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UNIVERSIDAD DE CARTAGENA FACULTAD DE MEDICINA DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA CARLOS MONERIZ PRETELL PhD Bioquímica y Biología Molecular Cartagena, 2012 NUCLE NUCLE Ó Ó TIDOS TIDOS

Nucleótidos 2012

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bioquimica nucleotidos

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  • UNIVERSIDAD DE CARTAGENAFACULTAD DE MEDICINA

    DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA

    CARLOS MONERIZ PRETELLPhD Bioqumica y Biologa Molecular

    Cartagena, 2012

    NUCLENUCLETIDOSTIDOS

  • Reguladores metablicosReguladores metablicos

    CoenzimasCoenzimas

    NAD, FAD, CoANAD, FAD, CoA

    Funciones

    Monmeros del ADN -ARN

    Monmeros del ADN -ARN

    Transferencia deenerga

    Transferencia deenerga

    ATP

    Ingeniera GenticaIngeniera GenticaPCR, Souther,PCR, Souther,

    ClonaciClonacinn

    Frmacos Anti-cancergenos

    Frmacos Anti-cancergenos

    55--fluorouracilofluorouracilo66--mercaptopurinamercaptopurina

    Esteres fosfato, formados por : base nitrogenada, azcar y grupo fosfato

    Base

    Azcar

    P

    ADP: Agregacin plaquetariaAdenosina: Vasodilatador

    ADPPlaquetas

  • NN N

    N

    1

    2 3 4

    56

    78

    9

    Anillodepurina

    PURINAS

    ADN

    ARN

  • ADN ARN ADN

    ARN

    PIRIMIDINAS

    N

    N 12 3 4

    56

    AnillodePirimidina

  • Estabilizar

    la

    doble

    hlice

    de

    ADN.

    Las

    purinas

    y

    pirimidinas

    son

    complementarias

    entre

    s.

    La

    adenina

    y

    la

    timina

    son

    complementarias

    (A=T),

    unindose

    gracias

    a

    dos

    puentes

    de

    hidrgeno,

    mientras

    que

    la

    guanina

    y

    la

    citosina

    (GC)

    se

    unen

    mediantetrespuentesdehidrgeno

    Cualeslaimportanciadelapresenciadelosgrupos qumicosenlaspurinasypirimidinas?

  • Los

    nucletidos,

    adems

    de

    bases

    nitrogenadas,

    contienen un

    azcar

    (ribosa

    o

    desoxirribosa)

    y

    fosfato

    (1

    a

    3).

    Porqu

    elDNAcontiene2desoxirribosayelRNAno?

    DosgruposOHcontiguossonmssusceptiblesahidrlisis.

    LaausenciadeOHenposicin2

    (DNA)lohacemsestable.

    El

    DNA

    debe

    ser

    estable,

    mientras

    que

    el

    RNA

    est

    destinado

    a

    ser destruidodespusdesuutilizacin.

    BaseBaseO

    FosfatoFosfato

    OHOH

    Ribosa 123

    4

    5

    a)Ribonucletidos

    BaseBaseO

    FosfatoFosfato

    HOH

    Desoxirribosa 123

    4

    5

    b)Desoxirribonucletidos

  • NuclesidosyNucletidos

    Adenina

    N

    N

    NH

    N

    NH2

    Adenosina

    NO

    OH

    OH

    N

    NN

    NH2

    OH

    Monofosfatodeadenosina(AMP)Adenilatoocidoadenlico

    NO

    O

    OH

    OH

    OH

    O

    P N

    NN

    NH2

    OH

    Nuclesido

    =Azcar+Base

    Nucletido

    =Azcar+Base+fosfato

    Base Nuclesido Nucletido

    NOO

    OH

    OHOH

    OP

    NH

    O

    O

    CH3

    Monofosfatodetimidina(dTMP)Timidilatoocidotimidilico

    NH

    NH

    O

    O

    CH3

    Timina

    NOOH

    OH

    NH

    O

    O

    CH3

    Timidina

  • Base Nuclesido Nucletido

    Adenina AdenosinaDesoxiadenosina

    Adenilato(AMP)Desoxiadenilato(dAMP)

    Guanina GuanosinaDesoxiguanosina

    Guanilato(GMP)Desoxiguanilato(dGMP)

    Citosina CitidinaDesoxicitidina

    CitidilatoDesoxicitidilato

    Timina TimidinaDesoxitimidina

    TimidilatoDesoxitimidilato

    Uracilo Uridina Uridilato

    Nomenclatura

  • Distribucindenucletidosenla clula

    Distribucindenucletidosenla clula

    Laformamsabundanteeselderivado5nucletido.

