Axe Transversal

Interactions Durables (ID)

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Une forte implication du laboratoire

• 1/3 du potentiel de recherche• 1/4 des publications• 1/3 des programmes• Un ensemble de responsabilité au niveau national

(prog. AFSSA, INSERM, GDR, GDRE, comité de pilotage et animation de groupes de réflexion du REID…)

• Une offre d’enseignement importante et renouvelée (UE ID en M1, Epidémiologie en M2…)

Répartie équitablement dans les trois départements

Deux organismes

Un phénotype= une nouvelle unité fonctionnelle

Des systèmes où la complexité est l’objet d’étude

Epidémiologie(suivis de populations et modélisation)

Analyse fonctionnelle(quantification, post-génomique)

Dynamique co-évolutive(Expérimentation, modélisation,

Co-Phylogénie)

cellule individu

Infra-population

population

Transmission

génome

génome

Analyse génomique(séquences et bio-info)

Environnement

Hôte

symbioteCo-évolution

IdentificationStructure du génome- Transposition- Transferts et pertes de gènes

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

Interactions moléculaires et cellulaires- Régulation (immunité…)- Mécanismes et expresssion du phénotype étendu

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

Epidémiologie- Conséquences du phénotype étendu- Comportements- Dynamique des populations

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

- Gestion (relation médecine-écologie)- Transitions parasitisme-mutualisme

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

-Adaptation locale (interaction GxGxE/spécialisation)-Émergence (perturbations environnementales / stochasticité)

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

Environnement

Les systèmes en poupées russes

cellule individu

Infra-population

population

Transmission

génome

génome

Hôte

symbioteCo-évolution

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

cellule individu populationgénomeHôteCo-évolution

Les cycles complexes et les réservoirs

Objectif de l’axe IDRenforcer les interactions

• La démarche intégrative– Quels mécanismes sont en jeu ?

– Sous quelles pressions de sélection se mettent-ils en place et quelles contraintes imposent-ils ?

• La démarche comparative– Des modèles qui couvrent toute une gamme de type

d’interactions

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-population Transmission

génome

génome

Environnement

Régulation

Le compartiment intra-hôte

- Eléments transposables- HIV/FIV- Symbioses chez les insectes

Mécanismes et conséquences génomiques

Impact individuel et populationnel

Hôte

symbioteCo-évolution

cellule individu population

Infra-communauté Transmission

génome

génome

Environnement

Compétition/coopérationFavorisation

Le compartiment intra-hôte

Transferts de gènesMécanismes d’interactions

Impact individuel et populationnel

- Eléments transposables- HIV/FIV- Symbioses chez les insectes

- Listeria- Toxoplasmose- Pestivirose

Fonctionnement de l’axe ID

• Journées thématiques intra-labo– Dynamique intra-hôte, multi-infections et ID

– Comportement et ID

– Biologie Moléculaire, Génomique et post-génomique des ID

– …

• Actions ciblées « P(ID)2 » (Programmes Interactions Durables Inter-Départements)– Financements

– Co-directions

– …