Los biobancos en la investigación del futuro.

Biobancos de grandes consorcios internacionales: retos y oportunidades

Roberto Elosua

Grupo de Epidemiología y Genética Cardiovascular, IMIM. Barcelona

• Biobancos – Diseñados a priori. – Diseñados a posteriori.

• Retos:

– Calidad de las muestras biológicas. – Exhaustividad de variables asociadas a la muestra. – Validez de los fenotipos clínicos. – Harmonización de la información entre biobancos. – Aspectos éticos. – Regulación acceso a muestras e información. – Financiación. – Aspectos legales y diferencias entre países

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• Biobancos – Diseñados a priori. – Diseñados a posteriori.

• Retos:

– Calidad de las muestras biológicas. – Exhaustividad de variables asociadas a la muestra. – Validez de los fenotipos clínicos. – Harmonización de la información entre biobancos. – Aspectos éticos. – Regulación acceso a muestras e información. – Financiación. – Aspectos legales y diferencias entre países

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Biobanco • Estructura que recoge y almacena material biológico

asociado a información médica y de estilos de vida/ambiente.

• Las muestras biológicas y los datos se recogen de forma continuada y se realiza un seguimiento a largo plazo.

• Destinado a la investigación de proyectos ya definidos o que se puedan definir en el futuro. Abiertos a la comunidad científica.

• Utiliza codigos de anonimización/disociación que garantizen la privacidad de los donantes.

• Regulado por una normativa, órganos de gobierno (comité científico, comité de ética, …) y procedimientos (consentimiento, acceso datos, …) bien definidos.

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Grandes consorcios: diseñados a priori Biobank Sample Size url

UK 500.000 www.ukbiobank.ac.uk

deCode Iceland 250.000 www.decode.com

Estonian 1.000.000 www.geenivaramu.ee/en

Canadian CARTaGENE 43.000 www.cartagene.gc.ca

US Precision Medicine Initiative 1.000.000 www.nih.gov/precision-medicine-initiative-cohort-program

China Precision Medicine Initiative >1.000.000

Korean 500.000

Japan 300.000

GCAT project 50.000 http://www.gcatbiobank.org; http://www.p3g.org

Plataforma Biobancos http://www.redbiobancos.es

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UK biobank

• UK Biobank is a major national health resource, … • … with the aim of improving the prevention, diagnosis

and treatment of a wide range of serious and life-threatening illnesses.

• UK Biobank recruited 500,000 people aged between 40-69 years in 2006-2010 from across the country to take part in this project.

• They have undergone measures, provided blood, urine and saliva samples for future analysis, detailed information about themselves and agreed to have their health followed.

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UK biobank

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UK biobank

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USA and China

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GCAT project

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Diseñados a posteriori: Exome Aggregation consortium (ExAC)

• A coalition of investigators seeking to aggregate and harmonize exome sequencing data from a wide variety of large-scale sequencing projects, and to make summary data available for the wider scientific community.

• The data set provided spans 60,706 unrelated individuals sequenced as part of various disease-specific and population genetic studies.

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• Biobancos – Diseñados a priori. – Diseñados a posteriori.

• Retos:

1. Calidad de las muestras biológicas. 2. Exhaustividad de variables asociadas a la muestra. 3. Validez de los fenotipos clínicos. 4. Harmonización de la información entre biobancos. 5. Aspectos éticos. 6. Regulación acceso a muestras e información. 7. Financiación. 8. Aspectos legales y diferencias entre países

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1.-Calidad de las muestras biológicas

• Aspectos pre-analíticos: – Obtención: metodología, momento de obtención, … – Procedimientos, identificación, trazabilidad.

• Estabilidad de las muestras: – Calidad, pureza. – Contaminación microorganismos. – Contaminación cruzada.

• Conservación: – Control temperatura. Trazabilidad.

OECD Guidelines on Biobanking: https://www.oecd.org/sti/biotech/44054609.pdf Sample handling and storage validation UK BK. Int J Epidemiol. 2008;37:i2-6. 12/29

2.-Exhaustividad de variables asociadas a la muestra

• Información clínica:

– Estática. – Dinámica, estrategias de

seguimiento.

• Otra información asociada:

– Antecedentes, historia familiar. – Estilos de vida. – Factores ambientales.

Public Population Project in Genomics and Society P3G: http://www.p3g.org/

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3.-Validez de los fenotipos clínicos: mediciones y linkage con bases de datos electrónicas

• Validez de los diagnósticos: – autodeclarados; – medidos; – en historia clínica electrónica; – en bases de datos administrativas; – en registros de mortalidad.

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3.-Validez de los fenotipos clínicos

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4.-Harmonización vs estandarizacion

• Biomedical Informatics Grid (http://cabig.nci.nih.gov) • European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (http://epic.iarc.fr/ centers/iarc.php) • Public Population Project in Genomics (http://www.p3g.org) • PHOEBE45 (population biobanks) (http://www.phoebe-eu.org) • EuroBioBank (rare diseases) (http://www.eurobiobank.org) • GenomeEUtwin (sibling and twin cohorts) (http://www.genomeutwin.org) • TuBaFrost (frozen human tissue bank) (http://www.tubafrost.org) • NUGENOB (nutrition and obesity) (http://www.nugenob.org) • Organisation for Economic Co-operation and Development (OECD) (http://www.oecd.org/dataoecd/7/13/38777417.pdf) • US National Cancer Institute (NCI) (http://biospecimens.cancer.gov/ global/pdfs/NCI_Best_Practices_060507.pdf) • International Society of Biological and Environmental Repositories (http://www.isber.org/Pubs/BestPractices2008.pdf)

• Posibilidad de compartir información. • Recogida de datos de forma uniforme:

– Estandarizada. – Harmonizada.

