Решения TaqMan® для исследований экспрессии генов Гарантированное получение быстрых и надежных результатов

2

Лидер в области исследований экспресии генов

Life Technologies™ - лидер в области исследований экспрессии генов, обеспечивающий подготовку образцов на мировом уровне по технологиям Ambion® и проведение ПЦР в реальном времени с реактивами TaqMan® и SYBR® Green с использованием лучших в отрасли приборов и программного обеспечения.

Технология TaqMan® - золотой стандарт в исследовании экспрессии генов по производительности, качеству и содержанию. Разработанные на основе сочетания многолетнего опыта в экспертном биоинформатическом дизайне праймеров и зондов и в проведении тщательного тестирования в рамках различных методик и интегрированных платформ, наборы TaqMan® обеспечивают получение в высшей степени надежных и точных результатов для исследований с использванием ПЦР в реальном времени.

Мы предлагаем более миллиона специально разработанных оптимизированных наборов для постоянно растущего списка модельных организмов, представленных широким спектром форматов, среди которых Вы сможете подобрать подходящий вариант для Вашего исследования. В сочетании с прецизионной системой производственного контроля качества, наборы обеспечат быстрое получение точных и надежных результатов анализа экспрессии генов.

3

Содержание

4 Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов Надежная 5’-нуклеазная активность реактивов для ПЦР в реальном времени

6 Широчайший выбор готовых наборов Сконцентрируйтесь на результатах, а не на подборе и оптимизации наборов для исследования

8 Подтвержденное функциональное качество Надежные реактивы, которые позволят Вам быть уверенным в своих результатах

12 Гибкость форматов Большой выбор форматов для разных исследований

16 Дополнительные реактивы Все, что Вам нужно для получения надежных результатов

18 Поддержка Вашего исследования на каждом шагу Надежность на каждом этапе - от производства отдельных компонентов до контрольных экспериментов

Наборы TaqMan® для анализа экспрессии геновНадежная 5’-нуклеазная активность реактивов для ПЦР в реальном времениПолучение результатов, которым Вы сможете доверять. Оригинальные наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов упоминаются в десятках тысяч публикаций и считаются золотым стандартом для количественного определения уровня экспрессии генов учеными по всему миру.

Действие наборов TaqMan® для анализа экспрессии генов основано на проявлении 5’ нуклеазной активности полимеразы и каждый набор содержит пул праймеров и зондов для исследования нужного Вам объекта. Вот как они работают (Рис. 1):

1. В начале ПЦР температуру увеличивают для того, чтобы двойная спираль ДНК денатурировала. В этот момент сигнал от флуоресцентного красителя на 5´ конце TaqMan® зонда гасится нефлуоресцентным MGB гасителем, расположенным на 3´ конце пробы.

2. На следующем этапе температура снижается, позволяя праймерам и зондам отжигаться на целевой последовательности.

3. Taq полимераза синтезирует комплементарную ДНК на денатурировавшей цепи, используя немеченые праймеры. Когда полимераза достигает TaqMan® зонда, она расщепляет зонд за счет своей 5´-экзонуклеазной активности, отделяя краситель от гасителя.

С каждым циклом ПЦР высвобождается все больше молекул красителя, что ведет к возрастанию интенсивности флуоресценции, пропорционально количеству молекул синтезируемого ампликона.

Рис. 1. Этапы работы набора TaqMan® для анализа экспрессии генов.

4

5

Самый большой выбор готовых пробСконцентрируйтесь на результатах, а не на подборе и оптимизации наборов для исследования

Готовые Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов (по состоянию на октябрь 2011)

