Geoloogilised kogud EestisGeoloogilised kogud EestisOlle Hints (TTÜ Geoloogia Instituut)Mare Isakar (TÜ geoloogiamuuseum)Rutt Hints (Eesti Loodusmuuseum)

Juttu tuleb:Juttu tuleb:

Peamised asutused ja nende kogudTÜ geoloogiamuuseum Eesti Loodusmuuseum TTÜ Geoloogia InstituutEMU PKI, Mullateaduse ja agrokeemia osakond

SARV: geokogude infosüsteemtööpõhimõttednäited elust enesest

Geoloogia eripäradGeoloogia eripärad

Oma sisult oluliselt laiem kui teised rahvuskollektsioonid:

sisaldab nii loomi, taimi, protiste kui kõikvõimalikke eluta looduse objekte (setted, kivimid, mineraalid, vedelikud, tehismaterjalid)

Kivid on tihti suured ja rasked

Geoloogiline ajafaktor

Kogumine – lokaliteedi tähtusus

TÜ geoloogiamuuseumTÜ geoloogiamuuseum

asutatud 18024 töötajat

Fossiilid: 35000Kivimid, mineraalid, meteoriidid 41000mikrofossiilide preparaadid 30000lisaks arhiiv ja fotod

Al. 2003 kasutati KVIS andmebaasi, mis sellisel kujul siiski loodusteadustele hästi ei sobiSuur ekspositsioonOsa hoidlaruume halavas seisukorras

Eesti Loodusmuuseumgeoloogia osakond

Eesti Loodusmuuseumgeoloogia osakond

asutatud 1864museaalid 30000

sh 500 taksonoomilist tüüpi

1 + 0.5 + 0.5 töötajat

TTÜ Geoloogia InstituutTTÜ Geoloogia Instituut

Kogu asutatud: 1947

Töötajad:osakonnajuhataja

2 põhikohaga

2-3 osakoormusega / ajutiste lepingutega tudengit

TTÜ Geoloogia InstituutTTÜ Geoloogia Instituutfossiilid, kivimid, minaraalid 400000kivimiproovid (abikogu) 100000Paleosoikumi mikrofossiilide preparaadid 60000Kvaternaari diatomee ja õietolmupreparaadid 10000puursüdamikud 4500 kastilisaks arhiiv ja fotod

Eesti GeoloogiakeskusEesti Geoloogiakeskus

puursüdamikud 1770 puurauku

17900 kasti

70 km

kivimiõhikud 20000 tk

käsipalad / säilikud 10000 tk

kivimiproovid (duplikaadid)

EMU PKI, Mullateaduse ja agrokeemia osakond

EMU PKI, Mullateaduse ja agrokeemia osakond

Mullamuuseummullamonoliidid 120 tk

mullaproovid 5000 tk

SARV: geokogude infosüsteemSARV: geokogude infosüsteem

Milleks?andmebaas ei ole eesmärk vaid vahendkoguhoidjate töö kergendamiseksteadurite töö kergendamiseksandmete ristkasutuse ja avalikustamise võimaldamiseks

Sai alguse vajadusest sorteerida ja hallata teaduskogusid, kasvas välja Exceli tabelitestHakkab tööle kui kriitiline mass andmeid sisestatudOn kasutuses:

TTÜ Geoloogia InstituudisEesti Loodusmuuseumistestimisel TÜ geoloogiamuuseumis (ca 1 nädal)

SARV: geokogude infosüsteemSARV: geokogude infosüsteem

AndmemudelAndmemudel

kokku ca 85 tabelit, ca 20 olulisemat, sh.eksemplar

kollektsioon

leiukoht

kirjandus

isik ja organisatsioon

klassifikatsioon

laen

...

Geoloogiale spetsiifilised:stratigtraafia

puursüdamik

kivimiproov

AndmemudelAndmemudel

TarkvaraTarkvara

ServerOperatsioonisüsteem (Debian Linux)

sh. tulemüür, varundamine, logimine, jms.

