A-I – Základní informace o žádosti o akreditaci...A-I – Základní informace o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Univerzita Palackého v Olomouci Název součásti

A-I – Základní informace o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Univerzita Palackého v Olomouci

Název součásti vysoké školy: Přírodovědecká fakulta

Název spolupracující instituce: —

Název studijního programu: Molekulární a buněčná biologie,

Typ žádosti o akreditaci: schválení studijního programu

Schvalující orgán: Rada pro vnitřní hodnocení UP

Datum schválení žádosti:

• Akademický senát PřF UP – kladné vyjádření k návrhu studijního programu: 29. 1. 2020 • Vědecká rada PřF UP – schválení návrhu žádosti o udělení oprávnění uskutečňovat

studijní program: • Rada pro vnitřní hodnocení Univerzity Palackého v Olomouci – schválení žádosti o

udělení oprávnění uskutečňovat studijní program:

Odkaz na elektronickou podobu žádosti: UPShare: portal.upol.cz

Odkazy na relevantní vnitřní předpisy: UPShare: portal.upol.cz

ISCED F: 0511

B-I – Charakteristika studijního programu Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie Typ studijního programu navazující magisterský Profil studijního programu akademicky zaměřený Forma studia prezenční Standardní doba studia 2 Jazyk studia Český Udělovaný akademický titul Mgr. Rigorózní řízení Ano Udělovaný akademický titul RNDr. Garant studijního programu prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. et Ph.D. Zaměření na přípravu k výkonu regulovaného povolání

Ne

Zaměření na přípravu odborníků z oblasti bezpečnosti České republiky

Ne

Uznávací orgán

Oblast(i) vzdělávání a u kombinovaného studijního programu podíl jednotlivých oblastí vzdělávání v % Biologie, ekologie a životní prostředí

Cíle studia ve studijním programu Navazující program Molekulární a buněčná biologie poskytuje široké obecně biologické vzdělání se zaměřením na buněčnou biologii, genetiku, molekulární biologii, a molekulární toxikologii a farmakologii, dále disponuje znalostmi z mikrobiologie, biochemie a biotechnologií. Důraz je kladen na vysokou odbornou náplň studia a přímé propojení teoretických poznatků s jejich praktickým využitím. Absolvent je profilován k samostatné vysoce odborné práci na kvalitní metodické úrovni a s moderními instrumentálními prostředky. Je schopen vědecko-výzkumné činnosti v oboru a prezentace získaných výsledků na odpovídající odborné a formální úrovni; stejně tak komunikace se spolupracovníky.

Profil absolventa studijního programu Cílem studijního programu je příprava absolventa s hluboce specializovanými teoretickými znalostmi v navazujících oborech buněčné a molekulární biologie, zejména v oblasti molekulární genetiky, toxikologie a farmakologie. Důraz je kladen na vysokou odbornou náplň studia, absolvent je schopen propojit teoretické poznatky s jejich praktickým využitím, je schopen analyzovat problém, navrhnout metodické postupy a využití moderních instrumentálních prostředků vhodných k jeho řešení, a adekvátním způsobem vyhodnotit výsledky. Tyto znalosti a schopnosti dokáže aplikovat při studiu a analýze biologických vzorků různého původu a stupně komplexnosti. Absolvent Je schopen tvůrčího a týmového řešení problémů v rámci vědecko-výzkumné činnosti v oboru a prezentace získaných výsledků na odpovídající odborné a formální úrovni.

Pravidla a podmínky pro tvorbu studijních plánů Pravidla a podmínky pro tvorbu studijních plánů jsou v souladu s vnitřní normou R-B-17/07 Standardy pro institucionální akreditaci a standardy studijních programů na Univerzitě Palackého v Olomouci. Kreditový systém: ECTS.

Podmínky k přijetí ke studiu Uchazeči jsou přijímání na základě úspěchu ve složení písemného přijímacího testu z buněčné biologie, molekulární biologie a genetiky. Přijímací zkouška je promíjena studentům Molekulární a buněčné biologie, kteří ukončili bakalářský program s váženým studijním průměrem ≤ 1,5 a složili státní závěrečnou zkoušku s celkovým hodnocením ≤ 2.

Návaznost na další typy studijních programů Navazující magisterský program navazuje na bakalářský program Molekulární a buněčná biologie PřF UP v Olomouci, přijetí ke studiu se řídí podmínkami k přijetí ke studiu; platnými pro všechny uchazeče o studium. Na studijní program navazuje doktorský studijní program Molekulární a buněčná biologie PřF UP a další DSP UP.

B-IIa – Studijní plány a návrh témat prací (bakalářské a magisterské studijní programy) Označení studijního plánu Molekulární a buněčná biologie, NMgr.

Povinné předměty Název předmětu rozsah způsob

ověření počet kred.

vyučující dop. roč./sem.

profil. základ

KBB/DIPL1 Diplomová práce 1 91s Zp 7

vede semináře: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %), vedoucí DP

1ZS ZT

KBB/GENMK Genomika 26p Zk 3 přednášející: Ing. Hana

Šimková, CSc. (100 %) 1ZS PZ

KBB/MBBMI Molekulární biologie a genetika mikroorganismů

26p Zk 3

přednášející: prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (60 %), RNDr. Lucie Janovská, Ph.D. (40 %)

1ZS ZT

KBB/POS1EN Advanced Seminar 1 13s Zp 1

vede semináře: prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (100 %)

1ZS PZ

KBB/TOX Toxikologie 26p Zk 3

přednášející: doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100 %)

1ZS ZT

KBB/CVGEN Cvičení z genomiky 78c Zp 6

vede cvičení: Ing. Hana Šimková, CSc. (60 %), Mgr. Dana Šafářová, Ph.D. (40 %)

1LS PZ

LRR/CVPRO Cvičení z proteomiky 39c Zp 3

vede cvičení: Mgr. René Lenobel, Ph.D. (34 %), Mgr. Ivo Chamrád, Ph.D. (33 %), Mgr. Radim Simerský, Ph.D. (33 %)

1LS PZ

KBB/DIPL2 Diplomová práce 2 117c Zp 9

vede cvičení: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %), vedoucí DP

1LS PZ

KBC/MREG Metabolické regulace 26p Zk 3

přednášející: doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. (100 %)

1LS ZT

KBB/POS2 Pokročilý oborový seminář 2 13c Zp 1

vede semináře: prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (100 %)

1LS PZ

LRR/PRO Proteomika 26p Zk 3 přednášející: Mgr. René

Lenobel, Ph.D. (100 %) 1LS PZ

KBB/DIPL3 Diplomová práce 3 195c Zp 15

vede cvičení: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %), vedoucí DP

2ZS PZ

KBB/POS3EN Advanced Seminar 3 13s Zp 1

vede semináře: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %)

2LS PZ

KBB/DIPL4 Diplomová práce 4 325s Zp 25

vede semináře: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %), vedoucí DP

2ZS ZT

KBB/POS4 Pokročilý oborový seminář 4 13s Zp 1

vede semináře: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100 %)

2LS PZ

Podmínka pro splnění skupiny povinných předmětů: získání 84 kreditů

Povinně volitelné předměty - skupina 1 KBB/TOXL Legislativa toxikologie 13p Ko 1 přednášející: RNDr. Petr

Nádvorník, Ph.D. (100 %) 1ZS PZ

KBB/ENVTX Environmentální toxikologie 26p Zk 2

přednášející: prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (100 %)

1ZS ZT

KBB/MOLEK Molekulární ekologie 26p Zk 3

přednášející: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. (50 %), RNDr. Miloslav Kitner, Ph.D. (50 %)

1ZS PZ

KBB/IPRP Izolace a purifikace rekombin. proteinu

39s Zp 3 vede semináře: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. (100 %) 1ZS PZ

KBB/PCMTS Prakt. cv. z moder. technik studia buňky

26c Zp 2 vede cvičení: Mgr. Aneta Grycová, Ph.D. (100%) 1ZS PZ

KBB/VMSBP Vybrané metody studia buněčných procesů

39s Ko 3 vede semináře: Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D. (100%) 1ZS PZ

KBB/ANGEN Anatomie genomu 26p Zk 3

přednášející: prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. (100 %)

1LS ZT

KBB/FATOX Forenzní analytická toxikologie

26p Zk 2

přednášející: doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (25 %), Mgr. Barbora Sokolová, Ph.D. (75 %)

1LS ZT

KBB/MOLFA Molekulární farmakologie 26p Zk 2

přednášející: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (25 %), PharmDr. Lenka Zemánková, Ph.D. (75 %)

1LS PZ

KBB/MOLTX Molekulární toxikologie 26p Zk 2

přednášející: prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (100 %)

1LS ZT

LRR/BUCY Buněčný cyklus a apoptóza 26p Zk 3

přednášející: doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D. (100 %)

ZS ZT

KBB/EPIG Epigenetika 26p Zk 3

přednášející: Privat. doc., Mgr. Aleš Pečinka, Ph.D. (100 %)

ZS ZT

KBB/MTSB Moderní techniky studia buňky

13p Ko 2

přednášející: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (25 %), Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D. (75 %)

ZS ZT

KBC/PBM Pokročilé biochemické metody

26p Zk 3

přednášející: Véronique Hélene Bergougnoux-Fojtík, Ph.D.(35 %), prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D.(8 %), Mgr. David Kopečný, Ph.D. (8 %), Mgr. René Lenobel, Ph.D. (16 %), doc. RNDr. Petr Tarkowski, Ph.D. (8 %), Mgr. David Zalabák, Ph.D.(25 %)

ZS PZ

LRR/BCHM Biochemické markery 26p Ko 2 přednášející: Mgr. Karel

Doležal, Dr. (100 %) ZS PZ

KBB/GCPSB Genetika člověka 26p Ko 2

přednášející: doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100 %)

LS ZT

KBB/GCCSB Cvičení z genetiky člověka 13c Zp 1

vede cvičení: doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100 %)

LS PZ

KBC/BPOL Struktura a funkce biomakromolekul

26p Zk 3 přednášející: prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D. (100 %)

LS PZ

KBC/CGI Klonování a genové inženýrství

26p+13s Ko 3

přednášející a vede semináře: dr. Bergougnoux-Fojtík V. (50%), Mgr. David Zalabák, Ph.D.(50 %)

LS PZ

KBC/ENZ Enzymologie 26p Zk 3

přednášející: doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. (25 %), Mgr. Mária Škrabišová, Ph.D. (75 %)

LS ZT

Podmínka pro splnění této skupiny předmětů: získání nejméně 24 kreditů

Součásti SZZ a jejich obsah Státní závěrečná zkouška se skládá ústně ze tří povinných a jednoho povinně volitelného předmětu, a obhajoby diplomové práce. Povinné SZZ: KBB/OBHDP – Obhajoba diplomové práce Obhajoba vypracované diplomové práce. KBB/SZZGE - Genomika Genetické mapování – mapování vazebné a asociační, genetické markery, mapovací populace, genetické mapování u člověka. Fyzické mapování, mapování cytogenetické, optické, mapování pomocí radiačních hybridů, fyzické kontigové mapy, integrace fyzických a genetických map. Izolace genů metodou pozičního klonování, využití syntenie. Celogenomové sekvenování – strategie a postup, sekvenační technologie nové generace, sestavování a anotace sekvencí. Identifikace polymorfismů (SNP) a genotypizace, vysokokapacitní systémy pro analýzu genotypu. Transkriptomika – analýza transkriptomu pomocí mikročipů a sekvencování. Funkční genomika – metody přímé a reverzní genetiky. Genomové projekty prokaryot, rostlin, živočichů a člověka. KBB/SZZPR - Proteomika Proteomika, peptidomika – cíle oboru, komplexita a dynamičnost proteomu. Strategie analýzy peptidů a proteinů – principy, rozdíly, využití. Základní postupy přípravy vzorků, vysvětlení důvodů použití. Metody prefrakcionace komplexních směsí proteinů. Elektroforetické metody analýzy proteinů - isoelektrická fokusace; nativní, denaturační a redukující elektroforéza; dvoudimenzionální elektroforéza. Štěpení proteinů pro identifikaci pomocí MS metod. Multidimenzionální techniky identifikace peptidů a proteinů. Hmotnostní spektrometrie – základní procesy v MS, ionizační techniky ESI, MALDI, OrbiTrap, tandemové hmotnostní analyzátory. Metody excitace a fragmentace peptidů. Interpretace hmotnostních spekter v proteomice. Metody identifikace peptidů a proteinů. Interpretace MS dat v proteomice, databázové vyhledávací algoritmy pro identifikace peptidů a proteinů, zdroje a typy databází. Kvantifikace v proteomice – přístupy, techniky a jejich aplikace. KBB/SZZBB - Biologie rostlinné a živočišné buňky Buňka, vnitrobuněčné kompartmenty, cytoskelet. Struktura membrán a přenos látek přes membrány (iontové kanály-Na/K-pumpa, transportní proteiny-P-glykoprotein). Komunikace mezi buňkami, membránové a intracelulární receptory (7 transmembránové receptory, receptory spřažené s G-proteiny, steroidní receptory – GR, TR, ER). Výměna látek, přenos energií. Metabolismus – enzymy a enzymová katalýza, allosterie (laktátdehydrogenasa, aspartátkarbomoylasa); regulace metabolismu (zymogeny, exprese, zpětná vazba); metabolismus sacharidů, lipidů, nukleových kyselin, proteinů a porfyrinu. Energetický metabolismus - zisk energie – ATP, oxidativní fosforylace, fotosyntéza. Metabolické dráhy, tkáňová a orgánová lokalizace metabolických drah. Komunikace a regulace na úrovni organismu. Buněčný cyklus a jeho kontrolní body, mitogenní signalizace, cytokinetický aparát a jeho organizace. Onkogeny, tumor supresorové geny. Povinně volitelné SZZ (student volí jeden předmět): KBB/SZZMT - Molekulární toxikologie Orgánově specifická toxicita – hepatotoxicita, hematotoxicita, nefrotoxicita, neurotoxicita, dermální toxicita, endokrinní toxicita. Mutageneze, karcinogeneze, teratogeneze. Absorbce, distribuce, metabolismus a eliminace cizorodých látek – xenobiotik. Matematický popis chování látek v těle – toxikokinetika. Regulace biotransformace – jaderné receptory. Toxicita kovů, environmentálních polutantů, přírodních látek – cannabinoidy, opiáty.

Radioaktivita. Akutní a chronická toxicita. Vyšetřovací metody v toxikologii. Legislativa pro nebezpečné chemické látky, látky návykové a jejich odpady. KBB/SZZGM - Molekulární genetika Klasifikace prokaryotního, eukaryotního a virového genomu, jejich struktura a velikost. Viry, replikace a exprese jejich genomu. Molekulárně-biologické pochody reprodukčního cyklu virů. Genetické a negenetické interakce mezi viry, evoluce virů a nové viry. Genom prokaryot, bakterie, archea, prokaryontní chromozomy, plazmidy, replikace a exprese prokaryotního genomu. Genetická variabilita bakterií, horizontální přenos genů, mobilní genetické elementy, rezistence bakterií vůči antibiotikům. Genom eukaryot, endosymbióza a původ eukaryot. Genomy mitochondrií a plastidů. Molekulární genetika kvasinek. Buněčné jádro, chromatin, uspořádání chromozómů v jádře, jadérko a jaderná tělíska. Změny kondenzace chromatinu a regulace genové exprese, Histonový kód, epigenetické změny a jejich mechanismy, umlčování retroelementů. Uspořádání genů v genomu, genové ostrovy a pouště, genomické izolátory, konzervované nekódující sekvence DNA. Distribuce repetitivních sekvencí DNA v genomu a jejich evoluce. Stabilita a variabilita genomů, kolinearita, syntenie, evoluce genovou duplikací, paralogní a ortologní geny. Struktura chromozomů eukaryot a jejich funkční domény. Typy chromozomů, změny počtu chromozomů, polyploidizace a mezidruhová hybridizace. Další studijní povinnosti —

Návrh témat kvalifikačních prací a témata obhájených prací

Plná znění diplomových prací jsou dostupná v rámci databáze Theses (http://www.theses.cz) nebo v rámci interní databáze UP – Stag. Vliv vybraných ATP-kompetitivních inhibitorů mTOR kinázy na signalizaci aryluhlovodíkovým receptorem (AhR) Studium rezistence vybraných mikroorganismů k antimikrobiálním látkám. Studium subpopulací imunitních buněk v bronchoalveolární lavážní tekutině a plicních biopsií u pacientů po transplantaci plic. Studium meiotických rekombinací u pšenice. Molekulární charakteristika Little cherry virus 1 v genových zdrojích meruněk. Molekulární detekce vybraných bodových mutací odpovědných za rezistenci k pyrethroidům v genu pro sodíkový kanál kleštíka včelího (Varroa destructor).

Návrh témat rigorózních prací a témata obhájených prací

Vliv kyslíku na růst anaerobních patogenních baktérií. Využití průtokové cytometrie v hematoonkologii. Buněčné základy imunitní odpovědi hostitele na experimentální infekci Francisella tularensis. Součásti SRZ a jejich obsah Státní rigorózní zkouška se skládá z ústní zkoušky a obhajoby rigorózní práce. Pravidla pro konání rigorózního řízení a udělování titulu "RNDr." upřesňuje Rigorózní řád Univerzity Palackého v Olomouci. Povinné předměty ústní rigorózní zkoušky: Molekulární biologie a genetika Struktura a funkce nukleových kyselin a bílkovin. Mechanismus replikace. Exprese genetické informace a její regulace. Molekulární podstata mutace, reparace DNA a ochrana nukleových kyselin před poškozením. Molekulární model crossing-overu, místně specifické rekombinace a genové konverze. Genomy prokaryot a eukaryot. Jaderný, mitochondriový a plastidový genom. Chromatin – typy chromatinu. DNA, histonové a nehistonové proteiny. Chromozóm. Klasifikace sekvencí DNA v genomu. Genové sekvence, repetitivní sekvence DNA, mobilní genetické elementy. Změny velikosti jaderného genomu, Fylogenetická analýza na úrovni genomů. Epigenetická dědičnost. Proměnlivost a genetická variabilita organismů. Knihovny DNA, jejich typy a konstrukce. Molekulární markery, jejich typy a izolace. Genetické a fyzické mapy, jejich konstrukce. Sekvenování DNA, fragmentační analýzu DNA, techniky hybridizace a značení nukleových kyselin, PCR, klonování a přípravu rekombinantních DNA, transgenní organismy, genová terapie.

http://www.theses.cz/

Buněčná biologie Struktura prokaryotní a eukaryotní buňky. Organizace rostlinné a živočišné buňky. Membránový princip funkční organizace buňky. Mechanismy transportu látek přes membrány. Membránové domény. Cytoskeletální proteiny a proteiny s nimi asociované, organizace a regulace dynamiky cytoskeletu. Buněčný cyklus a jeho regulace. Mitotický aparát v jednotlivých typech eukaryontních buněk, regulační aspekty jeho organizace. Buněčné dělení, regulace organizace cytokinetického aparátu u hlavních typu eukaryontních organizmů. Charakter a význam buněčné signalizace. Programovaná smrt buněk. Od buněk k tkáním a pletivům, prostorová paměť buňky, polarita. Kultivace buněk. Základní metody studia buněk. Specializovaný volitelný předmět ústní rigorózní zkoušky a) Genomika Mutace a polymorfizmus sekvencí DNA. Strategie mapování genomů. Genetické mapy. Fyzické mapy s malým, středním a velkým rozlišením. Izolace genů. Metody používané při fyzickém mapování. Projekty zaměřené na sekvenování celých genomů. Strategie sekvenování, „shot-gun“ strategie, „clone-by-clone“ strategie. Sekvenování genomů prokaryot a eukaryot. Anotace sekvencí DNA. Bioinformatika, databáze sekvencí DNA, počítačové programy, využití internetu. Syntenie a kolinearita. Komparativní genomika. Určování funkce genů. Funkční genomika, cDNA knihovny, DNA arrays a DNA čipy, jejich příprava a využití. b) Molekulární biologie a genetika mikroorganismů Velikost, struktura a klasifikace mikroorganismů genomu. Genom bakterií a archea, molekulárně genetické principy replikace a exprese prokaryotního genomu. Zdroje genetické variability bakterií a jejich molekulární mechanismy. Molekulární genetika kvasinek, buněčný cyklus, parasexualita, signální dráhy, regulace genové exprese, homologní rekombinace. Viry – genetické elementy. Strategie replikace a exprese virového genomu. Molekulárně-biologické pochody reprodukčního cyklu virů. Genetické a negenetické interakce mezi viry. Molekulární aspekty interakce virus-hostitel. Modelové organismy a jejich využití. c) Molekulární a buněčná biologie rostlin Genomy modelových druhů rostlin. Mapování a studium funkce genů. Reprodukce rostlin. Indukce kvetení, genetická a molekulární analýza vývoje květu, vznik gamet, opylování, tvorba semen, klíčení. Senescence a programová smrt rostlinné buňky. Reakce rostlin na biotický a abiotický stres. Mechanismus regulace transportu K+ v rostlinné buňce. d) Molekulární toxikologie Orgánově specifická toxicita. Mutageneze, karcinogeneze, teratogeneze. Absorbce, distribuce, metabolismus a eliminace xenobiotik. Matematický popis chování látek v těle – toxikokinetika. Regulace biotransformace. Toxicita kovů, environmentálních polutantů, přírodních látek. Radioaktivita. Akutní a chronická toxicita. Vyšetřovací metody v toxikologii. Legislativa pro nebezpečné chemické látky, látky návykové a jejich odpady.

