Forenzicka DNK Analiza

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    1/36

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    2/36

    Dezoksiribonukleinska kiselina

    (DNK)

    Otkrice- Friedrich Miescher 1869.

    Phoebus Levene 1919.: DNK se sastoji od

    azotne baze, ecera i fosfatne jedinice.

    Watson & Crick 1953. Struktura DNK.

    TIPOVI DNKnuklearna (jedarna) DNKnDNK (3109bp)mitohondrijalna DNKmDNK (16649 bp)

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    3/36

    A

    Struktura DNK

    Dvostruki polinukleotidni lanacnukleotid

    nukleozid

    a. baza

    T

    G C

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    4/36

    ORGANIZACIJA DNK U CELIJI

    centromera

    telomera

    p

    qhromatide

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    5/36

    Delovi DNK koji sadre informacijuneophodnu za sintezu proteina nazivaju se

    geni.Samo oko 5 % DNK sadri ovakveinformacije.

    Mesto na DNK na kojem je smeten gennaziva se lokus

    Sestrinske hromatide sadre kopije istoggena (alele), koji se mogu biti istovetne

    (homozigot) ili razlicite (heterozigot)

    Delovi DNK koji se nalaze izmedju genskihlokusa nazivaju se introni

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    6/36

    VNTR DNK

    Satelitska DNK (2-100 bp sa ponavljanjemvie od 1000 puta)

    Minisatelitska DNK (9-100 bp saponavljanjem od 10 do 100 puta)

    Kratki tandemski ponovci (STR, 3-5 bp saponavljanjem od 10 do 100 puta)

    Mikrosateliti (1-2 bp sa ponavljanjem od10 do 100 puta)

    Alurepovi (1-5 bp sa ponavljanjem od 10do 40 uta

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    7/36

    DNK analiza

    1984 Alec Jeffreys RFLP (restrictionfragment lenght polymorphism)metod

    Uoio je da intronski delovi DNKsadre segmente koji se sastoje odviestrukog ponavljanja istovetne

    sekvencije nukleotida VNTR (variablenumber of tandem repeats)

    Broj ponavljanja u tim segmentima

    varira izmedju osoba-osnova za

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    8/36

    Ubistva u Narborough-u

    1983, 1986 ubistva dve tinejderke,isti modus operandi

    posle ispitivanja Richard Bucklandpriznao ubistvo jedne rtve osloboen na osnovu DNK analize

    5000 analiziranih uzoraka Colin Pitchfork- osuen na osnovu

    DNK analize

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    9/36

    Algoritam DNK analize

    Prikupljanje uzoraka - biolokih tragova Uzimanje biolokih uzoraka od nesporno

    identifikovane osobe

    Izolovanje molekula DNK iz biolokogmaterijala

    Provera koliine i kvaliteta molekula u DNK

    materijalu Obrada molekula DNK primenom

    odgovarajuih enzima

    Dobijanje DNK profila iz biolokih uzoraka

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    10/36

    ta sve moe biti uzorak zaDNK analizu

    Bioloki fluidi/ekskrementi Tragovi na nosaima

    Krv Zalogaj hrane

    Sperma Konac za ciscenje zubaPljuvaka Cetkica za zube

    Koncentrovan urin akalica

    Znoj Opuak

    Feces Upotrebljena papirna maramica

    elijski bris Posteljina

    Sve to sadri celije sa jedrom

    ... ...

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    11/36

    Tip uzorka Koliina DNK

    Krv 20.000 - 40.000 ng/ml

    mrlja 1 cm2 200 ng

    mrlja 1 mm2 2 ng

    Sperma 150.000 - 300.000 ng/mlKosa

    Icupana 1 - 750 ng/dlaka

    Pokidana 1 - 12 ng/dlaka

    Pljuvacka (tj. saliva) 1.000 - 10.000 ng/ml

    Urin 1 - 20 ng/ml

    Kolicine DNK u pojedinim uzorci

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    12/36

    Izolovanje DNK

    Chelex ekstrakcija (primena jonizmenjivackihsmola)

    QiaAmp ekstrakcija

    Organska ekstrakcija (serija organskihekstrakcija)

    Diferencijalna ekstrakcija

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    13/36

    Odredjivanje kolicine DNK u

    uzorku

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    14/36

    RFLP analiza

    1. Isecanje DNK molekula na restrikcione

    fragmente upotrebom restrikcionih

    enzima (endonukleaza)

    2. Razdvajanje DNK fragmenata razliiteveliine korienjem gel elektroforeze

    3. Prenoenje DNK sa gela na najlonsku

    membranu, Southern-blot metodom4. Hibridizacija DNK probe na membrani

    5. Vizualizacija lokacije hibridizovanih proba

    6. Inter retaci a rezultata

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    15/36

    Razdvajanje DNK fragmenata

    A

    -Razvajanje se vri po ejstvomelektrinog polja u agaroznom gelu

    -Kradi fragmenti bre putuju kapozitivnoj elektrodi

    -Fragmenti restrikcije se izdvajaju u

    obliku diskretnih trka

    -Specifina boja se vezuje za traketako da postaju vidljive pod UV

    svetlou

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    16/36

    Southern blot i hibridizacija

    traka RFLP trake se prenose na nitroceluloznu ili

    najlonsku membranu (Southern blot)

    Hibridizacija- vezivanje komplementarne DNKprobe koja je obeleena raioaktivnimizotopom (32P) ili fluorescentnim agensom

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    17/36

    Detekcija FRLP fragmenata

    Autoradiografija

    Luminescencija

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    18/36

    Primeri RFLP tehnike

    Utvrivanje oinstva Utvrivanje poinioca

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    19/36

    Karakteristike RFLP analize

    Visoka specifinost

    Neophodan dvostruki lanac DNK

    Ne moe da radi sa deliminodegradiranom DNK.