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5.-Aspectos éticos

• Consentimiento informado. • Privacidad. • Confidencialidad. • Protección de datos. • Compartir datos. • Beneficios compartidos, comercialización, propiedad

intelectual. • Discriminación genética.

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5.a-Consentimiento informado: específico vs amplio vs dinámico

Intereses-Autonomia de los donates

Intereses de la investigación

Específico: Cada proyecto necesita un consentimiento informado específico.

PROS CON

Se protege y potencia el interés y la autonomía del donante.

Se puede “quemar” al donante con un bombardeo de información. Se enlentecen los proyectos de investigación.

Se evita el paternalismo y se fomenta la reciprocidad y participación del donante.

Se puede informar periódicamente de los proyectos aprobados.

Se previenen usos no deseados/previstos en el momento de donación de muestras.

Se pueden enlentecer avances en la investigación.

Caulfield T. Med Law Int 2009;10:85–100. 18/29

5.a-Consentimiento informado: específico vs amplio vs dinámico

Intereses-Autonomia de los donates

Intereses de la investigación

Amplio: El donante autoriza el uso de sus muestras para proyectos de investigación abiertos (supervisión CEIC, información al donante de proyectos aprovados, …)

PROS CON

Permite el uso de las muestras para estudios futuros aprobados por un CEIC.

No se garantiza la autonomía ni la libertad de los donantes.

Debe informar a los donantes de los estudios aprobados con sus muestras.

Permite acelerar nuevos proyectos de investigación y el (potencial) avance de la ciencia.

Paternalismo, falta de reciprocidad

Caulfield T. Med Law Int 2009;10:85–100. 19/29

5.a-Consentimiento informado: específico vs amplio vs dinámico

Intereses-Autonomia de los donates

Intereses de la investigación

Dinámico: utilización de nuevas tecnologías (web 2.0, redes sociales, …) para informar al donante de nuevos proyectos de investigación y solictar su consentimiento.

PROS CON

Se protege y potencia la autonomía del donante en tiempo real.

Proyectos nuevos pueden ser muy similares a otros antiguos y se requiere aprobación expresa.

Se garantiza la información del donante en tiempo real.

El consentimiento amplio también puede garantizar esta información.

Se potencia la participación, reciprocidad y confianza de los donantes en el biobanco.

Se puede “quemar” al donante con una información y demanda de acción excesiva.

Steinsbekk KS. Eur J Hum Genet 2013;21:897. 20/29

5.a-¿Qué opina la población?

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5.b-Privacidad y confidencialidad

• Anonimización vs Disociación

• Ley Orgánica de protección de datos 15/1999, Real decreto 1720/2007

• Documento de seguridad, registro de incidencias, control de acceso, identificación usuarios, copias de seguridad, gestión soportes.

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5.b-Protección de datos N

elso

n GS

. SAS

A p

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on

Data

Priv

acy,

Ano

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n an

d de

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tific

atio

n

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5.c-Data sharing: the Fort Lauderdale Agreement

• A public declaration of scientists and professionals in biomedicine supporting the free and unrestricted use of genome sequencing data by the scientific community before that data is used for publication.

• The Agreement was the main outcome of a meeting in Fort Lauderdale, Florida, organized by the Wellcome Trust in 2003 and involved about 40 individuals.

• The Agreement's main outcome was for a shared system of responsibility among funding agencies, resource producers, and resource users to maintain and expand a community resource of genomic data.

• The tenets of the Fort Lauderdale Agreement were adopted by the relevant funding agencies.

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5.d-Beneficios compartidos, comercialización, propiedad intelectual.

• Confianza-Transparencia – ¿Qué van a obtener los donantes por su participación?

• Conocer los resultados de los proyectos de investigación: ¿agregados, individualizados?

• ¿Rendimiento económico?

• Participación activa de los donantes – Inclusión de asociación de pacientes en el diseño,

implementación (Ej: asociaciones enfermedades raras,…). – Compromiso, comunicación. – Evitar conflictos: deCode vs Mannverd (Association of

Icelanders for Ethics in Science and Medicine).

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• Política de acceso a las muestras y datos bien definida, justa, transparente y que no impida la investigación. Firma de un acuerdo entre el biobanco y el investigador.

• Respetar el consentimiento informado del participante. Proyecto de investigación aprobado por un CEIC, y con entrega de informe anual de su progreso.

• Definir políticas de priorización de uso de muestras biológicas. • Garantizar que los resultados de las determinaciones realizadas se

incorporan al biobanco. • Definir políticas y estrategias sobre en qué situaciones y qué

mecanimos puede utilizar el donante para obtener sus datos individuales.

• Acuerdo sobre propiedad intelectual.

6.-Regulación acceso muestras y datos

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7.-Financiación

• Personal: contratación y formación continuada. • Espacio. • Congeladores. • Sistemas de monitorización/seguridad. • LIMS y sistemas de información seguros. • Procedimientos normalizados de trabajo. Control de

calidad. Acreditación. • Sostenibilidad. Integración sistema público de salud.

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Muchas gracias y ¡felicidades por el 5º aniversario!