遺伝子共発現データベースCOXPRESdb トーゴーの日シンポジウム202014

Licensed under a Creative Commons 表示4.0国際ライセンス©2020大林武（東北大学大学院情報科学研究科）

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公共の遺伝子発現量データ

大林武（東北大学大学院情報科学研究科）

Gene

Gene共発現データ

Gene

Gene

種内統合した共発現データ

ヒトの場合

128455GeneChips

22897runs

発現プロファイルが似ている遺伝子関係を提示するデータベース

遺伝子A

遺伝子B

様々なサンプル

遺伝子C

遺伝子D

Gene

Gene

様々なサンプル

遺伝子共発現データベースCOXPRESdb トーゴーの日シンポジウム202014

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共発現ネットワークの描画ガイド遺伝子と共発現する遺伝子のリスト

パラログの片方しか 共発現していない例

オーソログがない

注目している共発現データ プラットフォーム比較 種間比較

PPIも表示

太さは共発現強度