    Dugotrajna procedura

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    20/36

    Polymerase chain reaction

    (PCR)

    1983 Kary Mullis

    Umnoavanje delova ili itavog lanca

    DNK Moe da funkcionie i sa samojednim molekulom DNK

    Termoregulisani ciklusi umnoavanja identauracije

    TAQ polimeraza

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    21/36

    Postupak PCR

    http://ubuntuone.com/5J4FvAwjJ1qD61VC8s8cRr

    http://ubuntuone.com/5J4FvAwjJ1qD61VC8s8cRrhttp://ubuntuone.com/5J4FvAwjJ1qD61VC8s8cRrhttp://ubuntuone.com/5J4FvAwjJ1qD61VC8s8cRrhttp://ubuntuone.com/5J4FvAwjJ1qD61VC8s8cRr
  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    22/36

    SHORT TANDEM REPEATS

    (STR)

    Mesta (lokusi) na DNK molekulu kojisadre kratke segmente (obicno cetiri

    baze) koji se ponavljaju STR koji se koriste za DNK

    identifikaciju su visokopolimorfni.

    Postoji vie od 10000 poznatih STRregiona, ali se u forenzickoj analizi

    koristi svega 6-15

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    23/36

    Razdvajanje fragmenata posle

    STR analize

    Kapilarna elektrofreza Elektroferogram

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    24/36

    Primer STR analize

    Uzorak sa

    mesta zlocina

    Uzorak DNKzrtve

    1. osumnjiceni

    2. osumnjiceni

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    25/36

    Mitohodrijska DNK

    Svaka mitohondija (5-100 po celiji) sadri2-3 molekula mDNK koje svaka za sebe

    sadre tano 16569 baznih parova.

    Kodirajui i nekodirajui regionisu razdvojeni

    Regioni HV1 i HV2 (ukupno 1100baznih parova i koriste se u

    forenzikoj analizi kada nijedostupna nuklearna DNK

    Mitohondrijska DNK ne sadri

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    26/36

    HV1 i HV2 regioni se umnoavajupomodu PCR ge se uz

    stanarne sastojke oaju iprekiai sinteze obeleenidideoksi ribonuleotid fosfati

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    27/36

    Analiza Y hromozoma

    Nasledjuje se samo od oca

    Slui za odreivanje DNA profila kada su u

    uzorku prisutne celije vie osoba.

    Ciljni lokusi se nalaze na delu hromozoma

    koji nije podloan rekombinaciji.

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    28/36

    Interpretacija rezultata DNK

    analize Ukljucivanje (inkluzija) neiskljucivanje

    Iskljucivanje (ekskluzija)

    Nepotpuni/neuverljivi rezultati

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    29/36

    Baze podataka

    UK (NDNAD) oko 2 miliona profila

    FBI (CODIS) 4, 5 milona profila

    Nacionalne baze

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    30/36

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    31/36

    Sluaj ubistva Nikol Simpson i RonalaGoldmana

    12 juna 1994. u svom stanu pronadjena jeizbodena N. B. Simpson. U drugoj

    prostoriji naeno je beivotno telo R.Goldmana.

    Glavni osumnjieni je O. J. Simpson, biviigra amerikog fudbala i glumac

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    32/36

    Mesto

    zloina

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    33/36

    Kua i automobil osumnjienog sapoloajima dokaznog materijala

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    34/36

    Analizirano 45 uzoraka krvi pronaenih namestu zloina, u kui i vozilu

    osumnjienog

    Uzorci su analizirani pomou RFLP i STRmetode.

    U veini uzoraka naena DNK O. J.Simpsona pomeana sa DNK rtvi.

    Zbog proceduralnih greaka u uzorkovanjuDNK O. J. Simpson je osloboen

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    35/36

    Carska porodica Romanov

    STR tehnika je koridena za utvrivanje srostva

    Analiza mDNA je koridena za utvrivanje ientiteta

  • 8/13/2019 Forenzicka DNK Analiza

    36/36

    mDNA Carice Aleksandre FjodorovneRomanov utvreni preko slinosti sa mDNA

    princa Filipa. (1991, 1998)

    mDNA Cara Nikolaja II Romanova je pokazivalaheteroplazmiju (6,126).

    Poreenje sa mDNA njegovog brata Velikogvojvode Georgija pokazali su slaganje.

    Carevid Aleksej i Velika kneginja Marija suimali ientian mDNA kao A. Fjoorovna