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免疫炎症相关基因多态性与 非小细胞肺癌预后的关联研究. 胡志斌. 南京医科大学公共卫生学院 Tel (fax) : (025)86862756 E-mail: [email protected]. 免疫炎症与肿瘤发生发展的机制. Schetter et al. Carcinogenesis. 2010;31:37-49. IL4 C-5 89T 和 C-33T 基因多态性 共同影响肾细胞癌预后. Kleinrath et al. J Clin Oncol. 2007;25:845-51. 宿主免疫炎症基因多态性与 B 细胞淋巴瘤预后的研究. - PowerPoint PPT Presentation
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免疫炎症与肿瘤发生发展的机制
Schetter et al. Carcinogenesis. 2010;31:37-49
IL4 C-589T 和 C-33T 基因多态性共同影响肾细胞癌预后
Kleinrath et al. J Clin Oncol. 2007;25:845-51.
变量 HR 95% CI P
年龄 1.0 1.0-1.0 0.953
性别 1.3 0.7-2.3 0.386
分级I-II 1.0
III 2.0 1.0-3.7 <0.05
IV 5.4 2.4-11.9 <0.001
IL4 基因型 3.1 1.4-6.9 <0.01
Habermann et al. Blood. 2008;112:2694-702.
IL1A (rs1800587) 、 IL8RB (rs1126580) 、 IL4R
(rs2107356) 和 TNF (rs1800629)4 个多态性可以联合预测 B
细胞淋巴瘤预后。
宿主免疫炎症基因多态性与 B 细胞淋巴瘤预后的研究
危险基因型
病例 死亡(%)
校正 HR
(95% CI)
0-1 74 12.2 1.00(reference)
2-3 247 26.7 2.76(1.37-5.56)
4 44 47.7 6.77(3.05-15.0)
研究假设
Lung Cancer Clinical Outcome
Host immune gene polymorphisms ?
研究对象病例的选择:
江苏省人民医院和江苏省肿瘤医院 病理学确诊 NSCLC 新发病例 未接受放疗化疗等抗肿瘤治疗
资料收集:
面访问卷调查患者一般情况、临床相关情况、个人健康状况等 定期随访获得患者治疗和预后信息
变量 病人( 568) % 死亡 ( 311) MST
( 月 ) Log-rank P
年龄 ≤ 60 285 50.2 155 24.7 0.690
> 60 283 49.8 156 25.0
性别 男 434 76.4 241 24.7 0.805
女 134 23.6 70 27.8病理类型 腺癌 353 62.2 192 26.2 0.519
鳞癌 184 32.4 99 24.0
其它 31 5.5 20 17.9
肿瘤分期 I 144 25.4 46 60.4 <0.001
II 71 12.5 29 47.6
III 221 38.9 133 19.6
IV 132 23.2 103 13.4
手术 否 200 35.2 155 15.3 <0.001
是 368 64.8 156 36.8
化疗或放疗 无 106 18.7 47 33.0 0.102
有 462 81.3 264 23.5
研究对象一般情况
基因多态性选择和检测候选基因策略选择潜在功能性 SNPs
宿主免疫炎症通路: 52 个基因 5’ 侧翼区, 5’UTR , 3’UTR ,外显子区氨基酸改变的 SNP : 187 个位点
Illumina Golden Gate 芯片进行基因分型设计失败: 15 个位点分型成功率低 (<90%) 或明显不符合 HWE
: 18 个位点
Gene SNPs Location Alleles
Log-rank P
Additive model
Dominant model
Recessive model
COX2 rs204175' flanking
regionC:G 0.071 0.999 0.022
IFNA1 rs13321905' flanking
regionA:G 0.020 0.006 0.774
IFNAR2 rs4986956 Phe8Ser G:A 0.010 0.002 0.273
IFNGR2 rs9808753 Gln64Arg A:G 0.076 0.240 0.027
IL1A rs1800587 5'-UTR G:A 0.038 0.081 0.138
IL1A rs18007945' flanking
regionG:A 0.030 0.064 0.138
IL1A rs17561 Ala114Ser C:A 0.029 0.088 0.104
IL1A rs1304037 3'-UTR A:G 0.035 0.108 0.104
IL5Rrs1171341
95' UTR A:G 0.012 0.498 0.005
IL-8 rs40735' flanking
regionA:T 0.106 0.402 0.035
IL8RB rs1126579 3'-UTR A:G 0.067 0.020 0.513
IL10RA rs9610 3'-UTR A:G 0.072 0.042 0.111
....TLR10
rs11096957
His241Asn C:A 0.073 0.027 0.212
单因素分析 NSCLC 预后相关 SNP
位于 18 个免疫炎症基因的27 SNP 与 NSCLC 预后显
著相关( Log-rank P <0.05 )
Variables β SE HR 95% CI P
Stage (Dummy variable) 0.49 0.08 1.63 1.39-1.92<0.001
Surgical Operation (Ever vs. never) -0.61 0.14 0.55 0.41-0.72<0.001
TLR3 rs3775291 (Additive model) 0.23 0.09 1.26 1.06-1.49 0.010
IL-5R rs11713419 (Recessive model)
1.76 0.52 5.792.11-15.90
0.001
IL23R rs6682925 (Dominant model) 0.30 0.12 1.35 1.05-1.72 0.017
TLR1 rs5743551 (Additive model) -0.20 0.09 0.82 0.69-0.97 0.020
多因素分析筛选 NSCLC 预后独立预测因子
Unfavorable loci Patients DeathsMST
(Months)Adjusted HR a (95% CI)
0 53 17 51.90 1.00
1 184 98 27.40 2.23(1.33-3.75)
2 246 139 22.10 2.60(1.57-4.31)
3 82 56 17.70 3.13(1.82-5.40)
4 1 1 5.50 16.22(2.10-125.22)
免疫炎症基因联合基因型与 NSCLC 死亡风险
a Adjusted for smoking status, histology, stage, surgical operation and chemotherapy or radiotherapy status
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
0 20 40 60 80Survival time (Months)
0 unfavorable genotype
1 unfavorable genotype
2 unfavorable genotypes
3 unfavorable genotypes4 unfavorable genotypes
Cumulative Survival
免疫炎症基因联合基因型与 NSCLC 预后
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1
0.5 1 1.5 2 2.5 3 3.5 4 4.5 5
Time (year)
AU
C
Surgery+Stage in 568 patients
4 SNPs in 568 patients
Surgery+Stage+4 SNPs in 568 patients
免疫炎症基因型联合临床信息共同预测 NSCLC 死亡风险
结 论
免疫炎症基因多态性可能是非小细胞肺癌潜在的预后预测因子。
国家自然科学基金重点项目 (30730080)
国家自然科学基金杰出青年基因(30425001)
国家重点基础研究规划项目( 973 )(2002CB512902)
沈洪兵 教授 南京医科大学公共卫生学院
许林 教授 南京医科大学附属江苏省肿瘤医院
陈亦江 教授 南京医科大学附属江苏省人民医院
致 谢
谢 谢