Pengantar Biokimia

  • View
    23

  • Download
    6

Embed Size (px)

DESCRIPTION

biokimia

Transcript

  • Pengantar Biokimia

  • Tujuan Mata Kuliah:Memberikan pengetahuan dan pemahaman tentang prinsip-prinsip serta proses-proses biokimia yang berhubungan dengan struktur dan fungsi pada makhluk hidup, serta kemampuan menggunakan pemahamannya tentang substansi dan proses biokimia yang terdapat pada mahluk hidup.

  • Materi perkuliahan:Pendahuluan Susunan Kimia Sel Karbohidrat LipidProteinAsam nukleatEnzim dan koenzim

  • Materi perkuliahan:8. Metabolisme karbohidratMetabolisme lipidMetabolisme asam amino dan proteinHormonDarah

  • Segel, IH., Biochemical Calculations, New YorkMurray, RK, et.al, Biokimia Harper ed. 25, EGC JakartaHorton, H.R., et.al, Principles of Biochemistry, 3rd ed. Prentice Hall. 2002Day, RA dan Underwood AL., Analisis Kimia Kuantitatif, ed. 6. Erlangga, Jakarta, 2002Murray, RK., et.al, Harpers Illustrated Biochemistry, 26th ed. McGraw Hill, 2003Conn, EE., et.al, Outline of Biochemistry, John Wiley and Sons, 1997Greenspan, FS. And Gardner, DG., Basic and Clinical Endocrinology, 7th ed. McGraw Hill, 2004Montgomery, R., Conway, TW. And Spector, AA., Biokimia. Berorientasi pada Kasus Klinik. Ed. 5. Jilid 1. Binarupa Aksara, 1993Holme, DJ and Peck, H., Analytical Biochemistry, 2nd ed. Longman, New York, 1993Kresno, SB., Imunologi Diagnosis dan Prosedur Laboratorium, FKUI, 2001Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar A, FKUI, 2002Hardjasasmita, P., Ikhtisar Biokimia Dasar B, FKUI, 2002Achmad, H., Kimia Larutan, Citra Aditya Bakti, 2001Bodansky, M., Kimia Peptida, ITB, 1998Bellaart, AC., Ikhtisar ringkas Vitamin dan Hormon penting, Djambatan, 1983DAFTAR PUSTAKA

  • DAFTAR PUSTAKAAchmad, H dan Tupamahu, Struktur Atom, Struktur Molekul dan Sistem Periodik, Citra Aditya Bakti, 2001Koolman, J., dan Rohm, KH., Atlas Berwarna dan Teks Biokimia, Hipokrates, 2001Wirahadikusumah, M., Biokimia, metabolisme energi, karbohidrat dan lipid, ITB, 1985Toha, AHA., Biokimia, Metabolisme Biomolekul, Alfabeta, 2005Sadikin, M., Biokimia Darah, Widya Medika, 2001Wahab, AS., dan Julia, M., Sistem Imun, imunisasi dan penyakit imun, Widya Medika, 2002Jusuf, M., Gentika I, Sagung Seto, 2001Sadikin, M., Biokimia Enzim, Widya Medika, 2002Wirahadikusumah, M., biokimia protein, enzim dan asam nukleat, ITB, 2001Gropper, SS., Smith, JL. And Groff, JL., Advanced Nutrition and Human Metabolism, 4th ed, Wadsworth, 2005Linder, MC, Biokimia Nutrisi dan Metabolisme, UI-Press, 1992Schumm, DE., Intisari Biokimia, Binarupa Aksara, 1992Rastogi, SC., Biochemistry, 2nd ed, McGraw Hill, 2003Brody, T., Nutritional Biochemistry, Academic Press, 1994

  • PENILAIAN

    Kehadiran 5% (10%)UTS 35% (25%)UAS 40% (50%) TUGAS/LAP. PR.20% (15%)

  • PendahuluanPada makhluk hidup senantiasa terjadi aktivitas dan perubahan-perubahan.Proses-proses yang terjadi pada makhluk hidup berhubungan dengan reaksi-reaksi kimia dalam selProses-proses serta seluruh aktivitas dalam makhluk hiudp bisa dipelajari dari aspek biokimia

  • Definisi the science concerned with the chemical basis of life.

    The science concerned with the chemical constituentof living cells and with the reactions and process they undergo.

