18
"ס"סס סססססPubmed סססס ס- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez בבבב בבבבב בבבבב בבב בבבב, בבבבב בבבבבב ב"ב בבבב, בבבבבבבבבבב בבבבבב, בבבבבבב[email protected] , http://library.md.huji.ac.il

כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

  • Upload
    bijan

  • View
    64

  • Download
    4

Embed Size (px)

DESCRIPTION

כ"אב טיפוס" Pubmed מאגר ה- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez. Entrez. PubMed הוא חלק ממערכת גדולה לאחזור מידע המבוססת על רשת האינטרנט, שפותחה ע"י המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי (NCBI) : National Center for Biotechnology Information בספריה הלאומית הרפואית של ארה"ב. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

-מאגר ה Pubmed "כ"אב טיפוס http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 2: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

PubMed הוא חלק ממערכת גדולה לאחזור מידע המבוססתלמידע הלאומי המרכז ע"י שפותחה האינטרנט, רשת על

:( NCBI)ביוטכנולוגי National Center for Biotechnology Information

בספריה הלאומית הרפואית של ארה"ב. רפואה, החיים: מדעי בתחומי מידע מאגרי כוללת המערכת ביולוגיה, – האנושי הגנום חלבונים, ורצף מבנה

טקסונומיה ועוד. PubMed ,הנרחבת המאגרים במערכת אחד מאגר הוא

Entrezלאחזור מידע בכל תחומי מדעי החיים ,.

Entrez

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 3: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

PubMedדרכי גישה למאגר :הגישה הנוחה והפשוטה היא דרך הקישור מאתר הספריה הרפואית

http://library.md.huji.ac.il

זוהי הדרך המומלצת משום שהיא מבטיחה גישה לעיתונים שהספריה מנוייה עליהם.

ניתן להגיע אל המאגר דרך כל מנוע חיפוש כמו גוגל למשל בתיבת החיפוש ולהגיע ישירות PubMedבאמצעות הקשת המילה

אל המאגר מכל מחשב המחובר לרשת האינטרנט. אם כי כאמור זוהי אופציה טובה לחיפוש בלבד.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 4: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

PubMed הוא ( שירות של הספריה הלאומית הרפואית של ארה"בNLM .). בסיס 50 מליון הגדרות נושאים ביו-רפואיים משנות ה-15כולל מעל

:המקורות הם המאגרים.1Medline – -מאגר המידע הביבליוגרפי של הNLM -מליון 13 המכיל כ

, בכתבי עת בתחום מדעי החיים מתוך כ- 1966הפניות למאמרים משנת מדינות מחוצה לה. חלק ניכר מן ההפניות 70 עיתונים מארה"ב ומ- 5000

כולל גישה לטקסט מלא, או גישה לתקצירי מחברים. תחומי הכיסוי הם רפואה, רפואת שיניים, סיעוד, וטרינריה, מערכת הבריאות, והמדע הפרה

. קליני

.2OldMedline - 1950מאגר מידע ובו הפניות למאמרים מהשנים – Mesh מליון הפניות. כיום אין אפשרות חיפוש לפי 2, הכולל כ- 1965

termsבמאגר זה ,.דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל 23

[email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 5: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

ניתן לבצע חיפוש חופשי ו/או לפי:נושאשם מחבר/תשנות פרסום המאמר

המונחים יאותרו בשדות שונים, על ידי שימוש באופרטורים בוליאנים:AND OR NOT )!!!באותיות גדולות – חשוב(

LIMITS ניתן לבקש הגבלה לשדה החיפוש שבו יופיע המונח, למשל - באלו כתבי עת, בכותרת או בתקציר, בקישורים או בציטוטים, כך גם

ניתן לבחור את שפת המאמר, את קבוצת הגיל ואת המין של נושאי המאמר.

HISTORY ניתן לשמור היסטוריה של חיפוש ולבצע חיפוש בתוצאות -שנתקבלו ו/או נשמרו.

