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生物化学II
7.電子伝達と酸化的リン酸化 (18章) (2016/11/21)
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グルコースの完全酸化 C6H12O6 + O2 → 6CO2 + 6H2O 細胞内では2分割して実施する 1.解糖とクエン酸サイクルで C6H12O6 + 6H2O → 6CO2 + 24H
+ + 24e-
2.電子伝達系で 6O2 + 24H
+ + 24e- → 12H2O
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解糖とクエン酸サイクルで生じた 電子(24e-)とプロトン(24H+)は NAD+とFADを還元して10NADH、2FADH2となり ミトコンドリア内膜の電子伝達系に移動 電子伝達では 1.NADHとFADH2から電子を移動 (NAD+とFADに再酸化) 2.酵素複合体を通して O2をH2Oに還元 3.プロトンの移動による 化学勾配を用いて 酸化的リン酸化でATPを合成
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真核細胞内のエネルギー産生機関 外膜で細胞質から仕切られ、 内膜でマトリクスと膜間部に区切られる 内膜はクリステを形成し表面積を増やしている
18.1 ミトコンドリア
外膜
内膜
膜間部
マトリクス
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A.内膜 マトリクス ピルビン酸デヒドロゲナーゼ、 クエン酸サイクル酵素などを含む ミトコンドリア独自のDNA、RNA、リボソームも含む 内膜 電子伝達系複合体、F1FO-ATPアーゼなどを持つ マトリクスと膜間部のイオン拡散を制限して プロトン濃度勾配を作る
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B.ミトコンドリア膜のトランスポーター 外膜 ポリンが存在し10kDa以下の分子は自由拡散する 膜間部の代謝産物などは細胞質と同じ 内膜 O2、CO2、H2Oのみが自由に透過 ATP、ADP、ピルビン酸、リンゴ酸、アスパラギン酸、 Ca2+、Piなどはトランスポーターで通過 その他の物質移動は制限され、 内膜両側にはイオン濃度勾配が生じる
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NADH用のシャトル系 NADHのトランスポーターはない 解糖系でできたNADHは 電子のみをオキサロ酢酸を介した リンゴ酸-アスパラギン酸 シャトルで還元当量として移動 その他に グリセロリン酸シャトルもある
内膜 マトリクス 膜間部
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ATP/ADPトランスロケーター ATPをマトリクスから膜間へ ADPを膜間からマトリクスへ 交換輸送する H+濃度勾配で駆動される リン酸キャリア(Piトランスポーター) H+濃度で駆動されるシンポート
マトリクス
膜間部
ATP(4-)
ADP(3-)
内膜
H+濃度高い
コンフォメー ション変化
マトリクス
膜間部 Pi(-)
内膜
H+濃度高い
H(+)
-電荷を排出
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18.2 電子伝達 NADHをO2で酸化する場合 1/2O2 + NADH + H
+ → H2O + NAD+
NAD+ + H+ + 2e- → NADH E˚ = -0.315 V 1/2O2 + 2H
+ + 2e- →H2O E˚ = 0.815 V 1/2O2 + NADH + H
+ → H2O + NAD+ E˚ = 1.130 V
自由エネルギー変化は ΔG˚ = -218 kJ mol-1 NADH 1molあたり およそ2.5molのATPを合成する(76.3 kJ)ので 効率はおよそ35%
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電子伝達は ミトコンドリア内膜での 4複合体の反応 (複合体IIはクエン酸回路) NADHからH2Oまでの ΔE˚=1.13Vを 段階的に反応させる
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電子の移動 複合体I NADHからCoQH2 複合体II コハク酸(FADH2)からCoQH2 複合体III CoQH2からCytc(Fe2+) 複合体IV Cytc(Fe2+)からH2O
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C.複合体I(NADH-補酵素Qオキシドレダクターゼ) フラビンモノヌクレオチド (FMN)、 8〜9個の鉄硫黄クラスターを持ち 結合した補酵素Q(CoQ)を 還元しCoQH2にする
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1.NADHの電子をFMNに移動してFMNH2に還元 2.鉄硫黄クラスターに電子が移動 (Fe3+→Fe2+)還元 3.CoQに移動してCoQH2に還元 NADH + H+ + CoQ → NAD+ + CoQH2 H+を4個膜間に汲み出す
FMN→FMNH2
CoQ→CoQH2
鉄硫黄 クラスター
NADH
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B.複合体II(コハク酸-補酵素Qオキシドレダクターゼ) コハク酸デヒドロゲナーゼ(クエン酸サイクル酵素)、 FAD、鉄硫黄クラスター、シトクロムb-560を持ち、 CoQへ電子を受け渡す シトクロムはヘム(ポルフィリン誘導体)を持ち 中心のFeの酸化還元(Fe2+/Fe3+)で 電子を授受する
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1.コハク酸の電子をFADに 移動してFADH2に還元 2.鉄硫黄クラスターに移動 (Fe3+→Fe2+)還元 3.CoQに移動してCoQH2に還元 コハク酸 + CoQ → フマル酸 + CoQH2 (FADH2 + CoQ → FAD + CoQH2) 複合体IIはH+の汲み出しには関与しない 複合体I及びII由来のCoQH2は 膜内を拡散して 電子を複合体IIIに移動する
FAD→FADH2
CoQ→CoQH2
鉄硫黄 クラスター
コハク酸