B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/ANGEN - Anatomie genomu Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence

Způsob ověření studijních výsledků

Zkouška Forma výuky Přednáška

Forma způsobu ověření studijních výsledků a další požadavky na studenta

Kombinovaná Písemný test, min 75%

Garant předmětu prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující prof. Ing. Jaroslav Doležel, DrSc. (100%) Stručná anotace předmětu Předmět studia, chromozomální teorie dědičnosti, DNA jako nositelka dědičné informace, struktura DNA, genetický kód, genom eukaryot a prokaryot, velikost genomu, typy sekvencí DNA v genomu Strukturní geny a geny kódující funkční RNA, transkripce, introny a exony, původ intronů, alternativní sestřih, repetitivní sekvence DNA, biologický význam repetitivních sekvencí a jejich patogenicita. Genom prokaryot, eubakterie a archebakterie, příklady sekvenovaných prokaryot. Genom eukaryot, genomy mitochondrií a plastidů, buněčné jádro, chromatin, chromozomální domény, uspořádání chromozómů v jádře, jaderná tělíska, místa replikace DNA. Histonový kód, změny kondenzace chromatinu a regulace genové exprese, umlčování retroelementů, role RNA interference, genomické izolátory. Funkční domény chromozómů, centroméra, neocentroméra, sekundární konstrikce, nukleolární dominance, teloméra, vznik nové teloméry. Pohlavní chromozómy, evoluce pohlavních chromozómů, regulace dávky genů, B chromozómy, imprinting. Izochory, uspořádání genů v genomu, genové ostrovy a pouště, konzervované nekódující sekvence DNA, distribuce repetitivní DNA v genomu, stabilita a variabilita genomů. Evoluce genomů, kolinearita a syntenie, evoluce genovou duplikací, paralogní a ortologní geny, polyploidizace, mezidruhová hybridizace, evoluce repetitivních sekvencí DNA. Poznatky získané sekvenování celých genomů živočichů a rostlin. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Allis ,C.D., Jenuwein, T., Reinberg, D., Caparros, M.L. Epigenetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2007. ISBN 13: 978-0-87969-7. Lewin, B. Genes VII.. Oxford University Press, Oxford, 2000. Snustad, D.P., Simmons, M.J. Genetika. Masarykova Univerzita, Brno, 2009. Brown, T.A. Genomes. John Wiley and Sons, Inc., New York, 1999.. Leitch, I. J., Greilhuber, J., Doležal, J., & Wendel, J. F. Plant genome diversity. Wien: Springer, 2013. ISBN 978-3-7091-1159-8. Gregory, T.R. The Evolution of the Genome. Elsevier, Amsterdam, 2005. Lynch, M. The Origins of Genome Architecture. Sinauer Associates. Inc. Publishers, Sunderland, 2007. Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústí nad Labem, 2000.

Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/CVGEN - Cvičení z genomiky Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 78c hod. 78 kreditů 6 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zápočet Forma výuky cvičení


Kombinovaná 100% účast, vypracování protokolů provedených experimentů a jejich vyhodnocení

Garant předmětu Ing. Hana Šimková, CSc. Zapojení garanta do výuky předmětu

Cvičení (60%)

Vyučující Mgr. Dana Šafářová, Ph.D. (40%), Ing. Hana Šimková, CSc. (60%) Stručná anotace předmětu Klonování DNA a analýza bakteriálních klonů. Příprava a analýza BAC-ové knihovny. Kvantitativní PCR, detekce patogenních mikroorganismů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Praktické návody pro cvičení (e- zdroje, web katedry) Brdička, R. Lidský genom na rozhraní tisíciletí. Grada Publishing, Praha, 2001. Cantor, C.R., Smith, C.L. Genomics: The Science and Technology Behind the Human Genome Project, John Wiley and Sons, New York, 1999. Cullis, C.A. Plant Genomics and Proteomics. John Wiley and Sons, Inc., New York, 2004. Primrose, S.B. Principles of Genome Analysis: A guide to mapping and sequencing DNA from different organisms. Blackwell Science Inc., 1998.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/DIPL1 - Diplomová práce 1 Typ předmětu Povinný/ZT doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 91s hod. 91 kreditů 7 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zápočet Forma výuky seminář


Kombinovaná

Garant předmětu prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. Zapojení garanta do výuky předmětu

Semináře (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%), vedoucí diplomových prací Stručná anotace předmětu Teoretická příprava na řešení diplomové práce – volba tématu diplomové práce, vyhledání a studium literárních zdrojů. Návrh řešení problému, stanovení rámcových a dílčích cílů, jejich diskuse s vedoucím práce. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím práce.

Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) 0 hodin Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/DIPL2 - Diplomová práce 2 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 117c hod. 117 kreditů 9 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná


Cvičení (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%), vedoucí diplomových prací Stručná anotace předmětu Experimentální řešení problematiky diplomové práce. Průběžná analýza výsledků. Dosažení dílčích cílů. Upřesňování řešení v závislosti na postupu prací. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím práce.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/DIPL3 - Diplomová práce 3 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 2/ZS Rozsah studijního předmětu 195c hod. 195 kreditů 15 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zápočet Forma výuky Cvičení


Kombinovaná


Cvičení (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%), vedoucí diplomových prací Stručná anotace předmětu Experimentální řešení problematiky. Průběžná analýza výsledků. Dosažení dílčích cílů. Upřesňování řešení v závislosti na postupu prací. Kontrola dosažení rámcových cílů a dokončení experimentů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím práce.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/DIPL4 - Diplomová práce 4 Typ předmětu Povinný/ZT doporučený ročník / semestr 2/LS Rozsah studijního předmětu 325s hod. 325 kreditů 25 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, vypracovaná závěrečná práce


Semináře (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%), vedoucí diplomových prací Stručná anotace předmětu Teoretická analýza získaných experimentálních dat, sepsání vlastní diplomové práce.

Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím práce.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/ENVTX - Environmentální toxikologie Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, písemný test, min. 70%

Garant předmětu prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Environmentální toxikologie představuje moderní, multidisciplinární obor, který se zabývá všemi aspekty působení environmentálních polutantů na organismy a ekosystémy. Program kurzu je zaměřen především na poskytnutí přehledu mechanismů působení toxických environmetálních faktorů na lidský organismus a obratlovce, ale zároveň poskytuje přehled základních metodik používaných v environmentální toxikologii pro testování toxicity a studium tvorby, transportu a akumulace environmentálních polutantů. Součástí kurzu je také popis rizik spojených s expozicí základním skupinám environmentálních polutantů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Josephy P.D. a Mannervik B. (2006). Molecular toxicology. Oxford University Press. Landis, W.G. (2011). Introduction to environmental toxicology: molecular substructures to ecological landscapes. CRC Press.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/EPIG – Epigenetika Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr /ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zkouška Forma výuky přednáška


Ústní zkouška v rozsahu probírané látky

Garant předmětu Privat. Doc., Mgr. Aleš Pečinka, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující Privat doc., Mgr. Aleš Pečinka, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Epigenetiku definujeme jako mitoticky a/nebo meioticky děděné změny genové exprese, ke kterým dochází beze změny primární genetické informace (tedy beze změny sekvencí nukleotidů v DNA). Epigenetika je také charakterizována jako tzv. chromatinová dědičnost, neboť bylo prokázáno, že je způsobena (či lépe provázena) strukturními i chemickými modifikacemi chromatinu -především DNA a nukleosomálních histonů. Řadu epigenetických fenoménů provází nemendelistická dědičnost. To znamená, že epigeneticky řízené lokusy se zpravidla vyznačují neúplnou penetrancí a variabilní expresivitou. Klasickým příkladem nestabilního (mozaikového) fenotypu je tzv. poziční efekt u octomilky, kdy exprese genu odpovídající za barvu očního pigmentu se může podrobovat epigenetickému umlčování vlivem sousedního heterochromatinu. Jiným dobře popsaným epigenetickým jevem jsou paramutace u kukuřice, kdy dochází k dědičné změně exprese jedné alely vlivem druhé. Od 80. let 20. století došlo s nástupem technik molekulární biologie k objasnění základních mechanismů řady epigenetických jevů - např. genomového imprintingu u placentálních savců a krytosemenných rostlin, paramutací nebo epigenetického umlčování transposonů a transgenů. Předmět Epigenetika podává kritický rozbor těchto fenoménů s důrazem na vývojové, šlechtitelské a biomedicínské aspekty. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Allis,C.D., Jenuwein, T., Reinsbers, D., Caparros, M.L. (2007). Epigenetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Mozgova, I., Hennig L. (2015). The Polycomb Group Protein Regulatory Network. Annual Review of Plant Biology 66:269-296. Pecinka, A., Chevalier, C., Colas, I., Kalantidis, K., Varotto, S., Krugman, T., Michailidis, C., Vallés, M.-P., Munoz, A., Pradillo, M. (2019). Chromatin dynamics during interphase and cell division: similarities and differences between model and crop plants. Vyskot, B. (2010). Epigenetika. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/FATOX - Forenzní analytická toxikologie Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zkouška Forma výuky Přednášky


Kombinovaná Písemný test, min. 70%

Garant předmětu doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující Mgr. Barbora Sokolová, Ph.D. (75%), doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (25%) Stručná anotace předmětu V úvodních přednáškách je posluchač nejprve seznámen s historií toxikologie a podobory toxikologie s hlavním zaměřením na klinickou a forenzní toxikologii. Je vysvětlen jak účinek xenobiotik a jejich mechanismy na molekulární úrovni (farmakodynamika), tak osud xenobiotik v organismu zaměřený na časový průběh koncentrací xenobiotik a jejich metabolitů (farmakokinetika, resp. toxikokinetika). V následující systematické části jsou probírány jednotlivé skupiny omamných a psychotropních látek, významné noxy v akutních intoxikacích v současnosti z hlediska klinické a forenzní toxikologie, předávkování léčivy a návykovými látkami, abuzus. Posluchač je seznámen s laboratorní toxikologickou diagnostikou (systematická toxikologická analýza při identifikaci neznáme noxy, interpretace nálezu). V závěru kurzu jsou probírány základní legislativní normy. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Balíková, M. (2017). Forenzní a klinická toxikologie. Galén Praha. Dostálek, M. (2006). Farmakokinetika. Grada Publishing, Praha. Katzung B. G. (2006). Základní a klinická farmakologie. H&H. Lüllmann, H., Mohr, K., Wehling, M. (2002). Farmakologie a toxikologie. Grada Publishing., Praha.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/GCCSB - Cvičení z genetiky člověka Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr /LS Rozsah studijního předmětu 13c hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná 100% účast na cvičeních, vypracování protokolů, test min. 60%


Cvičení (100%)

Vyučující doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Zásady bezpečnosti práce v laboratoři. Izolace DNA z bukální sliznice a z vlasů. Stanovení koncentrace vyizolované DNA. End-point PCR. Elektroforetická separace amplikonů. Detekce amplikonů a analýza výsledků. Příklady na dědičnost z rodokmenů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Choi Hyun-Jung. (2008). DNA fingerprinting using PCR: a practical forensic science activity. Journal of Biological Education. Brdička, R. Lidský genom na rozhraní tisíciletí. Grada Publishing, Praha, 2001. Bryšová V. a kol. Základy klinické genetiky. MU, Brno, 1995. Kapras, J. et al. (1996). Kapitoly z lékařské biologie a genetiky. Praha, UK Karolinum. Mueller, F.M., Young, I.D. (2001). Emeryś Elements of Medical Genetics. Churchill Livingstone. Schaaf, Christian P. (2012). Human Genetics: From molecule to medicine. Lippincott Wiliams and Wilkins, Baltimore. Sršeň, Sršňová. Základy klinickej genetiky. Osveta, Martin, 2005. Thompson, J. and Thompson, M. (2001). Genetics in Medicine. W.B. Saunders Company.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/GCPSB - Genetika člověka Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr /LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Kolokvium Forma výuky přednáška


Kombinovaná Písemný test min. 60% + seminární práce


Přednášky (100%)

Vyučující doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Historie genetiky, úkoly, konzultace, testování (prenatální diagnostika), léčba genetických poruch. Chromosomy analýza, chromosomové aberace. Mendelistické zákony dědičnosti. Dědičnost vázaná na pohlaví. Asistovaná reprodukce. Genetika mitochondriálních chorob. Molekulární genetika svalových nemocí. Molekulární genetika neurologických nemocí. Molekulární genetika oka. Genetika imunity. Genetika chování, etika vs. genetika. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Brooker. (2014). Analysis and Principles. McGraw-Hill Education, 5 th edition. Hatina, J., Sykes, B. Lékařská genetika, problémy a přístupy. Academia Praha, 1999. Kingston, H. M. ABC of Clinical Geneteics. 3rd edition, BMJ Books 2002. Kočárek E., Pánek M., Novotná D. (2006). Klinická cytogenetika I. Skriptum UK 2. LF, Karolinum, Praha. Lewin B., Krebs J.E., Goldstein E.S., Kilpatrick S.T. Lewin's GENES XI. Lewis R. (2010). Human Genetics, Concepts and Aplications, 9th edition. The McGraw-Hill Companies. Pasternak J. J. An Introduction to human molecular genetics - Mechanisms of inherited diseases, 2nd edition, A John Wiley and Sons, Inc., 2005. Pierc B.A. (2014). Genetics: A Conceptual Approach, 5th edition. W. H. Freeman. Snustad D. P., Simmons M. J. (2009). Genetika. Masarykova univerzita, Brno, 1. vydání. Strachan, T., Read A. (2011). Human molecular genetics. Garland Science, Taylor & Francis Group, LLC.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/GENMK – Genomika Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zkouška Forma výuky přednášky


ústní zkouška v rozsahu probírané látky

Garant předmětu Ing. Hana Šimková, CSc. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující Ing. Hana Šimková, CSc. (100%) Stručná anotace předmětu Genetické mapování vazebné a asociační. Mapovací populace, genetické mapování u člověka. Genetické markery, vysokokapacitní markerové systémy. Molekulární fyzické mapy - mapování pomocí panelu radiačních hybridů, fyzické kontigové mapy, optické mapy, mapování založené na zachycení konformace chromatinu (3C metody). Strategie celogenomového sekvenování - redukční přístupy, hierarchické sekvenování, celogenomové neuspořádané (shotgun) sekvenování. Sekvenační technologie nové generace. Postup sestavování genomové sekvence, anotace sekvencí.Studium diverzity - jednonukleotidové polymorfismy (SNP), jejich identifikace a genotypizace, vysokokapacitní platformy. Analýza transkriptomu pomocí mikročipů a sekvenování RNA (RNAseq), analýza dat.Fuknkční genomika - metody přímé a reverzní genetiky, identifikace regulačních sekvencí, analýza struktury chromatinu.Identifikace genů metodou pozičního klonování, využití syntenie.Významné genomové projekty. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Birren a kol. (1997). Genome analysis - Mapping Genomes. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Brdička, R. Lidský genom na rozhraní tisíciletí. Grada Publishing, Praha, 2001. Cantor, C.R., Smith, C.L. Genomics: The Science and Technology Behind the Human Genome Project, John Wiley and Sons, New York, 1999. Cullis, C.A. Plant Genomics and Proteomics. John Wiley and Sons, Inc., New York, 2004. Gibson, G., Muse, V.S. (2004). A Primer of Genome Science. Sinauer Associates, Inc., Sunderland. Hunt, S. P., Livesey, F. Functional Genomics: A Practical Approach. Oxford University Press, Oxford, 2000. Meksem, K., Kahl, G. (2005). The Handbook of Plant Genome Mapping. Wiley-VCH Verlag, Weinheim. Primrose, S.B. Principles of Genome Analysis: A guide to mapping and sequencing DNA from different organisms. Blackwell Science Inc., 1998. Rashidi, H.H., Buehler, L.K. Bioinformatics Basics. CRC Press, Boca Raton, 2000.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/IPRP - Izolace a purifikace rekombinantního proteinu Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 39s hod. 39 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná

Garant předmětu RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Semináře (100%)

Vyučující RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Izolace a purifikace rekombinatní bakteriální Taq DNA polymerázy.

Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Šmarda, J., Doškař, J., Pantůček, R., Růžičková, V., & Koptíková, J. (2005). Metody molekulární biologie. Brno: Masarykova univerzita. Alberts, B., Bray, D., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (2000). Základy buněčné biologie. Espero Publishing, Ústi nad Labem. Sambrook, J., Russell, D.W. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. (3rd edition). Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/MBBMI - Molekulární biologie a genetika mikroorganismů Typ předmětu Povinný/ZT doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní ústní zkouška v rozsahu náplně přednášek (3 náhodně zvolené otázky)

Garant předmětu prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (60%)

Vyučující RNDr. Lucie Janovská, Ph.D. (40%), prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (60%) Stručná anotace předmětu Organizace a komplexita virového genomu. Virové quasi-species. Životní cyklus virů: vstup viru do buňky, strategie replikace a exprese virového genomu, skládání a zrání virových částic, uvolnění viru z buňky. Genetické a negenetické interakce mezi viry. Původ a evoluce virů. Struktura a komplexita genomu bakterií a archeí. Mutace u bakterií. Horizontální přenos genů: transformace, konjugace, transdukce. Binární dělení prokaryotních buněk. Exprese genetické informace. Geny podílející se na sporulaci a tvorbě biofilmu. Mechanismy rezistence k antibiotikům Genom kvasinek. Saccharomyces cerevisiae - molekulárně-biologický a genetický modelový organizmus: buněčný cyklus a jeho regulace, reprodukce kvasinek: pohlavní a nepohlavní strategie. Tetrádová analýza, komplementační test, disrupční kazety, vektory, in vivo expresní systémy. Patogenní kvasinky. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Lewin, B. Genes IX. Sudbury, Mass: Jones and Bartlett, 2008. ISBN 9780763740634. Snustad, D.P., Simmons, M.J. Genetika. Masarykova Univerzita, Brno, 2017. ISBN 978-80-210-8613-5. Snustad, D.P., Simmons, M.J. Genetika. Masarykova Univerzita, Brno, 2009. ISBN 978-80-210-4852-2. Šipický M., Šubík J. Genetika kvasiniek.. Veda, Vydavaťelstvo SAV, Bratislava, 1992. Guthrie C., Fink G.R. Guide to Yeast Genetics and Molecular Biology, Parts A, B, and C.. Methods in Enzymology Vol. 194 (1991), 350 (2002), 351 (2002). Academic Press - Elsevier, 1991. Griffiths, A. et al. Introduction to genetic analysis.. W.H. Freeman and Company, New York, 2005. Navrátil M., Navrátilová L., Válová P. Kapitoly z molekulární biologie a genetiky mikroorganizmů. Vydavatelství UP, Olomouc, 2015. Cann, A.J. Principles of Molecular Virology.. Elsevier Ltd, 2001. Rosypal S. Úvod do molekulární biologie, I., II., III. a IV. díl. Brno, 1997.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/MOLEK - Molekulární ekologie Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní ústní zkouška v rozsahu přednášek


Přednášky (50%)

Vyučující RNDr. Miloslav Kitner, Ph.D. (50%), RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. (50%) Stručná anotace předmětu Informační makromolekuly (RNA, DNA, proteiny, polysacharidy), základní postupy odběru a přepravy vzorků pro analýzu z terénu do laboratoře, metody extrakce a uchování informačních makromolekul, principy jejich elektroforetické separace. Základní techniky molekulární biologie, PCR, typy molekulárních markerů (kodominantní, dominatní markery, isozymy, RFLP, RAPD, AFLP, mikrosatelity, SNP polymorfismy, sekvenace, NGS) a základní techniky analýzy genetické variability (indexy genetické variability, faktory ovlivňující genetickou diverzitu). Základní pojmy genetiky populací, měření variability v populacích, Hardy-Weinbergův princip, ustavování rovnováh, disperzní síly narušující rovnováhy (migrace, mutace, selekce, drift, inbríding, asortativní oplození). Genetika a pohlaví, způsoby determinace pohlaví, genetická determinace pohlaví, systémy s odchylkou pohlaví od poměru 1:1, sociální hmyz, determinace pohlaví u ptáků (CHD geny). Evoluce a migrace člověka, eugenické a dysgenické události v jeho vývoji. Moderní eugenická opatření a dysgenické faktory. Rozdíly a charakteristiky ras a etnik. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Kantartzi, S. K. (2013). Microsatellites: methods and protocols. New York, N.Y: Humana Press. Alberts, B., Wilson, J. & Hunt, T. (2015). Molecular biology of the cell. New York, N.Y: Garland Science. Freeland J. R. (2005). Molecular Ecology. John Wiley & Sons. Krebs, J. E., Goldstein, E. S. & Kilpatrick, S. T. (2014). Lewin's genes XI. Burlington, Mass: Jones & Bartlett Learning. Navrátil M., Navrátilová B., Válová P. (2015). Kapitoly z molekulární biologie a genetiky mikroorganismů. Olomouc. Rozšiřující literatura: Wessner, D. R., Dupont, C. & Charles, T. (2013). Microbiology. Hoboken, N.J: Wiley.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/MOLFA - Molekulární farmakologie Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Písemná test v rozsahu přednášek min. 70%


Přednášky (25%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (25%), PharmDr. Lenka Zemánková, Ph.D. (75%)

Stručná anotace předmětu Úvod do terminologie farmakologie. Strukturální faktory a fyzikálně-chemické vlastnosti léčiv, jejich význam pro účinek léčiv. Farmakokinetika, základní procesy (absorpce, distribuce, metabolismus a exkrece léčiv), fyziologické bariéry distribuce, faktory ovlivňující farmakokinetiku, základní farmakokinetické parametry. Farmakodynamika, mechanismy působení léčiv, lékové interakce, nežádoucí a toxické účinky, preklinické a klinické zkoušení léčiv. Strukturální a funkční rodiny receptorů, interakce léčiv s molekulárními cíli, molekulární dráhy, kvantifikace účinků. Hlavní molekulární aspekty působení vybraných farmakoterapeutických skupin. Antibiotická rezistence a antibiotická politika. Biologická léčba. Genová terapie. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Lüllmann, H., Mohr, K., Hein, L., Wirth, J., & Wenke, M. Barevný atlas farmakologie. Praha: Grada, 2012. ISBN 978-80-247-3908-3. Katzung, B. G., Masters, S. B., & Trevor, A. J. Basic & clinical pharmacology. New York, N.Y: McGraw-Hill, 2012. ISBN 978-0-07-176401-8. Fusek, M., Vítek, L., Blahoš, J., Hajdúch, M., & Ruml, T. Biologická léčiva: teoretické základy a klinická praxe. Praha: Grada, 2012. ISBN 978-80-247-3727-0. Lincová, D., & Farghali, H. Základní a aplikovaná farmakologie. Praha: Galén, 2007. ISBN 9788072623730.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/MOLTX - Molekulární toxikologie Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence





Garant předmětu prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující prof. RNDr. Jan Vondráček, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Molekulární toxikologie je obor toxikologie, který je primárně zaměřen na studium molekulárních a buněčných odpovědí, které zprostředkovávají vlastní toxicitu analyzovaných látek. Výsledky těchto analýz přispívají nejen k popisu základních mechanismů toxicity, ale zároveň umožňují porozumět systémovým dopadům toxického působení studovaných látek, které je nezbytné pro analýzu rizik a kontrolu ohrožení. Moderní studia molekulární toxikologie také pomáhají identifikovat řadu fyziologických mechanismů regulace buněčných funkcí, které jsou základem složitých interakcí chemikálií a biologických faktorů v organismu. Hlavním cílem tohoto kurzu je umožnit studentům pochopení základních mechanismů přispívajících k toxickému působení cizorodých látek, které negativně ovlivňují buněčné funkce, a poskytnout jim přehled moderních metodických přístupů k analýze toxicity na buněčné a molekulární úrovni. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Josephy P.D. a Mannervik B. (2006). Molecular toxicology. Oxford University Press. Ramos K. (2010). Cellular and Molecular Toxicology (Comprehensive Toxicology vol. 2). Elsevier.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/MTSB - Moderní techniky studia buňky Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr /ZS Rozsah studijního předmětu 13p hod. 13 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence






Přednášky (25%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (25%), Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D. (75%) Stručná anotace předmětu Úvod do problematiky, historické aspekty a milníky studia buňky, přehled moderních technik, výzvy a cíle současné buněčné biologie. Metodologie buněčné a molekulární toxikologie. Buněčné kultury, mechanismy buněčného poškození, metody hodnocení buněčného poškození. Sondy a značky. Využití cDNA a RNA sond ke studiu buňky. Techniky Northern blot, Ribonuclease Protection Assay, Electrophoretic Mobility Shift Assay, Gene Reporter Assays. OMICS: Transcriptomika, proteomika, genomika, metabolomika - komplexní přístupy studia funkce buňky. Farmakogentetika - genom a účinek léku. Studium genové exprese - metody gene reporter assay, RT-PCR, elektroforetické metody. Ovlivnění genové exprese - metody transfekce/transdukce a gene silencing. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Alberts a kol. (2002). Molecular Biology of the Cell. New York. Rang, H.P., Dale, M.M., Ritter, J.M. (2003). Pharmacology. 5th ed., Churchill Livingstone, Edinburgh.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/PCMTS - Praktická cvičení z moderních technik studia buňky Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26c hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná 100% účast na cvičeních, 70% test

Garant předmětu Mgr. Aneta Grycová, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Cvičení (100%)

Vyučující Mgr. Aneta Grycová, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Techniky a zásady práce s lidskými buněčnými nádorovými liniemi za sterilních podmínek. Kultivace lidských hepatomových HepG2 buněk, trypsinizace a pasážování buněk, určení počtu a životnosti buněk, vysetí buněk. Transientní transfekce buněk reportérovým plasmidem technikou lipofekce. Design farmakologického experimentu, příprava roztoků agonistů a antagonistů, nasazení testovaných látek na transientně transfekované HepG2 buňky. Lýze buněk permeabilizací surfaktantemu, stanovení katalytické aktivity světluškové luciferasy s využitím automatického chemiluminimetru. Výpočet hodnot IC50 pro antagonistu a EC50 pro agonistu. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Návody cvičení (e-zdroje, web katedry)


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/POS1EN – Advanced Seminar 1 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 13s hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, pravidelná účast, prezentace na zadané téma (anglicky), vedení aktivního dialogu.