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 6: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

שלוש דרכים עיקריות לביצוע חיפוש:

מילים בשפה החופשית, בהסתמך ,PubMedחיפוש פשוט ב-1.המנוע מציע Searchעל המיפוי האוטומטי: הזנת מילים ב-

"תיקון" בעת הזנת מונח שגוי.

בשדות מוגדרים או בכולם יחד, חיפוש באמצעות האינדקס:2.Preview/Indexמחבר, כותרת: חיפוש מתקדם

לפי נושאים עם תתי נושאים, עם :Meshחיפוש באמצעות ה- 3. …abcהזנת מונח שגוי המנוע מציע אפשרויות נוספות לפי

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 7: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

מיפוי מונחים אוטומטי

מיפוי מונחים אוטומטי פירושו "בדיקת התאמה" של מונחים "בלתי כשירים" על פי הטבלאות שלהלן.

מונחים "בלתי כשירים" הכוונה למונחים ללא הגדרת שדה חיפוש מראש. המונחים הנ"ל, אם כן, יעברו "בדיקת התאמה" על פי הסדר הבא:

- עץ הנושאים הרפואי עליו נפרט Mesh א. מול הב. מול טבלת תרגום מונחים

ג. מול טבלת מונחים של כתבי העת ד. מול טבלה ואינדקס של מחברים

stop words מתעלם ממילות עצר –PubMedבתהליך זה (in out of and.ומילות קישור )

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 8: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

MeSH

הוא למעשה רשימת נושאים רפואיים מפותחת, בדמות עץ בעל ענפים כאשר כל רמה מתרחבת לרמות נוספות, למעשה זהו תיזאורוס מבוקר של הספריה הרפואית

.MEDLINE(, המשמש למיפתוח מאמרים עבור ה- NLMהלאומית של ארה"ב )

או ברשימת הקישורים -PubMed בסרגל החיפוש האופקי בMeSHניתן להגיע ל מאפשרים אחזור עקבי של מידע עבור נושאים שניתן MeSHהאנכית. מונחי

מארגן את התארנים במבנה היררכי כך שהדולה MeSHלהגדירם במילים שונות. מספק דרך יעילה עבור MeSHימצא מאמרים באופן מדויק יותר. המבנה של

הדולה לעלעל בעץ הנושאים כדי למצוא את התארנים המתאימים לו.

למשל: "אקופונקטורה כעיסוק" או "אקופונקטורה כטיפול"

"שעון יד" או "שעון קיר"

Page 9: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

Mesh ב- home deliveryדוגמא לחיפוש: המונח נקבל שני נושאים:

Midwiferyהשני : שיכיל את הנושאים הבאים:

Midwives Midwife Traditional Birth Attendant Birth Attendant, Traditional Birth Attendants, Traditional Traditional Birth Attendants

Home Childbirth :האחדשיכיל את הנושאים הבאים:

Childbirth, Home Childbirths, Home Home Childbirths Delivery, Home Deliveries, Home Home Deliveries Home Delivery Childbirths at Home Childbirth at Home

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 10: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

בעברית למדריכים הפניותhttp://library.md.huji.ac.il/Eresources/databases/index.asp

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 11: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

Pubmed התא האישי שלי ב-

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 12: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

This message contains My NCBI what's new results from the National Center for Biotechnology Information )NCBI( at the U.S. National Library of Medicine )NLM(.Do not reply directly to this message.

Sender's message: Search: )Hyperthyroidism )"last 5 years" )Female( )English( )middle age((( nutrition )"last 5 years" )FemaleSent on Monday, 2008 Oct 13

Search )Hyperthyroidism AND )"last 5 years"[EDat] AND )Female[MeSH Terms]( AND )English[lang]( AND )middle age[MeSH]((( AND nutrition AND )"last 5 years"[EDat] AND )Female[MeSH Terms]( AND )English[lang]( AND )middle age[MeSH]((Click here to view complete results in pubmed. )Results may change over time.(To unsubscribe from these e-mail updates click here.

