Adalah ilmu pengetahuan tentang dasar kimiawi kehidupan yang mempelajari komposisi kimia dan perubahan kimia dari suatu zat hidup selama proses kehidupan The Chemistry of Living Thing

Terarah/ teratur Khas/ spesifik

Dapat terjadi spontan

Pasteur: peristiwa peragian dapat terjadi jika ada sel

Buchner: dpt terjadi tanpa sel, asalkan ditambahkan ekstrak yg berasal dari sel ragi

Berarti dalam sel terdapat substansi yg mampu menjalankan reaksi-reaksi kimia

Pertengahan abad 19 :Kimia organik menjadi ilmu kehidupan yang terpisah dari cabang ilmu kimia lain

Th 1828:Friedrick WhlerSintesis urea dr ammonium sianat

Th 1820: J V LiebigMengkategorikan makanan menurut sistem klasifikasi KH, lemak dan proteinMemperkenalkan konsep metabolisme

Th 1840: Schwann & SchleidenMemperkenalkan teori sel sbg unit struktural dasar dari semua organisme

Th 1830: L PasteurMengajukan teori keberadaan fermen yg terorganisasi yg hanya berfungsi pd selragi hidup yg memfermentasi glukosamenjadi alkohol dan CO2

Th 1878: W KhneMemperkenalkan istilah enzim utk fermen

Th 1878 E Fischer (Nobel 1902)Menemukan:-Metoda kunci & anak kunci antara E & S-Pembentuk protein adl asam amino-Pemecahan protein oleh enzim pencernaan

E Buchner (Nobel 1907)Ekstrak ragi mampu melakukan fermentasi

Th 1926: J B Sumner (Nobel 1946)Kristalisasi urease

Th 1930: J H Northrup (Nobel 1946) Kristalisasi pepsin & tripsinHans A Krebs (Nobel 1953) Siklus urea & asam sitrat(pembentuk energi)

Th 1950: L Pauling& RB Corey (Nobel 1954)Konformasi helix dr protein

Th 1953: F Sanger (Nobel 1958)Rangkaian as amino dari hormon insulin

Th 1940: G Beadle & E Tatum (Nobel 1958)Hipotesis: setiap gen bertanggung jawab thd struktur dr hanya satu enzim

Th 1953:J Watson&FHC Crick (Nobel 1962)Struktur heliks ganda dr DNAHipotesis Dogma Sentral dr biologi molekuler

Th 1961: F Jacob & J Monod (Nobel 1965)Pengaturan katalitik enzim

Mulai th 1970: Era BioteknologiDiperkenalkan teknik DNA rekombinanMisal:-Rekayasa genetika -Antibodi monoklonal -Produksi obat-obatan

Penggunaan ilmu biokimia:Mengungkapkan penyebab penyakitPengobatan yg rasional & efektifTest skrining utk diagnosisPemantauan perkembangan penyakitPenilaian reaksi tubuh thd terapi

H R= gugus yg terikat R= H pd glisinH2N C COOH RPenggolongan Asam amino:Rantai samping alifatikRantai samping mempunyai gugus hidroksilRantai samping mengandung atom sulfurRantai samping mengandung gugus asidik/ amida Rantai samping mengandung gugus alkaliMengandung cincin aromatikAsam imino

Zwitter ion

AlaninAsparaginAsam aspartatSisteinAsam glutamatGlutaminGlisinProlinSerinTirosin diproduksi dari fenilalanin

ArgininHistidinIsoleusinLeusinLisinMetioninFenilalaninTreoninTriptofanValin

Struktur protein terdiri dari 4 susunan :

Struktur PrimerAdalah urutan asam amino yang membentukprotein dengan ikatan peptida. Ikatan peptidamembentuk bidang datar, rantai samping (R) berada pd konfigurasi trans pada sisi yg berlawanan dari ikatan peptida

O R HC C N CH R H

Struktur sekunder:Struktur sekunder protein ditentukan oleh struktur primer. Struktur sekunder dibentuk dan dipertahankan oleh ikatan H antara C=O dg NHpada ikatan peptidaAda 2 kemungkinan struktur sekunder yg sering dijumpai: yaitu heliks- dan -pleated sheet/lembaran-