Semináře (100%)

Vyučující prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (100%) Stručná anotace předmětu Posluchači budou seznámeni s možnostmi prezentace výsledků formou publikace nebo přednášky. Počítá se také s prezentací studentů o významných aktuálních výsledcích publikovaných ve vědeckém tisku. Formou přednášek pracovníků Katedry buněčné biologie a genetiky a odborníků z dalších univerzitních i akademických pracovišť včetně zahraničních hostů se budou studenti seznamovat s nejnovějšími poznatky molekulární genetiky a buněčné biologie. Seminář je veden v anglickém jazyce. Studijní literatura a studijní pomůcky

Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím semináře.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/POS2 - Pokročilý oborový seminář 2 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 13s hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, Účast na exkursích, prezentace poznatků získaných během exkurse, aktivní diskuse


Semináře (100%)

Vyučující prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. (100%) Stručná anotace předmětu Seminář 1. ročníku navazujícího magisterského studia, během kterého studenti navštíví a seznámí se špičkovými vědeckými pracovišti molekulární biologie a genetiky. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Podle tématu doporučená vedoucím semináře.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/POS3EN – Advanced Seminar 3 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 2/ZS Rozsah studijního předmětu 13s hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, Pravidelná účast, prezentace na zadané téma (anglicky), vedení aktivního dialogu (anglicky)


Semináře (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%) Stručná anotace předmětu Formou přednášek pracovníků Katedry buněčné biologie a genetiky a odborníků z dalších univerzitních i akademických pracovišť včetně zahraničních hostů se budou studenti seznamovat s nejnovějšími poznatky molekulární genetiky a buněčné biologie. Posluchači budou seznámeni s formami zpracovávání výsledků výzkumu a jejich prezentace. Důraz bude kladen na porozumění mluvené angličtině a následnou diskusi k tématu. Počítá se také s prezentací vlastních výsledků studentů a referáty studentů o významných aktuálních výsledcích publikovaných ve vědeckém tisku. I v tomto případě bude kladen důraz na prezentaci a její obhájení v angličtině. Studijní literatura a studijní pomůcky Podle tématu doporučená vedoucím semináře.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/POS4 - Pokročilý oborový seminář 4 Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 2/LS Rozsah studijního předmětu 13s hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Kombinovaná, pravidelná účast, prezentace na zadané téma, prezentace výsledků z diplomové práce


Seminář (100%)

Vyučující prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. (100%) Stručná anotace předmětu Seminář 2. ročníku navazujícího magisterského programu věnovaný prezentaci východisek a výsledků diplomových prací studentů. Studijní literatura a studijní pomůcky Podle tématu doporučená vedoucím semináře.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/TOX - Toxikologie Typ předmětu Povinný/ZT doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Písemná test, min. 70%


Přednášky (100%)

Vyučující doc. Ing. Radim Vrzal, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu 1. Principy toxikologie - klasifikace toxických látek, spektrum nežádoucích účinků, charakterizace vztahu dávka odpověď. 2. Toxikologie složek stravy I. 3. Toxikologie složek stravy II 4. Matematický popis chování toxických látek v těle – toxikokinetika 5. Jadernými receptory zprostředkovaná endokrinní disrupce 6. Toxické působení látek využívaných pro válečné účely I. 7. Toxické působení látek využívaných pro válečné účely II. 8. Látky s nežádoucími vlivy na matku a vyvíjející se plod I. 9. Látky s nežádoucími vlivy na matku a vyvíjející se plod II. 10. Toxické působení látek na srdce a vaskulární systém 11. Příznaky otrav a jejich léčba u vybraných intoxikací I. 12. Příznaky otrav a jejich léčba u vybraných intoxikací II. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Boelsterli, Urs A. (2007). Mechanistic toxikology: The molecular basis of how chemicals disrupt biological targets, 2nd edition. Gupta, Ramesh C. (2009). Handbook of Toxicology of Chemical Warfare Agents, 1st edition. Gupta, Ramesh C. (2011). Reproductive and Developmental Toxicology, 1st edition. Klaassen, Curtis D. (2008). Casarett and Doull?s Toxicology: The basic science of poison, 7th edition.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/TOXL - Legislativa toxikologie Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 13p hod. 13 kreditů 1 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní zkouška v rozsahu přednášek


Přednášky (100%)

Vyučující RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu V rámci předmětu budou studenti seznámeni s legislativou ČR (zákony, vyhlášky a další normy) týkající se nebezpečných chemických látek, které mohou svými chemickými nebo fyzikálními vlastnostmi ohrozit život a zdraví člověka a/nebo některou ze složek životního prostředí. Dále s legislativou týkající se látek návykových (omamných a psychotropních). Základem je Nařízení EP a Rady (ES) č. 1907/2006 (REACH) o registraci, hodnocení, povolování/omezování chemických látek a Nařízení EP a Rady (ES) č. 1272/2008 (GHS) a (CLP). V rámci legislativy ČR bude věnován důraz na zákon č. 350/2011 Sb. o chemických látkách a chemických směsích, zákon č. 258/2000 Sb. o ochraně veřejného zdraví, zákon č. 185/2001 Sb. o odpadech, ČSN 01 8003 - Zásady pro bezpečnou práci v chemických laboratořích, zákon č. 59/2006 Sb. o prevenci závažných havárií způsobených vybranými nebezpečnými chemickými látkami nebo chemickými přípravky (ve znění zákona 488/2009 Sb.). Zmíněna bude i další související legislativa jako např. vyhláška MŽP 163/2012 Sb. o zásadách správné laboratorní praxe nebo některé partie Trestního zákoníku (40/2009 Sb. - Hlava VII: Trestné činy obecně nebezpečné - Díl 1: Trestné činy obecně ohrožující). Prostor bude věnován i legislativě související s balením, označováním a transportem chemických látek, která platí v ČR: vyhláška MPO č. 402/2011 Sb. o hodnocení nebezpečných vlastností chemických látek a chemických směsí a balení a označování nebezpečných chemických směsí, vyhláška MŽP č. 374/2008 Sb. o přepravě odpadů a o změně vyhlášky č. 381/2001 Sb., kterou se stanoví Katalog odpadů, Seznam nebezpečných odpadů a seznamy odpadů a států pro účely vývozu, dovozu a tranzitu odpadů a postup při udělování souhlasu k vývozu, dovozu a tranzitu odpadů (Katalog odpadů), ve znění pozdějších předpisů nebo zákon č. 477/2001 Sb. o obalech ve znění zákona č. 66/2006 Sb. Ale též i značení a přeprava nebezpečných látek v dalších oblastech Evropy, Severní Ameriky a Austrálie a Nového Zélandu, kdy se lze často s tímto značením setkat na baleních chemikálií, které dodávají firmy ze zahraničí: NFPA 704, Hazardous Materials Identification System (HMIS), Emergency Response Guidebook, Hazchem a European Agreement concerning the International Carriage of Dangerous Goods by Road (ADR). Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Nařízení EP a Rady (ES) č. 1272/2008 o klasifikaci, označování a balení chemických látek a směsí (Globally Harmonised System /GHS/ of Classification, Labelling, and Packaging /CLP/) ve změně nařízení komise (ES) č. 790/2009 a ve změně nařízení komise (EU) č. 453/2010. Nařízení EP a Rady (ES) č. 1907/2006 o registraci, hodnocení, povolování/omezování chemických látek(Registration, Evaluation and Authorization of Chemicals - REACH). Pravidla o bezpečnosti, ochraně zdraví a ochraně životního prostředí při práci s chemickými látkami a chemickými přípravky na Univerzitě Palackého v Olomouci ze dne 9. 4. 2013. Zákon č. 185/2001 Sb. o odpadech. Zákon č. 258/2000 Sb. o ochraně veřejného zdraví. Zákon č. 350/2011 Sb. o chemických látkách a chemických směsích. Zákon č. 353/1999 Sb. o prevenci závažných havárií. Zákon č. 61/2014 Sb., kterým se mění zákon č. 350/2011 Sb., o chemických látkách a chemických směsích a o změně některých zákonů (chemický zákon), ve znění zákona č. 279/2013 Sb., a některé další zákony. ČSN 01 8003 Zásady pro bezpečnou práci v chemických laboratořích.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBB/VMSBP - Vybrané metody studia buněčných procesů Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr 1/ZS Rozsah studijního předmětu 39s hod. 39 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Kolokvium Forma výuky seminář


Kombinovaná Znalosti v rozsahu tématiky, vypracování protokolů

Garant předmětu Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Seminář (100%)

Vyučující Mgr. Aneta Vrzalová, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Teoretický úvod. In vitro translace funkčního rekombinantního proteinu z DNA templátu. Imobilizace protilátky na agarosovou matrici, co-imunoprecipitace, eluce proteinového komplexu, SDS-PAGE, Western blot, imunodetekce, vyhodnocení výsledků. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Alberts, B. a kol. (2002). Molecular Biology of the Cell, 4th ed. Garland Science, New York. Cooper G. M. (1997). The cell. A molecular approach. ASM Press, Washington DC, USA. Jansen, J.C., Ryden, L. Protein Purification, Wiley-VCH, Weinheim, 1998.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBC/BPOL - Struktura a funkce biomakromolekul Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr /LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 Kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní ústní zkouška - schopnost diskutovat o dvou náhodně vybraných tématech v souvislostech celého předmětu.

Garant předmětu prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Typy proteinových struktur. Post-translační modifikace a skládání proteinů. Enzymy a molekulární motory. Membránové proteiny. Určení a predikce struktury a funkce proteinů. Struktura nukleových kyselin. Interakce DNA/RNA-protein. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany. Lipidy, lipidové agregáty a biologické membrány. Struktury signálních komplexů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. (2015). Molecular Biology of the Cell, 6th edition. Garland Science.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBC/CGI - Klonování a genové inženýrství Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr /LS Rozsah studijního předmětu 26p+13s hod. 39 Kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Kolokvium Forma výuky Přednáška, seminář


Písemná, test shodný s obsahem předmětu

Garant předmětu Véronique Hélene Bergougnoux-Fojtík, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (50%), semináře (50%)

Vyučující Přednášky a semináře: Véronique Hélene Bergougnoux-Fojtík, Ph.D. (50%), Mgr. David Zalabák, Ph.D.(50%)

Stručná anotace předmětu Přednáška pokrývá následující témata: Nástroje genového klonování - restrikční endonukleasy, DNA polymerasy, ligasy a reverzní transkriptasy, plasmidy a klonovací vektory. Techniky PCR: princip, optimalizace, typy a využití. Mutageneze in vitro, cílené změny genetického materiálu, náhodná mutageneze, mutageneze pomocí mutagenních oligonukleotidů, mutageneze místně cílená, kazetová mutageneze, využití supresorových tRNA. Tvorba a využití cDNA a genomových knihoven. Genové čipy, DNA microarrays, Affymetrix technologie. Klonovací strategie: Optimalizace exprese klonovaných genů, faktory ovlivňující expresi genů v cizorodých hostitelích, selekční markery. Klonování genů v prokaryotech. Klonování genů v kvasinkách a jeho využití pro analýzu eukaryotického genomu. Způsoby přenosu cizích genů do eukaryotických buněk (mikroinjekce, elektroporace, transfekce, vektorové systémy, biolistické metody). Obecná charakteristika vektorů pro přenos genů do eukaryot, selekční markery. Klonování genů v rostlinách a jeho využití. Přenos genů pomocí vektorů odvozených od Ti-plasmidu. RNAi, zhášení genů a genový "knock out". Klonování genů v živočišných buňkách. Přenos cizích genů do zárodečných buněk (vajíček, embryí) hmyzu, obojživelníků a savců. Využití metod rekombinantní DNA v zemědělství, průmyslu a zdravotnictví. Bt kukuřice, DNA vakcinace a "plantibiotics", biokontrola životního prostředí., ochrana proti bioterorismu atd. Transgenní živočichové: Dolly a Polly, Cumulina, lidské proteiny, klonování lidského genomu. Genové terapie, hlavní strategie genové terapie in vitro a in vivo. Klonování a kmenové buňky. Příprava transgenních organismů. Rizika přípravy transgenních organizmů, pravidla bezpečnosti práce s transgenními organizmy. Etické problémy související s mezidruhovým přenosem genů a přípravou transgenních organizmů. Legislativa GMO. Náplní semináře je diskuse klonovacích strategií a samostané vypracování strategie pro funkční expresi zadaného genu. Studenti se seznámí se softwarem pro molekulárně genetickou analýzu, editaci a porovnání sekvencí, navrhování primerů a restrikční analýzu. Budou využívat a naučí se orientovat v genetických databázích na Internetu. Studijní literatura a studijní pomůcky Základní literatura: Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. (2015). Molecular Biology of the Cell, 6th edition. Garland Science. Doporučená literatura: Green M.R., Sambrook J. (2012). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press. Lodish H., Berk A., Zipursky S.L., Matsudaira P., Baltimore D., Darnell J. (2002). Molecular cell biology, 5th ed. W.H. Freeman and Co., Basingstoke, England. Sabrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. (2001). Molecular cloning. A laboratory manual. 3nd ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBC/ENZ - Enzymologie Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr /LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Písemná, písemná zkouška potvrzující znalost vyučované látky je v délce 1 hodiny, 11 otázek, maximální počet bodů 55.

Garant předmětu doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (25%)

Vyučující doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. (25%), Mgr. Mária Škrabišová, Ph.D. (75%) Stručná anotace předmětu Historický přehled. Základní charakteristika enzymů. Kofaktory. Názvosloví enzymů. Lokalizace enzymů. Izolace, purifikační postupy. Struktura enzymů. Metody studia aktivního centra. Kovalentní modifikace enzymů. Mechanismus enzymové katalýzy. Enzyme kinetics - the Michaelis-Menten equation Michaelisova konstanta, reakční řád, enzymové jednotky, číslo přeměny. Vliv pH a teploty na aktivitu enzymů. Jedno, dvou a třísubstrátová reakce. Enzymová specifita a regulace - alosterická regulace, kovalentní modifikace. Inhibice enzymů. Metody stanovení enzymové aktivity. Kontrola metabolických drah. Organizované enzymové systémy. Enzymy v buňkách. Klinické aspekty enzymologie. Využití enzymů v praxi. Studijní literatura a studijní pomůcky Základní literatura: Berg, J.M., Tymoczko, J.L. and Stryer, L. (2007). Biochemistry. New York, USA. Cornish-Bowden A. (2012). Fundamentals of Enzyme Kinetics,Weinheim, Germany. Weinheim, Germany. Macholán L., Barthová J., Kučera I. (1994). Enzymologie MU Brno, 1994. MU Brno. Purich D. L. Enzyme Kinetics: Catalysis and Control. London, 2010. Doporučená literatura: Bisswanger H. (2011). Practical Enzymology. Weinheim, Wiley. Bugg T. D. H. (2012). Intoduction to enzyme and coenzyme chemistry 3rd Ed. WestSussex UK. Marangoni A. G. (2003). Enzyme Kinetics a Modern Approach. New Jersey. Price N. C., Stevens L. (2000). Fundamentals of enzymology. New York, USA.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBC/MREG - Metabolické regulace Typ předmětu Povinný/ZT doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní Písemná zkouška potvrzující znalost vyučované látky je v délce 1 hodiny, 8 otázek, maximální počet bodů 24.

Garant předmětu doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Regulace na úrovni buňky a mezibuněčné komunikace. Typy signálních molekul a mezibuněčných signalizací u eukaryot. Metabolismus hormonů a základní experimentální metody při studiu jejich účinku. Mechanismy přenosu signálu zprostředkované povrchovými receptory. Heterotrimerní transdukční G-proteiny a jejich funkce. Super-rodina GTPas a jejich buněčné funkce. Receptorové tyrosin-specifické kinasy (RTK) a MAP kinasová signální dráha. Signalizace zprostředkovaná intracelulárními receptory, mechanismus účinku steroidních a thyreoidálních hormonů. Další signální dráhy, guanylylcyklasy a NO synthasa. Konvergence, divergence a crosstalk různých signálních drah. Adaptace cílových buněk, desensitizace receptorů. Receptorové nemoci, choroby spojené s poruchami přenosu signálu. Interakce různých hormonů při regulaci komplexních fyziologických dějů. Studijní literatura a studijní pomůcky Základní literatura: Berg, J.M., Tymoczko, J.L. and Stryer, L. (2007). Biochemistry. New York, USA. Doporučená literatura: Voet D., Voet J. G., Pratt, Ch. W. (2006). Fundamentals of Biochemistry. New York, USA. http://bcs.whfreeman.com/biochem6/


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu KBC/PBM - Pokročilé biochemické metody Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr /ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Písemná test (15 otázek, 1,5 hodiny) s hodnocením minimálně 20 z 30 možných bodů.

Garant předmětu Véronique Hélene Bergougnoux-Fojtík, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (35%)

Vyučující Véronique Hélene Bergougnoux-Fojtík, Ph.D.(35%), prof. RNDr. Ivo Frébort, CSc., Ph.D.(8%), Mgr. David Kopečný, Ph.D. (8%), Mgr. René Lenobel, Ph.D. (16%), doc. RNDr. Petr Tarkowski, Ph.D. (8%), Mgr. David Zalabák, Ph.D.(25%)

Stručná anotace předmětu Rámcový program: Metody stanovení prostorové struktury proteinů. Úvod do metabolomiky. Úvod do analýzy proteomu. Glykomika a lipidomika. Biosenzory. Úvod do konfokální a elektronové mikroskopie. Základy klonování a genového inženýrství. Principy a využití qPCR. Buněčné kultury a produkce rekombinantních proteinů. Genetická transfomace obilovin. Geneticky modifikované organismy. Studijní literatura a studijní pomůcky Základní literatura: Boyer R. (2012). Biochemistry Laboratory. Upper Saddle River, New Jersey.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu LRR/BCHM - Biochemické markery Typ předmětu Povinně volitelný/PZ doporučený ročník / semestr /ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 2 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Kolokvium Forma výuky Přednáška


Ústní Ústní kolokvium v rozsahu náplně přednášek

Garant předmětu Mgr. Karel Doležal, Dr. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující Mgr. Karel Doležal, Dr. (100%) Stručná anotace předmětu Biochemické a molekulární markery - principy, rozdělení, příklady použití v taxonomiii, in-vitro kulturách, ochraně genofondu atd. Somaklonální variabilita. Proteinové markery a izoenzymy. Polyakrylamidová gelová elektroforéza. Specifické a nespecifické barvení proteinů. Chemotaxonomie - principy, skupiny látek, metody studia (plynová a kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometrie) zpracování dat. Vývoj molekulárních markerů. Fyzické a genetické mapování a mapovací populace. Molekulární cytogenetika. Metody fyzické lokalizace sekvencí DNA na chromozómech a v interfázních jádrech. Využití metod založených na hybridizaci molekul DNA a polymerázové řetězové reakci (PCR) jako zdroje molekulárních markerů a interpretace dat. Využití molekulárních markerů pro klonování a charakterizaci důležitých genů. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Lewin, B. (2000). Genes VII. Oxford University Press, Oxford. Singh, R.J. (2003). Plant Cytogenetics. CRC Press, Boca Raton. Tanksley , D.S., Orton, T.J. (eds.). (1983). Isozymes in Plant Genetics and Breeding, Part A. Elsevier, Amsterdam - Oxford - New York. Wagner, R.P. et al. (1993). Chromosomes. A Synthesis. Wiley-Liss, New York. Šípal, Z., Anzenbacher, P., Peč, P., Pospíšil, J., Růžička, I. (1992). Biochemie. SPN, Praha.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu LRR/BUCY - Buněčný cyklus a apoptóza Typ předmětu Povinně volitelný/ZT doporučený ročník / semestr /ZS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní Ústní zkouška v rozsahu náplně přednášek ověřující znalosti a schopnost diskuse o problematice

Garant předmětu doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Modelové organismy pro studium buněčného cyklu. Regulace buněčného cyklu (cyklin-dependentní kinasy, ubiquitinligasy). Duplikace chromosomů (struktura chromatinu, počátky replikace, regulace a kontrola průběhu). Raná mitóza (zahájení a regulace, proteinkinasy CDK, polo a aurora, kondenzace chromatinu, koheze chromatid). Mitotické vřeténko (mikrotubulární cytoskelet, centrosomy a kinetochory). Dokončení mitózy (kontrolní bod, anafáze a telofáze). Cytokineze (aktin a myosin, buněčná a jaderná membrána). Kontrolní body (reakce buňky na poškození DNA, senzory poškození a efektory opravy). Buněčný cyklus a nádorová transformace. Apoptóza fyziologické a patofyziologická. Vnější a vnitřní dráha (receptory a ligandy smrti, mitochondrie, apoptosom). Molekulární exekutoři (proteasy a DNAsy). Metody studia buněčného cyklu a apoptózy.Doporučené znalosti:Základní znalosti buněčné biologie, molekulární biologie a biochemie. Studijní literatura a studijní pomůcky Základní literatura: Knowles M., Selby P. (2005). Introduction to the Cellular and Molecular Biology of Cancer, 4th ed. Oxford University Press. Morgan D. O. (2006). The Cell Cycle: Principles of Control. New Science Press, Ltd. Tannock I. F., Hill R. P., Bristow R. G., Har


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu LRR/CVPRO - Cvičení z proteomiky Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 39c hod. 39 kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence


Zápočet Forma výuky Cvičení


100% účast, dokončení experiment

Garant předmětu Mgr. René Lenobel, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Cvičení (34%)

Vyučující Mgr. Ivo Chamrád, Ph.D. (33%), Mgr. René Lenobel, Ph.D. (34%), Mgr. Radim Simerský, Ph.D. (33%), studenti DSP

Stručná anotace předmětu 1. Extrakce rozpustné frakce proteinů z biologického materiálu. 1D nebo 2D elektroforéza. Barvení gelu Commassi Briliant Blue. 2. Izolace proteinových spotů z gelu. Štěpení vybraných proteinů pomocí trypsinu popřípadě i jiných enzymů (např. chymotrypsin) v gelu ("In-gel digestion"). Extrakce naštípaných peptidů z gelu. 3. Příprava extraktů pro analýzu LC-MS. LC-MS analýza extrahovaných peptidů, zpracování MS dat pomocí softwaru Mascot Distiller a identifikace proteinu pomocí veřejně přístupné datatáze MASCOT. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Keough T., Lacey M. P., Youngquist R. S. (2000). Derivatization procedures to facilitate de novo sequencing of lysine-terminated tryptic peptides using postsource decay matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry, Rapid Communication. Mass Spectrom. 14, 2348-2356. Keough T., Youngquist R. S., Lacey M. P. (1999). A method for high-sensitivity peptide sequencing using postsource decay matrix-assisted laser desorption ionization mass spektrometry. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 7131-7136. Marekov L. N., Steinert P. M. (2003). Charge derivatization by 4-sulfophenyl isothiocyanate enhances peptide sequencing by post-source decay matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. J. Mass Spectrom. 38, 373-377. Pingoud A., Urbanke C., Hoggett J., Jeltsch A. (2002). Biochemical methods: A concise guide for students and researchers. Wiley-VCH Verlag GmbH, Weinheim, Germany. Wang D., Kalb S. R., Cotter R. J. (2004). Improved procedures for N-terminal sulfonation of peptides for matrix-assisted laser desorption/ionization post-source decay peptide sequencing, Rapid Communication. Mass Spectrom. 18, 96-102. Westermeier, R., Naven, T. (2002). Proteomics in practice. A laboratory manual of proteome analysis. Wiley-VCH, Weinheim, Germany. Winter M., Sherman N. E. (2000). Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, USA.