Вид Количество наборов

Покрытие гена (%)*

Человек (H. sapiens) 212,207 99.7

Мышь (M. musculus) 185,566 99.6

Крыса (R. norvegicus) 151,955 86.7

Рис (O. sativa) 99,822 95.6

Арабидопсис (A. thaliana) 97,879 94.4

Нематода (C. elegans) 92,687 96.2

Корова (B. taurus) 67,104 82.5

Макака-резус (M. mulatta) 66,480 53.9

Данио (D. rerio) 63,712 80.9

Лягушка (X. tropicalis) 56,764 88.8

Собака (C. familiaris) 55,202 64.3

Курица (G. gallus) 48,432 93.0

Дрозофила (D. melanogaster) 41,607 95.3

Сахарная кукуруза (Z. mays) 38,446 59.6

Свинья (S. scrofa) 9,868 90.5

Делящиеся дрожжи (S. pombe) 6,538 94.6

Кролик (O. cuniculus) 5,924 81.0

Пекарские дрожжи (S. cerevisiae) 5,525 93.8

Соя (G. max) 3,456 41.1**

Лошадь (E. caballus) 2,970 76.3

Морская свинка (C. porcellus) 2,037 72.4%

Виноград (V. vinifera) 965 60.1%**

Пшеница (T. aestivum) 760 47.1%**

Суммарно 1,315,906 80.32%, 23 вида

*Процентное покрытие соответствует генам из базы данных RefSeq.**Эти виды не представлены в базе данных RefSeq.

Используя готовые наборы TaqMan® Вам не придется тратить время на разработку и оптимизацию исследования, Вы сможете сконцентрироваться на полученных результатах. • Исследуйте практически любой генетический

продукт - в Вашем распоряжении находится более 1,3 миллионов готовых решений, а также у Вас есть возможность заказа индивидуальных наборов, интересующих Вас, не входящих в список готовых решений

• Наборы практически для всех генов человека, мыши и крысы в базе данных RefSeq

• Доступны для 23 видов и некоторых патогенов

• Наборы для различных регионов транскриптов и практически на каждое экзонное соединение в геноме человека

• Штаммо-нейтральные (универсальные для всех штаммов) наборы для мыши и крысы

Для получения более подробной информации и для составления заказа посетите lifetechnologies.com/taqmangex

• Не можете найти готовое решение? Конфигуратор индивидуальных наборов TaqMan® позволит Вам составить и заказать нужный Вам набор TaqMan® для анализа любого гена любого организма. Сконфигурировать и заказать набор можно на lifetechnologies.com/cadt. Индивидуальные наборы TaqMan® s обычно доставляются в течение 60-70 рабочих дней.

• Эндогенные контроли TaqMan® - коллекция TaqMan® наборов, таргетирующие, часто используемые контрольные генные продукты при нормализации количества образца, в ходе ПЦР в реальном времени.

6

Для моего объекта исследований подходят несколько разных наборов. Как выбрать правильный?Геномные карты выравнивания на нашем сайте дают возможность в точности понять, какие продукты генов можно детектировать и как они выравниваются по геномным локусам. Верхняя часть карты содержит исследуемый ген. Ниже располагаются все Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов, расставленные в соответствии с геномной локусной картой. Еще ниже находятся известные транскрипты локусов, для которых указаны номера доступа RefSeq.

A. Название гена.

B. Выравнивание ампликона TaqMan® к гену. Наведите курсор на набор, чтобы увидеть его название и номер, а также транскрипты, которые он способен детектировать. Нажмите на набор, чтобы открыть панель с детальной информацией, а затем добавьте набор в корзину.

C. Пробы, обеспечивающие наилучшее покрытие, отмечены звездочкой.

D. Конкретизируйте свой выбор, указав, какой тип набора Вам требуется.

E. Все транскрипты RefSeq, соответствующие генным локусам, с указанием экзонов

Гарантия для наборовTaqMan® Assays qPCRLife Technologies™ гаранитирует качество каждого готового набора TaqMan®, который Вы покупаете. Мы боремся за то, чтобы помочь Вам достичь всех целей Вашего исследования, и верим, что наши готовые праймеры и зонды из наборов TaqMan® обеспечат получение высококачественных и готовых к использованию результатов ПЦР в реальном времени.

Мы хотим, чтобы Вы остались довольны своим выбором и были уверены в качестве услуг, предоставляемых Life Technologies™ - поэтому мы гарантируем, что каждый набор TaqMan® Assay будет характеризоваться надлежащими:

• Качеством – высококачественное производство для воспроизводимых результатов от лота к лоту

• Производительностью – наилучшая чувствительность, специфичность и точность

• Содержанием - самая большая коллекция праймеров и зондов, разработанная на высочайшем уровне и получившая самое широкое признание в мире.

