Upload
bigdatabm
View
164
Download
7
Embed Size (px)
Citation preview
MirOB:
инструмент анализа генных сетей для
решения задач персонализированной
медицины
http://mirob.interactome.ru
Визуализция данных
Вначале была база данных
Надо бы это все визуализировать
Генная сеть TP53 на GraphViz
Много статичной и однородной
информации на одном экране.
Что делать?
Создали графическую и цветовую нотацию:
Опять инфохаос
Связали Ген-РНК-Белок-микроРНК в единые сущности
А что будет, если использовать открытые базы?
данных?ç
Еще улучшили графическую нотацию
Информация об узле Информация о ребре
Информация о генной сети
Все равно все очень сложно и непонятно.
Фильтры
Планируем добавить фильтры:
● Тканевая специфичность
● Cut-off по уровням экспрессии
● По сигнальным каскадам
● Другие
Колоректальный рак
Gene Ontology?
MirOB Ontology!
Cisplatin resistance gene network
Диаграмма уровней экспрессии микроРНК
Случайно уронили SNPPer
Лекартсва, действующие на мишени
MirOB -- инструмент анализа генных сетей
http://mirob.interactome.ru
Что дальше
● Динамическая визуализация генных сетей
● Градации по экспрессионным уровням на генной сети
● Анализ “сырых” данных NGS в облаке
● GWAS анализ
● База данных генных сетей для совместного обсуждения
● Распределенные вычисления
Полноценный workflow от загрузки любых данных, до
понятного отчета.
Александр Фокин, CEO MirOB
http://mirob.interactome.ru
+7 910 452 44 84