B-III – Charakteristika studijního předmětu Název studijního předmětu LRR/PRO – Proteomika Typ předmětu Povinný/PZ doporučený ročník / semestr 1/LS Rozsah studijního předmětu 26p hod. 26 Kreditů 3 Prerekvizity, korekvizity, ekvivalence




Ústní 2 otázky + vysvětlení 5 přehledných pojmů z přednášek

Garant předmětu Mgr. René Lenobel, Ph.D. Zapojení garanta do výuky předmětu

Přednášky (100%)

Vyučující Mgr. René Lenobel, Ph.D. (100%) Stručná anotace předmětu Úvod do proteomiky. Základní pojmy z oblasti separace proteinů (elektroforéza, chromatografie), hmotnostní spektrometrie, zpracování obrazu ("imaging"), využívání genových a proteinových databází. Význam expresní, diferenční a funkční proteomiky. Technologie proteomiky, aplikace. Identifikace a charakterizace proteinů v proteomice. Částečná separace proteinových směsí (konvenční chromatografie, afinitní chromatografie, preparativní elektroforéza). Jednorozměrná (1-D) elektroforéza - SDS/PAGE. Dvojrozměrná (2-D) elektroforéza. Příprava vzorku. První dimenze - isoelektrická fokusace (IEF). Amfolyty, trubičkové IEF gely. Proužky s imobilizovaným pH gradientem ("IPG strips"). Metodika a instrumentace IEF separace. Barvení IPG stripů. Druhá dimenze - SDS/PAGE. Složení pufrů. Příprava gelů. Instrumentace SDS/PAGE separace (horizontální a vertikální aparatury). Barvení proteinů v SDS/PAGE gelech, kompatibilita barvení a hmotnostní spektrometrie. Fluorescenční barvení gelů. Analýza obrazu, denzitometr, software pro vyhodnocení 2-D gelů. Srovnávání dvou a více 2-D gelů, diference. Vyřezávání (excize) proteinových spotů. Elektroeluce. Chemické a enzymové štěpení proteinů v gelu. Štěpení v roztoku. Obecné principy hmotnostní spektrometrie. Ionizační techniky využívané v proteomice. Ionizace elektrosprejem (ESI), ionizace s účastí matrice (MALDI). Iontové analyzátory, kvadrupól (Q), iontová past (IT), analyzátor doby letu (TOF), reflektron. Tandemová hmotnostní spektrometrie (MS/MS) a její instrumentace. Technika MALDI-TOF post source decay (PSD). Peptidové mapování (peptide mass fingerprinting), sekvenční analýza peptidů (de novo sequencing). Identifikace proteinů vyhledáváním v databázích. Vyhledávací programy Mascot, Sequest a Protein Prospector. Organismy s nesekvenovaným genomem, EST databáze, program MS Blast. Multidimenzionální LC-MS/MS. Afinitní chromatografie a LC-MS/MS. Kvantitativní analýza v proteomice. Metody H2O18, ICAT, SILAC, AQUA. Shotgun proteomics - nástroj pro analýzu komplexních proteinových směsí. SELDI MS, klinická proteomika. Studijní literatura a studijní pomůcky Doporučená literatura: Keough T., Lacey M. P., Youngquist R. S. (2000). Derivatization procedures to facilitate de novo sequencing of lysine-terminated tryptic peptides using postsource decay matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry, Rapid Communication. Mass Spectrom. 14, 2348-2356. Keough T., Youngquist R. S., Lacey M. P. (1999). A method for high-sensitivity peptide sequencing using postsource decay matrix-assisted laser desorption ionization mass spektrometry. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 7131-7136. Marekov L. N., Steinert P. M. (2003). Charge derivatization by 4-sulfophenyl isothiocyanate enhances peptide sequencing by post-source decay matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. J. Mass Spectrom. 38, 373-377. Pingoud A., Urbanke C., Hoggett J., Keltech A. (2002). Biochemical methods: A concise guide for students and researchers. Weinheim Německo. Simson, R. J. (ed.). (2004). Purifying proteins for Proteomics: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. Wang D., Kalb S. R., Cotter R. J. (2004). Improved procedures for N-terminal sulfonation of peptides for matrix-assisted laser desorption/ionization post-source decay peptide sequencing, Rapid Communication. Mass Spectrom. 18, 96-102. Westermeier, R., Naven, T. (2002). Proteomics in practice. A laboratory manual of proteome analysis. Wiley-VCH, Weinheim, Germany. Winter M., Sherman N. E. (2000). Protein sequencing and identification using tandem mass spectrometry. John Wiley & Sons, Inc., New York, NY, USA.

Informace ke kombinované nebo distanční formě Rozsah konzultací (soustředění) hodin

Informace o způsobu kontaktu s vyučujícím

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Veronique Bergougnoux-Fojtík Tituly Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 12/20 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy 12/20 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/CGI - Klonování a genové inženýrství, garant, přednášející, 50% KBC/PBM - Pokročilé biochemické metody, garant, přednášející, 35%

Údaje o vzdělání na VŠ 2001-2005 PhD “Biologie Végétale” 1999-2000 Diplôme d’Etudes Approfondies ‘Génétique, Amélioration et Protection des Végétaux’, ENSA Rennes / U.F.R. Sciences Rennes I 1998-1999 Diplôme Inter-Universitaire ‘Biotechnologies Végétales’, ENSA Rennes / INP Toulouse / Université Pierre et Marie Curie (Paris VI) / Université Paris Sud XI 1997-1998 Maîtrise ‘Biologie Cellulaire et Physiologie’, U.F.R. Sciences Nice/Sophia Antipolis Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2017-dosud: Head of the Department of Molecular Biology, Centre Hana for Agricultural and Biotechnological Research, Olomouc, UPOL, Czech Republic 2011-dosud: Junior researcher at the Department of Molecular Biology, Centre Hana for Agricultural and Biotechnological Research, UPOL, Olomouc, Czech Republic 2009-2011: Junior researcher at the Laboratory of Growth Regulators, University Palacky, Olomouc, Czech Republic 2007-2009: Post-doc at the Department of Cell Biology, University Palacky, Olomouc, Czech Republic 2005-2007: Post-doc at UMR SAGAH, University of Science, Angers, France 2001-2005: Researcher assistant at University Jean-Monnet, Saint-Etienne, France Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 2 úspěšně obhájené diplomové práce; 2 úspěšně obhájené PhD práce V současnosti vedu 1 diplomovou práci a 2 PhD práce. Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 355 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 5 nejvýznamnějších výstupů publikační činnosti za posledních 5 let: Hloušková P, Černý M, Kořínková N, Luklová M, Minguet EG, Brzobohatý B, Galuszka P, Bergougnoux V* (2019)

Affinity chromatography revealed 14-3-3 interactome of tomato (Solanum lycopersicum L.) during blue light-induced de-etiolation. Journal of Proteomics, 193: 44-61

Vrabka J., Niehaus E., Münsterkötter M., Novák O., Pěnčík A., Tarkowská D., Hromadová K., Hradilová M., Oklešťková J., Galuszka P., Bergougnoux VH. Production and Role of Hormones During Interaction of Fusarium Species With Maize (Zea mays L.) Seedlings. Frontiers in Plant Science. 2018.

Humplík JF, Bergougnoux V, Van Volkenburgh E (2017) To stimulate or inhibit? That is the question for the function of abscisic acid. Trends in Plant Science, 22: 830-841

Hloušková P, Bergougnoux V* (2016) A subtracted cDNA library identifies genes up-regulated during PHOT1-mediated early step of de-etiolation in tomato (Solanum lycopersicum L.). BMC Genomics, 17: 291

Humplík JF, Bergougnoux V, Jandová M, Šimura J, Pěnčík A, Tomanec O, Rolčík J, Novák O, Fellner M (2015) Endogenous abscisic acid promotes hypocotyl growth and affects endoreduplication during dark-induced growth in tomato (Solanum lycopersicum L.). PlosONE 10(2): e0117793. doi:10.1371/journal.pone.0117793

Publikační činnost (Web of Science; 21.01.2020): 25 (citaci bez autocitace: 355; H-index: 11) Působení v zahraničí Podpis Datum 30.1:2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Karel Doležal Tituly Mgr., Dr., DSc. Rok narození 1967 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 36 do kdy 12/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 36 do kdy 12/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu LRR/BCHM - Biochemické markery, garant, přednášející, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ 1985-1990: magisterské studium, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Palackého v Olomouci, obor Anorganická chemie, dosažený titul Mgr. 1992-1996: doktorské studium, Lékařská fakulta Univerzity Palackého v Olomouci, obor Molekulární biologie, dosažený titul Dr. Disertační práce: "Metabolismus aromatických cytokininů v normálních a transgenních rostlinách".

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1990-1992 – Výzkumný pracovník ve Výzkumném a šlechtitelském ústavu pícninářském , Troubsko u Brna, Výzkumná stanice Zubří. Využití biochemických markerů ve šlechtění a in vitro kulturách trav. 1992-1996 – vědecký pracovník v UEB AV ČR Olomouc 1996-dosud – vědecký pracovník v Laboratoři růstových regulátorů PřF UP & UEB AV ČR Olomouc 2013-dosud – vedoucí Oddělení chemické biologie a genetiky CRH

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení diplomových (6) a disertačních (9) prací, již obhájených od roku 1996.

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 4671 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 159 původních publikovaných prací dle WOS, 62 udělených patentů PLAČKOVÁ, L., HRDLIČKA, J., SMÝKALOVÁ, I., CVEČKOVÁ, M., NOVÁK, O., GRIGA, M., DOLEŽAL, K.:

Cytokinin profiling of long-term in vitro pea (Pisum sativum L.) shoot cultures. Plant Growth Regulation 77 (2): 125-132, 2015. 30%

ANTONIADI, I., PLAČKOVÁ, L., SIMONOVIK, B., DOLEŽAL, K., TURNBULL, C., LJUNG, K., NOVÁK, O.: Cell-Type-Specific Cytokinin Distribution within the Arabidopsis Primary Root Apex. Plant Cell 27 (7): 1955-1967

2015 PLAČKOVÁ, L., OKLEŠŤKOVÁ, J., POSPÍŠKOVÁ, K., POLÁKOVÁ, K., BUČEK, J., STÝSKALA, J., ZATLOUKAL,

M., ŠAFAŘÍK, I., ZBOŘIL, R., STRNAD, M., DOLEŽAL, K., NOVÁK, O.: Microscale magnetic microparticle-based immunopurification of cytokinins from Arabidopsis root apex. Plant Journal 89 (5): 1065-1075, 2017 15%

HRDLIČKA, J., GUCKÝ, T., NOVÁK, O., KULKARNI, M., GUPTA, S., VAN STADEN, J., DOLEŽAL, K.: Quantification of karrikins in smoke water using ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spektrometry. Plant Methods 15: 81, 2019 20%

MATUŠKOVÁ, V., ZATLOUKAL, M., VOLLER, J., GRUZ, J., PĚKNÁ, Z., BRIESTENSKÁ, K., MISTRÍKOVÁ, J., SPÍCHAL, L., DOLEŽAL, K., STRNAD, M.: New aromatic 6-substituted 2 '-deoxy-9-(beta)-D-ribofuranosylpurine derivatives as potential plant growth regulators. Biorganic & Medicinal Chemistry 28 (2): 115230, 2020. 10%

Působení v zahraničí 1996-1997 6 měsíců, Bayreuth University, Dept. of Plant Physiology (prof. Erwin Beck) 1997-1999 1 rok, Swedish Agriculture University Umea; Dept. of Forest Genetics and Plant Physiology (Prof. Goran Sandberg) (a několik kratších studijních pobytů)

Podpis datum 30.1.2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující bakalářský program Jméno a příjmení Jaroslav Doležel Tituly prof. Ing, DrSc. Rok narození 1954 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 12 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 12 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/ANGEN – Anatomie genomu, garant, přednášející, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ obor zahradnický, Ing., 1978, Vysoká škola zemědělská, Fakulta agronomická, Brno Genetika, CSc., 1982, Ústav experimentální botaniky ČSAV Genetika, DrSc., 2001, Akademie věd ČR

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Ústav experimentální botaniky (ÚEB) ČSAV, vědecká aspirantura, 1978 – 1982 ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký asistent, 1982 – 1983 ÚEB ČSAV Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, vědecký pracovník, 1983 – 1985 ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, 1985 – 1986 ÚEB Olomouc, oddělení šlechtitelských biotechnologií, samostatný vědecký pracovník, 1986 – 1994 ÚEB AV ČR, Olomouc, vedoucí Laboratoře molekulární cytogenetiky a cytometrie 1994 – dosud ÚEB AV ČR Olomouc, vedoucí pracoviště, 1997 – dosud PřF UP v Olomouci, odborný asistent, 1992 – 2001 PřF UP v Olomouci, docent, 2001 – 2013 PřF UP v Olomouci, profesor, 2013 – dosud

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce: 3, Diplomové práce: 6, Disertační práce: 15 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Botanika 2001 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 12 983 Molekulární biologie a genetika 2013 MU Brno Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Kreplak, J., et al.: A reference genome for pea provides insight into legume genome evolution. – Nature Genet.1: 1411-

1422, 2019. Ford, B.A., etal.: Rht18 semidwarfism in wheat is due to increased GA 2-oxidaseA9 expression and reduced GA content.

– Plant Physiol. 177: 168-180, 2018. Thind, A.K., et al.: Rapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly.

– Nature Biotechnol. 35: 793-796, 2017. Mascher, M., et al.: A chromosome conformation capture ordered sequence of the barley genome. – Nature 544: 427-433,

2017 Sánchez-Martín, J., et al.: Rapid gene isolation in barley and wheat by mutant chromosome sequencing. – Genome Biol.

17: 221, 2016. Působení v zahraničí ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, studijní pobyt, 1985 – 1986, 12 měsíců National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1987, 6 týdnů Tree Improvement Research Centre, Kitwe, Zambie, expert FAO/IAEA, 1988, 4 týdny National Nuclear Research Institute, Accra, Ghana, expert FAO/IAEA, 1989, 4 týdny ENEA, C.R.E. Casaccia, Řím, Itálie, 1990 - 4 měsíce; 1993 - 4 měsíce, 1994 - 3 měsíce Podpis datum 15.1.2020

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Kreplak%20J%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=31477930

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Zdeněk Dvořák Tituly prof. RNDr., DrSc., Ph.D. Rok narození 1974 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/DIPL1 – Diplomová práce 1, garant, vede semináře KBB/DIPL2 – Diplomová práce 2, garant, vede cvičení KBB/DIPL3 – Diplomová práce 3, garant, vede cvičení KBB/DIPL4 – Diplomová práce 4, garant, vede semináře KBB/POS3EN – Advanced Seminar 3, garant, vede semináře, 100% KBB/POS4 – Pokročilý oborový seminář 4, garant, vede semináře, 100% KBB/MOLFA – Molekulární farmakologie, garant, přednášející, 25% KBB/MTSB – Moderní techniky studia buňky, garant, přednášející, 25% KBB/OBHDP – Obhajoba diplomové práce, garant KBB/SZZGE – Genomika, garant KBB/SZZPR – Proteomika, garant KBB/ SZZBB – Biologie rostlinné a živočišné buňky, garant KBB/SZZMT – Molekulární toxikologie, garant KBB/SZZGM – Molekulární genetika, garant Garant Bakalářského studijního oboru 1515R004 Molekulární a buněčná biologie, navazujícího magisterského oboru 1515T004 Molekulární a buněčná biologie, a doktorského studijního oboru 1515V004 Molekulární a buněčná biologie, s platností do 31.12.2025. Garant doktorského studijního programu P0511D030006 Molekulární a buněčná biologie a P0511D030005 Molecular and Cell Biology s platností do r. 2028.

Údaje o vzdělání na VŠ Mgr: Univerzita Palackého v Olomouci; Analytická chemie, 1997 Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská chemie a biochemie, 2001 RNDr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Analytická chemie, 2004 doc.: Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská chemie a biochemie, 2006 prof.: Univerzita Palackého v Olomouci, Biochemie, 2010 DrSc.: Slovenská Akadémia Vied, Biologické vedy, 2012

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1999-2010: Ústav soudního lékařství a medicinálního práva, Fakultní nemocnice Olomouc; toxikolog 1997-2001: Ústav lékařské chemie a biochemie, LF UP Olomouc; doktorské studium 2001-2002: přerušení kariéry - náhradní civilní služba 2002-2003: Institute National de la Santé Et de la Récherche Médicale INSERM U128, Montpellier, Francie; post-doc 2003-2006: Ústav lékařské chemie a biochemie, LF UP Olomouc; vědecký pracovník 2007-2008: Ústav lékařské chemie a biochemie, LF UP Olomouc; docent 2008-nyní: Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP; vedoucí katedry

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací práce: diplomová (2); rigorosní (1); disertační doktorská (8 obhájeno; 2 probíhající)

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Lékařská chemie a biochemie 2006 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 2770 2733 - Biochemie 2010 UP Olomouc

Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Nejvýznamnější publikační výstupy za posledních 5 let: (i) European Patent EP 260000B1: Bulletin 2017/11: Trávníček Z., Vančo J., Buchtík R., Dvořák Z.: Utilization of

copper complexes involving 2-phenyl-3-hydroxy-4(1H)-quinolinone and 1,10-phenanthroline derivatives for the preparation of drugs for the treatment of tumour diseases.

(ii) Bartoňková I., Dvořák Z.* (2018) Essential oils of culinary herbs and spices display agonist and antagonist activities at human aryl hydrocarbon receptor AhR. Food and Chemical Toxicology 111:374-384.

(iii) Abbott K.L., Chaudhury C.S., Chandran A., Vishveshwara S., Dvorak Z., Jiskrova E., Poulikova K., Vyhlidalova B., Mani S., Pondugula S.R. (2019) Belinostat, at Its Clinically Relevant Concentrations, Inhibits Rifampicin Induced CYP3A4 and MDR1 Gene Expression. Mol Pharmacol 95(3):324-334

(iv) Štěpánková M., Bartoňková I., Jiskrová E., Vrzal R., Mani S., Kortagere S., Dvořák Z.* (2018) Methylindoles and methoxyindoles are agonists and antagonists of human aryl hydrocarbon receptor AhR. Molecular Pharmacology 93(6):631-644.

(v) Bartonkova I., Grycova A., Dvorak Z.* (2016) Profiling of vitamin D metabolic intermediates towards VDR using novel stable gene reporter cell lines IZ-VDRE and IZ-CYP24. Chemical Research in Toxicology 29:1211-1222.

Působení v zahraničí 1998 (3 months), 2000 (3 months), 2002-2003 (1 year), 2005, 2006, 2007 (3 months) Detoxication et Physiopathologie Hepatique, Institut National de la Sante Et de la Recherche Medicale, INSERM U128, CNRS, Montpellier, France.