• Результатами - позволяют получать данные, которым Вы сможете доверять.

Если Вы не удовлетворены работой наших наборов TaqMan®, мы заменим их бесплатно. Ознакомиться со всеми положениями и условиями гарантии Вы можете на нашем сайте lifetechnologies.com/taqmanguarantee.

7

MGB-зонды TaqMan®- более прочное связывание с мишенью - более короткие и более специфичные.Зонды TaqMan® включают связывающийся с малой бороздкой ДНК (MGB – minor groove binder) фрагмент на 3’ конце, который повышает Tm (температуру плавления) зонда и стабилизирует гибрид зонд-мишень. Это означает, что зонды TaqMan® могут быть гораздо короче обычных зондов, обеспечивая лучшую дискриминацию мишеней и возможность их большего выбора.

Нефлуоресцентный гаситель (NFQ - Nonfluorescent quencher) делает чувствительность анализа максимальнойЗонды TaqMan® обладают интегрированным гасителем NFQ, который позволяет им абсорбировать (гасить) сигнал от флуоресцирующих красителей FAM™ или VIC® на другом конце пробы. Это свойство NFQ, в сочетании с короткой длиной зондов с MGB, снижает фоновый сигнал по сравнению с другими пробами, что ведет к повышению чувствительности эксперимента и точности полученных результатов.

Ct Стандартное отклонение

Количество образца

Набор TaqMan®

Набор без MGB

зонда

Набор TaqMan®

Набор без MGB

зонда 10 нг 9.72 13.35 0.02 0.15 1 нг 13.36 16.82 0.04 0.18 0.1 нг 16.76 20.23 0.07 0.1310–2 нг 20.19 23.72 0.04 0.1310–3 нг 23.64 27.31 0.03 0.1010–4 нг 27.01 30.66 0.04 0.1210–5 нг 30.24 32.82 0.13 0.19

При проведении ПЦР в реальном времени зонды TaqMan® работают лучше в сравнении с другими не MGB-зондами

~ 10-кратное улучшение чувствительности и точности

Высокий сигнал, низкий

уровень фона

НадежностьКачественные и надежные реактивы для уверенности в своих результатах

8

Рис. 2. Наборы TaqMan® обеспечивают лучшую чувствительность и точность. Сравнение двух наборов с 5’-нуклеазной активностью для проведения ПЦР 18S рРНК. Были приготовлены десятикратные разведения Universal Human RNA (универсальной РНК человека), после чего их проанализировали в 11 повторах ПЦР с применением наборов TaqMan® для анализа экспресси генов (меченные красителем FAM™, с NFQ) и наборов без MGB зондов (меченные красителем FAM™, с BHQ). ПЦР в реальном времени проводили в соответствии с инструкцией производителя. Во всем диапазоне в 6 логарифмов наборы TaqMan® продемонстрировали меньшие значения Ct, и соответствие друг другу на всех точках графика. Кроме того, наборы TaqMan® обладали более высоким соотношением сигнал/фон, что обеспечивает лучшую чувствительность и точность эксперимента.

Рис. 3.Чувствительность и широкий динамический диапазон. Последовательные 10-кратные разведения синтетической смысловой РНК, соответствующей 4 генным продуктам - CDC23, DDX39, DCDC2 и BIRC5 - добавляли к основе, содержащей РНК дрожжей, чтобы оценить чувствительность и динамический диапазон наборов TaqMan® для анализа экспрессии генов. Образцы, содержащие от 50 до 5х109 исследуемых молекул, подвергались обратной транскрипции, после чего 20% каждого образца использовали для проведения ПЦР в 4 повторностях с помощью TaqMan® мастер-микса для анализа экспрессии генов (TaqMan® Gene Expression Master Mix). Образцы, содержащие менее 10 копий, были детектированы (Ct ~35).