Cytb
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C.複合体III (補酵素Q-シトクロムcオキシドレダクターゼ) シトクロムb、 鉄硫黄クラスター、 シトクロムc1を持ち CoQH2からシトクロムcへ 電子を受け渡す CoQH2の電子は Cyt bとCyt c1へ 二分されて流れ Qサイクルを形成する
CoQH2
Cyt c1
Cyt b
鉄硫黄 クラスター
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Qサイクル サイクル1 CoQH2(2e-キャリア)から 1e-はCyt c1へ(Fe3+→Fe2+) 1e-はCoQに戻る(CoQ-·) サイクル2 CoQH2(2e-キャリア)から 1e-はCyt c1へ(Fe3+→Fe2+) 1e-はCoQ-·に戻りCoQH2を再生 合計でCoQH2を2分子使用して Cyt c12分子を生成し CoQH21分子を再生し 4個のH+を膜間に汲み出す CoQH2 + 2Cyt c1(Fe
3+) + 2H+(マトリクス)
→ CoQ + 2Cyt c1(Fe2+) + 4H+(膜間)
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D.複合体IV(シトクロムcオキシダーゼ) シトクロムa、a3、銅原子2箇所を持ち シトクロムcの電子をO2に受け渡す
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4 Cyt c(Fe2+) + 4H+ + O2 → 4 Cyt c(Fe3+) + 2 H2O 複合体内ではFe-Cu二核錯体と近隣のTyrが酸化還元に関与 この過程でさらに4個のH+を (NADH1個あたり2個のH+) 膜間に汲み出す
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電子伝達系まとめ NADH1個から複合体I、III、IVを通過すると 複合体I NADH + H+ + CoQ → NAD+ + CoQH2 (4H+膜間へ) 複合体III CoQH2 + 2Cyt C(Fe
3+) + 2H+(マトリクス)
→ CoQ + 2Cyt C(Fe2+) + 4H+(膜間)
複合体IV 2 Cyt c(Fe2+) + 2H+ + 1/2O2 → 2 Cyt C(Fe3+) + H2O (2H+膜間へ) 合計 NADH + H+ + 1/2O2 → NAD+ + H2O(10H+膜間へ) コハク酸(FADH2)1個から複合体II、III、IVを通過すると 複合体II コハク酸 + CoQ → フマル酸 + CoQH2 合計 コハク酸 + 1/2O2 → フマル酸 + H2O(6H+膜間へ)
A.化学浸透説 電子伝達系の自由エネルギーを利用して膜間にH+に汲み出し 膜を挟んでH+濃度勾配を作成する(電気化学ポテンシャル) 電気化学ポテンシャルを利用してATPを合成する
18.3 酸化的リン酸化
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B.F1FO-ATPアーゼ(ATPシンターゼ)
F1成分とFO成分から構成されるATP合成酵素
F1成分 サブユニットα3β3γδε から構成され擬3回対称を持つ ATP合成、分解する FO成分 サブユニットab2c12(大腸菌) から構成された膜貫通ユニット H+を輸送する
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F1成分でのATPの合成 3組のαβは異なる3コンフォメーションを持つ O(オープン) リガンド親和性が弱い L(ルーズ) リガンドと緩やかに結合 T(タイト) リガンドと強く結合し、触媒活性を持つ 1)L部位に ADPと無機リン酸が結合 2)FO成分の回転由来のエネルギーが(γεを介して)入り L→T、T→Oにコンフォメーション変化 3)T部位で酵素反応してATPができ、水がとれる O部位のATPは外れる
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H+通過によるFO成分の回転 1)H+が膜間からaサブユニットに入り cサブユニットに結合 2)cサブユニットがコンフォメーション変化して aサブユニットを押して回転 3)120度分ひずみがたまると γεが回転してエネルギーを伝える 4)H+が一周するとaサブユニットから マトリクス側へH+を放出
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酸化的リン酸化によるATP合成数 1個のATP合成にはおよそ4個のH+が必要 NADH (10H+)から約2.5個ATP FADH2 (6H+)から約1.5個ATP
アセチルCoA1個でクエン酸サイクルから NADH (3分子)から約7.5個ATP FADH2 (1分子)から約1.5個ATP GTP(1分子)=1個ATP 合計 約10個ATP グルコース1個からでは 解糖 NADH (2分子)から約5個ATP、2個ATP アセチルCoA合成 (2分子) NADH (2分子)から約5個ATP クエン酸回路 約10個ATP×2=約20個ATP 合計 約32個ATP
A.ATPとNADH濃度による制御 電子伝達系はNADH→Cyt c(複合体I〜III)はほぼ平衡で シトクロムcオキシダーゼ(複合体IV)不可逆 シトクロムcオキシダーゼが制御点 Cyt C濃度で制御 = [NADH]/[NAD+]比、[ATP]/[ADP]比が関与
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18.4 酸化的代謝の制御
解糖とクエン酸サイクルの制御 ATP/ADPやNADH/NAD+比で制御 クエン酸によるPFKの制御 ミトコンドリア内の余剰なクエン酸は 細胞質に輸送されてPFKを阻害する
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B.好気代謝と嫌気代謝 嫌気代謝 C6H12O6 + 2ADP + 2Pi → 2乳酸 + 2H+ + 2H2O + 2ATP 好気代謝 C6H12O6 + 32ADP + 32Pi + 6O2→ 6CO2 + 38H2O + 32ATP 好気代謝は嫌気代謝よりも16倍効率が良い しかし、好気代謝の場合 シトクロムcオキシダーゼでのO2還元が不十分だと 活性酸素種(ROS、O2
-•など)ができ、 他の生体分子が酸化され細胞機能が障害される スーパーオキシドディスムターゼとカタラーゼで 除去する機構がある