Upload
others
View
8
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Część III: Przekazywanie sygnałów
1
MATERIAŁY POMOCNICZE PROJEKTOWANIE NOWYCH LEKÓW
prof. dr hab. inż. Jan Mazerski
PRZEKAZYWANIE SYGNAŁÓW
Cechą charakterystyczną układów żywych jest zdolność do zachowywania wewnętrznej
homeostazy układu (komórki, organizmu) w zmieniającym się otoczeniu. Nawet najprostsza
komórka zawiera dziesiątki systemów, których współdziałanie niezbędne jest dla utrzymania
homeostazy komórki. Sytuacja komplikuje się jeszcze dodatkowo w przypadku organizmów
wielokomórkowych, w których zapewniona być musi koordynacja działania:
- poszczególnych komórek w ramach tkanek
- poszczególnych tkanek w ramach narządów i układów
- poszczególnych układów w ramach całego organizmu.
Utrzymywanie współdziałania poszczególnych systemów wymaga wymiany informacji pomiędzy
nimi.
... Nadajnik Odbiornik
Nośnik sygnału
Efektor
Wzmacniacz
Zgodnie z teorią przekazu informacji każdy układ sygnalizacyjny musi składać się z:
nadajnika sygnału
czynnika przenoszącego sygnał
odbiornika i wzmacniacza sygnału
efektora, czyli systemu reagującego na obecność lub brak sygnału.
OOddbbiióórr ssyyggnnaałłóóww zzeewwnnąąttrrzzkkoommóórrkkoowwyycchh
Niezbędnym warunkiem zachowania homeostazy jest odizolowanie się komórki od
otaczającego ją środowiska. Funkcję tą spełnia przede wszystkim błona komórkowa stanowiąca
barierę transportową dla prawie wszystkich składników środowiska. Jednakże całkowita izolacja
komórki od otoczenia nie jest możliwa. Komórka pobiera ze środowiska składniki odżywcze
niezbędne dla prawidłowego funkcjonowania i rozwoju i usuwa do środowiska zbędne i często
szkodliwe produkty przemiany materii.
Część III: Przekazywanie sygnałów
2
Z punktu widzenia optymalnej strategii przetrwania w zmieniającym się środowisku
komórka powinna mieć możliwość uzyskiwania informacji o stanie tego środowiska. Informacja ta
powinna mieć charakter wyprzedzający (ostrzegawczy), czyli pojawić się w komórce wcześniej niż
stan środowiska wpłynie (zwykle niekorzystnie) na stan samej komórki.
Cząsteczka sygnałowa
Większość informacji o stanie środowiska odbieranych przez
pojedynczą komórkę ma charakter chemiczny: nośnikiem sygnału jest
stężenie określonego związku chemicznego pełniącego rolę cząsteczki
sygnałowej. Jest przy tym charakterystyczne,
że zdecydowana większość znanych
cząsteczek sygnałowych nie wnika do
wnętrza komórki. Wyjątkiem są hormony sterydowe, które na drodze
biernej dyfuzji przenikają przez błonę komórkową i docierają do jądra
wpływając na profil ekspresji genów.
Receptory błonowe
Na powierzchni komórki znajdują się białka pełniące funkcję receptora sygnału. Po
związaniu cząsteczki sygnałowej (liganda) receptor zmienia swoją strukturę III- i IV-rzędową,
również po wewnętrznej stronie błony.
Błona
Cząsteczka sygnałowa
Receptor
Błona
Receptor
W ten sposób, poprzez zmianę konformacji białka transbłonowego, do wnętrza komórki
przekazywana jest informacja o pojawieniu się cząsteczki sygnałowej. Receptory błonowe mają
duże powinowactwo do ligandu i mogą reagować na stężenia nanomolowe (10-9 mola/L).
Cząsteczka sygnałowa
Hormon sterydowy
Część III: Przekazywanie sygnałów
3
Wzmacniacze sygnału
Jednakże aby komórka zareagowała na pobudzenie receptora sygnał musi ulec wzmocnieniu
(multiplikacji). Receptor stanowi zwykle część kompleksu białkowego w skład którego wchodzi
ponadto układ wzmacniający sygnał. Wzmocnienie sygnału polega na wygenerowaniu odpowiednio
dużej liczby cząsteczek lub jonów stanowiących wtórną cząsteczkę sygnałową.
Znanych jest wiele wtórnych cząsteczek sygnałowych i wiele sposobów ich wytwarzania w
odpowiedzi na zmianę konformacyjną białka receptorowego. Układy wzmacniające można z
grubsza zaliczyć do jednej z dwóch klas:
wzmacniaczy enzymatycznych, lub
wzmacniaczy kanałowych.
Zasada działania wzmacniaczy enzymatycznych polega na uaktywnieniu enzymu lub układu
enzymatycznego na skutek zmiany konformacji wewnątrzkomórkowej domeny białka
receptorowego. Uaktywniony enzym wytwarza szereg wtórnych cząsteczek sygnałowych w
odpowiedzi na związanie z receptorem pojedynczej zewnątrzkomórkowej cząsteczki sygnałowej.
Błona
Cząsteczka sygnałowa
Wtórna cząsteczka sygnałowa
Receptor Wzmacniacz
enzymatyczny
Błona
Cząsteczka sygnałowa
Receptor
Wzmacniacz kanałowy
Wtórna cząsteczka sygnałowa
Receptory błonowe korzystające ze wzmacniaczy kanałowych są w istocie kanałami jonowymi
bramkowanymi zewnątrzkomórkową cząsteczką sygnałową. Związanie jednej lub kilku cząsteczek
sygnałowych wywołuje otwarcie kanału i napływ określonych jonów, np. Ca2+, do wnętrza
komórki. W przypadku wzmacniaczy kanałowych stopień wzmocnienia jest zwykle bardzo duży,
gdyż wtórną cząsteczką sygnałową są w tym przypadku jony napływające do komórki.
Wygaszenie sygnału
Związanie cząsteczki sygnałowej z receptorem uruchamia szlak przekazu sygnału. Jednakże,
aby komórka mogła reagować na aktualny stan środowiska sygnał z receptora musi zostać
wygaszony. W przeciwnym razie komórka utraci zdolność reagowania na nowe sygnały. Proces
sygnalizacyjny, którego nie udało się zakończyć we właściwy sposób, może być przyczyną wielu
poważnych chorób, w tym nowotworów.