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Ivo Frébort Tituly Prof. RNDr., CSc., Ph.D. Rok narození 1965 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 28

20 do kdy N

02/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 28

20 do kdy N

02/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/BPOL - Struktura a funkce biomakromolekul, garant, přednášející, 100% KBC/PBM - Pokročilé biochemické metody, přednášející 8%

Údaje o vzdělání na VŠ 1988 ukončení studia oboru Analytická chemie na PřF UP Olomouc, 1989 RNDr. 1992 CSc. v oboru Biochemie – MU Brno; 1997 Ph.D. v oboru Bioresources Science – United Graduate School of Tottori University, Japonsko

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1989–1992 Katedra analytické a organické chemie PřF UP - vědecký pracovník 1992–1997 Department of Biological Chemistry, Faculty of Agriculture, Yamaguchi University, Japonsko - vědecký pracovník, Ph.D. student 1997–1999 Katedra biochemie PřF UP – odborný asistent 1999–2005 Katedra biochemie PřF UP – docent od 2005 Katedra biochemie PřF UP – profesor od 2010 Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum (PřF UP) – ředitel Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení prací: Bc. 3 (Satoko Utsunomiya, Naomi Nishiyama, Václav Mik), Mgr. 12 (Tomáš Zárybnický, Šárka Pečová, Lenka Skoupá, Šárka Chlopčíková, Zbyněk Lamplot, Vladislava Černíková, Ivo Frydrych, Václav Mik, Kateřina Kolaříková, Lucie Šromová, Selma Žilić, Dušana Schlosserová), Ph.D. 6 (Petr Galuszka, Pavel Sauer, Marta Greplová, Hana Jablonská, Eva Jiskrová, Edita Holásková) Předseda oborové rady a garant doktorského studijního programu Biochemie na UP, člen oborové rady doktorského studijního programu Biochemie na MU Brno, člen habilitačních komisí a komisí pro řízení pro jmenování profesorem Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 1998 VŠCHT Praha WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1680 Biochemie 2005 UK Praha Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Holásková E, Galuszka P, Mičúchová A, Šebela M, Öz MT, Frébort I (2018) Molecular farming in barley: development of

a novel production platform to produce human antimicrobial peptide LL-37. Biotechnol J 13(6): 1700628; IF 3.507 Hluska T, Šebela M, Lenobel R, Frébort I, Galuszka P (2017) Purification of maize nucleotide

pyrophosphatase/phosphodiesterase casts doubt on the existence of zeatin cis-trans isomerase in plants. Front Plant Sci 8, 1473; IF 4.291

Pospíšilová H, Jiskrová E, Vojta P, Mrízová K, Kokáš F, Majeská Čudejková M, Bergougnoux V, Plíhal O, Klimešová J, Novák O, Dzurová L, Frébort I, Galuszka P (2016) Transgenic barley overexpressing a cytokinin dehydrogenase gene shows greater tolerance to drought stress. New Biotechnol 33, 692-705; IF 3.119

Holásková E, Galuszka P, Frébort I, Öz MT (2015) Antimicrobial peptide production in plants for medical and agricultural biotechnology. Biotechnol Adv 33, 1005-1023; IF 9.848

Dzurová L, Forneris F, Savino S, Galuszka P, Vrabka J, Frébort I (2015) The three-dimensional structure of “Lonely Guy” from Claviceps purpurea provides insights into the phosphoribohydrolase function of Rossmann fold-containing lysine decarboxylase-like proteins. Proteins 83; IF 2.499

Působení v zahraničí 1992–1997: Japonsko, Yamaguchi University (4,5 r) - Ph.D. studium, vědecký pracovník 2001: Německo, University of Tübingen (6 m), 2003: Německo, Free University of Berlin (3 m) - postdok 2007: Japonsko, Osaka University (2 m) - hostující profesor Další kratší stáže: Lund, Lyngby, Groningen, Řím, Berlín, Columbia (USA), Yamaguchi, Osaka, Okinawa Podpis datum 14.1.2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Aneta Grycová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1985 typ vztahu k VŠ bud. pp. rozsah bud 40 do kdy Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program bud. pp. rozsah bud. 40 do kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/PCMTS – Praktická cvičení z moderních technik studia buňky, garant, vede cvičení, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ Mgr. – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Biochemie, 2009 Ph. D. – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Biochemie, 2013

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2009-2013: Univerzita Palackého v Olomouci, Katedra buněčné biologie a genetiky – Ph. D. student, 2013-04/2016: Univerzita Palackého v Olomouci, Katedra buněčné biologie a genetiky – Odborný asistent 05/2016-08/2020: mateřská dovolená

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce – 2

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 39 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Bartonkova I, Grycova A, Dvorak Z. (2016) Profiling of Vitamin D Metabolic Intermediates toward VDR Using Novel

Stable Gene Reporter Cell Lines IZ-VDRE and IZ-CYP24. Chem Res Toxicol. 2016 Jul 18;29(7):1211-22. Vrzal R, Vrzalova A, Grycova A, Dvorak Z. (2017) Activated thyroid hormone receptor modulates dioxin-inducible aryl

hydrocarbon receptor-mediated CYP1A1 induction in human hepatocytes but not in human hepatocarcinoma HepG2 cells. Toxicol Lett. 2017 Jun 5;275:77-82.

Illés P, Grycová A, Krasulová K, Dvořák Z. (2018) Effects of Flavored Nonalcoholic Beverages on Transcriptional Activities of Nuclear and Steroid Hormone Receptors: Proof of Concept for Novel Reporter Cell Line PAZ-PPARg. J Agric Food Chem. 2018 Nov 14;66(45):12066-12078.

Působení v zahraničí 2012 - Unité UMR-S 747 Inserm-Université Paris Descartes, Paříž, Francie (3 měsíce) 2010 - Akademie věd Maďarsko, Budapešť (1 měsíc)

Podpis Datum 30.1:2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Ivo Chamrád Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1982 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 06/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy 06/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. Vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu LRR/CVPRO – Cvičení z proteomiky, vede cvičení. 33%

Údaje o vzdělání na VŠ Ph.D., studijní program Biochemie, studijní obor Biochemie, PřF UPOL, rok ukončení 2012 Mgr., studijní program Biochemie, studijní obor Biochemie, PřF UPOL, rok ukončení 2006 Bc., studijní program Biochemie, studijní obor Biochemie, PřF UPOL, rok ukončení 2004 Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2012 – doposud, vědecko-akademický pracovník, Oddělení biochemie proteinů a proteomiky, CR Haná, PřF, UPOL

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářská práce – 2 Diplomová práce – 2

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 134 145 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Chamrád I, Uřinovská J, Petrovská B, Jeřábková H, Lenobel R, Vrána J, Doležel J, Šebela M. (2018) Identification of Plant

Nuclear Proteins Based on a Combination of Flow Sorting, SDS-PAGE, and LC-MS/MS Analysis. Methods Mol Biol. 1696,57-79.

Simerský R, Chamrád I, Kania J, Strnad M, Šebela M, Lenobel R. (2017) Chemical proteomic analysis of 6-benzylaminopurine molecular partners in wheat grains. Plant Cell Rep. 36(10), 1561-1570.

Blavet N, Uřinovská J, Jeřábková H, Chamrád I, Vrána J, Lenobel R, Beinhauer J, Šebela M, Doležel J, Petrovská B. (2017) UNcleProt (Universal Nuclear Protein database of barley): The first nuclear protein database that distinguishes proteins from different phases of the cell cycle. Nucleus 8(1), 70-80.

Beresova L, Vesela E, Chamrad I, Voller J, Yamada M, Furst T, Lenobel R, Chroma K, Gursky J, Krizova K, Mistrik M, Bartek J. (2016) Role of DNA Repair Factor Xeroderma Pigmentosum Protein Group C in Response to Replication Stress As Revealed by DNA Fragile Site Affinity Chromatography and Quantitative Proteomics. J Proteome Res. 15(12), 4505-4517.

Beinhauer J, Lenobel R, Loginov D, Chamrád I, Řehulka P, Sedlářová M, Marchetti-Deschmann M, Allmaier G, Šebela M. (2016) Identification of Bremia lactucae and Oidium neolycopersici proteins extracted for intact spore MALDI mass spectrometric biotyping. Electrophoresis 37(22), 2940-2952.

Působení v zahraničí

Podpis Datum 23.1.2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Lucie Janovská (rozená Navrátilová) Tituly RNDr. Ph.D. Rok narození 1987 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 12/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 20 do kdy 12/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/MBBMI – Molekulární biologie a genetika mikroorganismů, přednášející, 40%

Údaje o vzdělání na VŠ 2018 IPVZ - AKK Odborné zdravotnické laboratorní metody 2011-2016 Lékařská fakulta UP v Olomouci, postgraduální studium, program Lékařská mikrobiologie 2013-2014 Přírodovědecká fakulta Masarykovy Univerzity v Brně, rigorózní studium – program Experimentální biologie, obor Speciální biologie, směr Mikrobiologie a molekulární biotechnologie 2006-2011 Přírodovědecká fakulta UP v Olomouci, bakalářský a navazující magisterský studijní program Biologie, obor Molekulární a buněčná biologie

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2018 - Junior researcher – Oddělení organické chemie a genetiky CRH 2017 - Odborný asistent – Ústav mikrobiologie LF UP v Olomouci 2015-2018 Vědecký pracovník – Laboratoř růstových regulátorů Univerzity Palackého v Olomouci a ÚEB AV ČR 2015-2016 Odborný pracovník – Ústav mikrobiologie LF UP v Olomouci 2012-2015 PhD. student - Spoluúčast na grantu MZČR 521100271/33

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 3 bakalářské práce, 2 diplomové práce

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 16 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Machníková R., Janovská L., Brulíková L. (2020): Solid-phase synthetic approach towards new pyrimidines as potential

antibacterial agents. Journal of Molecular Structure 1200, 127101 (IF 2,12) Bildziukevich U., Malík M., Ozdemir Z., Rárová L., Janovská L., Šlouf M., Šaman M., Šarek J., Nonamma, Wimmer Z.

(2020): Spermine amides of selected triterpenoid acid: dynamic supramolecular systém formation influences the cytotoxicity of the drugs. Journal of Materials Chemistry 8: 484-491 (IF 5,047)

Šlachtová V., Janovská L, Brulíková L. (2019): Solid-phase synthesis Pyrimidine Thiazolidinedione Conjugates Antimycobacterial Antibacterial. Journal of Molecular Structure 1183: 182-189 (IF 2,12)

Bildziukevich U., Rárová L., Janovská L., Šaman D., Wimmer Z. (2019): Enhancing effect of cystamine in its amides with betulinic acid as antimicrobial and antitumor agent in vitro. Steroids 148: 91-98 (IF 2,136)

Pulzova L., Navratilova L., Comor L. (2017): Alteration in outer membrane permeability: The universal drug resistance strategy in Klebsiella. Microbial Drug Resistance 23: 413-419 (IF 2,529)

Působení v zahraničí 2014 pracovní stáž, 1 měsíc, Ústav mikrobiológie a imunológie Jesseniovy Lekárske fakulty v Martine,

Komenského Univerzita v Bratislave a Ústav mikrobiológie Úradu verejného zdravotnictva Slovenskej Republiky so sídlom v Žiline

2012 pracovní stáž, 3 měsíce, Laboratory Bacteriological Research, Ghent University, Gent, Belgie

Podpis datum 30.1:2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Miloslav Kitner Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp. Rozsah 40 do kdy 08/20 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. Rozsah 40 do kdy 08/20 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/MOLEK – Molekulární ekologie, přednášející, 50%

Údaje o vzdělání na VŠ 1994-2000: Mgr. – PřF UP v Olomouci, obor: učitelství biologie a chemie pro střední školy 2000-2003: Ph.D. – PřF UP v Olomouci, obor: botanika 2003: RNDr. – PřF UP v Olomouci, obor: botanika Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2003-2004: Laboratoř růstových regulátorů PřF UP a AV ČR při UP v Olomouci; vědecký pracovník 2005-2011: Laboratoř molekulárních markerů, Katedra botaniky PřF UP Olomouc; vědecký pracovník 2011- dosud: Laboratoř molekulárních markerů, Katedra botaniky PřF UP Olomouc; odborný asistent

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Počet obhájených bakalářských prací – 3; diplomových prací - 1, disertačních prací – 1 před obhajobou.

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 526 532 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 47 publikací na WOS (h-index = 14). Lebeda A.et al. 2019. Research gaps and challenges in the conservation and exploitation of North American wild lettuce

(Lactuca L.) germplasm. – Crop Science 59: 2337-2356. Braun U. et al. 2019. Phylogeny and taxonomy of Golovinomyces orontii revisited. – Mycological Progress 18(3):335-357 Petrželová I. et al. 2017. Confirmation of Peronospora agrimoniae as a distinct species. – European Journal of Plant

Pathology 147: 887-896. Kitner M. et al. 2015. Coincidence of virulence shifts and changes in the population genetic structure of Pseudoperonospora

cubensis populations revealed by multilocus analyses. – Plant Pathology 64: 1461-1470. Sharma R. et al. 2015. Genome analyses of the sunflower pathogen Plasmopara halstedii provide insights into effector

evolution in downy mildews and Phytophthora. – BMC Genomics 16:741 Kitner M. et al. 2015. Genetic diversity in Israeli natural populations of three predominantly self-pollinating wild Lactuca

(L. serriola, L. saligna, L. aculeata) species. - Genetic Resources and Crop Evolution 67(2): 991-1008 Působení v zahraničí 2012, 3 měsíce: Německo, Biodiversity and Climate Research Centre (BiK-F) & the Goethe Univ., Frankfurt am Main, Department of Biological Sciences, Institute of Ecology, Evolution and Biodiversity 2014, 1 měsíc: Maďarsko, Department of Plant Pathology, Plant Protection Institute of the Centre for Agricultural Research of the Hungarian Academy of Sciences 2014, 1 měsíc: Německo, Biodiversity and Climate Research Centre (BiK-F) & the Goethe Univ., Frankfurt am Main, Department of Biological Sciences, Institute of Ecology, Evolution and Biodiversity


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Vladimír Kryštof Tituly doc. RNDr., Ph.D. Rok narození 1973 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu LRR/BUCY – Buněčný cyklus a apoptóza, garant, přednášející, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ Mgr., Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Analytická chemie, 1996 Ph.D., Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská fakulta, obor Lékařská biologie, 2002 RNDr., Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Botanika, 2003 Docent, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, obor Biochemie, 2010

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1998-2004: PřF UP, výzkumný pracovník 2003-2012: Ústav experimentální botaniky, v.v.i., vědecký pracovník 2004-2009: PřF UP, vědecký pracovník 2007-2008: Vienna Medical University, Rakousko, vědecký pracovník od 2010: PřF UP, docent od 2012: Ústav experimentální botaniky, v.v.i., docent (úvazek 0,5)

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací vedení bakalářských prací (7x), diplomových prací (13x), doktorských prací (10x), oponentské posudky doktorských prací (6x) členství v oborové komisi doktorského studijního programu experimentální biologie (PřF UP)

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 2010 UP Olomouc WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 2171 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům 107 odborných publikací v zahraničních peer reviewed časopisech s IF 25 mezinárodních patentových přihlášek Více než 100 konferenčních příspěvků organizace mezinárodních konferencí (člen organizačního výboru 2x, editor sborníku 2x) výzkumné grantové projekty GAČR (5x hlavní řešitel, 3x odborný spolupracovník), IGA MZ (2x hlavní řešitel, 1x spoluřešitel), MŠMT (2x hlavní řešitel), OPVK (5x odborný spolupracovník) Hodnotící panel Grantové agentury České republiky (P303 Fyziologické obory, farmakologie, neurovědy a toxikologie), člen od roku 2017 5 nejvýznamnějších publikací za poslední 1 rok: Jorda R., Bučková Z., Řezníčková E., Bouchal J., Kryštof V.: Selective inhibition reveals cyclin-dependent kinase 2 as

another kinase that phosphorylates the androgen receptor at serine 81. Biochim. Biophys. Acta. 1865, 354-363, 2018. (autorský podíl 20%)

Gucky T., Řezníčková E., Radosova Muchova T., Jorda R., Klejova Z., Malinkova V., Berka K., Bazgier V., Ajani H., Lepsik M., Divoky V., Kryštof V.: Discovery of N2-(4-Amino-cyclohexyl)-9-cyclopentyl- N6-(4-morpholin-4-ylmethyl-phenyl)-9 H-purine-2,6-diamine as a Potent FLT3 Kinase Inhibitor for Acute Myeloid Leukemia with FLT3 mutations. J. Med. Chem. 61, 3855-3869. (autorský podíl 20%)

Jorda R, Hendrychová D, Voller J, Řezníčková E, Gucký T, Kryštof V. How Selective Are Pharmacological Inhibitors of Cell-Cycle-Regulating Cyclin-Dependent Kinases? J Med Chem. 2018 Oct 25;61(20):9105-9120. (autorský podíl 20%)

Milišiūnaitė V, Arbačiauskienė E, Řezníčková E, Jorda R, Malínková V, Žukauskaitė A, Holzer W, Šačkus A, Kryštof V. Synthesis and anti-mitotic activity of 2,4- or 2,6-disubstituted- and 2,4,6-trisubstituted-2H-pyrazolo[4,3-c]pyridines. Eur

J Med Chem. 2018 Apr 25;150:908-919. (autorský podíl 15%) Jorda R., Havlicek L., Sturc A., Tuskova D., Daumova L., Alam M., Skerlova J., Nekardova M., Perina M., Pospíšil T.,

Siroka J., Urbánek L., Pachl P., Rezacova P., Strnad M., Klener P, Krystof V.: 3,5,7-Substituted pyrazolo[4,3-d]pyrimidine inhibitors of cyclin-dependent kinases and their evaluation in lymphoma models. J. Med. Chem. 62, 4606-4623, 2019. (autorský podíl 10%)

Působení v zahraničí 1997 (1 měsíc) Dept. of Biochemistry, University of Dundee, Velká Británie, stáž 1998 (1 měsíc) Dept. of Genetics and Microbiology, Vienna University, Rakousko, stáž 2003 (1 měsíc) Dept. of Biophysics, Faculte de Pharmacie de Marseille, Francie, stáž 2004 (1 měsíc) Dept. of Biophysics, Faculte de Pharmacie de Marseille, Francie, stáž 2007-2008 Institute of Cancer Research, Vienna Medical University, Rakousko, stáž


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Petr Nádvorník Tituly RNDr., Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/TOXL – Legislativa toxikologie, garant, přednášející, 100% KBB/IPRP – Izolace a purifikace rekombin. proteinu, garant, přednášející, 100% KBB/MOLEK – Molekulární ekologie, garant, přednášející, 50%

Údaje o vzdělání na VŠ RNDr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Zoologie, 2005 Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Zoologie, 2004 Mgr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Učitelství biologie a chemie pro střední školy, 1999

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2004 (VII – dosud): Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP v Olomouci, odborný asistent 2004 (I–VI): Laboratoř růstových regulátorů PřF UP v Olomouci, vědecký pracovník 2003 (IX–XII): Ornitologická laboratoř při Katedře zoologie PřF UP v Olomouci, vědecký pracovník 2000 (X–XII): Ornitologická laboratoř při Katedře zoologie PřF UP v Olomouci, vědecký pracovník

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedoucí 52 bakalářských a 22 diplomových prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 195 199 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům - Osoba odborně způsobilá pro nakládání s nebezpečnými chemickými látkami a chemickými přípravky klasifikovanými jako vysoce toxické pro Univerzitu Palackého v Olomouci. - Osoba odborně způsobilá pro nakládání s nebezpečnými chemickými látkami a chemickými přípravky klasifikovanými jako vysoce toxické pro Přírodovědeckou fakultu Univerzity Palackého v Olomouci. - Tvorba písemných pravidel o bezpečnosti, ochraně zdraví a ochraně životního prostředí při práci s nebezpečnými chemickými látkami pro Univerzitu Palackého v Olomouci. - Periodická školení zaměstnanců UPOL nakládajících s nebezpečnými chemickými látkami a poradní a kontrolní činnost pro pracoviště UPOL, kde se zachází s chemickými látkami. - Molekulárně-biologické analýzy paternity a pohlaví u ptáků pro zoologické zahrady v ČR (ZOO Dvůr Králové, ZOO Lešná). - Spolupráce s Dr. Kašparem na vzniku genetické laboratoře na Pokusném včelíně v Pekařově (detašované pracoviště Výzkumného ústavu včelařského, Máslovice – Dol). - Popularizační přednášková činnost pro včelařské organizace (ČSV, PSNV). - Přednášková popularizační činnost a náborová činnost pro PřF UPOL (DOD, Gaudeamus). - Tvorba návodů pro praktická cvičení (KBB/IPRP, KBB/EMBSB, KBB/MBCSB) (web katedry). Působení v zahraničí 2001/2002: Univerzita v Uppsale (Švédsko), oddělení evoluční biologie a oddělení populační biologie - stáž v rámci Ph.D. studia (4 měsíce)

Podpis datum 27. 1. 2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Milan Navrátil Tituly prof. RNDr., CSc. Rok narození 1955 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/MBBMI – Molekulární biologie a genetika mikroorganismů, garant, přednášející, 60% KBB/POS1EN – Advanced Seminar 1, garant, vede semináře, 100% KBB/POS2 – Pokročilý oborový seminář 2, garant, vede semináře, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ Promovaný biolog: Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Brně (Masarykova univerzita), Biologie, 1980 RNDr.: Univerzita Jana Evangelisty Purkyně v Brně (Masarykova univerzita), Všeobecná biologie, 1981 CSc.: Virologický ústav SAV v Bratislavě, Virológia, 1991 doc.: Univerzita Palackého v Olomouci, Botanika, 2001 prof.: Univerzita Palackého v Olomouci, Botanika, 2010

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2010 – dosud: profesor, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 2002 – 2008: vedoucí Katedry buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 2001 – 2010: docent, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 1993 – 2000: odborný asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 1984 – 1993: výzkumný pracovní (vedoucí Výrobny diagnostických sér), Výzkumný a šlechtitelský ústav zelinářský v Olomouci 1982 – 1983: výzkumný pracovník, Výzkumný a šlechtitelský ústav ovocnářský v Holovousích 1980 – 1981: studijní pobyt, Ústav experimentální botaniky ČSAV v Olomouci

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedoucí 21 bakalářských, 21 diplomových a 3 doktorandských prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Botanika 2001 UP v Olomouci WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 496 624 - Botanika 2010 UP v Olomouci Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Šafářová D., Vavroušková K., Candresse T., Navrátil M. (2018): Molecular characterization of a novel Aureusvirus

infecting elderberry (Sambucus nigra L.). PLoS ONE 13(8): e0200506. Šafářová D., Candresse T., Navrátil M. (2018): Complete genome sequence of a novel bromovirus infecting elderberry

(Sambucus nigra L.) in the Czech Republic. Archives of Virology 163(2): 567–570. Šafářová D.; Faure C., Candresse T., Navrátil M., Nečas T., Marais A. (2017): First Report of Little cherry virus 1 infecting

apricot in the Czech Republic. Plant Disease 101 (5):845. Cerna H., Černý M., Habánová H., Šafářová D., Abushamsiya K., Navrátil M., Brzobohatý B. (2017): Proteomics offers

insight to the mechanism behind Pisum sativum L. response to Pea seed-borne mosaic virus (PSbMV). Journal of Proteomics 153: 78–88.