Рис. 4. Надежность работы и широкий динамический диапазонНаборы TaqMan® для анализа экспрессии генов применяли для анализа экспрессии 60 генов в серии двухкратных разведений универсальной референсной кДНК от 4 нг/мкл до 4 пг/мкл. Средний угловой коэффециент составил 1,02. Поскольку эффективность ПЦР при использовании наборов TaqMan® составляет практически 100%, каждая исследуемая молекула удваивается на каждом цикле, что повышает флуоресценцию вдвое.

Воспроизводимая количественная оценка с практически 100% эффективностью амплификации

• Специфичность: усовершенствованный критерий выбора праймеров/зондов наряду с содержанием в наборе MGB зонда, обеспечивает необходимую для получения надежных результатов специфичность и воспроизводимость эксперимента. Получайте результаты при амплификции интересующего Вас участка, а не при неспецифическом связывании красителя или амплификации близкородственных генов и псевдогенов.

• Чувствительность: NFQ в зондах TaqMan® максимально снижает уровень фона, а продуманная структура праймеров и зондов для ПЦР максимально увеличивают эффективность амплификации. Повышение чувствительности и точности – надежная детекция мишеней.

• Воспроизводимость: полностью воспроизводимые результаты от лунки к лунке, изо дня в день, от лаборатории к лаборатории - даже от производственной партии к партии.

• Широкий динамический диапазон: детектируйте от нескольких до миллионов целевых молекул при универсальных условиях эксперимента. Исследуйте весь спектр изменчивости экспрессии практически в любом эксперименте.

• Высокая эффективность амплификации: все наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов обладают 100% эффективностью ПЦР (±10%). Вы сможете с уверенностью применять сравнительный метод количественной оценки Ct (ΔΔCt).

• Удобство в использовании: для всех исследований используется единый профиль термоциклирования. Комбинируйте любые наборы в рамках одной плашки. Вы не столкнетесь с проблемами, связанными с ошибками программирования приборов.

• Исчерпывающая инструкция к наборам: данные по геномному картированию предоставляются до покупки.

Детекция до 10 молекул, за счет высокой чувствительности и большого динамического диапазона

9

Рис. 5. Показано, что наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов детектируют только заданные молекулы, в том числе среди высокогомологичных генов из семейства HOX. У беспозвоночных, таких, как Drosophila, правильно локализованная экспрессия генов семейства HOX критически важна для нормального эмбриогенеза. Тканеспецифичная экспрессия трех близкородственных продуктов генов HOX легко детектирована с помощью наборов TaqMan® для анализа экспрессии генов; результаты соответствовали опубликованным данным.

Ген RefSeq ID TaqMan® Assay ID Гомология

HOXA10 NM_018951.3 Hs00172012_m1 —

HOXC10 NM_017409.3 Hs00213579_m1 81%

HOXD10 NM_002148.3 Hs00157974_m1 79%

Гены семейства HOX - HOXA10, HOXC10 и HOXD10 - обладают ~80% гомологией последовательностей

Четкие результаты по экспрессии генов семейства HOX

Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов разработаны для детектирования только заданных молекул и легко различают высокогомологичные последовательности.

Специфичность исследования мРНККонструкция наборов TaqMan® обеспечивает специфичность исследования мРНК: четкая дифференциация даже высокогомологичных последовательностей Специфичность - важное условие при разработке наборов TaqMan®. Результатом ее является четкое детектирование строго заданных мишеней. Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов, предназначенные для анализа даже самых высокогомологичных семейств генов, обеспечивают амплификацию исследуемой молекулы с Ct, по крайней мере, на 10 циклов раньше, чем у ближайшего гомолога, или, по крайней мере, в 1000 раз большую дифференциацию, если молекулы обоих типов присутствуют в равных количествах.

10

Усовершенствованный биоинформатический анализНаборы TaqMan® для анализа экспрессии генов были разработаны с применением нашей специальной технологии, эффективность которой подтверждена тестированием более 18000 наборов (статистически значимая выборка). С тех пор наши клиенты раз за разом подтверждали надежность наборовTaqMan® в ходе собственных экспериментов, получая с их помощью четкие и воспроизводимые результаты.