Część III: Przekazywanie sygnałów
4
Wygaszanie sygnału odbywać się może na trzech poziomach:
1. receptora
2. wzmacniacza
3. wtórnej cząsteczki sygnałowej
Ad.1:
Ponieważ oddziaływanie liganda z receptorem ma charakter równowagowy, więc spadek
stężenia liganda w otoczeniu powoduje jego oddysocjowanie od receptora. W efekcie w receptorze
dochodzi do zmian konformacyjnych przywracających geometrię początkową. Prowadzi to do
zatrzymania pracy wzmacniacza i zaprzestania wytwarzania wtórnej cząsteczki sygnałowej.
Dysocjacja
Fosforylacja
Kinaza receptorowa
Ad.2:
W przypadku niektórych szlaków sygnalizacyjnych wykryto mechanizm wygaszania sygnału
poprzez oddziaływanie na efektywność pracy wzmacniacza. Ten mechanizm regulacyjny zapobiega
nadmiernemu gromadzeniu się wtórnych cząsteczek sygnałowych w przypadku długotrwałego
działania ligandu.
Ad.3:
Przerwanie procesu sygnalizacyjnego na poziomie receptora lub wzmacniacza nie jest
równoznaczne z wygaśnięciem sygnału: w dalszym ciągu w komórce obecne jest duże stężenie
wtórnej cząsteczki sygnałowej. Dlatego każdy proces sygnalizacyjny musi być wyposażony w
mechanizm wygaszania działający na poziomie wtórnej cząsteczki sygnałowej. Wtórne cząsteczki
sygnałowe wytwarzane przez wzmacniacz enzymatyczny są zwykle rozkładane przez inny układ
enzymatyczny działający niezależnie od procesu sygnalizacyjnego. Wtórne cząsteczki sygnałowe o
charakterze jonów są usuwane z komórki na zewnątrz lub gromadzone w odpowiednich organellach
komórkowych do ponownego wykorzystania.
Część III: Przekazywanie sygnałów
5
RReecceeppttoorryy 77TTMM
Największą rodzinę receptorów błonowych stanowią tzw. receptory o siedmiu helisach
transbłonowych, czyli receptory7TM. Białka należące do tej rodziny odpowiedzialne są za
przekazywanie sygnałów zapoczątkowanych przez tak zróżnicowane sygnały jak:
hormony,
neurotransmitery,
bodźce zapachowe i smakowe, oraz
fotony.
Znanych jest kilka tysięcy takich receptorów. Prawie 50% stosowanych leków działa na receptory
tej klasy.
Tak jak wskazuje ich nazwa receptory 7TM zawierają siedem
helis przebijających biwarstwę lipidową błony. Receptory te
nazywane są też receptorami wężykowatymi (serpentynowymi), gdyż
łańcuch polipeptydowy wije się jak wąż w poprzek błony.
Pierwszym białkiem z tej rodziny, dla którego określono strukturę 3D była rodopsyna – białko
odgrywające kluczową rolę w procesie widzenia. Wszystkie poznane dotychczas receptory tej klasy
mają bardzo podobny schemat budowy różniąc się jedynie w szczegółach. Nadrodzinę receptorów
7TM dzieli się na klasy ze względu na budowę cząsteczki sygnałowej.
Wyróżniamy więc receptory:
adrenergiczne
dopaminowe
histaminowe
opioidowe
serotoninowe
muskarynowe
melotaninowe
i szereg innych. Każdy z typów receptorów dzieli się jeszcze na szereg podklas ze względu na efekt
biologiczny jaki wywołuje jego aktywacja. Działanie receptora 7TM omówimy na przykładzie
receptora -adrenergicznego (-AR) i receptora 1-adrenergicznego (1-AR).
Związanie liganda przez receptor 7TM wywołuje zmiany konformacyjne w pętlach
cytoplazmatycznych i na C-końcu łańcucha peptydowego. Szczegóły tych zmian nie są jeszcze w
pełni poznane.
Miejsce wiązania liganda
Część III: Przekazywanie sygnałów
6
Białko G
Z receptorem 7TM związane jest od strony cytoplazmatycznej białko
zwane białkiem G. Jego nazwa pochodzi od tego, że z białkiem tym wiążą się
nukleotydy guanylowe GDP i GTP. Białko G w stanie nieaktywnym jest
heterotrimerem zbudowanym z podjednostek , i . Podjednostka jest
GTPazą i w stanie nieaktywnym związany jest z nią nukleotyd GDP.
Podjednostki i są zakotwiczone w błonie komórkowej poprzez kowalencyjnie
związane z nimi kwasy tłuszczowe.
Stwierdzono, że białko G występować może w wielu izoformach. Obecnie znamy 20
podjednostek , 6 podjednostek i 12 podjednostek . Poznano też strukturę krystalograficzną
niektórych białek G lub ich podjednostek. Wydaje się, że największe znaczenie dla specyficzności
przekazu sygnału ma rodzaj podjednostki . Ma ona wpływ zarówno na typ receptora z którym
wiąże się dane białko G jak i na rodzaj białka enzymatycznego odbierającego i przekazującego dalej
sygnał. Dlatego białka G dzieli się na klasy właśnie ze względu na rodzaj podjednostki . Poniższa
tabela przedstawia główne rodziny białek G.
Podjednostka
Typ receptora Pierwotna cząsteczka
sygnałowa (ligand) Efekt komórkowy
Gs adrenergiczny adrenalina i noradrenalina,
hormony tarczycy,
glukagon,
substancje zapachowe
stymulacja cyklazy adenylanowej, wzrost poziomu cAMP
Gi 2 adrenergiczny acetylocholina,
aminy adrenergiczne,
neuroprzekaźniki
inhibicja cyklazy adenylanowej
Gt rodopsyna foton stymulacja fosfodiesterazy cGMP
Gq 1 adrenergiczny acetylocholina,
aminy adrenergiczne,
neuroprzekaźniki
aktywacja fosfolipazy C, wzrost poziomu IP3 i wewnątrz-komórkowego stężenia jonów Ca2+
G12 trombina,
peptydy chemotaktyczne,
interleukiny
regulacja wzrostu komórki, rozwój embrionalny, aktywacja wymiany Na+/H+, aktywacja fosfolipazy D, apoptoza
Część III: Przekazywanie sygnałów
7
Zmiany konformacyjne w cytoplazmatycznej domenie receptora 7TM powodują aktywację
białka G. Kompleks ligand-receptor oddziałuje z podjednostką katalizując wymianę GDP na
pochodzący z roztworu GTP. Podjednostka związana z GTP odłącza się od dimeru tworząc
odpowiedniego typu białko G.