Šafářová D., Zemánek T., Válová P., Navrátil M. (2016): 'Candidatus Phytoplasma cirsii', a novel taxon from Creeping thistle (Cirsium arvense (L.) Scop.). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 1745-1753.

Působení v zahraničí Instituto Valenciano de Investigaciones Agrarias, Moncada, Španělsko, 3 měsíce

Podpis datum 30.1:2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Aleš Pečinka Tituly doc. Mgr., Ph.D. Rok narození 1978 typ vztahu k VŠ bud. pp. rozsah 8 do kdy Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program bud. pp. rozsah 8 do kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/EPIG – Epigenetika, garant, přednášející, 100% Údaje o vzdělání na VŠ Bc. – obor Systematická biologie a ekologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc, ČR, obhájeno 1999. Mgr. – obor Systematická biologie a ekologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého, Olomouc, ČR, obhájeno

2001. rer. nat. Dr. (ekvivalent Ph.D.) - University of Halle-Wittenberg, Halle (Saale), SRN, obhájeno 2005. Nostrifikováno

Univerzitou Palackého v Olomouci (2017). Privat Dozent (habilitace) – v oboru Botanika na Ruhr University Bochum (RUB), katedra Rostlinné physiologie,

Bochum, Spolková republika Německo (SRN), obhájeno 2017. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2017 – Vedoucí skupiny, Centrum strukturní a funkční genomiky rostlin, Ústav experimentální botaniky AV ČR v. v. i., Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum, Olomouc, ČR 2010 – 2017 Vedoucí skupiny, MPIPZ, Oddělení rostlinného šlechtění a genetiky, ředitel. Prof. Dr. Maarten Koornneef, Cologne, SRN. 2006 – 2010 Post-doc, Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology (GMI), laboratoř rostlinné epigenetiky, vedoucí PD Dr. Otrun Mittelsten Scheid, Vienna, Rakousko. 2001 – 2005 Ph.D. studium, Leibnitz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), Gatersleben, SRN. Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Počet obhájených bakalářských prací: 3, diplomových prací: 5, disertačních prací: 6 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Botanika 2017 Ruhr University Bochum WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1968 2236 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Díaz M, Pecinkova P, Nowicka A, Baroux C, Sakamoto T, Gandha PY, Jeřábková H, Matsunaga S, Grossniklaus U, Pecinka A (2019): SMC5/6 complex subunit NSE4A is involved in DNA damage repair and seed development in Arabidopsis. Plant Cell 31:1579-1597. Finke A, Mandáková T, Nawaz K, Vu G.T.H., Novák P., Macas J., Lysak M.A., Pecinka A (2019): Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda. Plant J 99:1066-1079. van Esse GW, Walla A, Finke A, Koornneef M, Pecinka A, von Korff M (2017): Six-Rowed Spike3 (VRS3) Is a Histone Demethylase That Controls Lateral Spikelet Development in Barley. Plant Physiology 174: 2397-2408. doi: 10.1104/pp.17.00108. Willing E-M, Piofczyk T, Albert A, Winkler JB, *Schneeberger K, Pecinka A (2016): UVR2 ensures trans-generational genome stability under simulated natural UV-B in Arabidopsis thaliana. Nature Communications, 7: e13522 Pietzenuk B, Markus C, Gaubert H, Bagwan B, Abdelsamad A, Merotto A, Bucher E, Pecinka A (2016): Recurrent evolution of heat-responsiveness in Brassicaceae COPIA elements. Genome Biology, 17: e209 Působení v zahraničí 09/2001 – 01/2006 – doktorand, Leibnitz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK), laboratoř Evoluce karyotypu, vedoucí Prof. Ingo Schubert, Gatersleben, SRN. 03/2006 – 08/2010 - Post-doc, Gregor Mendel Institute of Molecular Plant Biology (GMI), laboratoř rostlinné epigenetiky, vedoucí PD Dr. Otrun Mittelsten Scheid, Vienna, Rakousko. 09/2010 – 08/2017 - Vedoucí skupiny, MPIPZ, Oddělení rostlinného šlechtění a genetiky, ředitel. Prof. Dr. Maarten Koornneef, Cologne, SRN. Podpis datum 30.1.2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení David Kopečný Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1977 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 12/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy 12/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/PBM - Pokročilé biochemické metody, přednášející, (15%)

Údaje o vzdělání na VŠ Ph.D., Lékařská chemie a biochemie, 2006, LF UPOL (ČR) Ph.D., Biologie, 2006, Université Paris XI (Francie)

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ UP Olomouc, PřF, Katedra biochemie, postdoc, 2006 – 2012 UP Olomouc, PřF, CRH – Oddělení biochemie proteinů a proteomiky, junior researcher, 2010 – dosud Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 3 bakalářské práce, 7 diplomových prací, 2 disertační práce jako vedoucí práce Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 466 487 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Kopečná M, Vigouroux A, Vilím J, Končitíková R, Briozzo P, Hájková E, Jašková L, von Schwartzenberg K, Šebela M,

Moréra S, Kopečný D. (2017) Plant J. 92, 229-243 (9%) Končitíková R, Vigouroux A, Kopečná M, Andree T, Bartoš J, Šebela M, Moréra S, Kopečný D. (2015) Biochem J. 468,

109-123 (13%). Kopečná M, Blaschke H, Kopečný D, Vigouroux A, Koncitíková R, Novák O, Kotland O, Strnad M, Moréra S, von

Schwartzenberg K. (2013) Plant Physiol. 163, 1568-1583 (10%). Kopečný D, Končitíková R, Tylichová M, Vigouroux A, Moskalíková H, Soural M, Šebela M, Moréra S. (2013) J. Biol.

Chem. 288, 9491-9507 (13%). Groeme R, Airouche S, Kopečný D, Jaekel J, Savko M, Berjont N, Bussieres L, Le Mignon M, Jagic F, Zieglmayer P,

Baron-Bodo V, Bordas-Le Floch V, Mascarell L, Briozzo P, Moingeon P. (2016) J. Biol. Chem. 291, 13076-87 (7%).

Působení v zahraničí INRA Versailles, Francie, 2018-2019 – 6 měsíců v rámci projektu „Podpora mobility na UP“ CNRS Gif-sur-Yvette, Francie, 2012 – 1 měsíc, PostDoc University Hamburg, Německo, 2009 – 1 měsíc, PostDoc INRA-AgroParisTech Grignon, Francie, 2009 – 3 měsíce, FEBS fellowship, PostDoc INRA Versailles, Francie, 2004-2005 – 12 měsíců, MARIE CURIE long term fellowship, Ph.D. student INRA Versailles, Francie – 2003, 2 měsíce, EGIDE fellowship, Ph.D. student INRA/INAPG Grignon, Francie, 2002 - 3 měsíce, ERASMUS fellowship, student


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení René Lenobel Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1971 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 12/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy 12/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu LRR/PRO – Proteomika, garant, přednášející, 100% LRR/CVPRO – Cvičení z proteomiky, garant, vede cvičení, 34% KBC/PBM – Pokročilé biochemické metody, přednášející, 16%

Údaje o vzdělání na VŠ Mgr. – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, Analytická chemie, 1995 Ph.D. – Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, Analytická chemie, 2002

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2002-2005: Laboratoř růstových regulátorů, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta - junior scientist 2005-2007: Max-Planck-Institute of Biochemistry, Munich, Německo - Postdoctoral Fellowship 2007-2011: Laboratoř růstových regulátorů, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta - research scientist 2011-dosud: Centrum Regionu Haná pro zemědělský a biotechnologický výzkum, Oddělení biochemie proteinů a proteomiky, Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta - senior research

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Ph.D. - 2; Chamrád I. (Afinitní chromatografie v proteomice); Švehlová L. (Studium interakce nukleových kyselin s proteiny pomocí metod afinitní chromatografie) Bakalářské (4) a magisterské (4) práce.

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 993 1133 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Významné publikace Chamrad, I; Urinovska, J; Petrovska, B; Jerabkova, H; Lenobel, R; Vrana, J; Dolezel, J; Sebela, M (2018): Identification

of Plant Nuclear Proteins Based on a Combination of Flow Sorting, SDS-PAGE, and LC-MS/MS Analysis. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1696, pp. 57-79, DOI:10.1007/978-1-4939-7411-5_4 (15%)

Sebela, M; Jahodarova, E; Raus, M; Lenobel, R; Hasler, P. (2018): Intact cell MALDI-TOF mass spectrometric analysis of Chroococcidiopsis cyanobacteria for classification purposes and identification of possible marker proteins. PLOS ONE 13(11), DOI: 10.1371/journal.pone.0208275 (15%)

Simersky, R; Chamrad, I; Kania, J; Strnad, M; Sebela, M; Lenobel, R. (2017): Chemical proteomic analysis of 6-benzylaminopurine molecular partners in wheat grains. PLANT CELL REPORTS 36(10), pp. 1561-1570, DOI: 10.1007/s00299-017-2174-4 (20%)

Hluska, T; Sebela, M; Lenobel, R; Frebort, I; Galuszka, P. (2017): Purification of Maize Nucleotide Pyrophosphatase/Phosphodiesterase Casts Doubt on the Existence of Zeatin Cis-Trans Isomerase in Plants. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 8, article 1473, DOI: 10.3389/fpls.2017.01473. (15%)

Beresova, L.; Vesela, E.; Chamrad, I.; Voller, J.; Yamada, M.; Furst, T.; Lenobel, R.; Chroma, K.; Gursky, J.; Krizova, K.; Mistrik, M.; Bartek, J.(2016): Role of DNA Repair Factor Xeroderma Pigmentosum Protein Group C in Response to Replication Stress As Revealed by DNA Fragile Site Affinity Chromatography and Quantitative Proteomics. Journal of Proteome Research 15(12), pp. 4505-4517, DOI: 10.1021/acs.jproteome.6b00622 (15%)

Přednášky 18. Škola hmotnostní spektrometrie, rok 2017, přednáška: Od hmotnostních spekter k proteinům..11-15. 9. 2017, Luhačovice 19. Škola hmotnostní spektrometrie, rok 2018, přednáška: Možnosti využití MS při studiu interakcí proteinů, 10.-14. 9. 2018, Špindlerův Mlýn

20. Škola hmotnostní spektrometrie, rok 2019, přednáška: Variabilita využití proteomických přístupů v rostlinné biologii. 9. - 13. 9. 2019, Špindlerův Mlýn Projekty – 2016 – FRUP_2016_039 grant, název: Profilace a podpora výuky praktických znalostí z oblasti pokročilých experimentálních metod z proteomiky v předmětu Cvičení z proteomiky (LRR/CVPRO) pro studenty magisterských studijních oborů Experimentální biologie, Fyziologie rostlin a Molekulární a buněčná biologie., Univerzita Palackého v Olomouci, PřF – řešitel

Působení v zahraničí 1993 5 týdnů, Tübingen, Německo, University Tübingen, Department of Genetic, Dr. T. Schmülling – stáž. 1996 5 týdnů, Norwich, Anglie, Institute of Food Research, Department of Biochemistry, Dr. G. M. Wyatt – stáž. 2002 5 týdnů, Antwerpy, Belgie, University of Antwerp, Department of Plant Physiology and Biochemistry, Prof. Dr. H.A. Van Onkelen – stáž. 2003 3 měsíce, Antwerpy, Belgie, University of Antwerp, Department of Plant Physiology and Biochemistry, Prof. Dr. H.A. Van Onkelen – stáž. 2005 24 měsíců, Mnichov, Německo, Max-Planck-Institute of Biochemistry, Department of Cell Biology, Prof. Erich Nigg – postDoc stáž

Podpis datum 15. ledna 2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Lenka Luhová Tituly doc. RNDr., Ph.D. Rok narození 1961 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/MREG – Metabolické regulace, garant, přednášející, 100% KBC/ENZ – Enzymologie, garant, přednášející, 25%

Údaje o vzdělání na VŠ 1984 – studijní obor Biochemie na Přírodovědecké fakultě Univerzity J. E. Purkyně v Brně (nynější Masarykova univerzita) – titul RNDr. 1997 – doktorské studium oboru Lékařská chemie a biochemie na Lékařské fakultě Univerzity Palackého v Olomouci – titul Ph.D

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 1984–1985: Ústav lékařské chemie LF UJEP Brno – asistent 1985–1986: Ústav lékařské chemie LF UP Olomouc – vědecký aspirant 1991–1992: VŠÚZ Olomouc – výzkumný pracovník 1992–2003: Katedra biochemie PřF UP Olomouc – odborný asistent 2004–dosud: Katedra biochemie PřF UP Olomouc – docent 2012–dosud: vedoucí Katedry biochemie PřF UP.

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení prací: 19 obhájených bakalářských prací, 26 diplomových prací a 2 disertační práce, u 2 obhájených disertačních prací konzultant. Aktuálně vedení 1 DP a 3 disertačních prací. Garant: bakalářského a navazujícího magisterského studijního oboru Biochemie v rámci studijního programu Biochemie. Oborové rady doktorských studijních programů, člen oborové komise Biochemie na PřF UP v Olomouci, člen oborové komise doktorského studijního programu Biofyzika na PřF UP, Biochemie na VŠCHT v Praze a člen oborové komise pro Strukturní biologii, Ph.D programu Life Sciences PřF MU v Brně. Vypracování oponentských posudků: posouzení10 disertačních prací a 2 habilitačních prací jako oponent.

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Fyziologie rostlin 2003 MZLU Brno WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 671 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Pedagogická činnost za posledních 10 let (vše na PřF UP Olomouc): 5 přednáškových celosemestrálních kurzů (garantuje a přednáší), pro které připravila elektronické výukové materiály; 1 oborový semináře (garantuje) Výzkumné projekty: 1) 2012-2015: P501/12/0590: Charakterizace procesů zapojených v indukci resistence rostlin na patogeny s využitím elicitinů se změněnou schopností vyvolávat obranné reakce (hlavní řešitel) 2) 2005-2011: MSM 6198959215 Variability of components and interactions in plant pathosystem and impact of environmental factors on their expression (spoluřešitel) Projekty pro rozvoj studijního programu: 1) 2009- 2012 OP VK 2.3 CZ.1.07/2.3.00/09.0018 AescuLab - systematické laboratorní vzdělávání studentů a pracovníků VaV v oblasti Life Sciences s podporou e-learningu (hlavní řešitel), 2) 2010-2013: OP VK CZ.1.07/2.2.00/15.0271 ImBio. E-learningová podpora praktické výuky biochemie a imunologie (hlavní řešitel) 3) 2012-2014: OP VK CZ.1.07/2.4.00/31.0133 BiochemNet. Vytvoření sítě pro podporu spolupráce biomedicínských pracovišť a zvýšení uplatnitelnosti absolventů biochemických oborů v praxi (spoluřešitel), 4) 2012-2015: OP VK CZ.1.07/2.2.00/28.0171 FytoChem. Mezioborová integrace výuky zaměřená na rostlinnou biochemii a fytopatologii (spoluřešitel).

Akreditace studijního programů: bakalářská Biochemie, navazující magisterská Biochemie, akreditace oboru habilitačního řízení /oboru řízení ke jmenování profesorem (2014) Pět nejvýznamnějších publikací za posledních 5 let: Janků M., Luhová L., Petřivalský M. On the Origin and Fate of Reactive Oxygen Species in Plant Cell Compartments.

Antioxidants 2019, 8, 105; doi.org/10.3390/antiox8040105 Jedelská T., Šmotková Kraiczová V., Berčíková L., Činčalová L., Luhová L., Petřivalský M. Tomato Root Growth

Inhibition by Salinity and Cadmium Is Mediated By S‐Nitrosative Modifications of ROS Metabolic Enzymes Controlled by S‐Nitrosoglutathione Reductase. Biomolecules 2019, 9, 393; doi.org/10.3390/biom9090393, IF - 4.694

Tichá T, Sedlářová M., Činčalová L, Drábková Trojanová Z, Mieslerová B, Lebeda A, Luhová L, Petřivalský Involvement of S-nitrosothiols modulation by S-nitrosoglutathione reductase in defence responses of lettuce and wild Lactuca spp. to biotrophic mildews (2018) Planta 247/5. 1203-1215.

Tichá T, Lochman J, Činčalová L, Luhová L, Petřivalský M. Redox regulation of plant S-nitrosoglutathione reductase activity through post-translational modifications of cysteine residues (2017) Biochemical and Biophysical Research Communications 494, 27-33.

Satková P, Starý T, Plešková V, Pečínková M, Kašparovský T, Činčalová-Kubienová L, Luhová L, Mieslerová B, Mikulík J, Lochman J and Petřivalský M (2016) Diverse responses of wild and cultivated tomato to BABA, oligandrin and 4 Oidium neolycopersici infection. Ann Bot (2017) 119 (5): 829-840.

Působení v zahraničí 2003 Itálie, University of Roma Tre (2 měsíce)


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Radim Simerský Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1979 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 36 do kdy 10/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 36 do kdy 10/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu LRR/CVPRO – Cvičení z proteomiky, vede cvičení, 33%

Údaje o vzdělání na VŠ 2009: Ph.D., doktorské studium, obor Botanika, PřF UP v Olomouci Mgr., Učitelství pro střední školy, Bi-Ch, PřF UP v Olomouci

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2007-2010: Vědecký pracovník oborů biologických, Laboratoř růstových regulátorů UP Olomouc & AVČR 2010-2013: Junior researcher, Oddělení biochemie proteinů a proteomiky, Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum 2013-dosud: Akademický vědecký pracovník, Oddělení biochemie proteinů a proteomiky, Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bc. – 2 Mgr. – 1

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 49 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Chamrád I., Simerský R. (eq.c.), Bérešová L, Strnad M, Šebela M, Lenobel R. Proteomic Identification of a Candidate

Sequence of Wheat Cytokinin-Binding Protein 1. J. Plant Growth Regul 33, 896-902. (2014) Simersky R., Chamrad I. (eq.c.), Kania J., Strnad M., Sebela M., Lenobel R. Chemical proteomic analysis of 6-

benzylaminopurine molecular partners in wheat grains. Plant Cell Rep 36, 1561-1570. (2017)



C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Barbora Sokolová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1980 typ vztahu k VŠ pp rozsah 6 do kdy 05/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp rozsah 6 do kdy 05/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/FATOX – Forenzní analytická chemie, přednášející, 75%

Údaje o vzdělání na VŠ 2003 – obor Klinická a toxikologická analýza, PřF UK Praha, titul Bc. 2005 – obor Klinická a toxikologická analýza, PřF UK Praha, titul Mgr. 2011 – katedra Lékařská chemie a biochemie, LF UPOL, titul Ph.D.

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2006 – 2012: toxikolog, Ústav soudního lékařství a medicínského práva, FN Olomouc 2011 – dosud: zástupce vedoucího Úseku instrumentálních metod, Laboratoře Agel a.s. Nový Jičín 2018 – dosud: analytik, Institut environmentálních technologií, VŠB-TU Ostrava

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Praxe 8 let na Ústavu soudního lékařství (FN Ostrava, Olomouc) a dále 9 let na Úseku instrumentálních metod Laboratoří Agel, kde se rutinně provádí vyšetření v rámci klinické toxikologie a biochemie.



C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Dana Šafářová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1969 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 06/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy 06/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/CVGEN – Cvičení z genomiky, vede cvičení, 40%

Údaje o vzdělání na VŠ Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Botanika, 2004 Mgr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Systematická biologie a ekologie, 1993

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2009 – dosud: tajemník katedry pro pedagogické záležitosti, Katedra buněčné biologie a genetiky, PřF UP Olomouc 1999 – dosud: odborný asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 2006 – srpen 2008: zástupce vedoucího katedry pro studijní záležitosti 2005 – 2008: tajemník katedry, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 1997 – 1999: asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 1993 – 1996: odborný pracovník s VŠ, Katedra buněčné biologie a genetiky PřF UP Olomouc 1993: samostatný výzkumný pracovník, firma Mippo, Dvůr Králové nad Labem Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací vedoucí 23 bakalářských a 7 diplomových prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 397 369 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Massart S. et al. (2019) Virus Detection by High-Throughput Sequencing of Small RNAs: Large-Scale Performance

Testing of Sequence Analysis Strategies. Phytopathology 109(3):488-497. Šafářová D. et al. (2018) Molecular characterization of a novel Aureusvirus infecting elderberry (Sambucus nigra L.). PLoS

One 13(8):e0200506. Šafářová D, Candresse T, Navrátil M. (2018) Complete genome sequence of a novel bromovirus infecting elderberry

(Sambucus nigra L.) in the Czech Republic. Arch Virol. 163(2):567-570. Cerna H et al. (2017) Proteomics offers insight to the mechanism behind Pisum sativum L. response to Pea seed-borne

mosaic virus (PSbMV). J Proteomics. 5;153:78-88. Šafářová, D., Zemánek, T., Válová, P., Navrátil, M. (2016) ‘Candidatus phytoplasma cirsii’, a novel taxon from creeping

thistle [Cirsium arvense (L.) Scop.] IJSEM 66 (4):1745-1753. Působení v zahraničí


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Hana Šimková Tituly Ing., CSc. Rok narození 1966 typ vztahu k VŠ pp rozsah 12 do kdy 05/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp rozsah 12 do kdy 05/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/GENMK – Genomika, garant, přednášející, 100% KBB/CVGEN – Cvičení z genomiky, garant, vede cvičení, 60%

Údaje o vzdělání na VŠ Fytotechnika, Ing., 1989, AF VŠZ v Brně Genetika, CSc., 1997, AV ČR

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ Ústav experimentální botaniky ČSAV, studijní pobyt, 1989-1990 Ústav experimentální botaniky AVČR, vědecký aspirant, 1990-1996 Ústav experimentální botaniky AV ČR, vědecký pracovník, 1996-dosud PřF UP v Olomouci, odborný asistent, 2006-dosud

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Bakalářské práce: 1 Diplomové práce: 2 Disertační práce: 2 Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 4679 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Tulpová, Z., Toegelová, H., Lapitan, N.L.V., Peairs, F.B., Macas, J., Novák, P., Lukaszewski, A.J., Kopecký, D.,

Mazáčová, M., Vrána, J., Holušová, K., Leroy, P., Doležel, J., Šimková, H.: Accessing a Russian Wheat Aphid resistance gene in bread wheat by long-read technologies. – Plant Genome 12: 180065, 2019. – 40%

International Wheat Genome Sequencing Consortium: Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome. – Science 361(6403): 7191, 2018. – 5%

Šimková, H., Kubaláková, M., Vrána, J., Cápal, P., Doležel, J.: Chromosomal genomics of barely. In: Stein, N., Muehlbauer, G. (eds): The Barley Genome. Compendium Plant Genomes, Springer, 2018. – 90%

