الفيروس بروتينات الفيروس وظائف بروتينات Functions of Viral Functions of ViralوظائفProteinsProteins

- I الفيروسي الجينوم Protection of Viral حمايةgenome

الخارجي - الغطاء تجمع

النووي - الحامض لتعليب تميزمتخصص

غالف - لتكوين للعائل الخلوي الغشاء مع تفاعلفيروسي

- II الفيروسي الجنيوم Delivery of the نقلgenome

بالمستقبالت - Receptors األرتباط

التقشر - تحفز ِإ=شاراتخاصة أرسال

مع اإل - الخلوي الندماج للعائل غشاء

الخلية - داخل مركبات مع التفاعل

- III العائل مع أخرى Other interactionsتفاعالتwith host

العائل - الجسم مناعة مع التفاعلمواقع - ِإلى لنقل العائل الخلية مركبات مع التفاعل

للتجمع داخليةحيوية : - Hemagglutinationانزيمات

HA RBC

التكاثر - في مهمه انزيمات RNA - dependent - DNA - polymerase (RT) Retrovirus

RNA - dependent - RNA Polymerase RNA virusDNA - dependent - RNA Polymerase DNA virus

Transcription النسخ

تحلل

Hemagglutination

الفيروس تكاثر دورة Steps in Replication خطوات cycle of virus

Attachment األتصال 1 .مستقبالت خالل I - Through receptors من

CD4 HIV

Ig Poliovirus

Heparan sulfate HSV, Adenovirus

العشوائي II - Random collision التصادم

T- cell

Virus attachment

External environment

Cytoplasm

Lipid bilayer

Transporter (membrane

channel)

Integral membrane

protein

Signalling receptor

Surface glycoprotein

الدخول 2 .Entry

-I الغشائي Membrane Fusion االندماجParamyxovirus + HIV

Surface Fusion

Receptor-mediated endocytosis

Fusion in endosome

Lysis of endosome

cytoplasm

plasma membrane

coated pit coated vesicle

acidification

Travels to nuclear membrane

Direct uncoating (e.g. Paramyxoviridae)

Partial uncoating; nuclear import (e.g., HIV-1)

e.g., Influenzavirus

Uncoating

e.g., Adenovirus

الدخول 2 .Entry

- II مستقبالت خالل من -Receptor التحوصل

mediated Endocytosis

ندوسوم األ في Fusion in االندماجEndosome

Influenza virus

Surface Fusion

Receptor-mediated endocytosis

Fusion in endosome

Lysis of endosome

cytoplasm

plasma membrane

coated pit coated vesicle

acidification

Travels to nuclear membrane

Direct uncoating (e.g. Paramyxoviridae)

Partial uncoating; nuclear import (e.g., HIV-1)

e.g., Influenzavirus

Uncoating

e.g., Adenovirus

j

Surface Fusion

Receptor-mediated endocytosis

Fusion in endosome

Lysis of endosome

cytoplasm

plasma membrane

coated pit coated vesicle

acidification

Travels to nuclear membrane

Direct uncoating (e.g. Paramyxoviridae)

Partial uncoating; nuclear import (e.g., HIV-1)

e.g., Influenzavirus

Uncoating

e.g., Adenovirus

الدخول 2 .Entry

- II مستقبالت خالل من -Receptor التحوصل

mediated Endocytosis

االندوسوم Lysis of Endosome تحللAdenovirus

Uncoating التـقـشـر 3 .