Pojawienie się w komórce białka G jest równoznaczne z przekazem informacji, że receptor
związał się z pierwotną cząsteczką sygnałową. Przez długi czas uważano, że dimer nie odgrywa
żadnej roli w przekazywaniu sygnału. Obecnie wykazano, że może on wpływać na aktywność
enzymów wytwarzających wtórne cząsteczki sygnałowe. Wpływ ten może być bardzo
zróżnicowany w zależności od konkretnego zestawu izoform. Wydaje się, że pewne zestawy
izoform podjednostek i są nieaktywne, niektóre wpływają na aktywność innego enzymu niż
białko G, a jeszcze inne na ten sam enzym.
GTPGTP +
Aktywacja
Pojedynczy kompleks ligand-receptor może wywołać wymianę nukleotydów i dysocjację setek
heterotrimerów białka G. Zatem już na tym etapie dochodzi do wzmocnienia sygnału.
Receptor -adrenergiczny (-AR)
Jest to poza rodopsyną najlepiej poznany receptor 7TM. Jego
podstawową cząsteczką sygnałową jest adrenalina. Białko G wiążące się
z tym receptorem zawiera podjednostkę typu s. Po aktywacji receptora uwalniane jest więc białko
Gs. Białko Gs stymuluje działanie kolejnego enzymu: cyklazy adenylanowej. Enzym ten
przekształca ATP w cAMP. Białko Gs i cyklaza adenylanowa są związane z
błoną podczas gdy cAMP może przemieszczać się po całej komórce przekazując
sygnał zapoczątkowany związaniem adrenaliny. Tak więc wtórną cząsteczką
sygnałową jest w tym układzie cAMP, a nie białko Gs.
O A
OH
O
P OO
OH
Część III: Przekazywanie sygnałów
8
ATP cAMPATP cAMP
Na etapie cyklazy adenylanowej dochodzi do ponownego wzmocnienia sygnału: jedna
zaktywowana cząsteczka AC może wyprodukować w zasadzie dowolną liczbę cząsteczek cAMP.
Na szczęście w układ ten wbudowany jest wyłącznik czasowy. Białko Gs ma aktywność GTPazy i
po pewnym czasie hydrolizuje związany z nią GTP do GDP.
Cyklaza adenylanowa
Białko Gs zawierające GDP nie ma już powinowactwa do cyklazy i odłącza się od niej. Cyklaza
pozbawiona białka Gs podlega zmianom konformacyjnym, które powodują przejście w stan
nieaktywny i utratę aktywności enzymatycznej. Białko Gs(GDP) wiąże się z dimerem
odtwarzając kompletne białko G. Wiąże się ono następnie z receptorem -AR i komórka gotowa
jest na odbiór kolejnego sygnału. Przedstawione powyżej losy białka G noszą nazwę cyklu białka G.
Cyklaza adenylanowa
W komórkach występuje kilkanaście odmian cyklazy adenylanowej. Wszystkie one są
białkami błonowymi zawierającymi 12 helis transbłonowych i dwie duże domeny
Część III: Przekazywanie sygnałów
9
cytoplazmatyczne. Poszczególne izoformy AC różnią się efektywnością katalityczną i wrażliwością
na czynniki modulujące tą efektywność. Występuje ponadto duże zróżnicowanie tkankowe
zawartości poszczególnych izoform cyklazy adenylanowej. Umożliwia to zróżnicowaną odpowiedź
poszczególnych tkanek na pojawienie się tego samego liganda.
CAMP jako wtórna cząsteczka sygnałowa
Wywołany aktywnością enzymatyczną AC wzrost tężenia cAMP wywołuje w komórce
wiele różnorodnych zmian. Rodzaj i zakres tych zmian zależy przede wszystkim od typu komórki
(nabłonkowa, mięśniowa, nerwowa, itd.), ale również od aktualnego stanu komórki (etap cyklu
komórkowego) oraz aktywności innych szlaków sygnałowych. Do typowych zmian wywołanych
podwyższeniem wewnątrzkomórkowego stężenia cAMP należą np.:
przyspieszenie rozpadu substancji zapasowych
zwiększenie wydzielania soków żołądkowych
zmniejszenie agregacji płytek krwi
zmiana stopnia fosforylacji białek cytoszkieletu
otwarcie niektórych kanałów jonowych
i wiele innych. Jest przy tym charakterystyczne, że większość zmian (poza otwarciem kanałów
jonowych) związana jest z fosforylacją określonych białek. Rodziną enzymów, których aktywność
bezpośrednio zależy od poziomu cAMP okazały się kinazy białkowe typu A (PKA). Kinazy te są
więc ostatnim, efektorowym etapem szlaku sygnałowego zapoczątkowanego związaniem się
ligandu z receptorem -AR.
Kinazy białkowe typu A (PKA)
Poszczególne enzymy z tej klasy fosforylują grupy hydroksylowe w łańcuchach bocznych
seryny i treoniny wybranych białek. Specyficzność substratowa PKA nie jest zbyt duża, więc
regulacja aktywności tych enzymów odbywa się m.in. przy pomocy tzw. białek kotwiczących PKA
określanych terminem AKAP (ang. A Kinase Anchoring Proteins). Różne typy białek kotwiczących
są przypisane do określonych kompartmentów komórki. AKAP mają zdolność wiązania się z PKA
bez zmiany aktywności tej ostatniej. Można przypuszczać, że fosforylacji będą ulegały przede
wszystkim białka znajdujące się w bezpośrednim sąsiedztwie AKAP, a tym samym i PKA.
Ufosforylowanie białek będących substratami PKA zmienia ich aktywność enzymatyczną
lub powinowactwo do innych białek. Zmiana ta ma przy tym charakter trwały: jest wynikiem
utworzenia wiązania kowalencyjnego a nie równowagowych oddziaływań fizykochemicznych. Z
punktu widzenia zasad teorii sterowania nie jest to rozwiązanie poprawne, gdyż uniemożliwia
Część III: Przekazywanie sygnałów
10
powrót do stanu wyjściowego. Tym samym układ nie byłby w stanie reagować poprawnie na
kolejne sygnały docierające szlakiem sygnałowym. Układy żywe nie mogą sobie pozwolić na taką
sytuację, gdyż grozi ona śmiercią komórki. W przypadku efektu działania kinaz białkowych A rolę
strażnika przywracającego (a przynajmniej starającego się przywrócić) stan początkowy pełnią
fosfatazy białkowe. Enzymy te odcinają hydrolitycznie grupy fosforanowe wprowadzone przez
kinazy.