Разработка и производство наборов TaqMan®

Данный процесс используется для создания всех наборов TaqMan® для анализа экспрессии генов, в том числе складских, собираемых под заказ и индивидуальных наборов TaqMan® (Custom Plus TaqMan® Assays). Мы предлагаем ~55000 складских позиций и более 1,33 миллиона наборов, составляемых под заказ, которые производятся после поступления заказа. Индивидуальные наборы TaqMan® RNA идеально подходят для недавно открытых генов и специфических вариантов сплайсинга, обеспечивая тот же уровень надежности результатов, что и уже разработанные наборы TaqMan®.

11

Конфигурации для различных исследовательских задачВам требуется проанализировать сотни (или тысячи) образцов и оценить экспрессию нескольких генов? Или в ходе Вашего исследования задействованы всего несколько образцов, но требуется проанализировать наличие длинного списка разных мРНК? Какими бы ни были условия Вашего эксперимента, Вы сможете подобрать нужный Вам набор TaqMan® для анализа экспрессии генов и прибор для ПЦР в режиме реального времени.

Гибкие форматыШирокий выбор форматов для любых исследовательских целей

12

Размер Количество реакций* Концентрация Репортерный

красительНомер по каталогу

Очень маленькие (складские)1

75 20X FAM™ 4453320

Очень маленькие (собранные на

заказ)2

75 20X FAM™ 4448892

Маленькие (складские)1

250 20X FAM™ 4331182

Маленькие (собранные на

заказ)2

360 20X FAM™ or VIC® 4351372,4448489 (VIC®)

4448484 (VIC®-PL**)

Средние (собранные на

заказ)2

750 20X FAM™ or VIC® 4351370,4448490 (VIC®)

4448485 (VIC®- PL**)

Большие (собранные на

заказ)2

2,900 60X FAM™ or VIC® 4351368,4448491 (VIC®)

4448486 (VIC®-PL**)

* Количество реакций рассчитано исходя из размера реакционной смеси 20 мкл.. ** Ограниченные по праймерам. 1. Складские наборы, как правило, поставляются в течение 45-60 рабочих дней. 2. Собранные на заказ наборы, как правило, поставляются в течение 60-70 рабочих дней.

Индивидуальные 96-луночные плашки с наборами TaqMan® • Выберите складской набор

TaqMan® для анализа экспрессии генов

• Минимальный заказ 6 плашек

• Выберите формат - стандартный (20-мкл реакционный объем) или Fast (10 мкл реакционный объем )

• Поставляется, как правило, в течение 70-80 рабочих дней

Чтобы получить дополнительную информацию и совершить заказ, посетите наш сайт lifetechnologies.com/arrayplates

Наборы TaqMan® в форматах 96-луночных плашек или 384-луночных микропроточных карт• Сконфигурируйте индивидуальные форматы наборов TaqMan® из складских уже разработанных наборов или

воспользуйтесь нашей коллекцией наборов для анализа различных «генных подписей»

• Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов могут быть раскапаны в два разных формата: 96-луночные плашки (стандартные или Fast) или 384-луночные микропроточные карты

(Чтобы наборы TaqMan®, собранные под заказ или индивидуальные, были нанесны на Ваши плашки или карты, сделайте заказ с помощью нашей услуги TaqMan® Custom Plating Service, или свяжитесь с менеджером по продажам для дополнительных возможностей)

Наборы + контроли

Число повторностей

Число образцов на

плашкуНазвание

Номер по каталогу

(стандартные)

Номер по каталогу

(Fast)

95 + 1* 1 1 Формат 96 4391524 4413255

92 + 4** 1 1 Формат 96 + 4391525 4413256

47 + 1* 2 1–2 Формат 48 4391526 4413257

44 + 4** 2 1–2 Формат 48 + 4391527 4413258

31 + 1* 3 1–3 Формат 32 4391528 4413259

28 + 4** 3 1–3 Формат 32 + 4391529 4413260

15 + 1 6 1–6 Формат 16 4413264 4413261

12 + 4 6 1–6 Формат 16 + 4413265 4413262

7 + 1 12 1–12 Формат 8 4413266 4413263

* Доступен с 1 производственным контрольным набором для анализа 18S РНК. Данные форматы используют для плашек с наборами для макак-резус, собак или смеси видов.** Поставляется с 1 производственным контрольным набором для анализа 18S РНК, а также с наборами для 3 дополнительных

кандидатных эндогенных контрольных генов: GAPDH, HPRT1 и GUSB, которые подходят для анализа образцов человека, мыши или крысы.