- Direct or Partial uncoatingجزئي أو مباشر

Paramyxovirus + HIV

- Endosome …. Conformational changesشكلية تغيرات

Influenza + Adenovirus

الفيروس 4 . بروتينات وِإنتاج التكاثرReplication and viral protein production

Class I: Double - stranded DNA

النواه - في Adenovirus + Herpes التكاثرvirus

السيتوبالزم - في poxvirus التكاثر

DNA REPLICATION

DNA

5’

3’

NICKED

DNA

5’

3’

DN

A

5’

3’

DN

A

5’

3’ 5’ 3’

SIMPLIFIED SCHEME

Class II : Single - stranded DNA

النواة - double - stranded intermediate (Template)

Parvovirus

Positive (+) RNA virus replicative cycle

+ AAA

Viral proteins off+ strand

-

+AAA Viral

particles

nucleus

Class III: Double - stranded RNA

Segmented مجزأة -

Reovirus السيتوبالزم -

DOUBLE-STRANDED RNA GENOMES

AAA(+ve) sense mRNA

Double-stranded genomic RNAIf used, RNA modifying enzymes are packaged in virion.

RNA polymerase must be packaged in virion.

Translation Cleavage

ترجمهانقسام

Class IV: Single – stranded (+) sense RNA

Cytoplasm السيتوبالزم-

I - Polycistronic mRNA

mRNA polyproteins proteins

Picornavirus

PLUS (POSITIVE) SENSE RNA GENOMES

AAA(+ve) sense mRNA

Class IV: Single – stranded (+) sense RNA

Cytoplasm السيتوبالزم-

II - complex transcription

1 – (I) RNA Pol. Enzyme + (II) CapsidTogavirus

2 - Subgenomic RNA Coronavirus

I + II genomic RNA

Class V: Single - stranded (-) sense RNA

السيتوبالزم - I - Non -segmented genome

Paramyxovirus

II- Segmented genome

النواه - Orthomyxovirus

MINUS (NEGATIVE) SENSE RNA GENOMES

AAA(+ve) sense mRNA

(-ve) sense genomic RNA

MINUS (NEGATIVE) SENSE RNA GENOMES

RNA polymerase must bepackaged in virion.

AAA(+ve) sense mRNA

(-ve) sense genomic RNAIf used, RNA modifying enzymes are packaged in virion.

Negative-strand virus replication

(-) Strand

Protein synthesisfrom + strand RNA

Viral genome (-)coded off + strand RNA

(-)

(+) (+)(+)

(+)

5’ 3’

5’ 3’

3’ 5’

Infectious virusparticles

Class VI: single - stranded (+) sense RNA with DNA intermediate

RNA dDNA RNA

Retrovirus

C

RT Host

N

RETROVIRUSES

DSDNA

+VE RNA

DSDNA

Reverse transcriptase mustbe packaged in virion.

Class VII: Double - stranded DNA with RNA intermediate

dDNA RNA dDNA

Hepadnavirus (HBV)

N C

RT

One - Step Growth Cycle:

الكسوف Eclipse period فترة) 11H (Post-infection (PI)

Genome Free inside cellNo infectious Particles

التكاثر Synthetic phase طور)12 H (P.I.

Infections particles

Typical Growth Curve:

10

8

6

4

2

PFU/ml

Hours post adsorption

4 12 20 28 36 44 50

Total or intracellular +extracellular

Extracellular

Eclipseperiod

Latent period

One - Step Growth Cycle:

الكسوف • Eclipse فترةperiod

التكاثر • Synthetic phase طور

المتأخر • Latent period الطور(18 H) P.I.

No extracellular virus

والتحرر 5 . Assembly + Release التجمع

التركيبية - النووية - البروتينات األحماضالفيروسية - األنزيمات

التكاثر - موقع على يعتمد التجمع موقع

Picornavirus , Poxvirus , Reovirus…etcCytoplasm

Adenovirus , Polyomavirus …etcNucleus

Virus Assembly

Free infectious virion

cytoplasm

viral matrix protein

viral glyco-

proteins

viral nucleo- capsid

والتحرر 5 . + Assembly التجمعRelease

Maturation النضج-

- Infectious

- Conformational changes

Fo F1 + F2 paramyxovirus

Fusion protein

CleavageProteases

التحرر Release

- I التحلل LysisNon - envelopedLytic viruses

- II التبرعم BuddingEnveloped

I + II death of cell (CPE)