66
第第第 第第第第第 DNA 的的的的的

第十章 基因信息的传递

  • Upload
    leona

  • View
    99

  • Download
    13

Embed Size (px)

DESCRIPTION

第十章 基因信息的传递. DNA 的生物合成. 基因 : 生物活性产物编码的 DNA 功能片段. 复制 : 以 DNA 作为 模板 指导的 DNA 合成,即将 DNA 携带的信息传至子代 DNA DNA 合成也可以 RNA 为 模板 指导合成,通常将其称作反转录作用 , 见于 RNA 病毒. 模板 作用: 大量生 产同一产品. 模 板. 中心法则 Central Dogma. DNA. 复制. 逆 转录. 转录. RNA. 翻译. 蛋白质(病毒). 少数病毒复制. 翻译. 蛋白质. 父链. 子链. 第一节 半保留复制. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: 第十章   基因信息的传递

第十章 基因信息的传递

DNA的生物合成

Page 2: 第十章   基因信息的传递

复制:以 DNA作为模板指导的 DNA合

成,即将 DNA携带的信息传至子代 DNA

DNA合成也可以 RNA为模板指导合成,通常将其

称作反转录作用 ,见于 RNA病毒

基因:生物活性产物编码的 DNA功能片段

Page 3: 第十章   基因信息的传递

模 板

模板作用:大量生产同一产品

Page 4: 第十章   基因信息的传递

中心法则 Central Dogma

RNA

DNA

蛋白质

转录

翻译

复制

逆转录

少数病毒复制 翻译 蛋白质(病毒)

Page 5: 第十章   基因信息的传递

第一节 半保留复制

定义:两个子代分子中各有一条链来自亲代,各有另一条新合成的链,这

种复制方式叫半保留复制

父链

子链

Page 6: 第十章   基因信息的传递

1958 – Matthew Meselson和Franklin Stahl

美国科学家马修 .梅塞尔(Matthew Keelson)

福兰克林 .斯塔尔 (Franklin Stahl)

Page 7: 第十章   基因信息的传递

(蓝 : 15N)

(棕 : 14N)

DNA半保留复制的证据

培养于普通培养液

继续培养于普通培养液

含 15N-DNA的细菌 普通 DNA

重 DNA

第一代 中等密度 DNA

第二代普通 DNA中等密度 DNA

意义?

新合成 的链

Page 8: 第十章   基因信息的传递

重 DNA

普通 DNA

中等密度 DNA

全保留

混 合

一代 二代

一代 二代

Page 9: 第十章   基因信息的传递

复制的起始点与方向

亲代 DNA开链,复制起始点呈叉型移动

复制叉亲代 DNA 分子

3’

5’

3’

5’复制起始点( ori): DNA复制要从 DNA分子的特定部位开始,此部位称复制起始点

    原核:一个起始点,约 245bp,特殊的重复序 列

    真核:多个起始点

ori

Page 10: 第十章   基因信息的传递

E.coli复制起始点 oriC跨度为245bp,有 3组串联重复序列和 2对反向重复序列

Page 11: 第十章   基因信息的传递

GATTNTTTATTT…GATCTNTTNTATT…GATCTCTTATTAG

串联重复序列

反向重复序列

…TTTGGATAA…..TTATCCACA AATAGGT--T

TGTGGATTA……TTATACACA… A--TA--GTGT

回文结构

AGCTTCGA

Page 12: 第十章   基因信息的传递

复制方向

• DNA合成的方向单向、双向?

1个起始点

Page 13: 第十章   基因信息的传递

双向复制

oriori

复制子 ori ori

真核生物两个相邻复制起始点之间的 DNA 片段

以起始点为中心,向两个方

向进行复制

Page 14: 第十章   基因信息的传递

多个起始点

Page 15: 第十章   基因信息的传递

第二节 DNA复制的酶学

1. 模板:解开成单链的 DNA母链

3. DNA聚合酶, DNA-pol

2. 底物 dNTP : dATP, dGTP, dCTP, dTTP

4. 引物( primer): RNA引物

5. 其他酶和蛋白质因子

Page 16: 第十章   基因信息的传递

一、复制的化学反应

生成磷酸二酯键N1OH3`5`+dN2TP N1N2-OH

3`5`+PPi

DNA pol

3’——TAGAAGACCTATTGGCC——5’5’——ATCTTCTGGATAACCGG——3’

Page 17: 第十章   基因信息的传递

二、 解链相关酶类

1. 解旋酶 (helicase)

2. 拓扑异构酶( topoisomerase I、 II) 3. 单链 DNA结合蛋白(SSB)

Page 18: 第十章   基因信息的传递

2.1 解旋酶 (helicase)

解螺旋酶

作用:断裂互补碱基间的氢键,使 DNA成单链

dnaA 、 B 、 C… DnaA 、 B 、 C…

ATP

Page 19: 第十章   基因信息的传递

2.2 拓扑异构酶( Topo)

