3
CONTENIDOS PARTE I INTRODUCCIÓN Y GENERALIDADES 1 Capítulo 1. Lavida 3 1. Procariontes 3 2. Eucariontes 7 3. Bioquímica: prólogo 14 4. Genética:revisión 19 5. El origen de la vida 29 6. Bibliografía bioquímica 34 Capítulo 2. Solucionesacuosas 41 1. Propiedades del agua 41 2.Ácidos,basesy buffers 46 Capítulo 3. Principios de termodinámica: revisión 55 1. Primera ley de la termodinámica: la energía se conserva 55 2. Segunda ley de la termodinámica: el universo tiende hacia el desorden máximo 57 3. Energía libre: el indicador de espontaneidad 60 4. Equilibriosquímicos 61 Apéndice: dependencia de la concentración de energía libre 64 PARTE 11 BIOMOLÉCULAS 69 Capítulo 4 . Aminoácidos 71 1. Los aminoácidos de las proteínas 71 2. Actividad óptica 78 3. Aminoácidos "no estándares" 82 Capítulo5 . Ácidos nucleicos, expresión génica y tecnología del DNA recombinante 87 1. Nucleótidos y ácidos nucleicos 87 2. El DNA es el portador de la información genética 89 3. DNA de doble hélice 93 4. Expresión y replicación génicas: panorama general 100 5. Clonaciónmolecular 109 Capítulo 6 . Técnicas de purificación de proteínas y ácidos nucleicos 135 1. Aislamientode proteínas 135 2. Solubilidade las proteínas 139 3. Separacionescromatográficas 141 4. Electroforesis 152 5. Ultracentrifugación 159 6. Fraccionamiento de ácidos nucleicos 163 Capítulo 7. Estructuras covalentes de las proteínas y los ácidos nucleicos 169 1. Determinación de la estructura primaria de las proteínas 170 2. Secuenciaciónde los ácidos nucleicos 183 3. Evolución química 190 4. Bioinformática: introducción 200 5. Síntesis química de polipéptidos 212 6. Síntesis química de oligonucleótidos 216 Capítulo 8 . Estructura tridimensional de las proteínas 227 1. Estructura secundaria 227 2. Proteínas fibrosas 239 3. Proteínas globulares 247 4. Estabilidad de las proteínas 267 5. Estructura cuaternaria 275 Apéndice: visualización de las ilustraciones estereoscópicas 278 Capítulo 9. Plegamiento, dinámica y evolución estructural de las proteínas 287 1. Plegamiento de las proteínas: teoría y experimentos 287 2. Proteínas accesorias al plegamiento 299 3. Predicción y diseño de la estructura de las proteínas 311 4. Dinámica de las proteínas 314 5. Enfermedades conformacionales: amiloides y priones 318 6. Evolución estructural 324 Capítulo 10. Hemoglobina: función proteica en el microcosmo 333 1. Funciónde la hemoglobina 333 2. Estructura y mecanismo 341 3. Hemoglobinasanormales 353 4. Regulación alostérica 359 Apéndice: derivación de las ecuaciones del modelo de simetría 365 Capítulo 11 . Azúcares y polisacáridos 371 1. Monosacáridos 371 2. Polisacáridos 377 3. Glucoproteínas 384 Capítulo12 . Lípidos y membranas 397 1. Clasificación de los lípidos 397

CONTENIDOS - Universidad CESodin.ces.edu.co/Contenidos_Web/41025148.pdfEstructuras covalentes de las proteínas y los ácidos nucleicos 169 1. Determinación de la estructura primaria

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: CONTENIDOS - Universidad CESodin.ces.edu.co/Contenidos_Web/41025148.pdfEstructuras covalentes de las proteínas y los ácidos nucleicos 169 1. Determinación de la estructura primaria

CONTENIDOS

PARTEIINTRODUCCIÓNY GENERALIDADES 1

Capítulo 1 . Lavida 3

1.Procariontes 32. Eucariontes 73. Bioquímica:prólogo 144. Genética:revisión 195. Elorigende la vida 296. Bibliografíabioquímica 34

Capítulo 2 . Solucionesacuosas 411.Propiedadesdelagua 412. Ácidos,basesy buffers 46

Capítulo 3 . Principios de termodinámica:revisión 55

1. Primera ley de la termodinámica: la energíase conserva 55

2. Segunda ley de la termodinámica: el universo tiendehacia el desorden máximo 57

3. Energía libre: el indicador de espontaneidad 604. Equilibriosquímicos 61

Apéndice: dependencia de la concentración de energíalibre 64

PARTE 11

BIOMOLÉCULAS 69

Capítulo 4 . Aminoácidos 71

1. Los aminoácidos de las proteínas 712. Actividad óptica 783. Aminoácidos "no estándares" 82

Capítulo5 . Ácidos nucleicos, expresión génica ytecnología del DNA recombinante 87

