GENOMAS VIRALES Y PROYECTOS DE

SECUENCIAMIENTO DE GENOMAS

VIRALESPresentado por:

Santiago Andrés Pérez

Danilo Andrei Chacón

VIRUS

Los virus son parásitos intracelulares incapaces de replicarse por si mismos. Se reproducen mediante la infección de células huésped y la usurpación de maquinaria celular para producir mas particular virales.

COMPOSICIÓN DE LOS VIRUS

Dependiendo del virus el Acido nucleico puede ser DNA o RNA pero no ambos. Los ácidos nucleicos contienen bases raras o modificadas.

Las proteínas forman la cubierta protectora donde se encuentra el material genético, entre 2 a 30 polipéptidos y corresponde del 50 al 90% de la masa de un virus

PRIMER VIRUS DESCUBIERTO

Virus del mosaico del tabaco (TMV)

Dimitri Yosifovich Ivanoski (1892)

Martinus W. Beijerinck (1898)

Wendell Meredith Stanley (1935)

DEMOSTRACION MATERIAL GENETICO VIRUS

Alfred Hershey y Martha Chase demostraron que el material genético de los virus era el DNA y no las proteínas

ESTRUTURA DE UN BACTERIOFAGO

CLASIFICACION VIRUS SEGÚN MATERIAL GENETICO

Virus ADN: Virus ADN bicatenario

Virus ADN monocatenario

Virus ARN: Virus ARN bicatenario

Virus ARN monocatenario positivo

Virus ARN monocatenario negativo

Virus ARN monocatenario retrotranscrito

Virus ADN bicatenario retrotranscrito

CLASIFICACION VIRUS SEGÚN SI SU GENOMA TIENE SENTIDO PARA TRADUCCION

Sentido positivo: RETROVIRIDAE

CORONAVIRIDAE

FLAVIVIRIDAE

TOGAVIRIDAE

CALICIVIRIDAE

PICORNAVIRIDAE

Sentido negativo: RHABDOVIRIDAE

PARAMYXOVIRIDAE

ORTHOMYXOVIRIDAE

FILOVIRIDAE

ARENAVIRIDAE

BUNYAVIRIDAE

BACTERIOFAGO

Virus que infectan exclusivamente a bacterias

Fago λ

Fago T4

Fago T7

Fago R17

Fago M13

CICLO DE VIDA BACTERIOFAGO

Adsorción

Inyección del material genético viral

Replicación del material genético viral

Síntesis de las envolturas proteicas

Empaquetamiento del DNA dentro de la envoltura proteica y ensamblaje de la envoltura

Lisis y liberación de las partículas viral

EXPERIMENTO DE HERSHEY Y CHASE

CICLO LITICO Y CICLO LISOGENICO

SECUENCIAMIENTO

Conjunto de métodos y técnicas bioquímicas cuya finalidad es la determinación del orden de los nucleótidos (A, C, G y T) en un oligonucleótido de ADN.

SECUENCIAMIENTO SINTETICO DE SANGER

SECUENCIACION DE MAXAM-GILBERT

PIROSECUENCIACION

GENOMA

Totalidad de la información genética que posee un organismo en particular y que codifica para él.

COMO SE HACE UN SECUENCIAMIENTO

Materiales: El ADN molde o segmento de ADN que se desea secuenciar.

Un enzima que replique el ADN

Un Primer

Cuatro nucleótidos trifosfato (dATP, dCTP, dGTP y dTTP)

Nucleótidos didesoxi (ddATP, ddTTP, ddCTP y ddGTP)

Procedimiento: Realizarse en cuatro tubos diferentes, cuatro mezclas de reacción. Cada

mezcla de reacción contiene los cuatro nucleótidos trifosfato (dATP, dCTP, de dTTP y dGTP), ADN polimerasa I, un cebador marcado radiactivamente y un nucleótido didesoxi, por ejemplo ddATP, a una concentración baja.

En cada mezcla de reacción se producen una serie de moléculas de ADN de nueva síntesis de diferente longitud que terminan todas en el mismo nucleótido y marcadas todas radiactivamente por el extremo 5‘

Los fragmentos de ADN de nueva síntesis obtenidos en cada mezcla de reacción se separan por tamaños mediante electroforesis en geles verticales de acrilamida muy finos (0,5 mm de espesor) y de gran longitud (cerca de 50 cm) que permiten distinguir fragmentos de ADN que se diferencian en un solo nucleótido.Los productos de cada una de las cuatro mezclas de reacción se insertan en cuatro calles o carriles diferentes del gel.

Una vez terminada la electroforesis, el gel se pone en contacto con una película fotográfica de autorradiografía. La aparición de una banda en una posición concreta de la autorradiografía en una de las cuatro calles nos indica que en ese punto de la secuencia del ADN de nueva síntesis (complementario al ADN molde) está la base correspondiente al nucleótido didesoxi utilizado en la mezcla de reacción correspondiente.

Procedimiento: Teniendo en cuenta que el ADN de nueva síntesis crece en la

dirección 5‘3', si comenzamos a leer el gel por los fragmentos de menor tamaño (extremo 5') y avanzamos aumentando el tamaño de los fragmentos (hacia 3'), obtendremos la secuencia del ADN de nueva síntesis en la dirección 5‘3'.

PRIMER GENOMA VIRAL SECUENCIADO

En 1977 el genoma de ADN del bacteriófago φX174 fue completamente secuenciado por Frederick Sanger utilizando el método de secuenciación de ADN conocido como Método de Sanger

LOS VIRUS SON SERES VIVOS?

No están considerados seres vivos, para que sea un ser vivo tienen que cumplir las tres funciones vitales:

Nutrición

Relación

Reproducción

Los virus no poseen un metabolismo

No son capaces de reproducirse por si solos, necesitan parasitar una celula

REPRODUCCION

Proceso biológico que permite la creación de nuevos organismos, siendo una característica común de todas las formas de vida conocidas

TRANSDUCCION

Proceso mediante el cual el ADN es transferido desde una bacteria a otra mediante la acción de un virus

CARACTERISTICAS BACTERIOFAGO φX174

Tiene una muy pequeña cantidad de ADN

Se identificaron 11 genes en 5.386 bases

Conformado por un solo cromosoma, en una topología circular

El contenido genómico (GC) es 44 % y el 95 % de los nucleótidos corresponde a genes codificantes

ENFERMEDADES PRODUCIDAS POR VIRUS

Gripe

Varicela herpes zóster

Hepatitis B VHB

Poliomielitis poliovirus

Mialgia epidémica Coxsackie

Dengue DEN-1, DEN-2, DEN-3 ó DEN-4

Fiebre amarilla Flavivirus amaril

Herpes genital herpesvirus hominus

Mononucleosis infecciosa Epstein Barr

Rabia Rhabdovirus

Rubéola Rubivirus Togaviridae

Viruela Variola virus

Sarampión paramixovirus

Sida VIH

GENOMA VIRUS HEPATITIS B

GENOMA RETROVIRUS

BIBLIOGRAFIA

Introducción a la Biologia Celular. Editorial Panamericana.2006.

B. Alberts, D. Bray, K.Hopkin ,A. Johnson , J.Lewis M.Raff, K. Roberts, and P.Walker

La Célula. Editorial Marbán. 2010.

Geoffrey M. Cooper

http://es.wikipedia.org/wiki/Virus