Szerkezet alapú virtuális Szerkezet alapú virtuális gyógyszerkutatásgyógyszerkutatás

/ a humán H4 receptoron // a humán H4 receptoron /

Szerkezet alapú virtuális Szerkezet alapú virtuális gyógyszerkutatásgyógyszerkutatás

/ a humán H4 receptoron // a humán H4 receptoron /

Kiss Kiss Róbert Róbert 11

1 Semmelweis Egyetem, Gyógyszerészi Kémiai Intézet, Budapest, H-1092, Hungary

/Tel: +36-70/3626271 Email: kissrobert81@freemail.hu/

G-protein G-protein kapcsoltkapcsolt receptor receptorokok

• 1 Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, Behnke CA, Motoshima H, Fox BA, Le Trong I, Teller DC, Okada T, Stenkamp RE, Yamamoto M, Miyano M (2000) Science 289(5480):739-45

• Transzmembrán receptorok

• Nagyfokú homológia a transzmembrán domain-ben

• Specifikus motívumok• A mai gyógyszerek kb. 40%-a GPCR-eken keresztül hat• Eddig 1 GPCR-ről van experimentális 3D szerkezet• Homológia modellezés

• 7 alfa hélix

??Homológia modellezésHomológia modellezés

A humán hisztamin H4 receptor szerkezete

Bovine rhodopsin kristály szerkezete

AA hum humáán hisn hiszztamin H4 receptortamin H4 receptor szerkezeteszerkezete

HisHisztamin kötődésztamin kötődés

VirtuVirtuáállisis screening screening

• Építettünk egy jól működő modellt a humán H4 receptorra

• Összegyűjtöttük számos cég megrendelhető molekula adatbázisát

Virtuális screening

In vitro screening

A világ eddigi legnagyobb szerkezet A világ eddigi legnagyobb szerkezet alapú virtuális screening-je…alapú virtuális screening-je…

Számítógépes kapacitás

Software támogatás

ClusterGrid Project

FlexX license 1000CPU-ra

~ 8 800 000

molekula

És a többiekÉs a többiek……

Köszönöm a figyelmetKöszönöm a figyelmet!!