生物基因组序列比对分析,分子进化 兔肝 DNA 的提取与二苯胺显色法测定 DNA 含量 目的基因 SNP 位点的鉴定及其意义

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综合性设计性实验 -1. 生物基因组序列比对分析,分子进化 兔肝 DNA 的提取与二苯胺显色法测定 DNA 含量 目的基因 SNP 位点的鉴定及其意义. 此实验共包括如下三个部分 第一部分:生物基因组序列比对分析,分子进化 第二部分:兔肝 DNA 的提取和测定 第三部分:目的基因 SNP 位点的鉴定及其意义. 第一部分:生物基因组序列比对分析、分子进化. - PowerPoint PPT Presentation

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  • DNADNASNP-1

  • DNASNP

  • ,,, (Comparative Genomics)GC%

  • cDNAsyntenycollinearity

  • tree of life

  • DNA

  • 1

  • 2Clustal X

  • 3MEGAPHYLIPPAUPhttp://www.megasoftware.net/

  • 4

  • DNA UV-120

    DNA

  • 0.15M0.15MDNA

  • DNA 1. 2. DNADNADNADNA

  • 15% SDSSDSSDSCHCl3/IAA--DNACHCl3/IAA

  • 10min95-10s1

  • DNADNA---r595nmml20400gDNA

  • 8100595nmDNAg/ml.DNAUB10min, 595nmBDNA

  • 220-320nm260nmA260/A280 A260/A280 1.8 DNA > 1.8 RNA < 1.8

  • 3601000nm150400nm UV-120

  • UV-120UVHeatON10min0-100%T0% TABS 0-20% A

  • 0.01N NaOH 260nm280nmA260/A280DNA

  • SNPSNP(single nucleotide polymophism) 1 % SNP SNP1000

  • SNPSNP SNP(coding SNP, cSNP)SNPSNP(regulatory SNP, rSNP)cSNPcSNP (synonymous cSNP)cSNP (non-synonymous cSNP)cSNPPRKCHcSNP(1425G/A)GA cSNP1(MDR1)3435 SNP(3435C/T)MDR1 mRNA mRNA SNP(GCKR)16 SNP(rs780094, T/C)CT2rSNPIFN-rSNP(-764G/C)C G IFN-g 2~3

  • SNP

  • NCBISNPFascinEzrinNGAL receptorSNPSNPSNPSNPSNPSNPSNP

    P1