    Biokimia merupakan studi tentang susunan kimia sel, senyawa-senyawa yang menunjang aktivitas makhluk hidup serta energi yang diperlukan atau dihasilkan

    Jadi kajian biokimia mencakup: struktur kimia serta reaksi-reaksi kimia yang terjadi pada organisme hidup

  • Ruang lingkup kajian BiokimiaStruktur kimia komponen-komponen sel makhluk hidupHubungan antara fungsi biologi dengan struktur kimiaMetabolisme, totalitas reaksi kimia yang terjadi pada makhluk hidupProses-proses dan substansi kimia yang berhubungan dengan informasi penurunan sifat biologi

  • Sejarah Istilah biokimia diperkenalkan oleh Neuberg ahli kimia Jerman pada tahun 1903

    Para ahli biokimia harus membuktikan bahwa komponen kimia makhlukhidup dan makhluk tak hidup sangat berbeda

    Th 1500 1800 ; merupakan tahun dimana perkembangan biokimia prinsip dasar kimia seperti reaksi kinetika dan komposisi molekul

    Pada abad ke-18 ahli kimia Swedia Karl Wilhelm Scheele :analisis kimia jaringan tumbuhan dan hewan

    PadaAkhir abad 19 : 1828 Friedrich Wohler sintesis urea1897 Eduard Buchner ekstrak ragi (enzim)

    Pada abad ke-20 J.B. Sumner membuktikan enzim urease dapat dikristalkan1950 s/d 1960 : John C. Kendrew dan Max Perutz ; struktur protein1944 : Oswald Avery, Colin MacLeod, Maclyn McCarty ; DNA1953 : James D Watson dan Francis H.C. Crick struktur 3D DNA

  • Pembentukan Urea

    ONH4NCO H2N - C - NH2 amonium sianat Urea

  • Hierarki organisasi molekul dlm selselInti sel, mitokondria,kloroplasEnzim, ribosom, sistemkontraktilAsam nukleatproteinpolisakaridalipidAs aminomononukleotidamonosakaridaAs lemak, gliserolRibosa, karbamoilfosfatAs alfa ketoPiruvat, malatAsetat, malonatCO2, H2O, N2organelSupramolekulBM 106-109MakromolekulBM 103-109Building block (BM 100-350Senyawa antara (BM 50-250)Seny kimia di sktr (BM 18-44)

  • TINGKATAN ORGANISASI MAKHLUK HIDUP DAN UKURANNYA

  • STRUKTUR ATOM YANG PENTING PADA MATERI HIDUP

  • CONTOH STRUKTUR PROTEIN

  • STRUKTUR LIPID

  • Perkembangan biokimiaPerkembangan kimia tak lepas dari penemuan alat bantu berupa mikroskop elektron, yang mengungkap tabir reaksi-reaksi kimia dalam selDitunjang pula oleh genetika : penemuan konsep gen ---kromosom yang terdiri dari senyawa protein dan asam nukleatPada tahun 1953 James Watson dan Francis Crick menjelaskan struktur double helix DNASelanjutnya berkembang dengan penemuan vitamin, enzim sebagai biokatalis serta struktur kimia senyawa organik lain

  • Metode dan persiapan yang dilakukan di laboratorium biokimia

    Metode pemisahan dan pemurnian biomolekuler fraksinasi garam (salt fraksinasi)kromatografi (kertas, pertukaran ion, afinitas, lapis tipis, gas-cair, cair dg tekanan tinggi, gel filtrationelektroforesisultrasentrifugasi Metode penentuan struktur biomolekuler analisis elementalspektrofotometrisekuensing Persiapan proses biokimia hewan coba; isolasi organJaringan; sel homogenatorganel sel; isolasi gen

  • Contoh : Penyebab utama beberapa penyakit (mekanisme biokimia dlm sel atau dlm tubuh)agen fisik : trauma (mekanisme), suhu yang ekstrim, perubahan tekanan atmosfir, radiasi dan kejutan listrikagen kimia : obat, senyawa racunagen biologi : virus, bakteria, jamur, parasitkekurangan O2 : kehilangan darah, deplesi kapasitas darah mengangkut O2, keracunan pada enzim oksidatifgangguan genetik : kongenital, molekulerreaksi imunologi : anafilaksis, penyakit autoimunketidakseimbangan gizi : defisiensi, kelebihanketidakseimbangan endokrin : defisiensi hormon, kelebihan

  • Manfaat BiokimiaPenerapan biokimia dalam bidang pertanian dan kedokteranMemecahkan masalah-masalah giziPenyakit akibat kekurangan giziBerperan dalam farmakologi obat

  • beberapa kegunaan investigasi biokimia dan uji laboratorium yg berhubungan penyakit :

    manfaatContohpenyebab dan mekanisme penyakit Gangguan genetik sep cystic fibrosis pengobatan Diet rendah fenialaninutk PKU membantu diagnosis penyakit tertentu Plasma enzim kreatin kinase utk diagnosa myokard infark skrining (diagnosa dini) Pengukuran tiroksin (darah) atau TSH pada neonatal (hipotiroid congenital) membantu monitoring kemajuan suatu penyakit Plasma ALT utk melihat infeksi hati membantu menilai respon terapi suatu penyakit Pengukuran CEA/carcinoembryonic antigen darah (kanker kolon)