OGNI BASE ESISTE IN DUECONFORMAZIONI TAUTOMERICHE

H

H

H

H

La tautomeria amino-imminica

I tautomeri alternativi sono causa di errori durante la sintesi del DNA

A C

Imino Amino

C A

Imino Amino

Enolo Chetone

La tautomeria cheto-enolica

T G

TG

Enolo Chetone

Strutture secondarie insolite del DNA

Strutture scivolate

Strutture cruciformi

DNA a tripla elica

Il DNA triplex si forma graziealla formazione di legami H frale coppie di basi di Hoogsteen

6

7

6

7 34

43

DNA 105 pbT= 10W= 0Lk0= 10

DNA 105 pbT= 10W=-1Lk= 9

∆Lk = Lk - Lk0= 9 - 10 = -1

La quantità disuperavvolgimenti di unDNA è detta differenzadi linking e corrispondeal ∆Lk

Lk0= Linking number di un cccDNA rilassato

Le DNA TOPOISOMERASI umane

Non ben definitaRilassamento di DNA

superavvolto sia (+) che(-). Facilita lo scioglimentodi nodi o il decatenamento

dsbIIAIIβ

Condensazione deicromosomiSegregazione deicromosomiReplicazione

Rilassamento di DNAsuperavvolto sia (+) che

(-). Facilita lo scioglimentodi nodi o il decatenamento

dsbIIAIIα

RicombinazioneRilassamento solo di DNA

superavvoltonegativamente.

ssbIAIIIβ

RicombinazioneTrascrizione dei genidell’RNA ribosomiale

Rilassamento solo di DNAsuperavvolto

negativamentessbIAIIIα

ReplicazioneTrascrizioneRicombinazione

Rilassamento di DNAsuperavvolto sia (+) che (-)ssbIBI

FunzioneRuolo strutturaleTagliosul DNATipo

DNAtopoisomeras

i umane

DNA Topoisomerase I

L’enzima taglia un filamento della doppia elica, fa passare il filamento integroattraverso il taglio e poi richiude il taglio: il n° topologico (Lk) aumenta diun’unità

= n s.a.= n – 1 s.a.

DNA Gyrase