Andmebaasiserver (MySQL 5.0)mis hoiab ja väljastab andmeid

Failiserverpiltide jms hoidmiseks

Veebiserver (Apache 2)võimaldab andmeid kuvada Interneti kaudu

Kaardiserver (MapServer)

TarkvaraTarkvara

MS Accessi klient - andmete sisestajakuraatorite peamine töövahend info sisestamiseks, etikettide trükkimiseks jneSuhteliselt keeruline, oskamatu kasutaja võib pahandust teha, probleemiks sõltuvus Microsoftist ja töökndlusSamas on lihtne lisada keerulisi funktsioone, suhteliselt odav

Veebipõhine klient - andmete vaatajaveebibrauserkes-iganes ja kust-iganesautenditud kasutajatel suuremad õigusedhalvim mis võib juhtuda on see, et asi ei tööta ja otsitavat ei leita

TarkvaraTarkvara

Klient - andmete vaatajaveebibrauserkes-iganes ja kust-iganesautenditud kasutajatel suuremad õigusedhalvim mis võib juhtuda on see, asi ei tööta ja otsitavat ei leita

Prototüüp valmis 2004suur osa andmetest avalikult kättesaadavmitmed uued funktsioonid

pildidkaardidteadustöö andmestik (soovi korral)läbilõigete joonistamine

RiistvaraRiistvara

Server2 x 2.4GH Xeon protsessorit

3 SCSI kõvaketast RAID-massiivis

2 GB mälu

UPS

DLT lindiseade varundamiseks

hind = 3 keskmist sülearvutit

Andmeid on-lineAndmeid on-line

TTÜ GInov.

2001 nov. 2004 nov. 2006

üksikeksemplarid 17342 5439377532

(~25%)

originaalid 5098 8559 9888

proovid ja preparaadid (abikogu) 17822 39873 56653

puursüdamikukastid 0 0 2150

digifotod säilikutest 0 0 2524

lokaliteedid 2203 3392 4023

publikatsioonid 375 439 614

ELM

üksikeksemplarid17300

(~50%)

VõrgustikudVõrgustikud

TTÜ GI ja ELM liitunud BioCASE ja GBIF-igaon nn. ABCD andmetarnijaks, mille abil saab ise tekitada ka kohalikke võrgustikke

Case 1Case 1Teadur Mari-Ann külastab Hiiumaad ja kogub Kõrgessaare paljandist 23 eksemplari rugooseVälitöödelt naasnuna annab ta materjali üle teaduskogude osakonnaleRugooside spetsialist Dimitri selgitab välja et tegu on isenditega liigist Streptelasma (Kenophyllum) siluricum (Dybowski) Materjal võetakse arvele ja paigutatakse fondiKuna tegemist on hästi säilunud eksemparidega, siis tehakse neist kohe ka digipildidAasta hiljem otsib Austraalia kolleeg Barry oma töösse võrdlusmaterjali ja avastab, et Eestist on leitud olulist uut materjali ning soovib seda laenutadaPeavarahoidja vormistab laenu ja saadab materjali teeleTeadlane publitseerib artikli ning tagastab materjali

Case 2Case 2

Doktorant Mairy tööks on mikrofossiilide leviku uurimine. Ta on kogunud proovid Paatsalu puursüdamikust.Laboris proovid kaalutakse ja pannakse happesse lahustuma.Optilise mikroskoobi abil määratakse väljalahustatud kitiinikute jt mikrofossiilide süstematiline kuuluvus ning arvukus.Andmed sisestatakse erinevate uurijate poolt jooksvalt andmebaasiAndmebaasi lisamooduli abil, mis joonistab .svg vormingus graafikuid on lihtne konkreetseid andmeid visualiseerida ning lihtsustada publitseerimiskõlblike jooniste loomistPublitseeritakse artikkel, mis viitab andmebaasileInglise paleontoloog Ken loeb artiklit, ning külastab detailsemate andmete saamiseks andmebaasi veebipõhist liidestKen vaatab kataloogis detailset läbilõiget ja puursüdamiku fotosid ning teeb ettepaneku uurida koostööprojekti fütoplanktoni levikut samas läbilõikes