1. Nucleótidos y ácidos nucleicos 872. El DNA es el portador de la información genética 893. DNA de doble hélice 93

4. Expresión y replicación génicas: panorama general 1005. Clonaciónmolecular 109

Capítulo 6 . Técnicas de purificación de proteínas yácidos nucleicos 135

1. Aislamientode proteínas 1352. Solubilidadde las proteínas 1393. Separacionescromatográficas 1414. Electroforesis 152

5. Ultracentrifugación 1596. Fraccionamiento de ácidos nucleicos 163

Capítulo 7 . Estructuras covalentes de las proteínas ylos ácidos nucleicos 169

1. Determinación de la estructura primaria delas proteínas 170

2. Secuenciaciónde los ácidos nucleicos 183

3. Evolución química 1904. Bioinformática: introducción 200

5. Síntesis química de polipéptidos 2126. Síntesis química de oligonucleótidos 216

Capítulo 8 . Estructura tridimensional delas proteínas 2271. Estructura secundaria 2272. Proteínas fibrosas 2393. Proteínas globulares 2474. Estabilidad de las proteínas 2675. Estructura cuaternaria 275Apéndice: visualización de las ilustraciones

estereoscópicas 278

Capítulo 9 . Plegamiento, dinámica y evoluciónestructural de las proteínas 287

1. Plegamiento de las proteínas: teoría y experimentos 2872. Proteínas accesorias al plegamiento 2993. Predicción y diseño de la estructura de las proteínas 3114. Dinámica de las proteínas 3145. Enfermedades conformacionales: amiloides y priones 3186. Evolución estructural 324

Capítulo 10. Hemoglobina: función proteica enel microcosmo 333

1. Funciónde la hemoglobina 3332. Estructura y mecanismo 3413. Hemoglobinasanormales 3534. Regulación alostérica 359Apéndice: derivación de las ecuaciones del modelo

de simetría 365

Capítulo 11 . Azúcares y polisacáridos 3711. Monosacáridos 3712. Polisacáridos 3773. Glucoproteínas 384

Capítulo12 . Lípidos y membranas 397

1. Clasificación de los lípidos 397

Page 2: CONTENIDOS - Universidad CESodin.ces.edu.co/Contenidos_Web/41025148.pdfEstructuras covalentes de las proteínas y los ácidos nucleicos 169 1. Determinación de la estructura primaria

xiv Contenidos

2. Propiedades de los agregados lipídicos 4043. Membranasbiológicas 4094. Ensamblaje de la membrana y blanco proteico 4295. Lipoproteínas 454

PARTE 111

MECANISMOS DE ACCIÓN DELASENZIMAS 471

Capítulo 13. Introducción a las enzimas 4731. Perspectiva histórica 4732. Especificidad de sustrato 4743. Coenzimas 477

4. Regulación de la actividad enzimática 4795. Principiosde nomenclaturade lasenzimas 483

Capítulo 14. Velocidadesde las reaccionesenzimáticas 487

1. Cinética química 4882. Cinética de las enzima s 4923. Inhibición 498

4. Efectos del pH 5025. Reacciones con dos sustratos 503Apéndice: derivaciones de las variantes de la ecuación de

Michaelis-Menten 507

Capítulo 15. Catálisis enzimática 5131. Mecanismos catalíticos 5132. Lisozima 524

3. Serina proteasas 5334. Diseño de fármacos 546

PARTEIVMETABOLISMO 565

Capítulo 16. Introducción al metabolismo 5671. Vías metabólicas 5672. Mecanismos de las reacciones orgánicas 5713. Enfoques experimentales del estudio del metabolismo 5774. Termodinámica de los compuestos de fosfato 5845. Reaccionesde oxidación-reducción 5896. Termodinámica de la vida 593

Capítulo 17. Glucólisis 601

1. Vía glucolítica 6012. Reaccionesde glucólisis 605

3. Fermentación: destino anaeróbico del piruvato 6224. Regulación y control metabólico 6275. Metabolismo de otras hexosas aparte de

la glucosa 638

Capítulo18. Metabolismo del glucógeno 647

1. Degradación del glucógeno 6482. Síntesisdelglucógeno 653

3. Control del metabolismo del glucógeno 656

4. Enfermedades del almacenamiento de glucógeno 673

Capítulo 19. Transducción de señales 6811. Hormonas 6812. Proteínas G heterotriméricas 6983. Señalización basada en tirosincinasa 7084. Cascada de fosfoinositídicos 732

Capítulo 20. Transporte a través de membranas 753

1. Termodinámica del transporte 7532. Cinética y mecanismos de transporte 7543. Transporte activo dependiente de ATP 7664. Transporte activo impulsado por gradiente de iones 7745. Neurotransmisión 777

