIRUS

- VIRUS PATOGEN- MASA INKUBASIINFEKSI VIRUS

* INFEKSI AKUT* INFEKSI INAPPARENT (SUB KLINIK)* INFEKSI PERSINTEN

HSVHBV, CMVJCV

MASA INKUBASI :

- PENDEK ( 1-5 HARI) Penyakit Lokal ( Infeksi Respiratorius) Kecuali : WART / KUTIL

- LAMA / PANJANG (10-20 HARI) Virus harus diseminasi dan mencapai target organ (VARICELLA, RUBELLA, MORBILI) Kecuali : ARBOVIRUS

PORT ENTRY VIRUS

TRACTUS, RESPIRATORIUS : INHALASI Rhinovirus, Adenovirus, Influenza, ParaInf, RSV, Corona Variola, Varicella, Morbili, Rubella, Parotitis Infeksi General

TRACTUS DIGESTIVUSLokal : Rotavirus, Norwalk.**Enterovirus : HAV Infeksi General

KULITLokal : HPV, VZV, molluscum contagiosum, HSVGeneral : Arbovirus (serangga); HBV, CMV (Trancutaneus) Rabies, B Virus (gigitan binatang)

CONJUNCTIVA :Adenovirus 8, HSV 1, Enterovirus 70.

TRACTUS GENITALISHSV 1 HSV 2, HPV, CMV, HBV, HIV

IFEKSI FOETUS * Transplacenta Rubella, CMV, HIV, VZV, Parvovirus B 19*Kelahiran : HSV 2, HBV

EXKRESI VIRUS

Melalui :

Tractus RespiratoriusSalivaKulitTractus Digestifus : TinjaUrineSpermaASI : CMV Retrovirus : HTLV 1, HIV

HOST IMMUNE RESPONSE

Protein Viral merupakan antigen untuk organisme, dibuat dalam sel-sel tetapi berdasarkan informasi genetika viral, antigen ini akan merangsang lympocyt B dan lympocyt T.

A.Lympocyt B yang disensitifkan merupakan penyebab dari imunitas humoral. Dia akan mengsekresikan antibodi antiprotein viral, antibodi tidak dapat menembus bagian dalam sel, tetapi mereka akan menfixasi dirinya pada virus extracellulair diantara dua sel. Mereka adalah Ig A pada sekresi respiratoir dan digestif, Ig M & Ig G dalam darah sirkular. Antibodi ini akan menambatkan dirinya pada permukaan virus, akan mengelilingi virus tsb dan lapisan antibodi ini akan menghambat permulaan replikasi virus, menghambat masuknya virus dalam sel, terutama menempatkan dirinya antara permukaan virus dengan reseptor cytoplasmik.

B. Lympocyt T adalah penyebab imunitas selular, berperan bila ada modifikasi pada permukaan sel ter infektir dan menghancurkan sel-sel yang berubah itu dengan kontak direct, tanpa sangkut paut antibodi. Perubahan ini adalah perubahan dari membran selular, terutama yang dilihat pada virus berenvelop tetapi juga dengan virus telanjang. Modifikasi timbul awal sekali, sebelum pembentukan virus baru. Demikianlah sel-sel terinfeksi akan dihancurkan oleh lympocyt T sebelum membentuk virus baru. Maka lympocyt T yang disensitifkan akan menggagalkan infeksi dengan destruksi sel-sel terinfeksi.Terjadinya reaksi imunitas membutuhkan beberapa hari dan ada 2 cara pertahanan yang lebih cepat : FEBRIS, INTERFERON

Febris adalah suatu cara pertahanan karena meningkatnya temperatur multiplikasi virus berkurang sebagian besar virus tidak bermultiplikasi pada 400 celcius.

Interferon adalah glycoprotein celular diproduksi oleh sel-sel yang terinfeksi, yang syntesenya biasanya tertekan. Penetrasi virus dalam sel menginduksi syntese substansi tersebut yang kemudian berdifusi pada daerah sekitarnya dan menginduksi keadaan antiviral pda sel-sel non infeksi terletak dikejauhan.Jadi Interferon dilepaskan dari sel tuan rumah yang terinfeksi virus, dan juga diproduksi oleh lympocyt. Interferon mempunyai banyak efek termasuk melindungi sel dari infeksi dengan mencegah pelepasan seluruh virus dari sel terinfeksi, atau absorbsi virus dari sel membran dan melambatkan atau menyetop metabolisme, pertumbuhan, divisi tumor sel.Aksi antiviral dari Inteferon adalah intracelular.

8.1.1.Pengambilan dan pengolahan bahan pemeriksaan

SterilitasVirus berenvelop harus langsung dikerjakan / diinokulasiCara penyimpanan spesimen bila tidak langsung dikerjakan

8.1.2. ISOLASI DAN IDENTIFIKASI VIRUSBiakan Sel : - Macam-macam biakan sel : * Biakan sel primer * Biakan sel diploid beraspek fibroblast* Biakan sel linear continu : Hela, Hep 2, KB- Efek Sitopatogenik- Badan Inklusi Telur ayam berembryo : - Membrana chorioallantois - Cavum allantois - Cavum amnioticPercobaan Binatang

SEROLOGI :Menemukan antibody spesifik :- ELISA - Fiksasi Komplemen (FC) - Hambatan Hemaglutinasi (HI)- Imunofluoressen (IF) - Netralisasi- ImunoblotMenemukan antigen virus dalam lesi dengan menggunakan antibody : ELISA,IF,PCR.Menemukan Genom Virus : PCR, Hibridasi.

PARTIKEL VIRUS KOMPLIT : dengan mikroskop electron atau imun mikroskop electron.

PEMERIKSAAN HISTOLOGIK JARINGAN