Fosfatazy te są na tyle wydajne, że w przypadku braku aktywności szlaku sygałowego w krótkim
czasie przywracają niski stopień fosforylacji. Zależność wielkości efektu
końcowego pobudzenia receptora od wydajności dwóch przeciwstawnych
reakcji enzymatycznych (fosforylacja defosforylacja) jest bardzo
korzystna z punktu widzenia teorii sterowania. Regulowany układ znajduje
się bowiem w stanie równowagi chwiejnej (jak waga szalkowa) i podobnie
jak ona jest bardzo wrażliwy na niewielkie nawet zmiany „obciążenia” po
każdej ze stron.
Wygaszanie sygnału na poziomie cAMP
Jeżeli dany szlak sygnałowy ma służyć do regulacji układu (np. komórki) w czasie
rzeczywistym, to musi dysponować mechanizmami wygaszania sygnału na każdym etapie szlaku
sygnałowego pomiędzy receptorem i efektorem. Dotyczy to również wtórnej cząsteczki sygnałowej,
w tym przypadku cAMP.
ATP cAMP + PPi 5’-AMPAC PDE
ATP cAMP + PPi 5’-AMPAC PDE
Za rozkład cAMP odpowiedzialne są w komórce fosfodiesterazy cyklicznych nukleotydów, PDE.
Enzymy te hydrolizują cykliczny 3’,5’-adenozynomonofosforam do 5’-
adenozyno monofosforanu. Aktualny poziom cAMP zależy więc od szybkości
dwóch przeciwstawnych procesów: cyklizacji i hydrolizy. Jest to kolejny
przykład zastosowania w układzie regulacji zasad równowagi chwiejnej.
Chociaż formalnie na aktualne stężenie cAMP ma wpływ szybkość obu konkurencyjnych reakcji, to
jednak w większości znanych przypadków wykorzystania cyklicznych nukleotydów jako wtórnych
cząsteczek sygnałowych decydującą rolę odgrywa szybkość biosyntezy. Jedynie w przypadku szlaku
sygnałowego rodopsyny za szybkie zmiany poziomu cGMP odpowiada PDE bezpośrednio zależny
od poziomu pobudzenia receptora (natężenia światła).
Część III: Przekazywanie sygnałów
11
Receptor 1-adrenergiczny (1-AR)
Jest to receptor pobudzający, który po związaniu liganda wywołuje nagłe zwiększenie
stężenia jonów wapniowych w cytoplazmie. Receptory 1-AR biorą udział w regulacji wielu funkcji
fizjologicznych, takich jak ciśnienie tętnicze krwi, skurcz mięśni gładkich, pobieranie pokarmów
czy poprawa nastróju. Ten ostatni efekt związany jest z faktem, że receptory te występują w dużych
ilościach w większości rejonów mózgu.
Receptor 1-AR pobudzany być może przez wiele ligandów. Znajdują się wśród nich aminy
adrenergiczne (adrenalina, noradrenalina), ale również acetylocholina i niektóre inne
neuroprzekaźniki. Białka G związane z tym receptorem mają podjednostkę należącą do typu q.
Powstające po aktywacji receptora białko Gq, w odróżnieniu od białka Gs, oddziałuje z dwoma
białkami wzmacniającymi sygnał:
z fosfolipazą C (PLC) w wyniku czego uruchomiona zostaje tzw. kaskada fosfoinozytolowa,
oraz z
błonowym kanałem wapniowym uruchamiającym napływ Ca2+ do cytoplazmy.
Kaskada fosfoinozytolowa
Substratami fosfolipazy C są fosfoinozytydy o różnym stopniu ufosforylowania:
fosfatydyloinozytol (PI), fosfatydyloinozytylo(4)fosforan (PIP) oraz fosfatydyloinozytylo(4,5)bis-
fosforan (PIP2).
O
OO
O
OP
O
O
O
OH
OH
OH OH
OH
-
PI
O
OO
O
OP
O
O
O
OH
O
OH OH
OHPO3
2-
PIP
O
OO
O
OP
O
O
O
OH
O
OH OH
OPO3
PO3
2-
2-
PIP2
W wyniku hydrolizy wszystkich trzech lipidów powstaje ta sama wtórna cząsteczka sygnałowa:
1,2-diacyloglicerol (DAG). W odróżnieniu od wtórnej cząsteczki sygnałowej szlaku -AR (cAMP)
DAG nie dyfunduje w cytoplazmie, lecz pozostaje w biwarstwie lipidowej.
Część III: Przekazywanie sygnałów
12
O
OO
O
OH
DAG
O
OH
O
OH OH
OPO3
PO3
O3P2-
2-
2-
IP3
W szlaku sygnałowym receptora 1-AR istotne znaczenie mają procesy fosforylacji-
defosforylacji lipidów inozytolowych. Jeżeli substratem PLC jest PIP2, to poza DAG powstaje
druga wtórna cząsteczka sygnałowa: inozytolo(1,4,5)trifosforan (IP3). IP3 jest klasyczną wtórną
cząsteczką sygnałową i może swobodnie dyfundować w cytoplazmie. PIP2 powstaje z PI w wyniku
dwukrotnej fosforylacji: początkowo przez kinazę PI, a następnie przez kinazę PIP. Znany jest
również katalizowany enzymatycznie proces defosforylacji prowadzący od PIP2 do PI. Tak więc
komórka może, kontrolując stężenia poszczególnych substratów fosfolipazy C, kontrolować relację
pomiędzy ilością obu wtórnych cząsteczek sygnałowych.
Obydwie wtórne cząsteczki sygnałowe mają w szlaku przekazywania sygnału diametralnie
różne cele molekularne. Okazuje się jednak, że pomimo tego pomagają sobie wzajemnie w
osiągnięciu celu końcowego: uaktywnieniu efektora tego szlaku którym jest kinaza białkowa C
(PKC).
Diacyloglicerol (DAG)
DAG bierze udział w bezpośredniej aktywacji kinazy białkowej C (PKC) pozostając cały
czas składnikiem wewnątrzkomórkowej części biwarstwy lipidowej. Jest to więc bardzo
specyficzna wtórna cząsteczka sygnałowa.
A jednak również ona podlega takim samym prawom jak wszystkie inne cząsteczki sygnałowe.
Między innymi musi zostać wygaszony związany z nią szlak sygnałowy.
Część III: Przekazywanie sygnałów
13
Kwas fosfatydylowy
Diacyloglicerol (DAG)
Kwas tłuszczowy
Kwas tłuszczowy
Glicerol
Znamy dwie drogi modyfikacji diacylogliceroli prowadzące do utraty przez nie roli wtórnej
cząsteczki sygnałowej. Pierwsza z nich polega na estryfikacji grupy hydroksylowej glicerolu resztą
kwasu fosforowego z utworzeniem kwasu fosfatydylowego. Może on być następnie
wykorzystywany jako substrat do biosyntezy fosfolipidów błon komórkowej.