    ElnucletidoenmayorconcentracineselATP.

    Los

    nucletidos

    de

    desoxirribosa

    estn

    en

    concentraciones muybajas;estnsiemprerelacionadosconladivisincelular.

    Todos

    los

    nucletidos

    con

    funciones

    distintas

    a

    las

    de

    la formacindecidosnuclecossonnucletidosderibosa.

    Los

    organismos

    pueden

    sintetizar

    nucletidos

    de

    purina

    y pirimidina

    de

    novo.

    Por

    esto,

    las

    purinas

    y

    las

    pirimidinas

    no

    sonrequeridasenladieta.

    Las

    clulas

    que

    se

    dividen

    rpidamente

    necesitan

    grandes

    cantidades

    de

    RNA

    y

    DNA.

    Estas

    clulas

    tienen

    grandes requerimientosdenucletidos.

  • BiosntesisdenovodenucletidosdepurinaBiosntesisdenovodenucletidosdepurina

    Elsitiomayoritariodesntesisdepurinaseselhgado.

    Las

    purinas

    se

    sintetizan

    a

    nivel

    de

    nucletido

    a

    partir

    de compuestosdebajopesomolecular(aminocidos,azucaresy CO2

    .

    Labiosntesisserealizaapartirdelaribosafosfatada.

    El

    anillo

    de

    purina

    se

    ensambla

    sobre

    la

    ribosa

    fosfato simulandounengranajedepoleas.

    Purina

    Ribosa

    P Va de las Pentosas

    Glucosa-6P

    Ribosa-5P

  • PRPP:Metabolitocentralenlasvasdenovoyde recuperacindenucletidos

    PRPP:Metabolitocentralenlasvasdenovoyde recuperacindenucletidos

    5FosfoDribosil1pirofosfato

    (PRPP)

    es

    un derivadoactivadoderibosa5fosfato.

    PRPPsintetasaPRPPsintetasa

    Inhibidaporconcentracionesaltasdenucletidosdepurina:

    particularmenteporAMP,ADPyGMP

  • BiosntesisdenovodenucletidosdepurinaBiosntesisdenovodenucletidosdepurinaEtapas:

    FormacindePRPP

    aexpensasdela

    vadelapentosas.

    Sntesisdeinosinato(IMP)apartirde

    PRPP.

    SntesisdeAMP

    yGMP

    apartirde

    IMP.

    Etapas:

    FormacindePRPP

    aexpensasdela

    vadelapentosas.

    Sntesisdeinosinato(IMP)apartirde

    PRPP.

    SntesisdeAMP

    yGMP

    apartirde

    IMP.

    GlutaminaGlutamina

    GlutamatoGlutamato

    NH2O

    P

    OHOH

    11

    5Fosforribosilamina

    Sistemaenzimtico:1.PRPPamidotransferasa(Gln:N9)2.GARsintetasa(Gly:C4,C5yN7)3.GARtransformilasa(THF:C8)4.FGARamidotransferasa(Gln:N3)5.FGAMciclasa6.AIRcarboxilasa(CO2

    :C6)7.SAICARsintetasa(Asp:N1)8.SAICARliasa9.AICARtransformilasa(THF:C2)10.IMPsintasa

    Purina

    Ribosa

    P N

    NH

    N

    N

    9 pasos adicionales9 pasos adicionales

    PRPPamidotransferasaPRPPamidotransferasa

    La

    PRPP

    amidotransferasa

    se

    inhibeporAMP,IMP,yGMP.