拓扑 (topology)与拓扑异构DNA正超螺旋与负超螺旋

负超螺旋正超螺旋 DNA双螺旋

拓扑异构酶

超螺旋

螺旋

Page 20: 第十章   基因信息的传递

Topo酶:切割 DNA链,使其松弛后再连接

Helicase

TopoⅡ( DNA Gyrase)

Page 21: 第十章   基因信息的传递

Helicase

Supercoiled DNA

TOPOⅡ

Page 22: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 23: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 24: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 25: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 26: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 27: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 28: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 29: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

ATP

Page 30: 第十章   基因信息的传递

TOPOⅡ

Page 31: 第十章   基因信息的传递

2.3 单链 DNA结合蛋白( SSB)

作用:防止单链 DNA重新形成双链,防止单链 DNA被核酸酶水解

SSBSSB

Page 32: 第十章   基因信息的传递

三、 DNA聚合酶( DNA-pol)

即依赖于 DNA的 DNA聚合酶( DDDP)

真核生物有多种:

DNA-pol 、、、、…

原核生物有 3种:

DNA-polⅠ 、 Ⅱ 、 Ⅲ

Page 33: 第十章   基因信息的传递

DNA聚合酶功能

•5´3´聚合作用

•5´3´外切酶

•3´5´外切酶活性

Page 34: 第十章   基因信息的传递

5' ucgagcuag-OH 3 '

5 ' ucgagcuag

DNA poldNTP

5´3´聚合作用

3 ' agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 '

3 ' agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 '

catcggatcgcatcgtcacgtgctag 3 '

Page 35: 第十章   基因信息的传递

5’ 3’

内切酶

外切酶

外切酶与内切酶作用图解

5´3´ 外切酶活性的功能

切除引物,切除突变片段

5’ 3’

Page 36: 第十章   基因信息的传递

3’5’ 外切酶活性

校读

错配碱基

Page 37: 第十章   基因信息的传递

大肠杆菌三种 DNA聚合酶比较DNA

聚合酶Ⅱ

分子量

每个细胞的分子统计数

5´-3 ´聚合酶作用

3´-5 ´核酸外切酶作用

5´-3 ´核酸外切酶作用

转化率主要功能

活性( nt/min )

DNA聚合酶Ⅰ

DNA聚合酶Ⅲ(复合物)

109, 000

400

+

+

+

1

校读 ,修复1000

120, 000

40

+

+

-

0 .05

400, 000

10-20

+

+

+

50

复制100000

特 性

不清填补缺口

50

Page 38: 第十章   基因信息的传递

DNA聚合酶Ⅲ全酶

核心酶

Pol III

Pol III

延长因子

DNA聚合酶Ⅲ二聚体

Page 39: 第十章   基因信息的传递

小片段 大片段( Klenow fragment)5 ' →3 ' 聚合功能3 '→5 '外切酶活性 5'→3'外切酶活性

DNA pol I

Page 40: 第十章   基因信息的传递

四、引物酶 (Primase)和引发体

催化 RNA引物合成的酶叫引物酶,它是一种特殊的 RNA 聚合酶

DNA合成需在 RNA引物的基础上进行

RNA引物

5´ 3´

5´3´

Page 41: 第十章   基因信息的传递

DnaA

引发体( primosome):包括解螺旋 酶 、 DnaC、引物酶及 DNA复制的起始 区域

5´ 3´

3´ 5´引物酶

DnaC

引发体

解螺旋酶

Page 42: 第十章   基因信息的传递

五、 DNA连接酶 (DNA ligase)

功能: 催化 DNA双链的 3’羟基和相邻的5’磷酸基团形成磷酸二酯键,从而把两段相邻的 DNA链连成完整的链

Page 43: 第十章   基因信息的传递

小 结主要成员 主要作用

DnaA 识别复制起始位点

解螺旋酶 解开 DNA双链SSB 维持已解开单链 DNA的稳定

引物酶 合成 RNA引物

TOPO 使打结、缠绕、正超螺旋的 DNA松驰DNA-pol DNAⅢ 复制

DNA-pol Ⅰ 水解引物、填补空隙、修复作用

DNA 连接酶 催化双链 DNA中单链缺口的连接

Page 44: 第十章   基因信息的传递

第三节 DNA生物合成过程

1.复制的起始

2.链的延长

3.复制的终止

Page 45: 第十章   基因信息的传递

DNA合成期

哺乳动物的细胞周期

Page 46: 第十章   基因信息的传递

一 复制的起始(一 ) DNA解成单链

由特定蛋白质识别复制起始位点( ori),在解螺旋酶、 TOPO酶及单链DNA结合蛋白的共同作用下, DNA解链,解旋,形成复制叉

倒 Y

Page 47: 第十章   基因信息的传递

(二 )引发体的生成

解旋酶解开双链后引物酶进入形成引发体

5´ 3´

3´ 5´引物酶

DnaC

引发体

解旋酶

Page 48: 第十章   基因信息的传递

(三) RNA引物的合成

5´ RNA引物

5´ 3´

5´3´

Page 49: 第十章   基因信息的传递

参与复制起始的蛋白因子

名称 功能

DnaA 蛋白 辨认起始点

解螺旋酶( DnaB, Rep ) 解开 DNA双链DnaC 协助解螺旋酶

引物酶( DnaG ) 催化 RNA引物生成SSB 稳定解开的单链

拓扑异构酶 理顺 DNA链

OriC E.coli复制起始点

Page 50: 第十章   基因信息的传递

引物合成后,由 DNA polⅢ(在真核细胞为 DNA聚合酶和 )催化,按碱基配对原则,将 dNTP逐一添加到引物 3’ 末端,形成磷酸二酯键,使新合成的链不断延 长