Druga droga jest przeciwstawna i polega na hydrolizie, w wyniku której powstają dwie cząsteczki
kwasów tłuszczowych i glicerol.
Stwierdzono, że czynnikiem aktywującym kinazę białkową C mogą być również niektóre
silnie lipofilowe ksenobiotyki, czyli związki obce dla komórki. Ksenobiotykami takimi są np. estry
forbolu – znane od dawna silne związki rakotwórcze. Obecnie przypuszcza się, że wywołują one
proces nowotworzenia na skutek niekontrolowanego, długotrwałego pobudzania PKC.
Kinaza białkowa C (PKC)
Dotychczas znaleziono kilkanaście izoform PKC rozmieszczonych w sposób zróżnicowany
w określonych przedziałach (kompartmentach) komórkowych różnych tkanek. Również aktywacja i
dezaktywacja izoform PKC zależna jest lokalizacji w komórce i od rodzaju komórki. Zaktywowana
kinaza C fosforyluje grupy hydroksylowe reszt seryny i treoniny w różnorodnych białkach,
najprawdopodobniej przede wszystkim tych które występują w tym samym kompartmencie.
Kinazy białkowe działają w dwóch skalach czasowych. Krótkotrwała stymulacja enzymów z tej
klasy skutkuje przede wszystkim uaktywnieniem białek odpowiedzialnych za efekty krótkotrwałe:
Część III: Przekazywanie sygnałów
14
napływ jonów, sekrecja wewnątrz- i zewnątrzkomórkowych cząsteczek sygnałowych). Jeżeli jednak
stymulacja będzie długotrwała, to uruchomione zostaną mechanizmy regulujące procesy
długookresowe: różnicowanie i proliferacja komórek, zmiany nowotworowe, itp. PKC może
specyficznie regulować tak różnorodne procesy komórkowe wynika jak się zdaje z faktu, że
poszczególne izoformy i ich specyficzne substraty (enzymy podlegające fosforylacji) występują w
określonych przedziałach komórkowych.
W stanie nieaktywnym PKC jest białkiem rozpuszczalnym występującym w cytoplazmie
komórki. Aktywacja kinaz należących do tej rodziny połączona jest ze związaniem się enzymu z
błoną komórkową. Wynika to z faktu, że podstawowa cząsteczka sygnałowa odpowiedzialna za
aktywację PKC jest składnikiem błony – jest nią diacyloglicerol (DAG). Dla uzyskania pełnej
aktywności PKC wymaga ponadto odpowiednio wysokiego stężenia jonów wapnia. Jony te są
niezbędne dla utworzenia kolejnego połączenia z błoną poprzez oddziaływanie z fosfatydyloseryną
(PS).
Wszystkie poznane dotychczas izoformy PKC są enzymami
wielodomenowymi. We wszystkich wyróżnić można:
domenę katalityczną, (K)
2 domeny wiążące DAG, (C1)
domenę wiążącą PS i Ca2+, (C2)
domenę pseudosubstratu, (S)
W cytoplazmie, w konformacji nieaktywnej, miejsce katalityczne enzymu jest zablokowane
N-końcowym fragmentem łańcucha spełniającym rolę pseudosubstratu. Ma on
sekwencję rozpoznawaną jako substrat: –A-R-K-G-A-L-R-Q-K–, jednak w
miejscu seryny lub treoniny występuje alanina. Fragment taki łączy się z
miejscem katalitycznym enzymu, jednak fosforylacja nie może zajść z powodu
braku grupy hydroksylowej.
Domeny C1 zawierają po dwa bogate w cysteinę „palce cynkowe”, które mogą
wiązać się do znajdujących się w błonie dwóch cząsteczek diacyloglicerolu.
Domena C2 wiąże się z zawartą w błonie fosfatydyloseryną. Wiązanie to wymaga związania się z
enzymem dwóch kationów wapniowych i zachodzi tylko w obecności dostatecznie wysokiego
stężenia tych jonów.
Związanie domen C1 i C2 z błoną komórkową wywołuje globalną zmianę konformacyjną
całego białka. W wyniku tej zmiany domena pseudosubstratu nie może już przesłaniać miejsca
katalitycznego, co powoduje uczynnienie domeny katalitycznej:
(K)
(S)
(C2)
(C1A) (C1B)
(K)
(S)
(C2)
(C1A) (C1B)
Zn2+
Miejscewiążące DAG
Zn2+
Miejscewiążące DAG
Część III: Przekazywanie sygnałów
15
DAG Ca2+DAG Ca2+
Inozytolo(1,4,5)trifosforan (IP3)
IP3 uwolniony podczas hydrolizy PIP2 łączy się z wewnątrzkomórkowym receptorem
błonowym zlokalizowanym w błonie siateczki śródplazmatycznej (reticulum endoplazmatycznego).
Receptor ten jest w zasadzie kanałem wapniowym bramkowanym IP3. W wyniku tego połączenia
kanał wapniowy zostaje otwarty i gwałtownie wzrasta cytoplazmatyczne stężenie jonów Ca2+.
Obecnie znanych jest kilka typów receptorów IP3 i uważa się, że biorą one udział w rozwoju sieci
połączeń neuronalnych i ich plastyczności.
Pokazaliśmy już powyżej, przy omawianiu szlaku receptora -adrenergicznego, że każdy etap
przekazywania sygnału musi dysponować mechanizmem wygaszania. W przypadku IP3 wygaszanie
sygnału polega na stopniowej defosforylacji, aż do poziomu samego inozytolu. Inozytol
wykorzystywany jest następnie do resyntezy fosfatydyloinozytolu (PI).
Jony wapnia jako uniwersalna wtórna czasteczka sygnałowa
Jony wapnia są w komórkach eukariotycznych bardzo często wykorzystywane jako wtórne
cząsteczki sygnałowe. W niepobudzonych komórkach typowy poziom cytozolowego Ca2+ wynosi
ok. 100 nM podczas gdy w osoczu krwi ok. 5 mM. W niektórych organellach komórkowych jest
nawet większy, np. w reticulum endoplazmatycznym. Ten stromy gradient transbłonowy stwarza
możliwość gwałtownego podwyższenia lokalnego stężenia tych jonów. Osiągane to jest zwykle
przez otwarcie kanałów wapniowych zlokalizowanych w błonie komórkowej lub błonie reticulum.
Niskie cytozolowe stężenie jonów wapnia jest osiągane dzięki dwom bardzo wydajnym systemom
usuwania Ca2+ z komórki. Jest to napędzana hydrolizą ATP pompa wapniowa oraz antyport
sodowo-wapniowy.