Thind, A.K., Wicker, T., Šimková, H., Fossati, D., Moullet, O., Brabant, C., Vrána, J., Doležel, J., Krattinger, S.G.: Rapid cloning of genes in hexaploid wheat using cultivar-specific long-range chromosome assembly. – Nature Biotechnol. 35: 793-796, 2017. – 10%

Staňková, H., Hastie, A.R., Chan, S., Vrána, J., Tulpová, Z., Kubaláková, M., Visendi, P., Hayashi, S., Luo, M., Batley, J., Edwards, D., Doležel, J., Šimková, H.: BioNano genome mapping of individual chromosomes supports physical mapping and sequence assembly in complex plant genomes. – Plant Biotech. J. 14: 1523-1531, 2016. – 40%

Působení v zahraničí University of Arizona, Dept. Plant Sci., Tucson, USA, 1998, 1 měsíc Podpis datum 24. 1. 2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Mária Škrabišová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1982 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 20 do kdy 01/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 20 do kdy 01/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/ENZ – Enzymologie, přednášející, 75%

Údaje o vzdělání na VŠ Ph.D. – 2010: PřF UPOL, Obor Biochemie Mgr. – 2006: PřF UPOL, Obor Biochemie Bc. – 2004: PřF UPOL, Obor Biochemie

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2016-součastnost: Expert v oblasti molekulární biologie, University of Missouri, Columbia MO, USA 2013-současnost: Odborný asistent Katedry Biochemie, PřF UPOL 2010-2019: Junior researcher – CRH 2007-2010 Vědecko-akademický pracovník – Katedra Biochemie, PřF UPOL

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 3 bakalářské a 3 diplomové práce

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus Ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 495 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Výukové texty: Skripta pro Cvičení z molekulární biologie (2014) Vědecké publikace: Carrie Miranda C., Culp C., Škrabišová M., Joshi T., Belzile F., Grant D. M., Bilyeu K. Molecular tools for detecting Pdh1

can improve soybean breeding efficiency by reducing yield losses due to pod shatter (2019) Molecular Breeding 39:27 doi.org/10.1007/s11032-019-0935-1

Marchetti C.F., Škrabišová M., Galuszka P., Novák O., Causin H.F., Blue light suppression alters cytokinin homeostasis in wheat leaves senescing under shading stress. (2018) Plant Physiology and Biochemistry 130, DOI: 10.1016/j.plaphy.2018.08.005

Bilyeu K., Skrabisova M., Allen D., Rajcan I., Palmquist E. D., Gillen A., Mian R., Jo H. (2018) The Interaction of the Soybean Seed High Oleic Acid Oil Trait With Other Fatty Acid Modifications. J. Am. Oil Chem. Soc. DOI10.1002/aocs.12025

Šmehilová M., Dobrůšková J., Novák O., Takáč T., Galuszka P. (2016) Cytokinin-specific glycosyltransferases possess different roles in cytokinin homeostasis maintenance. Front Plant Sci. Aug 23;7:1264. doi: 10.3389/fpls.2016.01264

erp126. Působení v zahraničí 2013: University of Missouri, Columbia MO, USA (3 měsíce) 2006/2007: University of Missouri, Columbia MO, USA (7,5 měsíců) 2006: Free University of Berlin, Německo (1,5 měsíce)

Podpis Datum 30.1.2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Petr Tarkowski Tituly doc. RNDr., Ph.D. Rok narození 1976 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 36 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 36 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. Vztahu Rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/PBM - Pokročilé biochemické metody, přednášející, 8%

Údaje o vzdělání na VŠ Mgr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Analytická chemie, 1999. Ph.D.: Univerzita Palackého v Olomouci, Botanika, 2003. RNDr.: Univerzita Palackého v Olomouci, Botanika, 2006. Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2006-2011: Univerzita Palackého v Olomouci, odborný asistent; Od 2011: Univerzita Palackého v Olomouci, docent

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 2007-2020: vedoucí 15 bakalářských prací, vedoucí 16 diplomových prací, konzultant 1 rigorózní práce a vedoucí 1 disertační práce

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 2011 UP Olomouc WOS Scopus Ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 2451 2233 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Publikace (2015-2019): Cavar S, Zwanenburg B, Tarkowski P. (2015) Strigolactones - Occurrence, Structure, and Biological Activity in the

Rhizosphere. Phytochem. Rev. 14, 671-711. (30 %); Halouzka R., Tarkowski P., Ćavar Zeljković S. (2016) Characterization of Phenolics and other Quality Parameters of

Different Types of Honey. Czech Journal of Food Sciences, 34, 244-253. (33 %); Halouzka R, Tarkowski P, Zwanenburg B, Zeljkovic SC (2018) Stability of strigolactone analog GR24 toward

nucleophiles. Pest management science. 74, 896-904. (20 %); Jaworek P, Kopecny D, Zalabak D, Sebela M, Kouril S, Hluska T, Koncitikova R, Podlesakova K, Tarkowski P (2019)

Occurrence and biosynthesis of cytokinins in poplar. Planta 250, 229-244. (20 %); Beres T, Cernochova L, Zeljkovic SC, Benicka S, Gucky T, Bercak M, Tarkowski P (2019) Intralaboratory comparison of

analytical methods for quantification of major phytocannabinoids. Analytical and Bioanalytical Chemistry 411, 3069-3079. (15 %)

Působení v zahraničí 2001, Švédsko, Umea Plant Science Centre (7 měsíců); 2002 Švédsko, Umea Plant Science Centre (5 měsíců); 2003-2005 Švédsko, Umea Plant Science Centre (20 měsíců); 2005, Japonsko, Osaka University (1 měsíc).


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Jan Vondráček Tituly prof. RNDr., Ph.D. Rok narození 1970 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 12 do kdy 5/21 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 12 do kdy 5/21 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Brno pp 8 Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/ENVTX - Environmentální toxikologie, garant, přednášející, 100% KBB/MOLTX - Molekulární toxikologie, garant, přednášející, 100% Údaje o vzdělání na VŠ 1993: Obecná biologie, PřF MU Brno (RNDr.) 1996: Fyziologie a vývojové biologie živočichů, PřF MU Brno (Ph.D.)

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ hlavní pracovní poměr: 1997-2002 – vědecký pracovník, Laboratoř cytokinetiky, Biofyzikální ústav AV ČR, Brno; 2002-2005 – samostatný vědecký pracovník, Laboratoř cytokinetiky, Biofyzikální ústav AV ČR, Brno; 2006-3/2015 – vedoucí vědecký pracovník, vedoucí skupiny Buněčná a molekulární toxikologie v rámci Oddělení cytokinetiky, Biofyzikální ústav AV ČR, Brno; 4/2016-dosud – vedoucí Oddělení cytokinetiky, Biofyzikální ústav AV ČR, Brno; vedlejší pracovní poměr: 1997-6/2012 – vědecký pracovník, Oddělení chemie a toxikologie, Výzkumný ústav veterinárního lékařství, Brno; 7/2012-6/2015 – odborný pracovník, Oddělení fyziologie a imunologie živočichů, Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta MU, Brno; 7/2015-6/2017 – docent, Oddělení fyziologie a imunologie živočichů, Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta MU, Brno; 7/2017-dosud – profesor; Oddělení fyziologie a imunologie živočichů, Ústav experimentální biologie, Přírodovědecká fakulta MU, Brno; 6/2015-dosud – docent, Katedra buněčné biologie a genetiky, Přírodovědecká fakulta UP v Olomouci;

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací doktorské práce: 8 (5 dokončených); diplomové práce: 9 (7 dokončených); bakalářské práce: 9

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Fyziologie živočichů 2011 Masarykova univerzita,

Brno WOS Scopus ostatní

Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 2241 2407 - Fyziologie živočichů 2017 Masarykova univerzita,

Brno Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Vondráček J., Pěnčíková K., Neča J., Ciganek M., Grycová A., Dvořák Z., Machala M. (2017) Assessment of the aryl

hydrocarbon receptor-mediated activities of polycyclic aromatic hydrocarbons in a human cell-based reporter gene assay. Environ. Pollut., 220(Pt A): 307-316.

Zapletal O., Tylichová Z., Neča J., Kohoutek J., Machala M., Milcová A., Pokorná M., Topinka J., Moyer M. P., Hofmanová J., Kozubík A., Vondráček J. (2017) Butyrate alters expression of cytochrome P450 1A1 and metabolism of benzo[a]pyrene via its histone deacetylase activity in colon epithelial cell models. Arch. Toxicol., 91(5): 2135-2150.

Hýžďalová M., Pivnička J., Zapletal O., Vázquez-Gómez G., Matthews J., Neča J., Pěnčíková K., Machala M., Vondráček J. (2018) Aryl hydrocarbon receptor-dependent metabolism plays a significant role in estrogen-like effects of polycyclic aromatic hydrocarbons on cell proliferation. Toxicol. Sci., 165(2): 447-461.

Pěnčíková K., Svržková L., Strapáčová S., Neča J., Bartoňková I., Dvořák Z., Hýžďalová M., Pivnička J., Pálková L., Lehmler H.-J., Li X., Vondráček J., Machala M. (2018) In vitro profiling of toxic effects of prominent environmental lower-chlorinated PCB congeners linked with endocrine disruption and tumor promotion. Env. Pollution, 237: 473-486.

Svobodová J., Procházková J., Kabátková M., Krkoška M., Šmerdová L., Líbalová H., Topinka J., Kléma J., Kozubík A., Machala M., Vondráček J. (2019) 2,3,7,8-Tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) disrupts control of cell proliferation and apoptosis in a human model of adult liver progenitors. Toxicol. Sci. 172(2): 368-384.

Působení v zahraničí 1993: Katedra biochemie, University of Antwerp, UIA, Antverpy, Belgie


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Radim Vrzal Tituly doc. Ing., Ph.D. Rok narození 1979 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy N Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy N Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/TOX – Toxikologie, garant, přednášející, 100% KBB/FATOX – Forenzní analytická toxikologie, garant, přednášející, 25% KBB/GCCSB – Cvičení z genetiky člověka, garant, vede cvičení, 100% KBB/GCPSB – Genetika člověka, garant, přednášející, 100%

Údaje o vzdělání na VŠ Ing., Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, obor Biochemie, rok 2003 Ph.D., Univerzita Palackého v Olomouci, obor Lékařská chemie a biochemie, rok 2007 doc., Univerzita Palackého v Olomouci, obor Biochemie, rok 2011

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2006-2008: Univerzita Palackého v Olomouci, Lékařská fakulta, odborný asistent 2008-2011: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědeck fakulta, odborný asistent 2011-2017: Univerzita Palackého v Olomouci, Přírodovědecká fakulta, docent Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací počet vedených Bc. prací - 14, počet vedených Mgr. prací - 9, počet vedených Ph.D. prací - 1

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací Biochemie 2011 UP WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 1130 1271 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Ženata O, Marcalíková A, Vrzal R.,The Effect of Caffeine on Calcitriol-Inducible Vitamin D Receptor-Controlled Gene

Expression in Intestinal and Osteoblastic Cells. Calcif Tissue Int. 2019 Zenata O, Dvorak Z, Vrzal R., Mycophenolate Mofetil induces c-Jun-N-terminal kinase expression in 22Rv1 cells: an

impact on androgen receptor signaling. J Cancer. 2018 Zenata O, Dvorak Z, Vrzal R., Profiling of bisphenol S towards nuclear receptors activities in human reporter cell lines.

Toxicol Lett. 2017 Doricakova A, Theile D, Weiss J, Vrzal R., Differential effects of the enantiomers of tamsulosin and tolterodine on P-

glycoprotein and cytochrome P450 3A4. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 2017 Doricakova A, Vrzal R., A food contaminant ochratoxin A suppresses pregnane X receptor (PXR)-mediated CYP3A4

induction in primary cultures of human hepatocytes. Toxicology. 2015 výzkumný projekt GAČR - P303/12/0472, Studium mechanizmu regulace biotransformačního enzymu CYP3A4

prostřednictvím post-translačních modifikací nukleárních receptoru - význam pro terapii, 2012-2016, Spoluřešitel Působení v zahraničí 2005, 2006 - 2 x 6 měsíců, INSERM U632, Montpellier, Francie - stáž v rámci doktorského studia 2009 - 1 měsíc, Maďarská akademie věd, Budapešť 2014 - 1 měsíc, Univerzita v Heidelbergu, Německo


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Aneta Vrzalová Tituly Mgr., Ph.D. Rok narození 1984 typ vztahu k VŠ bud. pp. rozsah bud. 40 do kdy Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program bud. pp. rozsah bud. 40 do kdy Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/VMSBP - Vybrané metody studia buněčných procesů, vede cvičení, 100% KBB/MTSB - Moderní techniky studia buňky, přednášející, 75%

Údaje o vzdělání na VŠ Biochemie, 2013, UP v Olomouci, Přírodovědecká fakulta (Ph.D.) Biochemie, 2009, UP v Olomouci, Přírodovědecká fakulta (Mgr.)

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 09/2020 – budoucí pp., odborný asistent PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky 01/2017-08/2020 – mateřská dovolená 2013-2019 – odborný asistent, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky 2009-2013 – akademický vědecký pracovník, PřF UPOL, Katedra buněčné biologie a genetiky Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací Vedení: dvou úspěšně obhájených diplomových prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 82 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Pasquel D, A. Doricakova, H. Li, S. Kortagere, M.D. Krasowski, A. Biswas, W. G. Walton, M.R. Redinbo, Z. Dvorak , S.

Mani, Acetylation of lysine 109 modulates pregnane X receptor DNA binding and transcriptional activity. Biochim Biophys Acta, 2016, 1859(9):1155-1169, 1 - These authors contributed equally to this work.

Vrzal, R., O. Zenata, A. Doricakova, Z. Dvorak, Environmental pollutants parathion, paraquat and bisphenol A show distinct effects towards nuclear receptors-mediated induction of xenobiotics-metabolizing cytochromes P450 in human hepatocytes. Toxicol Lett, 2015. 238(1): p. 43-53.

Grycova, A., A. Doricakova, and Z. Dvorak, Impurities contained in antifungal drug ketoconazole are potent activators of human aryl hydrocarbon receptor. Toxicol Lett, 2015. 239(2): p. 67-72. IF2014 3.262

Doricakova, A. and R. Vrzal, A food contaminant ochratoxin A suppresses pregnane X receptor (PXR)-mediated CYP3A4 induction in primary cultures of human hepatocytes. Toxicology, 2015. 337: p. 72-8.

Doricakova, A., A. Novotna, R. Vrzal, P. Pavek, Z. Dvorak, The role of residues T248, Y249 and T422 in the function of human pregnane X receptor. Arch Toxicol, 2013. 87(2): p. 291-301.

Působení v zahraničí 2014 Zahraniční stáž, oddělení klinické farmakologie, Univerzita Heidelberg (1 měsíc) 2012 Zahraniční stáž, Albert Einstein College of Medicine, NYC, USA (3 měsíce) Podpis datum 15. 1. 2020

C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský rpogram Jméno a příjmení David Zalabák Tituly Mgr., Ph.D Rok narození 1985 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 12/20 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. Program pp. rozsah 40 do kdy 12/20 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBC/CGI – Klonvání a genové inženýrství, přednášející, 50% KBC/PBM – Pokročilé biochemické metody, přednášející, 25%

Údaje o vzdělání na VŠ 2013: Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, Biochemie, Doktorské studium (Ph.D.) 2009: Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, Molekulární a buněčná biologie, magisterské studium (Mgr.) 2007: Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, Molekulární a buněčná biologie, bakalářské studium (Bc.)

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2010-2014 – Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, Odd. Molekulární Biologie, vědecký pracovník (4 roky, pp.) 2014-dosud – Univerzita Palackého v Olomouci, PřF, Odd. Molekulární Biologie, junior researcher (6 let, pp.)

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací 3 obhájené BcP 3 obhájené DP

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 117 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Kubalová I, Zalabák D, Mičúchová A, Ikeda Y (2019) Mutations in tetrapyrrole biosynthesis pathway uncouple nuclear

WUSCHEL expression from de novo shoot development in Arabidopsis. Plant Cell Tissue and Organ Culture, doi.org/10.1007/s11240-019-01680-w

Jaworek, P., Kopečný, D., Zalabák, D. et al. (2019) Occurrence and biosynthesis of cytokinins in poplar. Planta 250: 229. Nisler J, Kopecny D, Koncitikova R, Zatloukal M, Bazgier V, Berka K, Zalabak D, Briozzo P, Strnad M & Spichal, L

(2017) Novel thidiazuron-derived inhibitors of cytokinin oxidase/dehydrogenase. Plant Mol Biol. 92, 235-248. Kopečný D, Končitíková R, Popelka H, Briozzo P, Vigouroux A, Kopečná M, Zalabák D, Šebela M, Skopalová J, Frébort

I & Moréra S (2016) Kinetic and structural investigation of the cytokinin oxidase/dehydrogenase active site. FEBS J 283, 361-377.

Zalabák D, Johnová P, Plíhal O, Šenková K, Šamajová O, Jiskrová E, Novák O, Jackson D, Mohanty A & Galuszka P (2016) Maize cytokinin dehydrogenase isozymes are localized predominantly to the vacuoles. Plant Physiol Biochem 104, 114-124.

Působení v zahraničí 11.2012 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři prof. Irene Lichtscheidl, Core Facility of Cell Imaging and Ultrastructure Research na University of Vienna, Rakousko. 08-10.2013 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři Dr Klause von Schwartzenberga, University of Hamburg, Biocenter Klein Flottbek, Dept. of Cell Biology and Phycology, Německo. 11.2013 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři Dr. Humberto Fabio Causina na Universidad de Buenos Aires, Argentina. 09.2016 – 04.2017 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři Dr Klause von Schwartzenberga, University of Hamburg, Biocenter Klein Flottbek, Dept. of Cell Biology and Phycology, Německo. 10.2017 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři Dr Klause von Schwartzenberga, University of Hamburg, Biocenter Klein Flottbek, Dept. of Cell Biology and Phycology, Německo. 06.2019 vědecko-výzkumný pobyt v laboratoři Dr Evy Benkové, IST Austria (Klosterneuburg, Rakousko)


C-I – Personální zabezpečení Vysoká škola Univerzita Palackého v Olomouci Součást vysoké školy Přírodovědecká fakulta Název studijního programu Molekulární a buněčná biologie – navazující magisterský program Jméno a příjmení Lenka Zemánková Tituly PharmDr., Ph.D. Rok narození 1984 typ vztahu k VŠ pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Typ vztahu na součásti VŠ, která uskutečňuje st. program pp. rozsah 40 do kdy 08/22 Další současná působení jako akademický pracovník na jiných VŠ typ prac. vztahu rozsah — Předměty příslušného studijního programu a způsob zapojení do jejich výuky, příp. další zapojení do uskutečňování studijního programu KBB/MOLFA – Molekulární farmakologie, přednášející, 75%

Údaje o vzdělání na VŠ PharmDr. a Ph.D. v oboru Farmakologie a toxikologie, Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, 2014 Mgr. v oboru Farmacie, Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, 2009

Údaje o odborném působení od absolvování VŠ 2019-dosud: Odborný asistent, Katedra buněčné biologie a genetiky, PřF UP Olomouc 2012-2014: Akademický pracovník AP1 asistentka, Katedra biologických a lékařských věd, UK v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové

Zkušenosti s vedením kvalifikačních a rigorózních prací

Obor habilitačního řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ Ohlasy publikací WOS Scopus ostatní Obor jmenovacího řízení Rok udělení hodnosti Řízení konáno na VŠ 207 Přehled o nejvýznamnější publikační a další tvůrčí činnosti nebo další profesní činnosti u odborníků z praxe vztahující se k zabezpečovaným předmětům Zemankova L, Varejckova M, Dolezalova E, Fikrova P, Jezkova K, Rathouska J, Cerveny L, Botella LM, Bernabeu C,

Nemeckova I, Nachtigal P.: Atorvastatin-induced endothelial nitric oxide synthase expression in endothelial cells is mediated by endoglin. J Physiol Pharmacol. 2015 Jun;66(3):403-13. PMID: 26084222

Působení v zahraničí ODBORNÁ STÁŽ: Centro de Investigaciones Biológicas, Madrid (září 2012, 1 měsíc) : studium TGFb receptorů v endoteliálních buňkách Podpis datum 20. 1. 2020

C-II – Související tvůrčí, resp. vědecká a umělecká činnost Přehled řešených grantů a projektů u akademicky zaměřeného bakalářského studijního programu a u magisterského a doktorského studijního programu Řešitel/spoluřešitel Názvy grantů a projektů získaných pro vědeckou, výzkumnou,

uměleckou a další tvůrčí činnost v příslušné oblasti vzdělávání Zdroj Období

řešitel: prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. et Ph.D.

GA19-00236S Úloha indolových metabolitů produkovaných střevním mikrobiomem ve střevní a jaterní regulaci metabolismu xenobiotik a lipidů

B, GAČR

2019 -2021


GA20-00449S Mikrobiální katabolity tryptofanu jako modulatory střevního zdraví prostřednictvím aryl uhlovodíkového receptoru

B, GAČR

2020 -2022


GBP303/12/G163 Centrum interakcí potravních doplňků s léčivy a nutrigenetiky

B, GAČR

2012-2018

Přehled řešených projektů a dalších aktivit v rámci spolupráce s praxí u profesně zaměřeného bakalářského a magisterského studijního programu Pracoviště praxe Název či popis projektu uskutečňovaného ve spolupráci s praxí Období — Odborné aktivity vztahující se k tvůrčí, resp. vědecké a umělecké činnosti vysoké školy, která souvisí se studijním programem Organizace mezinárodního mítingu: 4th Meeting of COST Action 1407 - Deep Investigation of Virus Associated Sequences (DIVAS), 20. - 23. března 2017, Olomouc, Česká republika

Informace o spolupráci s praxí vztahující se ke studijnímu programu

Katedra úzce spolupracuje pracovišti a pracovníky vědeckých a výzkumných institucí, zejména pak Ústavu experimentální botaniky AV ČR, Biofyzikálního ústavu AV ČR, pracovišti lékařské fakuty Univerzity Palackého v Olomouc, Státním veterinárním ústavem, pracovišti výzkumných center CR. Haná a RCPTM PřF UP v Olomouci

C-III – Informační zabezpečení studijního programu Název a stručný popis studijního informačního systému Název: IS/STAG (https://stag.upol.cz/) Informační systém studijní agendy IS/STAG je součástí univerzitního informačního systému Univerzity Palackého v Olomouci. Jedná se komplexní systém pokrývající administraci studia od podání přihlášky až po vydání diplomu a vazby na další související informační systémy.