二 复制的延长

3’——AAGACCTATT——5’5’——TTCTGGATAA——3’

DNA Pol I, II and IIIDNA Pol I, II and III

5’- DNA - OH5’- DNA - OH5’- DNA - OH5’- DNA - OH 5’- DNA - O5’- DNA - O - - PP - -N - OHN - OH

PPPPPPPP

++

++ ddNNTTPsPs

Page 51: 第十章   基因信息的传递

前导链前导链

后随链

3’

5’3’

5’

延 长5’

5’5’3’

3’

5’3’3’

5’

SSB

DNA Polymera

se

冈崎片断

RNA引物

引物酶

5’3’

5’

TOPOⅡ解旋酶

Page 52: 第十章   基因信息的传递

1.半不连续性: DNA复制过程中,一条链是连续复制,另一条链是不连续复制的现象

几个重要概念

4. 冈崎片段( Okazaki fragment):

不连续复制的片段

3. 随从链 : 链的延长方向 (5’3’)与解链方向相反,为不连续复制

2.领头链 :链的延长方向 (5’ 3’)与解链方向 相同 , 为连续复制

Page 53: 第十章   基因信息的传递

滚环复制

某些病毒、质粒、线粒体 DNA的特

殊复制形式

Page 54: 第十章   基因信息的传递

三 复制的终止

1. 原核生物复制终止

2.真核生物复制终止

Page 55: 第十章   基因信息的传递

1、原核生物 DNA为环状,双向复制的汇 合点就是复制终止点

原核生物复制终止

2. 领头链上的 RNA引物被 RNA酶水解后,由 DNA pol I 催化,由新合成链提供 -OH 补齐

终点

起点 RNA酶DNA pol I

连接酶

Page 56: 第十章   基因信息的传递

3、冈崎片段引物的消除和连接

RNA引物RNA酶

DNA pol I

DNA连接酶

Page 57: 第十章   基因信息的传递

端粒和端粒酶

端粒酶[组成 ]: RNA + 蛋白质[作用 ]:可作为反转录酶,以含端粒 DNA重复序列拷贝的 RNA作模板,合成端粒 DNA片段 [生物学意义 ]:     1.合成端粒,保证染色体复制的完整性     2.保护 DNA末段降解及相互融合

端粒 :真核线性染色体末端,含重复序列TTTGGG, 在端粒酶的作用下形成

Page 58: 第十章   基因信息的传递

第四节 DNA损伤(突变)与修复

DNA的损伤(突变): DNA分子一级结构的

改变称为 DNA损伤或突变

修复的意义 : DNA复制中的错误若保留下

来,在体细胞将影响功能;在性细胞将影响

后代,体内的修复系统保证了 DNA复制的高

度精确性

Page 59: 第十章   基因信息的传递

突变的类型

1. 点突变

2. 缺失、插入和框移突变

3. DNA重排

Page 60: 第十章   基因信息的传递

DNA损伤的修复

光复活酶

(可见光) T-T

1. 光修复

TT

Page 61: 第十章   基因信息的传递

2.切除修复 参与因子 : UvrA、 UvrB、UvrC

Page 62: 第十章   基因信息的传递

3.重组修复

RecA

DNA pol

切除修复

Page 63: 第十章   基因信息的传递

4. SOS修复

DNA分子多处受到较大范围的损伤,应急

诱导产生的修复作用称 SOS 修复

细胞能继续生存,但引起 DNA较长期的

广泛的突变

后果:

Page 64: 第十章   基因信息的传递

第五节 逆转录现象和逆转录酶

逆转录: RNA指导下的 DNA合成作用,以

RNA为模板在逆转录酶催化下,由 dNTP聚

合成 DNA的作用,新生 DNA分子存有 RNA

基因组的信息

逆转录酶 :又称为反转录酶,为依赖

RNA的 DNA聚合酶

Page 65: 第十章   基因信息的传递

逆转录酶是多功能酶,有三种酶活性:

1. 逆转录活性:即以 RNA为模板合成 DNA

2. RNase活性:水解 RNA:DNA中的 RNA

3. DNA pol活性:以 DNA为模板合成 DNA

特点:无外切酶活性,转录错误率高 2×10-

4

Page 66: 第十章   基因信息的传递

5’ 3’

5’ 3’

TTTT

poly A tail

3’ 5’

CCC3’5’ 3’GGG

5’

整合入细胞基因组

逆转录活性

RNase活性

RNA:DNA杂合链

RNA模板

单链 DNA

双链 DNA

DNA pol活性