W zrozumieniu roli jaką pełnią jony wapnia w procesach komórkowych bardzo pomogło
zastosowanie odczynników specyficznie wiążących się z tym jonem. Znane są bardzo specyficzne
jonofory wapniowe które po wniknięciu do błony komórkowej pozwalają szybko zwiększyć
cytozolowe stężenie Ca2+.
Część III: Przekazywanie sygnałów
16
Obniżenie stężenia dostępnego Ca2+, nawet do poziomu poniżej kilku nM, można z kolei uzyskać
wprowadzając do komórki wybiórcze związki kompleksujące. Ich obecność w cytoplazmie
zapobiega wzrostowi poziomu wolnego wapnia po otwarciu kanałów wapniowych.
Do monitorowanie stężenia wolnego Ca2+ w poszczególnych
częściach komórki oraz jego zmian po zadziałaniu określonych
bodźców wykorzystuje się fluorochromy będące jednocześnie
kompleksonami jonów wapnia. W przypadku takich fluorochromów
intensywność i barwa emitowanego światła zależy od stężenia jonów
wapnia. Zakres monitorowanego stężenia rozciąga się od
nanomolarnego do mikromolarnego. Zdjęcie obok pokazuje
mikrofotografię komórki nerwowej wybarwionej fluorochromen
wrażliwym na stężenie jonów Ca2+: kolor czerwony – wysokie
stężenie, kolor niebieski – niskie.
Jony wapnia łatwo i silnie oddziałują z wieloma białkami dzięki tworzeniu kompleksów. W
kompleksach tych jon Ca2+ jest kompleksowany przez 6 atomów tlenu pochodzących zarówno z
wiązań amidowych jak i zdysocjowanych grup karboksylowych. Zdolność tego jonu do
równoczesnego oddziaływania z wieloma atomami tlenu pozwala mu na sieciowanie różnych
segmentów białka i indukowanie dużych zmian konformacyjnych.
Pierwszym białkiem wiążącym jony wapnia którego strukturę 3D poznano była parwoalbumina.
Zawiera ona dwa podobne miejsca wiążące Ca2+ utworzone przez dwie helisy i łączącą je pętlę.
Każdy jon skoordynowany jest siedmioma atomami tlenu pochodzącymi z:
grup karboksylowych 3 reszt asparaginianu
grupy karboksylowej glutaminianu (obydwa atomy tlenu tej grupy)
wiązania peptydowego
cząsteczki wody związanej z jonem.
Część III: Przekazywanie sygnałów
17
Jon wapnia wiąże się z pętlą łączącą helisy E i F tego białka
ustawione tak jak palec wskazujący i kciuk prawej dłoni.
Strukturę tą nazwano motywem dłoni EF. Obecnie wiadomo, że
ten motyw strukturalny występuje w wielu białkach wiążących
Ca2+. Odpowiada mu bardzo charakterystyczna sekwencja
aminokwasowa. Wykryto ja dotychczas w ponad 100 białkach.
Kalmodulina
Prawie we wszystkich komórkach eukariotycznych funkcję podstawowego czujnika stężenia
jonów wapniowych pełni kalmodulina, CaM. Należy ona do białek zawierających motyw dłoni EF i
zawiera 4 takie miejsca wiązania. Gdy poziom jonów wapnia przekroczy 500 nM kalmodulina
osiąga stan wysycenia i białko ulega znacznym zmianom konformacyjnym. Zmiany te powodują
odsłonięcie powierzchni hydrofobowych poprzez które CaM może się teraz wiązać z innymi
białkami.
Kompleks Ca2+-CaM stymuluje szeroki wachlarz enzymów spośród których nas interesować
będą przede wszystkim kinazy białkowe zależne od kalmoduliny (kinazy CaM). Kinazy te regulują:
metabolizm substratów energetycznych
przepuszczalność jonową błon biologicznych
syntezę i uwalnianie neurotransmiterów
itp.
Kinazy białkowe jako efektory szlaków sygnałowych opartych na białku G
Cechą charakterystyczną szlaków sygnałowych opartych na receptorach 7TM i białku G jest
fakt, że efektorami tych szlaków są kinazy białkowe regulujące aktywność enzymów lub strukturę i
funkcję białek strukturalnych i motorycznych.
Widać to wyraźnie na przykładzie omówionych powyżej szlaków sygnałowych aktywowanych
receptorami adrenergicznymi. W szlaku receptora -AR wtórna cząsteczka sygnałowa (cAMP)
aktywuje kinazy białkowe A. W szlaku receptora 1-AR dochodzi do aktywacji dwóch klas kinaz
białkowych. Diacyloglicerol przy współudziale jonów wapnia aktywuje kinazy białkowe C, a
związana z jonami wapnia kalmodulina aktywuje kinazy CaM zależne.
Jest przy tym interesujące, że w kilku przypadkach wykazano, że substratem kinaz mogą być
białka wchodzące w skład szlaków sygnałowych. Jeżeli dotyczy to tego samego szlaku, to
występuje zjawisko ujemnego sprzężenia zwrotnego. Sprzężenie takie stanowi swoisty bezpiecznik
zapobiegający nadmiernej lub zbyt długotrwałej aktywacji danego szlaku.
Część III: Przekazywanie sygnałów
18
Jeżeli fosforylacja dotyczy białek innego szlaku, to dochodzi do sprzęgania szlaków sygnałowych:
aktywność jednego szlaku zależy od stopnia pobudzenia innego szlaku. Powstaje w ten sposób
skomplikowana sieć sprzęgniętych szlaków sygnałowych umożliwiająca bardzo precyzyjna
regulację homeostazy komórki.
Receptor 7TM
Białko GCyklaza
adenylowa
FosfolipazaC
Kinazabiałkowa A
cAMP
fosforylacja
białek
PIP2 [Ca+2]IP3
DAG
Kinazabiałkowa C
kalmodulina KinazaCaM
sygnał
fosforylacja
białek
fosforylacja
białek
Receptor 7TM
Białko GCyklaza
adenylowa
FosfolipazaC
Kinazabiałkowa A
cAMPcAMP
fosforylacja
białek
fosforylacja
białek
PIP2PIP2 [Ca+2]IP3
DAG
Kinazabiałkowa C
kalmodulinakalmodulina KinazaCaM
sygnał
fosforylacja
białek
fosforylacja
białek
fosforylacja
białek
fosforylacja
białek
Sprzęganie szlaków na etapie białek G (cross-talk)
Poza sprzęganiem szlaków sygnałowych na poziomie efektorowym stwierdzono
występowanie sprzężeń również na etapie pierwszego wzmocnienia, czyli białek G. Najlepiej
poznano to zjawisko dla receptorów adrenergicznych, chociaż istnieją również dowody na istnienie
podobnych sprzężeń pomiędzy innymi szlakami sygnałowymi.