Přístup ke studijní literatuře Studijní literatura je dostupná v univerzitní knihovně v budově Zbrojnice a v knihovně přírodovědecké fakulty. Fakultní knihovna sídlí ve dvou objektech: v budově na ulici 17. listopadu 12 je umístěn fond oborů chemie, geologie, geografie, geoinformatiky, rozvojových studií, fyziky, optiky, matematiky a informatiky; pobočka na ul. Šlechtitelů 27 pokrývá především oblast botaniky, biochemie, buněčné biologie a ekologie. Studenti mají také k dispozici elektronické informační zdroje (http://ezdroje.upol.cz/).

Přehled zpřístupněných databází Přístup do elektronických časopisů a knih: http://ezdroje.upol.cz/ecasopisy/index.php?lang=cs Studenti využívají i specializované veřejné informační databáze a portály jako např. NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov), Ensembl (http://www.ensembl.org), Expasy (http://expasy.org),

Název a stručný popis používaného antiplagiátorského systému Název: Theses.cz (http://theses.cz/) Systém Theses.cz je vyvíjen a provozován Masarykovou univerzitou. Slouží vysokým školám jako národní registr závěrečných prací a umožňuje mezi uloženými pracemi vyhledávat plagiáty. Veřejnosti jsou zpřístupňovány záznamy o závěrečných pracích, příp. plné texty (podle rozhodnutí školy).

https://stag.upol.cz/

http://ezdroje.upol.cz/

http://ezdroje.upol.cz/ecasopisy/index.php?lang=cs

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

http://www.ensembl.org/

http://expasy.org/

http://theses.cz/

C-IV – Materiální zabezpečení studijního programu Místo uskutečňování studijního programu

17. listopadu 12, Olomouc tř. 17. listopadu 50, Olomouc Šlechtitelů 27, Olomouc – Holice

Kapacita výukových místností pro teoretickou výuku 17. listopadu 12, Olomouc LP 1023 24 Přírodovědecká fakulta LP 1024 24 Přírodovědecká fakulta LP 1025 24 Přírodovědecká fakulta LP 1026 24 Přírodovědecká fakulta LP 1027 24 Přírodovědecká fakulta LP 1028 24 Přírodovědecká fakulta LP 1029 30 Přírodovědecká fakulta LP 1030 30 Přírodovědecká fakulta LP 1031 24 Přírodovědecká fakulta LP 1032 32 Přírodovědecká fakulta LP 1033 32 Přírodovědecká fakulta LP 1034 32 Přírodovědecká fakulta LP 1035 32 Přírodovědecká fakulta LP 1036 32 Přírodovědecká fakulta LP 1037 32 Přírodovědecká fakulta LP 1127 32 Přírodovědecká fakulta LP 1128 24 Přírodovědecká fakulta LP 2001 156 Přírodovědecká fakulta LP 3003 72 Přírodovědecká fakulta LP 3005 72 Přírodovědecká fakulta LP 5006 48 Přírodovědecká fakulta LP 5007 96 Přírodovědecká fakulta LP 5008 48 Přírodovědecká fakulta Šlechtitelů 27, Olomouc - Holice SE E1 42 Biologické centrum SE E2 24 Biologické centrum SE PC 20 Katedra botaniky SE 501 96 Katedra botaniky SE 502 36 Katedra botaniky SE 504 24 Katedra botaniky SE 507 40 Přírodovědecká fakulta Z toho kapacita v prostorách v nájmu

__ Doba platnosti nájmu __

Kapacita a popis odborné učebny tř. 17. listopadu 50, Olomouc LS S1 15 Katedra zoologie LS S2 30 Katedra zoologie LS 125 15 Katedra zoologie Šlechtitelů 27, Olomouc - Holice SE ALL 10 Katedra botaniky SE D 14 Katedra buněčné biologie SE HER 15 Katedra botaniky SE LAB1 5 Laboratoř růstových regulátorů SE LAB3 12 Laboratoř růstových regulátorů SE MKL 15 Katedra botaniky SE VL1 12 Katedra biochemie SE 503 15 Katedra buněčné biologie SE 506 15 Katedra botaniky

SE 510 15 Katedra botaniky SE 519 12 Katedra biochemie SE 520 12 Katedra biochemie SE 621 10 Katedra ekologie a životního prostředí

Z toho kapacita v prostorách v nájmu


Kapacita a popis odborné učebny Katedra buněčné biologie a genetiky disponuje (a) dvěma výukovými laboratořemi využívanými zejména v základní výuce, a to Laboratoří molekulární biologie (SE-D) a Laboratoří buněčné biologie a cytogenetiky (SE-503); (b) specializovanými výzkumnými laboratořemi vybavenými v souladu s jejich výzkumným zaměřením. Při realizaci výuky jsou využívány i specializované laboratoře ostatních kateder garantujících výuku specializovaných předmětů. Ve společných prostorách katedry jsou umístěné hlubokomrazící boxy, výrobník ledové tříště (Icematic), lyofilizátor (PowerDry PL3000, Heto), DNA koncentrátor (Speedvac), zásobní nádoba na 200 litrů tekutého dusíku, ultracentrifuga (Beckmann); dále je k dispozici umývárna vybavená dvěma autoklávy, třemi horkovzdušnými sušárnami a výrobníkem deionizované a ultračisté vody. Studenti na základě tématu své diplomové a pod vedením školitele mohou práci řešit i na spolupracujícím pracovišti, Ústavu experimentální botaniky, AV ČR, v. v. i., pracoviště Olomouc, a dalších pracovištích Univerzity Plackého kde disponují i patřičným vybavením pracoviště v souladu s potřebami řešení práce. Laboratoř molekulární biologie (SE-D) je vybavena pro základní obecné laboratorní úkony a techniky (vážení a odměřování látek, příprava roztoků, míchání a temperování, vzorků, centrifugace), pro izolaci nukleových kyselin a proteinů, měření jejich koncentrace a čistoty a jejich analýzu; součástí laboratoře jsou tři laminární boxy (PV100, Holten), bezodtahová digestoř, termostatovaná třepačka (EB), miniautokláv, dva PCR cyklery (XP, Bioer), výkonná chlazená centrifuga (Eppendorf), minicentrifugy (Hettich); UV/VIS spektrofotometry, vortexy, horizontální elektroforézy; laboratoř je též vybavena interaktivní tabulí s PC. Z toho kapacita v prostorách v nájmu


Laboratoř molekulární biologie (SE-D) je vybavena pro základní obecné laboratorní úkony a techniky (vážení a odměřování látek, příprava roztoků, míchání a temperování, vzorků, centrifugace), pro izolaci nukleových kyselin a proteinů, měření jejich koncentrace a čistoty a jejich analýzu; součástí laboratoře jsou tři laminární boxy (PV100, Holten), bezodtahová digestoř, termostatovaná třepačka (EB), miniautokláv, dva PCR cyklery (XP, Bioer), výkonná chlazená centrifuga (Eppendorf), minicentrifugy (Hettich); UV/VIS spektrofotometry, vortexy, horizontální elektroforézy; laboratoř je též vybavena interaktivní tabulí s PC. Kapacita místnosti je 16 pracovních míst.

Z toho kapacita v prostorách v nájmu Laboratoř buněčné biologie a cytogenetiky (SE-503) je vybavení pro základní laboratorní úkony a techniky (pipetování, příprava roztoků) a mikroskopování; laboratoř je vybavena binokulárními mikroskopy (Olympus), binokulárními lupami (Olympus), fluorescenčním mikroskopem (BX-60, Olympus) včetně CCD kamery a dokumentačního zařízení, doplněným velkoformátovým LCD monitorem pro projekci pozorovaných objektů, a bezodtahovou digestoří. Součástí je i interaktivní tabule s PC. Kapacita místnosti je 16 pracovních míst.



Kapacita a popis odborné učebny Výzkumná laboratoře: Laboratoř molekulární biologie mikroorganismů je vybavena pro detekci a molekulárně genetickou charakteristiku převážně rostlinných patogenů, disponuje vybavením pro základní laboratorní úkony a techniky (vážení a odměřování látek, příprava roztoků, míchání a temperování, vzorků, centrifugace), pro izolaci nukleových kyselin a proteinů a měření jejich koncentrace a čistoty (spektrofotometr, fluorometr) a jejich následnou analýzu. Součástí vybavení laboratoře jsou dva laminární boxy (PV100, Holten), termostatovaná třepačka (EB) a termostat pro inkubaci vzorků a kultivaci bakterií, dvě chlazené centrifugy (MR22 - Jouan, Hettich), homogenizátor vzorků (FastPrep24), magnetický izolátor, ELISA reader, promývačka ELISA desek, PCR cyclery (Biorad, Biometra), qPCR cycler (RotorGene), dokumetační zařízení G:box (Syngene), dva spektrofotomery (Nanodrop1000; Beckmann), fluorometr, zařízení pro blotace, zařízení pro elektroforetickou separaci NK a proteinů v agarozových a polyakrylamidových gelech.



Kapacita a popis odborné učebny Výzkumná laboratoř Laboratoř molekulární toxikologie a farmakologie je komplexem několika místností včetně dvou laboratoří pro sterilní práci (úroveň P2) vybavených pěti laminárními boxy, třemi CO2 inkubátory, dvěma inverzními mikroskopy a dalším vybavením nutným pro kultivaci lidských buněk. K dalšímu vybavení laboratoře patří RT-PCR přístroj (Light Cycler480 II, Roche), elektroforézy pro SDS-PAGE a western bloty, vybavení pro neradioaktivní EMSA, fluorescenční mikroskop (Olympus IX-73), automat pro vyvolávání autoradiogramů, C-DiGit Chemiluminescent Western Blot Scanner (LI-COR), CCD kamera, microarray skener Innoscan 910, automatická kapilární elektroforéza založená na imunodetekční platformě pro separaci proteinů na základě jejich velikosti Sally Sue (Protein Simple), nanodrop, 4D Nucleofector system (LONZA) a automat kombinující čtečku destiček s UV/VIS spektrofotometrem, chemiluminometrem a spektrofluorometrem (TECAN). Z toho kapacita v prostorách v nájmu


Kapacita a popis odborné učebny Výzkumná laboratoř Laboratoř populační genetiky je vybavena všemi potřebnými přístroji a zařízeními pro izolace DNA, PCR a provádění agarózových i polyakrylamidových elektroforéz se zaměřením na sekvenační elektroforézy s vysokým rozlišením. Součástí laboratoře je výkonná digestoř pro práci s látkami uvolňujícími dráždivé nebo toxické prachy, páry a plyny. V laboratoři je možné vážit chemikálie a odměřovat roztoky. Součástí laboratoře je přístroj pro výrobu deionizované a ultračisté vody. Z toho kapacita v prostorách v nájmu


Vyjádření orgánu hygienické služby ze dne __

Opatření a podmínky k zajištění rovného přístupu Rovný přístup je deklarován v Řádu přijímacího řízení Univerzity Palackého v Olomouci, ve Studijním a zkušebním řádu Univerzity Palackého v Olomouci a v Etickém kodexu akademických pracovníků a vědeckých pracovníků Univerzity Palackého v Olomouci. Specializovaným pracovištěm na UP zabývajícím se podporou studentů se specifickými vzdělávacími potřebami či studentů pocházejících ze sociálně či etnicky znevýhodněného prostředí je Centrum podpory studentů se specifickými potřebami. Jedná se o celouniverzitní zařízení poskytující komplexní odborný poradenský, technický a terapeutický servis studentům se specifickými potřebami ze všech fakult Univerzity Palackého.

C-V – Finanční zabezpečení studijního programu Vzdělávací činnost vysoké školy financovaná ze státního rozpočtu

Ano

Zhodnocení předpokládaných nákladů a zdrojů na uskutečňování studijního programu __

D-I – Záměr rozvoje a další údaje ke studijnímu programu Záměr rozvoje studijního programu a jeho odůvodnění Studijní program Molekulární a buněčná biologie zahrnuje široké spektrum odborných disciplín, včetně molekulární biologie, buněčné biologie, genetiky, genomiky, biochemie, farmakologie, toxikologie, fyziologie, fytopatologie apod. V podobě, v jaké je program MBB koncipován, je autonomním oborem, poskytujícím studentům plnohodnotné vzdělávání. Rozvoj studijního programu Molekulární a buněčná biologie bude spočívat zejména v těchto oblastech (nad rámec povinně vymezené studijní náplně): (i) Přednášky odborníků z praxe – v rámci specializovaných pokročilých seminářů budou o nejnovějších poznatcích a trendech v oboru Molekulární a buněčná biologie přednášet studentům erudovaní odborníci z praxe. Předpokládá se např. firma Olympus (mikroskopické techniky), Fischer Scientific (spektrální metody), Státní veterinární ústav (histologické a mikroskopické techniky), Roche (biomedicínský výzkum), Ústav experimentální botaniky AVČR (sekvencování zemědělských plodin) a další. (ii) Přednášky zahraničních odborníků – v rámci profilujících přednášek (fokusovaných na toxikologické a genetické disciplíny) a v rámci specializovaných seminářů budou studentům přednášet přední odborníci ze zahraničí. Předpokládá se např. dr. Július Brtko (Slovenská Akademie Věd), doc. Enikoe Kallay (Medicinal University Vienna), dr. Thomas Haarmann-Stemmann (Institute of Environmental Health, Duesseldorf), prof. Sridhar Mani (Albert Einstein College of Medicine, New York) atd. (iii) Zapojení do vědecko-výzkumné činnosti – studenti jsou v průběhu studia aktivně zapojeni do řešení výzkumných projektů svých vedoucích diplomové práce; typicky projekty GAČR či vnitřní grantová agentura UP. V rámci těchto projektů mohou studenti využívat moderní a vysoce specializované přístroje a experimentální techniky na školitelském pracovišti. Takto je zajištěno pokročilé vzdělávání a příprava pro praxi na vysoké úrovni, a je rovněž předpoklad publikačních výstupů v odborných časopisech.

Počet přijímaných uchazečů ke studiu ve studijním programu počet přijatých počet zapsaných 2015/2016 26 19 2016/2017 27 19 2017/2018 31 15 2018/2019 33 24 2019/2020 30 23

Předpokládaná uplatnitelnost absolventů na trhu práce Absolvent je schopen se uplatnit jako odborný pracovník nebo vedoucí pracovník ve vědecko-výzkumných a aplikovaných institucích zabývajících se výzkumem, vývojem; analýzou a hodnocením biologických vzorků; samostatný odborný pracovník ve specializovaných laboratořích se zaměřením na buněčnou biologii, genetiku a molekulární biologii, farmakologii, toxikologii, mikrobiologii, biochemii a biotechnologie. Jeho relevantní profesní pozicí je: samostatný vědecký nebo odborný pracovník, vedoucí laboratoří a výzkumných týmů; osoba způsobilá v molekulárně-biologických laboratorních metodách.

E – Sebehodnotící zpráva v rámci žádosti o schválení studijního programu 1. Silné stránky studijního programu Navazující magisterský studijní program Molekulární a buněčná biologie je uskutečňován v souladu se standardem tohoto programu. Profily absolventů jsou v souladu s nařízením vlády č. 275/2016 Sb. Náplní předmětů teoretického a profilového základu (dva základní směry: Genetika a Toxikologie) tento navazující magisterský studijní program pokrývá odpovídající, nařízením vlády definované, tematické okruhy, odrážející profilování studia a absolventa. Struktura studia, studijního plánu studentů je cílena na získání jak teoretických znalostí, tak praktických zkušeností profilujících absolventa pro široké uplatnění v praxi, formou vědecko-výzkumné činnosti i provozní praxe. Vysokou kvalitu studia a absolventů zajišťuje úzká spolupráce se špičkovými tuzemskými pracovišti akademickými, klinickými, provozními i státní správy, např. s Ústavem experimentální botaniky AV ČR, v. v. i., Biofyzikálním ústavem AV ČR, v. v. i., Centrem regionu Haná pro zemědělský výzkum, Farmaceutickou fakultou UK v Hradci Králové, Státním Veterinárním Ústavem v Olomouci, zdravotnickým zařízením AGEL v Novém Jičíně, Fakultní nemocnicí v Olomouci apod. Rovněž úzce spolupracujeme se zahraničními špičkovými pracovišti, kde řada studentů realizovala nepovinné výzkumné stáže, např. Institute for Environmental Medicine – Düsseldorf, Německo; Barbara Ann Karmanos Cancer Center, Detroit, USA; California Institute of Technology, Pasadena, USA; John Innes Centre, Velká Británie; INRA, Francie; IUF Leibnitz Institute, Dusseldorf, Německo; IVIA, Valencia, Španělsko, University of Warwick, Warwick, Velká Británie. Za silnou stránku studia lze považovat aktivní zapojení studentů do výzkumných projektů jejich vedoucích diplomových prací. Jedná se o projekty GAČR, NAZV, AZV (dříve IGA MZd). Samostatnou kapitolou je aktivní zapojení studentů do projektů Interní grantové agentury UP, kde jsou pro studenty prioritně vyčleněny prostředky na stipendia, účast na mezinárodních vědeckých konferencích a na spotřební laboratorní materiál. Silnou stránkou NMgr programu je možnost realizovat experimentální laboratorní práci na špičkových přístrojích jak v rámci garantující Katedry buněčné biologie a genetiky, tak na spolupracujících tuzemských a zahraničních institucích (vide supra).

2. Slabé stránky studijního programu Za slabou stránku studia lze považovat konkurenční tlak daný širokou nabídkou navazujícího magisterského studia jak na samotné PřF a Univerzitě Palackého v Olomouci, tak dalšími vysokými školami v ČR. Důsledkem této situace je nízká kompetitivnost na vstupu do studia. Objektivním problémem pak je globální nestálost financování vysokých škol, což má za následek, obtížné uchopení dlouhodobé strategie vzdělávání, zejména v kontextu financování na bázi kvantity nikoliv kvality. V neposlední řadě program Molekulární a buněčná biologie spadá do oblasti vzdělávání (dříve program) Biologie a ekologie, a má tudíž nižší koeficient ekonomické náročnosti ve srovnání např. s Biochemií, jakkoliv studijní program Molekulární a buněčná biologie využívá stejně nákladné experimentální a instrumentální přístupy.

3. Personální zabezpečení studijního programu prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc., Ph.D., je přední odborník na buněčnou biologii se zaměřením na humánní detoxikační systémy, zejména pak na studium transkripčně regulačních mechanismů lidských cytochromů P450; studium vlivu xenobiotik na enzymy metabolizující léčiva u člověka; a konstrukci buněčných in vitro modelů pro toxikologické, farmakologické a environmentální aplikace. Splňuje veškerá kritéria garanta studijního programu dle nařízení vlády č. 274/2016 Sb. a Standardů UP. Garanty jednotlivých předmětů profilujícího základu jsou profesoři (5), docenti (4) a odborní asistenti (5) graduovaní či jmenovaní v různých biologických a chemických oborech jako např. Molekulární biologie a genetika, Genetika, Botanika, Biochemie, Farmakologie. Do výuky jsou zapojeni pedagogové a celosvětově uznávaní odborníci, kteří pravidelně publikují výsledky ve vědeckých časopisech s IF, případně mají dlouholetou praxi v oboru.

4. Výhled personálního zabezpečení studijního programu Tým garantů předmětů, vyučujících, školitelů (vedoucích diplomových prací) a členů komisí pro obhajoby diplomových prací a pro státní závěrečné zkoušky je relativně stabilní, v krátkodobém horizontu se nedají očekávat výrazné změny. V poslední době došlo k rozšíření týmů i o perspektivní pracovníky s dlouhodobými zahraničními zkušenostmi. Ve střednědobém horizontu se dá očekávat rozšíření týmu o nové externí i interní vedoucí diplomových prací, v souladu s personální strategií garantující katedry a smluvně spolupracujícího pracoviště ÚEB, a plynulé nahrazení starších pedagogů po jejich odchodu do důchodu novými. Klíčová role spolupracujícího ÚEB, kde působí vyučující, vedoucí diplomových prací i členové zkušebních komisí, je garantována smlouvou o spolupráci mezi ÚEB AVČR, v. v. i., a PřF UP v Olomouci.

5. Výhled vzdělávací a tvůrčí činnosti ve studijním programu Strategie rozvoje ve vzdělávací činnosti: Studenti navazujícího magisterského programu Molekulární a buněčná biologie (NMgr MBB) jsou ve většině případů absolventi bakalářského studijního programu Molekulární a buněčná biologie, tudíž jsou po teoretické odborné stránce vysoce kompetentní a kompatibilní. V rámci svých specializací v návaznosti na řešené téma diplomové práce se pak dále profilují v jednotlivých oblastech, např. molekulární genetice a genomice, buněčné biologii nebo toxikologii. V rámci strategie rozvoje vzdělávání plánujeme podporovat studenty v aktivní účasti ve vzdělávání v těchto specializovaných oblastech, např. prostřednictvím zvaných přednášek odborníků z praxe a zahraničních spolupracovníků. Strategie rozvoje tvůrčí činnosti: Nad rámec existujícího vymezení tvůrčí činnosti v NMgr MBB, budeme podporovat a stimulovat intenzivnější zapojení studentů do grantových projektů jejich vedoucích diplomových prací. Dále pak intenzivně a pro-aktivně podporujeme účast studentů v mobilitních projektech a schématech (např. Erasmus+), a jejich střednědobé (cca 3 měsíční) výjezdy na odbornou praxi na zahraniční špičkové univerzity (Německo, Velká Británie, Dánsko, Španělsko..).

V Olomouci dne 11. března 2020

Prohlášení

V případě udělení oprávnění uskutečňovat navazující magisterský studijní program Molekulární a buněčná biologie bude studijní program garantován a studijní předměty garantovány a vyučovány na odpovídající odborné úrovni po celou dobu platnosti akreditace. Pokud dojde k případnému odchodu některých pracovníků, budou nahrazeni pracovníky s kvalifikací odpovídající daným požadavkům.

doc. RNDr. Martin Kubala, Ph.D. děkan Přírodovědecké fakulty

Univerzity Palackého v Olomouci

Přírodovědecká fakulta Univerzity Palackého v Olomouci 17. listopadu 1192/12 | 771 46 Olomouc | T: 585 634 060 www.prf.upol.cz

http://www.prf.upol.cz/

Příloha: Podepsané a naskenované osobní listy (část C-I) akademických pracovníků, kteří v době předložení žádosti o schválení studijního programu nemají k Univerzitě Palackého v Olomouci žádný pracovně-právní vztah.

Documents

A-I – Základní informace o žádosti o akreditaci...A-I – Základní informace o žádosti o akreditaci Název vysoké školy: Univerzita Palackého v Olomouci Název součásti