Entrez pubmed ResultsItem 1 of 1[ ]1: Camargo RY, Tomimori EK, Neves SC, G S Rubio I, Galrão AL, Knobel M, Medeiros-Neto G.Related Articles, Compound )MeSH Keyword(, Substance )MeSH Keyword(, LinkOutThyroid and the environment: exposure to excessive nutritional iodine increases the prevalence of thyroid disorders in Sao

Paulo, Brazil.Eur J Endocrinol. 2008 Sep;159)3(:293-9. Epub 2008 Jun 27. PMID: 18586897 [PubMed - indexed for MEDLINE]

דוגמה

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 13: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

לפי נתונים: PubMedחיפוש "ציטוט" בודד ב- שם מחבר, כותרת וכד'

PubMed Single Citation Matcher

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 14: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

:דוגמאות

חיפוש פשוט-Search :הזנת מונחים למשל: Acupuncture AND hot flashes

תוצאות.37מתקבלות

12370 מניב :  Acupunctureחיפוש של

  1698 מניב : Hot flashesחיפוש של

תוצאות. 37: מניב גם הוא Historyשילוב באמצעות

חיפוש באמצעות האינדקסPreview/Index :

החיפוש יעשה על ידי הקשת המונחים ובחירת השדות שבהם אנו רוצים לחפש את המונח: בכותרת, בשם המחבר, בשם העיתון או כל שדה אחר מהרשימה הקיימת.

כך שניתן ליצור מחרוזת חיפוש AND OR NOT)כל מונח יצורף או ינותק מהמונחים הקודמים בהתאם לבקשה )ארוכה ומורכבת כמו בדוגמה הבאה:

AND risk factor [Title] AND risk factor [Mesh term][Title] anorexia Search

-חיפוש באמצעות הMesh : כניסה ל נושאים דרך הסרגל משמאל, הקשת מונח תציג את הנושא מהיבטיםשונים, בחירה של היבט אחד ולחיצה עליו תציג את תתי הנושאים מהם ניתן לבחור את אלו הרצויים לחיפוש.

“(Acupuncture Therapy" [MAJR:NoExp] OR "Acupuncture Therapy/nursing" [MAJR:NoExp])

PubMedעם קבלת המחרוזת הרצויה בתיבה אפשר לשלוח את החיפוש למאגר ה-

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 15: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

טקסט מלא מאפשרת גישה לטקסט כניסה דרך אתר הספריה

העיתונים שהספריה מנוייה עליהם.מלא לכל ,בנוסףPubMed מכיל קישורים למאמרים

בטקסט מלא של מול"ים ברשת, וקישורים לאתרים כמו ספריות ומרכזים שמציעים גישה

חופשית וישירה למאמרים.

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 16: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

Pubmedדוגמא לקישור/גישה לטקסט מלא מ- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Select+from+History&db=pubmed&query_key=3

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

Page 17: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושלים  [email protected] , http://library.md.huji.ac.il 

מונחים לדוגמה בחיפוש הפשוט נקבל מבחר "אפשרויות" כזכור אם אנחנו מזינים מונח שגוי• נקבל טבלאות Preview/Indexאם נזין ב –• נקבל קטגוריות נושאים Meshאם נזין מונח ב-•

• Diabetic food• Crohn Disease )chrohon disease(• Fever / fiver• Menopause )Menapause(

Page 18: כ"אב טיפוס"  Pubmed  מאגר ה- ncbi.nlm.nih/sites/entrez

תצוגת התוצאות והקישור לטקסט מלאהאפשרות Display ,בצד שמאל מציעה צורות תצוגה שונות

מציגה את התמצית של המאמר Abstractבחירה באפשרות והקישור האפשרי לטקסט המלא, אם הוא בעיתון שלנו או

מוצע באופן חופשי. הדפסה: כל מאמר ניתן להדפסה מכל מחשב בספריה: על ידי

שליחה להדפסה למדפסת שבקומת הכניסה.

יש ללחוץ על סמל המדפסת PDF בפורמט שימו לב: ♥, ולא על סמל המדפסת של Acrobat Readerבתוכנת הדפדפן.

בהצלחה♥

  דרורה שיך עודה, ספריה רפואית ע"ש ברמן, האוניברסיטה העברית, ירושליםאפריל [email protected] , http://library.md.huji.ac.il