Aktualnie receptory adrenergiczne dzieli się na trzy duże rodziny:
receptory 1-AR uruchamiające szlak sygnałowy prowadzący do aktywacji kinaz
białkowych C oraz kinaz CaM
receptory 2-AR hamujące aktywność cyklazy adenylanowej i dezaktywujące kinazy
białkowe A
receptory -AR aktywujące cyklazy adenylanowe i kinazy białkowe A
Wszystkie te receptory są receptorami 7TM, lecz wykorzystują odmienne izoformy G. Pobudzone
receptory 1-AR uwalniają białko Gq, receptory 2-AR białko Gi, a receptory -adrenergiczne
białko Gs.
Część III: Przekazywanie sygnałów
19
Białko Gs aktywuje cyklazę adenylanową odpowiedzialną za wytwarzanie cAMP. Na cyklazę
działa również białko Gi, jednakże działa hamująco. Tak więc cyklaza jest miejscem sprzężenia
szlaków sygnałowych wywodzących się od receptorów - i 2-adrenergicznych. Sprzężenie to
pozwala bardzo precyzyjnie regulować cytozolowe stężenie cAMP. Tak starannie regulowany
poziom cAMP reguluje z kolei aktywność kinaz białkowych typu A.
-AR 2-AR 1-AR
Gs + Gi + Gq +
+ -
Cyklaza adenylanowa
Kinaza białkowa A
cAMP
+ +
- Fosfolipaza C
PIP2
DAG IP3
Szlak sygnałowy receptora 1-AR rozpoczyna się od aktywacji fosfolipazy C przez białko Gq.
Fosfolipaza ta uwalnia dwie cząsteczki sygnałowe: diacyloglicerol (DAG) i inozytolotrifosforan
(IP3). Jej aktywność zależy jednak nie tylko od stężenia Gq. Wykazano, że białko to jest substratem
niektórych kinaz białkowych typu A. Fosforylacja fosfolipazy C prowadzi do znacznego
zmniejszenia jej powinowactwa do białka aktywującego Gq, a tym samym do jej dezaktywacji. Tak
więc fosfolipaza C jest punktem sprzężenia wszystkich trzech szlaków sygnałowych receptorów
adrenergicznych.
W niektórych komórkach stwierdzono ponadto istnienie bezpośredniego sprzężenia szlaków
inicjowanych przez receptory 1 i 2. Wykazano mianowicie, że dimer podjednostek powstający
po pobudzeniu receptora 2-AR aktywuje fosfolipazę C równie skutecznie jak białko Gq. Tym
samym szlak receptora 1-AR sprzęgnięty jest dwukrotnie ze szlakiem receptora 2-AR. Pierwsze
sprzężenie, aktywujące - poprzez dimer , jest bezpośrednie i przejawia się od razu. Drugie
sprzężenie, hamujące - poprzez kinazę białkową A, przejawia swoje istnienie dopiero po pewnym
Część III: Przekazywanie sygnałów
20
czasie. Celem tego sprzężenia jest najprawdopodobniej wygaszenie zbyt długotrwałego pobudzenia
szlaku receptora 1.
SSzzllaakkii ssyyggnnaałłoowwee zz kkaasskkaaddąą ffoossffoorryyllaaccjjii
Szlaki sygnałowe omówione powyżej prowadziły do aktywacji kinaz białkowych będących
ostatnim, efektorowym etapem szlaku. Istnieją również szlaki które są inicjowane przez receptory
zawierające kinazę białkową w swojej strukturze. Aktywacja takich receptorów uruchamia szereg
następujących po sobie etapów fosforylacji, z których dopiero ostatni dotyczy fosforylacji
cząsteczek wykonawczych. Typowe elementy takich szlaków i stosowane mechanizmy ich regulacji
omówimy na kilku poniższych przykładach.
Receptor ludzkiego hormonu wzrostu
Jako pierwszy przykład rozważmy receptor ludzkiego hormonu wzrostu.
Sam hormon wzrostu jest białkiem monomerycznym zawierającym 217
aminokwasów. Ma postać zwartej struktury zawierającej wiązkę 4 ściśle
przylegających helis.
Receptor hormonu wzrostu składa się z 638 aminokwasów, które tworzą:
domenę zewnatrzkomórkową (ok. 250 aminokwasów)
pojedynczą helisę transbłonową
domenę wewnątrzkomórkową (ok. 350 aminokwasów).
W nieobecności hormonu receptor występuje w błonie w postaci monomeru. Hormon wiąże się
początkowo z domeną zewnątrzkomórkową pojedynczej cząsteczki receptora. Powstały kompleks
ma duże powinowactwo do kolejnej cząsteczki receptora. Powstaje dimer receptora zawierający
pojedynczą cząsteczkę hormonu (pierwotnej cząsteczki sygnałowej).
Dimeryzacja domen zewnątrzkomórkowych receptora prowadzi do zetknięcia się domen wewnątrz-
komórkowych. W receptorach tego typu z każdą z domen wewnątrzkomórkowych zasocjowana jest
czasteczka nieaktywnej kinazy białkowej. W przypadku receptora ludzkiego hormonu wzrostu jest
to tzw. kinaza janus 2 (JAK 2).
Część III: Przekazywanie sygnałów
21
Kinaza Janus (JAK2)
Kinazy Janus wykazują budowę modułową i zawierają 4 domeny. Na C-końcu znajduje się
domena kinazowa. Jej sekwencja aminokwasowa i właściwości biochemiczne pozwalają zaliczyć ją
do rodziny kinaz tyrozynowych. Obok niej znajduje się domena o dużym podobieństwie
sekwencyjnym do domeny kinazowej. Jednak niektóre kluczowe aminokwasy są w niej zmienione.
Nie do końca zbadane są również właściwości katalityczne tej domeny.
Domena kinazowa
Domena podobna do kinazowej
ERM SH2
Na N-końcu kinazy znajduje się domena ERM odpowiedzialna za zakotwiczenie enzymu w błonie
komórkowej. Bardzo charakteryztyczna jest kolejna domena, tzw. domena SH2. Domenami SH2
nazywamy fragmenty białek wiążące ufosforylowaną tyrozyną. W JAK2 domena ta składa się z ok.