Для получения дополнительной информации, посетите наш сайт, lifetechnologies.com/allgenes.

Наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов (отдельные пробирки)Уже разработанные наборы поставляются в 4 разных форматах, таким образом Вы можете заказать именно то количество наборов, которое Вам требуется для Вашего исследования. Кроме того, для наборов, собранных на заказ, в малом, среднем или большом размере, Вы можете заказать красители FAM™ или VIC® и ограниченные или не ограниченные по праймерам составы (очень маленькие форматы доступны только с красителями FAM™)

13

Плашки и карты с наборами TaqMan® для анализа “генной подписи” (TaqMan® Array Gene Signature)• Уже разработанные и заранее нанесенные наборы TaqMan® для анализа специфических генных продуктов,

относящихся к конкретным метаболическим путям, биомаркеров или связанных с конкретными заболеваниями, в рамках разработки лекарственных средств

• Эндогенные контрольные панели также способны оптимальным образом выявлять продукты генов “домашнего хозяйства” в рамках Вашего исследования

• Плашки для анализа “генной подписи” обычно поставляются в течение 60 рабочих дней, а карты - в течение 45-60 рабочих дней.

—Примеры доступных вариантов анализа:

– Апоптоз – Эндогенные контролеры

– Рак – Иммунная система и воспаление

– Пролиферация и регуляция клеточного цикла – Неврология

– Передача сигналов – Развивитие и стволовые клетки

–Токсикология и метаболизм лекарственных средств

Полную коллекцию 96-луночных плашек для анализа “генной подписи” Вы можете посмотреть на lifetechnologies.com/signatureplates. Чтобы посмотреть коллекцию 384-луночных микропроточных карт для анализа “генной подписи”, посетите lifetechnologies.com/signaturecards.

Индивидуальные 384-луночные микропроточные карты с наборами TaqMan®

• Выберите складской набор TaqMan® для анализа экспрессии генов

• Минимальный заказ - 10 карт

• Подходит для работы на системах для ПЦР в реальном времени QuantStudio™ 12K Flex, QuantStudio™ 7, ViiA™ 7 или 7900HT Fast

• Не нуждается в дополнительной автоматизации: карты обладают простыми загрузочными отверстиями на 8 образцов, каждый из которых связан с 48 лунками, содержащими лиофилизированные наборы TaqMan®

• Реакции на 1 мкл (2 мкл, включая заполнение канала и допустимый избыток)

• Поставляется, как правило, в течение 90 рабочих дней

Чтобы получить дополнительную информацию и совершить заказ, посетите наш сайт lifetechnologies.com/arraycards.

Пробы + контроли*

Число повторностей

Число образцов на карту Название Номер по

каталогу

11 + 1 4 8 Формат 12 4342247

15 + 1 3 8 Формат 16 4346798

23 + 1 2 (или 4) 8 (или 4) Формат 24 4342249

31 + 1 3 4 Формат 32 4346799

47 + 1 1 (или 2) 8 (или 4) Формат 48 4342253

63 + 1 3 2 Формат 64 4346800

95 + 1 1 (или 2) 4 (или 2) Формат 96a 4342259

95 + 1 2 (или 4) 2 (или 1) Формат 96b 4342261

191 + 1 2 1 Формат 192 4346802

380 + 4 1 1 Формат 384 4342265

* TПоставляется с 1 производственным контрольным набором для анализа 18S РНК.