Capítulo21 . Ciclo del ácido cítrico 7951. Generalidadesdelciclo 7952. Fuentes metabólicas de acetil-coenzima A 7983. Enzimas del ciclo del ácido cítrico 8124. Regulación del ciclo del ácido cítrico 8205. La naturaleza anfibólica del ciclo del ácido cítrico 823

Capítulo22. Transporte de electronesy fosforilaciónoxidativa 829

1. La mitocondria 8302. Transporte de electrones 8333. Fosforilación oxidativa 8524. Controlde la producciónde ATP 868

Capítulo 23 . Otras vías metabólicas delos carbohidratos 877

1. Gluconeogénesis 8772. El ciclo del glioxilato 8843. Biosíntesisde oligosacáridosy glucoproteínas 8864. Vía de las pentosas fosfato 897

Capítulo24 . Fotosíntesis 907

1. Cloroplastos 9082. Reaccioneslumínicas 9093. Reaccionesno lumínicas u "oscuras" 932

Capítulo 25 . Metabolismode los lípidos 9451. Digestión, absorción y transporte de los lípidos 9452. Oxidaciónde losácidosgrasos 9503. Cuerpos cetónicos 9654. Biosíntesis de ácidos grasos 9675. Regulación del metabolismo de los ácidos grasos 9776. Metabolismo del colesterol 979

7. Metabolismo de eicosanoides: prostaglandinas,prostaciclinas, tromboxanos, leucotrienos ylipoxinas 995

8. Metabolismo de fosfolípidosy glucolípidos 1007

Page 3: CONTENIDOS - Universidad CESodin.ces.edu.co/Contenidos_Web/41025148.pdfEstructuras covalentes de las proteínas y los ácidos nucleicos 169 1. Determinación de la estructura primaria

Capítulo 26 . Metabolismo de los aminoácidos 10231.Desaminaciónde aminoácidos 10242. Elciclode la urea 1029

3.Degradaciónmetabólicade aminoácidosindividuales 1033

4. Aminoácidos como precursores biosintéticos 10515. Biosíntesis de amino ácidos 10696. Fijación del nitrógeno 1084

Capítulo27 . Metabolismo energético: integración yespecialización de los órganos 1095

1. Principales vías y estrategias del metabolismoenergético: resumen 1095

2.Especializaciónde los órganos 10983. Homeostasis metabólica: regulación del apetito,

del gasto de energía y del peso corporal 11034. Adaptación metabólica 1107

Capítulo28. Metabolismo de los nucleótidos 1113

1. Síntesisde ribonucleótidos purínicos 11132. Síntesisde ribonucleótidos pirimidínicos 11203.Formaciónde desoxirribonucleótidos 1124

.4. Degradación de nucleótidos 11365. Biosíntesis de coenzimas nucleotídicas 1143

PARTEVEXPRESIÓN Y TRANSMISIÓN DELAINFORMACIÓN GENÉTICA 1151

Capítulo29. Estructura de los ácidos nucleicos 1153

1. Estructuras de doble hélice 11532. Fuerzas que estabilizan las estructuras de los ácidos

nucleicos 11613. DNA superenrollado 1168

Capítulo30 . Replicación, reparación yrecombinacióndel DNA 1183

1.Replicacióndel DNA: panorama general 11832. Enzimasde la replicación 11863. Replicación en procariontes 11984. Replicación en eucariontes 1209

Contenidos xv

5. Reparación del DNA 12206. Recombinación y elementos genéticos móviles 12327. Metilación del DNA Y expansiones por repetición de

trinucleótidos 1252

Capítulo 31 . Transcripción 1265

1. El papel del RNA en la síntesis de proteínas 12662. RNA polimerasa 12703. Control de la transcripción en procariontes 12874. Procesamiento postranscripcional 1304

Capítulo32 . Traducción 1335

1. El código genético 13352. RNA de transferencia y su aminoacilación 1342

3. Ribosomas y síntesis de polipéptidos 13594. Control de la traducción en eucariontes 13935. Modificación después de la traducción 13976. Degradación de las proteínas 1402

Capítulo 33 . Virus: paradigmas para la funcióncelular 1423

1. Virus del mosaico del tabaco 14252. Virus icosaédricos 14303. Bacteriófago A. 14414. Virus de la gripe 1461

Capítulo 34 . Expresión génica de los eucariontes 14751. Estructura de los cromo sornas 14752. Organización genómica 14863. Control de la expresión 15004. Diferenciación y crecimiento celulares 1537

Capítulo 35 . Fisiología molecular 1581

1. Coagulación sanguínea 15812. Inmunidad 1597

3. Motilidad: músculos, transporte de vesículas, cilios yflagelos 1631

íNDICE ANALíTICO 1681