100 aminokwasów
Aktywowana kinaza JAK
Fosforylacja krzyżowa
Dimeryzacja indukowana przez hormon
Wiązanie hormonu wzrostu do receptora prowadzi do jego dimeryzacji w wyniku której
dochodzi do zbliżenia kinaz JAK z obu receptorów. Powoduje to umieszczenie pętli aktywacji
jednej kinazy w centrum katalitycznym drugiej, co w efekcie prowadzi do fosforylacji obu kinaz
JAK2. Zaktywizowane kinazy pozostają związane z receptorem. Po aktywacji przez fosforylację
krzyżową JAK2 może fosforylować inne substraty białkowe.
Domeny SH2
W przypadku receptora hormonu wzrostu zaktywowana kinaza JAK fosforyluje
przynajmniej dwa ważne białka: i) regulator ekspresji genów nazywany STAT5 oraz ii) sam
receptor hormonu wzrostu.
Funkcja regulatora STAT5 polega na przekazaniu sygnału z cytoplazmy do jądra i aktywacji
określonych genów. W białku STAT5 fosforylacji ulega reszta tyrozyny położona w pobliżu N-
Część III: Przekazywanie sygnałów
22
końca. Powstała fosfotyrozyna wiąże się z domeną SH2 drugiej cząsteczki STAT5. Powstaje w ten
sposób bardzo stabilny dimer STAT5.
Monomery STAT
Dimer STAT zdolny do wiązania DNA
JAK 2
1. fosforylacja Tyr
2. wiązanie SH2 z fosfotyrozyną
Białko STAT5 w postaci dimeru przemieszcza się do jądra komórkowego, gdzie wiąże się do
swoistych miejsc na DNA i reguluje ekspresję genów.
Fosforylacja receptora hormonu wzrostu ma dwa skutki, obydwa wynikające z powstania
reszty fosfotyrozyny. Po pierwsze, ufosforylowany receptor kotwiczy do siebie kinazę JAK2
poprzez jej domenę SH2. Po drugie, powstała fosfotyrozyna może wiązać inne białka zawierające
domeny SH2, nawet takie których powinowactwo do nieufosforylowanego receptora jest niewielkie.
Powstają w ten sposób nowe receptor hormonu wzrostu o odmiennych szlakach przekazywania
sygnału.
Receptorowe kinazy tyrozynowe
Niektóre białkowe czynniki wzrostu takie jak insulina, czynnik wzrostu naskórka (EGF) czy
płytkopochodny czynnik wzrostu (PDFG) wiążą się z receptorami błonowymi o bardzo specyficznej
budowie. Receptory te zawierają domenę kinazy tyrozynowej jako integralny fragment części
wewnątrzkomórkowej receptora. Wydaje się, że w komórkach niektórych organizmów doszło w
trakcie ewolucji do fuzji genów kodujących receptor i kinazę sygnałową. Powstały w ten sposób
receptorowe kinazy tyrozynowe (RTK).
Mechanizm przekazywania sygnału występujący w receptorowych kinazach tyrozynawych
jest bardzo podobny do omówionego powyżej szlaku inicjowanego przez receptor hormonu
wzrostu.
Część III: Przekazywanie sygnałów
23
Domena zewnątrz-
komórkowa
Domena wewnątrz-
komórkowa
Omówimy go pokrótce poniżej na przykładzie receptora naskórkowego czynnika wzrostu (EGF).
Receptor EGF jest pojedynczym łańcuchem polipeptydowym składającym się z prawie 1200
aminokwasów. W formie wolnej występuje jako monomer pozbawionym aktywności
enzymatycznej. Związanie hormonu (po jednym na każdy receptor) powoduje jego dimeryzację a
następnie krzyżową fosforylację. W tej formie do reszt fosfotyrozyny receptora przyłącza się
poprzez swoje domeny SH2 białko adaptorowe Grb-2. Następnie do bogatych w prolinę obszarów
Grb-2 wiąże się białko Sos, a do niego kolejne białka szlaku sygnałowego.
Małe białka G
Inną ważną rodziną białek sygnałowych są tzw. małe białka G. Są to monomeryczne, małe
białka o aktywności GTPazowej. W odróżnieniu od omawianych poprzednio heterotrimerycznych
białek G zawierają one tylko jedną podjednostkę. Podobnie jak klasyczne białka G małe białka G
również cyklicznie zmieniają formę aktywną związaną z GTP, na nieaktywną związaną z GDP i z
powrotem. Małe białka G stanowią ogromną rodzinę białek podzieloną na podrodziny: Ras, Rho,
Arf, Rab i Ran. Każda z nich odpowiedzialna jest za regulację odmiennych procesów
zapewniających rozwój i homeostazę komórki.
Podrodzina Funkcja
Ras Reguluje wzrost komórki za pośrednictwem serynowo-treoninowych kinaz
białkowych
Rho Reorganizuje cytoszkielet za pośrednictwem serynowo-treoninowych kinaz
białkowych
Arf Reguluje szlaki wydzielania pęcherzyków, aktywuje fosfolipazę D
Rab Odgrywa główną rolę w szlakach wydzielniczych i endocytozie
Ran Uczestniczy w transporcie RNA i białek do i z jądra komórkowego
Heterotrimeryczne i małe białka G są spokrewnione ewolucyjnie. Małe białka G mają wiele
motywów strukturalnych wspólnych z podjednostkami G. Podobieństwa można również dostrzec
w mechanizmach przekazywania sygnału.
Część III: Przekazywanie sygnałów
24
Domena wewnątrz-
komórkowa
Domena zewnątrz-
komórkowa
Aktywowany Ras
Podstawowa różnica dotyczy sposobu aktywacji tych białek. Przypomnijmy, że podjednostka G
aktywowana jest zmianami konformacyjnymi receptora 7TM występującymi po związaniu liganda.
W przypadku małych białek G aktywacja jest wynikiem związania się z białkami szlaku
sygnałowego takimi jak białko Sos, omówione powyżej. Białko Sos jest określane czasami jako
czynnik wymiany nukleotydów guaninowych, gdyż jego oddziaływanie z małymi białkami G polega
na przyspieszeniu wymiany GDP na GTP. Zaktywowane w ten sposób białko Ras oddziałuje z
następnymi elementami szlaku sygnałowego, np. kinazami białkowymi, które w ten sposób
aktywuje.
Podobnie jak G, małe białka G wykazują aktywność GTPazową, która służy do wygaszenia
sygnału. Samoistna aktywność GTPazowa małych białek G jest niewielka, może jednak ulec
zwiększeniu pod wpływem związania białek pomocniczych GAP. Tak więc współdziałanie białka
Sos i białek GAP dostrajają szybkość obrotów małych białek G do aktualnych potrzeb komórki.