14

Наборы + контроли

Число повторностей

Число образцов

на плашкуНазвание Номер по

каталогу

18 3 До 48 Формат 18 4454009

56 1 До 48 Формат 56 4454013

112 1 До 24 Формат 112 4454005

168 1 До 16 Формат 168 4454007

224 1 До 12 Формат 224 4454011

Плашки для ПЦР в реальном времени OpenArray® • Наборы TaqMan® загружаются в 3072 сквозных отверстия на плашке OpenArray® и лиофилизируются

• Один исследователь сможет за 8-часовой день проанализировать вплоть до 576 образцов для получения данных по более чем 43000 точкам без необходимости в применении автоматики.

• Только для использования с системой ПЦР в реальном времени QuantStudio™ 12K Flex Real-Time System с блоковой кофигурацией OpenArray® и соответствующих наборов реактивов.

• Плашки OpenArray® со складскими наборами, как правило, поставляются в течение 60-70 рабочих дней, или в течение 80-90 рабочих дней в случае индивидуальных заказов.

Узнать больше о технологии OpenArray® для системы QuantStudio™ 12K Flex можно на на нашем сайте lifetechnologies.com/quantstudio.

Услуги по нанесению на плашки (TaqMan® Custom Plating Service): 96- или 384-луночные плашки96- или 384-луночные плашки сочетаются с любыми наборами TaqMan® для анализа экспрессии генов, в том числе с индивидуальными наборами, разработанными специально для Ваших последовательностей, и со сделанными под заказ пробами.

• Задайте требуемые параметры для наборов TaqMan®, в том числе для складских, сделанных под заказ, индивидуальных Custom Plus наборов или индивидуальных Custom зондов и праймеров TaqMan®

• Выберите 96- или 384-луночную плашку и стандартный или быстрый формат

• Получите лиофилизированный или жидкий состав

• Поставляется, как правило, в течение 89-90 рабочих дней

15

Дополнительные реагенты Все, что Вам требуется для получения надежных результатовLife Technologies™ обеспечит Вас всем необходимым для проведения анализа ПЦР в реальном времени, начиная от выделения РНК из любого образца, обратной траскрипции в кДНК, опциональной преамплификации с целью увеличения малых образцов для возможности исследования многих продуктов генов одновременно, и, конечно, анализом данных по результатам ПЦР в реальном времени.

16

Реактивы TaqMan® в сравнении с реактивами SYBR® Green для ПЦР в реальном времениLife Technologies™ предлагает два типа реактивов для детектирования продуктов ПЦР с помощью приборов для ПЦР в реальном времени:

• Наборы TaqMan® (также известные как «флуорогенные с 5’ нуклеазной активностью»)

• Красители SYBR® Green I

Реагенты наборов TaqMan® Реагенты SYBR® Green

Специфичность Высокая Низкая

Чувствительность - анализ малого числа копий Высокая Варьирует*

Воспроизводимость Высокая Варьирует*

Мультиплексирование Да Нет

Готовые наборы Да Нет

Пользовательский дизайн и оптимизация Нет Да

Цена Высокая Низкая*

Количественный анализ экспрессии генов Высокая Низкая

Количественный анализ ДНК Да Да (детектирование патогенов)

Иммунопреципитация хроматина (ChIP) Да Да

SNP-генотипирование Да Нет

микро РНК Да Нет

Число копий Да Нет

Детектирование соматических мутаций Да Нет

Анализ метаболических путей Да Нет

* Зависит от качества образца и от структуры/оптимизации праймеров

Детектирование на основе наборов TaqMan® Детектирование на основе SYBR® Green

Принцип действия Флуорогенный набор позволяет выявлять специфичный продукт ПЦР по мере его

накопления в ходе ПЦР

SYBR® Green I или сходные с ним красители связываются с двухцепочечной ДНК и выявляют продукт ПЦР по мере его

накопления в ходе ПЦР

17

Качественное производство и строгий контроль качестваНаборы TaqMan® производятся при строгом контроле качества в помещении наших сертифицированных по ISO 13485 производственных предприятий и никогда не поставляются из других источников.