    N

    NH

    N

    N

    O

    1

    23

    4

    5

    678

    9

    RibosaRibosaP IMPIMP

    GlutaminaGlutamina

    GlicinaGlicina

    Formil THFFormil THF

    BicarbonatoBicarbonato

    AspartatoAspartato

    Formil THFFormil THF

    GlutaminaGlutamina

  • SSntesisdentesisde AMPyGMPAMPyGMP

    IMP

    es

    el

    primer

    nucletido

    que

    se

    forma

    y

    es

    un

    lugar

    de

    ramificacindondesesintetizan

    los

    nucletidos

    de

    adenina

    y

    guanina.

    La

    energa

    para

    la

    reaccin

    de

    incorporacin

    de

    aspartato

    no

    provienedeATPsinodeGTP.

    La

    acumulacin

    de

    GTP

    estimula

    la

    va

    hacia

    la

    formacin

    de

    nucletidos

    de

    adenina.

    Al

    contrario,

    la

    acumulacin

    de

    ATP

    puede

    promover

    la

    sntesis

    de

    nucletidosdeguanina.

    EnzimasA1:AdenilosuccinatosintetasaA2:AdenilpsuccionatoliasaG1:IMPdeshidrogenasaG2:XMPaminasa

    EnzimasA1:AdenilosuccinatosintetasaA2:AdenilpsuccionatoliasaG1:IMPdeshidrogenasaG2:XMPaminasa

    La

    enzima

    que

    cataliza

    la

    va

    debiosntesisdeAMPseinhibe

    por

    AMP

    y

    la

    enzima

    que

    cataliza

    la

    va

    de

    biosntesis

    de

    GMPseinhibeporGMP.

    AdeninaGuanina

  • CATABOLISMO DE NUCLEOTIDOS DE PURINA

    CATABOLISMO DE NUCLEOTIDOS DE PURINA

    AMP

    N

    NH

    N

    NH

    O

    Hipoxantina

    GMP

    Adenosina Guanosina

    Nucleotidasa Nucleotidasa

    H2

    O

    Pi

    H2

    O

    Pi

    Inosina

    Adenosina

    desaminasa

    H2

    O

    NH3

    Nucleosido

    depurina

    fosforilasa

    Pi

    Ribosa1P

    Guanina

    Nucleosido

    depurina

    fosforilasa

    Pi

    Ribosa1P

    NH

    NH

    N

    NH

    O

    O

    Xantina

    Guanina

    desaminasa

    H2

    O

    NH3

    Xantina

    oxidasa

    H2

    O2O2 NH

    NH

    NH

    NH

    O

    O

    O

    cidorico

    Xantina

    oxidasa

    O2 H2

    O2

  • Vaderecuperacinosalvamento

    EndonucleasaEndonucleasaEndonucleasa

    PRPPPRPP

    Biosntesisdenovo

    Digestindecidos

    nuclecos

    Muerte

    celular

    Dieta

    HipoxantinaGuanina

    HGPRTHipoxantina

    Guanina

    fosforribosiltransferasa IMP

    GMP

    PRPPPRPP

    ACIDOURICOACIDOURICO(Purinas)(Purinas)

    UREIDOPROPIONATOUREIDOPROPIONATO(Pirimidinas)(Pirimidinas)

    fosfodiesterasafosfodiesterasafosfodiesterasa

    Las

    vas

    de

    recuperacin

    requieren

    la

    utilizacin

    depurinasypirimidinaspreformadas.

    Reutilizacindebasesnitrogenadas

    Rutadesalvamento

    Nmero de diapositiva 1Nmero de diapositiva 2Nmero de diapositiva 3Nmero de diapositiva 4Nmero de diapositiva 5Los nucletidos, adems de bases nitrogenadas, contienenun azcar (ribosa o desoxirribosa) y fosfato (1 a 3).Nmero de diapositiva 7Nmero de diapositiva 8Distribucin de nucletidos en laclulaNmero de diapositiva 10Nmero de diapositiva 11Nmero de diapositiva 12Nmero de diapositiva 13Nmero de diapositiva 14Nmero de diapositiva 15Nmero de diapositiva 16