Information scientifique
BICH 4033
Séminaire avancé en biochimie
2009
12009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique
Recherche bibliographique
Trouver l'information permettant de comprendre et rédiger le travail
22009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique
STRATEGIE SUGGEREE
Prendre connaissance du sujeto
Manuel de courso
Article de vulgarisation (“review”)
• Scientific American, La Recherche, etc.oS
ites web
info de base pour comprendre le sujet
figures (introduction séminaire ou travail écrit)
mots clé (pour faire la recherche bibliographique)
32009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique
STRATEGIE SUGGEREE - suite
Approfondir le sujetoA
rticles de synthèse • Annual Rev. Biochem
• Trends Biochem Science
➔ info pour aller plus en profondeur
➔ comprendre articles originaux (primaires)
➔ mots clé
42009 Séminaire de biochimie - recherche bibliographique
STRATEGIE SUGGEREE - suite
Repérer les références originales (primaires)o
Notées lors des phases précédenteso
Recherche dans les banques de données• SciRUs, Pubmed
➔ info servant à rédiger le travail et présentation
➔ figures ( Googles - image)
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Références originales (primaires)
o définition
• Article de recherche ou une idée, une observation, un fait, etc. a été mentionné pour la première fois = référence originale
o importance
• Permettre au lecteur de retracer et évaluer l’info et son origine
• Souligner la contribution du/des auteur/s
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BANQUES DE DONNEES
o Sources
• générales
• journaux spécifiques
• éditeurs de journaux spécifiques
oBanques informatisées
• Documents physiques (écrit, CD, etc.)
• Web <= plus faciles à employer et à consulter
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BANQUES DE DONNEES INFORMATISEES - suite
o Recherche
• sujet (sans/avec combinaison)
• auteur
• institution
• journal
• restriction: années, langue
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Banques plus employées: SCIRUS
SCI R USo
http://www.scirus.com/o
combine 3 principaux: Pubmed + Science Direct (Elsevier) +
o
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SCIRUS: recherche simple
o choix des sources (journaux scient vs web vs sites scient. spécialisés)
o sujet, auteur,o expression (guillemets), AND, ORo triage par date ou pertinenceo "refine”o "save result"
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SCIRUS: recherche avancée
o sujet (sans/avec combinaison)
o auteur
o journal
o années
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SCIRUS: documents repérés
o Article scientifique
o Pubmed ou science direct
o pdf
o enregistrer image
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Recherche d’articles de synthèse
oSources• Annual Review of…
• Trends in…
• Certains journaux primaires (JBC, Cell,….)
oRepérage• Site de la revue elle-même (Ann. Rev.)
• Science Direct (Trends in…,
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Plagiat
oVoir le réglement de l’Université
o“copier-coller”
oSimple traduction intégrale
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Citation
oNécessité de citation
oCitation intégrale vs mention
oLimites
oconcensus scientifique
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Citation: aspect légal et moral
droits d'auteur et copyright © (C)
"fair use"
universités et institutions de "haut savoir" => recherche et enseignement
libertés non accessibles aux institutions commerciales ou privées (but lucratif ou non)
pas de distribution à l'extérieur ou pour des fins commerciales
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o Usage individuel• non commercial
• académique
opermissions
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Emploi d’une illustration
tableau,image, photo d'un article scientifique "non commercial" (électronique ou papier) => mention
tableau ou image d'une source sans copyright © => mention
tableau ou image d'une source publique avec mention de © => mention
tableau ou image d'une source privée avec © commercial => permission (avec/sans $$$)
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Citations et références
o les faits doivent être appuyés par la littérature: références primaires (publication dans des revues arbitrées)
oau fur et à mesure
oles citations doivent se rapporter à la section référence
opas de notes infrapaginales (“footnotes”)
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Citations et références
TypesoI
ntégrale: le texte est cité tel quel• Facile à identifier
taille et styles des caractères, marges
• Peu employée en sciences fondamentales
Vs
oparaphrase
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Citations et références
Citation intégrale – exemple
D’après Scaggs et al
“The association of TPR with some RNAs is promoted by its
interaction with the mRNA-binding protein Nab2P.”
Ce type de régulation s’est cependant révélé restreint à certains types cellulaires transformés en culture.
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Citation intégrale vs périphrase
Autre exempleLa principale objection de Garawick est qu’
" Il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionel dans l'analyse cette forme hautement complexe du comporement socio-affectif »
Garawick 2004
Ceci a toujours poussé les chercheurs vers un paradigme de type structural, d'autant plus...
=========Puisqu'il est difficile de distinguer le prépondérant du conditionnel
(Garawick, 2004), les chercheurs ont surtout employé un paradigme de type structural dans l'analyse du comportement socio-affectif…..
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Citation et références
Liste des référencesoL
iste de références non pas une bibliographieor
éférences originales (primaires)on
om de la revue: employer les abréviations correctesof
ormat consistantof
aire les citations dans le texte
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Format numérique
oavantage: simple à faire, peu de place
oinconvénient: il faut tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute
ocitation dams le texte
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Format numérique - exemple
Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (3) et possèdent deux sous-unités identiques (3,4).
Référence dans la liste :1) K. Zolber (1995)……….
2) U. Premolli, G. von Rastapovitch et T. Kwan (2004)…
3) P. Delbert et A. Schulz (2002)......
4) A Schulz et A Capp (2007)…
5) Z. Alberts, P. Minard, Z. Palmer et K. Zolber (1999)…
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Format alphabétique
oavantage: pas besoin de tout renuméroter si on veut rajouter une citation à la dernière minute
oinconvénient: un peu plus complexe à faire, plus de place• 1 auteur: citer auteur + année
• 2 auteurs: cite les deux auteurs avec " ... & ... " (+ année)
• 3 et plus: cite premier auteur + " et al."
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Format alphabétique - exemple
Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (Delbert et Schulz (1992) et possèdent deux sous-unités identiques (Delbert et Schulz, 2002; Schulz et Capp, 2000)
Liste des références:Z. Alberts, P. Minard et K. Zolber (1999)….
B. Bernard, D. Delbert et E. Emilio (2003)…
P. Delbert et A. Schulz (2002)......
A Schulz et A Capp (1990)…
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Format alpha numérique
oavantage: peu de place, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute,
oinconvénient: un peu plus complexe à faire, renuméroter partiellement si on veut rajouter une citation à la dernière minute
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Format alpha-numérique (exemple)
Citation: L'albumine de l'éléphant rose a une masse moléculaire de 130,000 (5) et possèdent deux sous-unités identiques (5,23)
Liste des références:4).....
5) P. Delbert et A. Schulz (1992)...
22)……..
23) A Schulz et A Capp (1990)…
24).......
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Citation et références dans ce cours
o Tous les auteurs, titre complet de l'article, pages inclusives
o Dans le format suivant:JA Sumner, KPS Turner, J Walker (2005) Effect of
trimethylammonium on puromycin-induced dissociation of rat brain ribosomes, J. Biochem. 78:7895-99.
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