Комплексная поддержка по всему мируНужно ли Вам помочь подобрать набор TaqMan®, решить, какой формат лучше всего подходит для Вашего исследования, совершить заказ с помощью нашей онлайн-системы или разобраться с ходом Вашего эксперимента, представители наших отделов продаж и специалисты технической поддержки всегда к Вашим услугам.

Техническая поддержкаЕсли у Вас есть вопросы о том, как использовать наборы TaqMan® или как анализировать соответствующие результаты, позвоните или напишите по электронной почте специалистам из нашей технической поддержки. Они обладают соответсвующим опытом в области планирования и проведения экспериментов, знакомы с большим числом методик, основанных на применении наборов TaqMan®, и помогут с решением возможных проблем.

Быстрая доставка Мы постоянно стремимся к сокращению времени доставки нашей продукции. На данный момент мы разработали специальную налаженную систему заказа, которая непосредственно связывается с нашими производственными предприятиями для максимального снижения времени доставки.

Поддержка каждого шага Вашего экспериментаНадежность всего пути - от производства до контрольных экспериментов

• Аннотация к наборам TaqMan® —Вместе с набором предоставляется информация по мишеням для ПЦР в реальном времени, олигонуклеотидам и руководства с протоколами, также данную информацию можно найти на нашем сайте. Вся биологически релевантная информация тоже доступна, в том числе, данные об областях покрытия геномной последовательности, о детектируемых транскриптах и о размере ампликона. Протоколы с рекомендованными реактивами и условиями реакций также находятся на нашем сайте.

• Публикации—Имеется более чем 3500 публикаций в рецензируемых журналах, в которых цитируются наборы TaqMan® для анализа экспрессии генов. Таким образом, включение ID набора TaqMan® вместо последовательности является достаточным и применяется повсеместно.

• Программное обеспечение для приборов—Программное обеспечение для приборов Applied Biosystems® выводит данные по значениям пороговых циклов (Ct) для проведения количественного анализа. Эти значения можно использовать для построения стандартной кривой, определения ее углового коэффициента и значений коэффициента корреляции (r2). Для удобства при оценке соответствия требованиям MIQE значение количественной оценки цикла (Cq) можно использовать напрямую вместо Ct.

• Анализ данных—Мы предлагаем программное обеспечение для анализа данных, в том числе ExpressionSuite и DataAssist™ Software – простые в использовании программы для подсчета относительных значений экспрессии генов с помощью статистического анализа и визуализации данных; а также RealTime StatMiner® Software (Integromics) для дополнительного статистического анализа.

Все что Вам нужно, чтобы соответствовать требованиям MIQE для публикаций в рецензируемых изданияхМинимальные требования для публикации данных количественных экспериментов с ПЦР в реальном времени - Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR experiments (MIQE), опубликованные Bustin et al. в Clinical Chemistry (Апрель 2009) позволяют гарантировать, что данные, полученные при проведении ПЦР в реальном времени значимы, точны и воспроизводимы. Мы поддерживаем данную инициативу, высоко оценивая компетентность вышеупомянутых ученых. Для соблюдения указанных принципов мы предоставляем следующее:

18

Цена

Про

изво

дите

льно

сть 384

лунки

96 лунки

48 лунки

Плашки OpenArray®

7500/7500 Fastsystems

ViiA™ 7system

QuantStudio® 12KFlex system

StepOne®/StepOnePlus®

systems

Основано на 20-летнем опыте недрения инноваций, позволяющих нам лидировать в своей отраслиТолько портфолио для ПЦР в реальном времени Applied Biosystems® может расти в соответствии с развитием Ваших исследовательских потребностей. От простой надежности систем StepOne® до беспрецедентной производительности систем QuantStudio™ 12K Flex - только наша линейка приборов может обеспечить подобную гибкость, масштабируемость и качество работы.

lifetechnologies.com

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. © 2014 Thermo Fisher Scientific Inc. All rights reserved. All trademarks are the property of Thermo Fisher Scientific and its subsidiaries unless otherwise specified. AmpliTaq Gold and TaqMan are registered trademarks of Roche Molecular Systems, Inc., used under permission and license. CO29422 1014