Berupa heliks yg berputar ke kananGugus R dari AA mencuat keluar tegak lurus thd. sumbu heliksStruktur ini dipertahankan bersama-sama oleh ik. H ant. ggs karboksil dr 1 ikatan peptida dg NH dr AA ke-4 sesdh itu dlm helik Oleh karena itu, itu tiap ik. peptida, kec. yg terdpt di ke-2 ujung membtk. dua ik. H

Heliks- paling mantap bila: struktur primer mengand. AA dg rantai samping tidak ber- muatan spt. Ala,Leu, Phe, Tir,Trp, Sis, Met, His, Asn, Gln & Val

Heliks- menjadi tdk. mantap lagi bila: AA yg membtk. struktur primer memp. rantai samping yg besar/bermuatan spt. Ser, Ile, Tre, Asp, Glu, Lis & Arg

Pro tdk dpt didudukkan dlm heliks-

2. Lembaran / -pleated sheet (lembaran bergelombang)

Rantai protein meluas dg ggs. R berganti- ganti berada diatas & dibawah tl. punggung Ik. H terbtk. antara ik. Peptida yg berjln sec. antiparalel. Mungkin rantai yg berbeda atau rantai yg sama yg melipat, membtk. lengkungan spt. jepitan rambutIk. H tegak lurus thd. arah tl. punggung

Struktur Tertier

Adalah konfigurasi yg ditampilkan protein dlm ruangGabungan dari berbagai struktur sekunderStruktur tertier dimantapkan oleh adanyaInteraksi ion antara ggs. R yg bermuatanInteraksi hidrofobikIkatan disulfidaIkatan kovalen dg. ggs. prostetik

Berdasarkan struktur tertier, protein dibedakan:

Protein globular Mempunyai btk. yg lebih kurang bulat Mudah larut dlm air & larutan garam encerProtein fibrosa Membentuk serat-serat panjang spt. tali/ tongkat membtk struktur yg sangat kuat Tidak larut dlm air

Struktur kuartener

Adalah penataan suatu rantai protein dg rantai protein yg lain & dg koenzim yg tdkterikat secara kovalenMisal: InsulinHemoglobin tdd: 2 rantai & 2 rantai serta 4 ggs Heme

DENATURASI PROTEIN

Protein akan mengalami denaturasi oleh zat- Zat/kondisi yg dapat memecah ikatannya:pHSuhu tinggiUrea, guanidin, dan deterjen : memutus ikatan H Hidrolisis pd suasana basa:Ser &Thr rusakHidrolisis pd suasana asam: Trp rusak, Gln & Asn mengalami deaminasi

Protein yg mengalami denaturasi akan kehilangan aktivitas biologis & kelarutannya berkuranghidrolisis ikatan peptida

Katalisis enzimatikTransportasiCadanganStruktur/penunjang mekanisProteksiPembangkit dan penghantar impuls sarafPengatur pertumbuhan dan diferensiasi

Dr Rani S. Apt.Struktur & fungsi asam amino, protein dan enzim -Mioglobin dan hemoglobin -Mekanisme kerja enzim & Kinetika enzim2. Bioenergetika -Bioenergetika/peranan ATP -Oksidasi biologi -Rantai pernapasan & fosforilasi oksidatif3. Metabolisme Xenobiotik

Dra. Azizahwati MS, Apt1. Nutrisi,pencernaan & absorpsi 2. Metabolisme karbohidrat -Metabolisme & pembentukan energi -Siklus asam sitrat -Glikolisis & oksidasi piruvat -HMP Shunt & jln asam uronat -Metabolisme glikogen -Glukoneogenesis & pengaturan glc. darah -Metab. KH lain (fru. gal & glukosamin)

3. Metabolisme lipid -Oksidasi asam lemak & ketogenesis -Biosintesis asam lemak & Eikosanoid -Metab asilgliserol & sfingolipid -Transportasi & penyimpanan lipid -Kolesterol (sintesis, transport & ekskresi)

Prof Dr Yahdiana Harahap MS Apt

Mikronutrien (vitamin & mineral)Metabolisme protein & asam amino -Biosintesis AA nonesensial -Katabolisme rangka karbon AA -Produk khusus dari AA -Porfirin & pigmen empedu3. Nukleotida purin & pirimidin -Metabolisme nukleotida purin & pirimidin -Struktur & fungsi asam nukleat -DNA & RNA - Sintesis protein 4. Biokimia kanker

**