Axe Transversal
Interactions Durables (ID)
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Une forte implication du laboratoire
• 1/3 du potentiel de recherche• 1/4 des publications• 1/3 des programmes• Un ensemble de responsabilité au niveau national
(prog. AFSSA, INSERM, GDR, GDRE, comité de pilotage et animation de groupes de réflexion du REID…)
• Une offre d’enseignement importante et renouvelée (UE ID en M1, Epidémiologie en M2…)
Répartie équitablement dans les trois départements
Deux organismes
Un phénotype= une nouvelle unité fonctionnelle
Des systèmes où la complexité est l’objet d’étude
Epidémiologie(suivis de populations et modélisation)
Analyse fonctionnelle(quantification, post-génomique)
Dynamique co-évolutive(Expérimentation, modélisation,
Co-Phylogénie)
cellule individu
Infra-population
population
Transmission
génome
génome
Analyse génomique(séquences et bio-info)
Environnement
Hôte
symbioteCo-évolution
IdentificationStructure du génome- Transposition- Transferts et pertes de gènes
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
Interactions moléculaires et cellulaires- Régulation (immunité…)- Mécanismes et expresssion du phénotype étendu
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
Epidémiologie- Conséquences du phénotype étendu- Comportements- Dynamique des populations
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
- Gestion (relation médecine-écologie)- Transitions parasitisme-mutualisme
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
-Adaptation locale (interaction GxGxE/spécialisation)-Émergence (perturbations environnementales / stochasticité)
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
Environnement
Les systèmes en poupées russes
cellule individu
Infra-population
population
Transmission
génome
génome
Hôte
symbioteCo-évolution
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
cellule individu populationgénomeHôteCo-évolution
Les cycles complexes et les réservoirs
Objectif de l’axe IDRenforcer les interactions
• La démarche intégrative– Quels mécanismes sont en jeu ?
– Sous quelles pressions de sélection se mettent-ils en place et quelles contraintes imposent-ils ?
• La démarche comparative– Des modèles qui couvrent toute une gamme de type
d’interactions
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-population Transmission
génome
génome
Environnement
Régulation
Le compartiment intra-hôte
- Eléments transposables- HIV/FIV- Symbioses chez les insectes
Mécanismes et conséquences génomiques
Impact individuel et populationnel
Hôte
symbioteCo-évolution
cellule individu population
Infra-communauté Transmission
génome
génome
Environnement
Compétition/coopérationFavorisation
Le compartiment intra-hôte
Transferts de gènesMécanismes d’interactions
Impact individuel et populationnel
- Eléments transposables- HIV/FIV- Symbioses chez les insectes
- Listeria- Toxoplasmose- Pestivirose
Fonctionnement de l’axe ID
• Journées thématiques intra-labo– Dynamique intra-hôte, multi-infections et ID
– Comportement et ID
– Biologie Moléculaire, Génomique et post-génomique des ID
– …
• Actions ciblées « P(ID)2 » (Programmes Interactions Durables Inter-Départements)– Financements
– Co-directions
– …