Riječko superračunalo BURA i STeP 2

Riječko superračunalo BURA i STeP 2

Prof. dr. sc. Pero Lučin, dr. med.

V. MEĐUNARODNI INVEST FORUM 21. listopada 2016., Opatija

Hotel Royal

Lokacija Sveučilišta u Rijeci

© 2016. University of Rijeka 2

Rijeka 1689

31. srpnja, 1633


Snažan industrijski razvoj koncem 19. stoljeća


… i nakon II svjetskog rata


Dvosmjerni transfer tehnologije

© 2016 University of Rijeka 6

XXLXL

LMS

XS

© 2016. Pero Lučin 7

Povećati broj ljudi s istraživačkom kompetencijom


UniRi Campus

UniRi Hospital

Sveučilišna bolnica


2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020

Centre for High Throughput Technologyin Biomedicine

Laboratory

for

Proteomics

Laboratory

for Systems

Biomedicine

Laboratory

for Cell

biology

Laboratory for

Organic and

Solid State

Chemistry

Laboratory

for

Bioorganic

Chemistry


Centre for Micro and Nano Sciencesand Technologies

Laboratory for

Surface and

Materials

Science

Laboratory for

Precision

Engineering and

Microsystems

Technologies

Laboratory for

Ultrafast

Optocustics &

Quantum

Optics

Laboratory for

Elemental

Microanalysis


Faculty of Civil Engeneering

Hydraulic

laboratoryTransportation

laboratory

Geotechnical

laboratoryMaterials

laboratoryStructures

laboratory


Centre for Advanced Computing and Modelling

Laboratory for

Computer and

Network

Technologies

Laboratory for

E-Science, E-

Learning and

E-Business

Laboratory for

Signal

Processing and

Communication

Technologies

Laboratory for

AI Technologies

and Modeling


Rmax: 233.565 TFlop/s

Rpeak: 287.539 TFlop/s

Peak Power (kW): 108.48

Processor: Xeon E5-2690v3 12C 2.6GHz

Sockets per Node: 2

Cores per Socket: 12

Nodes: 288

Primary Interconnect: InfiniBand FDR

440 175 48

Prof. dr. sc. Zlatan Car© 2016. University of Rijeka 14


HPC u biomedicini

Istraživanje malignih bolestiObrada podataka putem superračunala u što kraćem vremenu omogućuje bolje razumijevanje mehanizama koji stvaraju genetsku nestabilnost, a time i pojavu malignih bolesti. Efikasnija dijagnostika poradi brže analize slikovnih podataka, a time i efikasnije liječenje te njega pacijenata.Razvoj personalizirane terapije uz pomoć računalnih modela i simulacija.

Stvaranje preciznog i realističnog modela mozga je iznimno kompleksan postupak koji zahtijeva ogromne računalne resurse koji su dostupni isključivo putem superračunala za potrebe modeliranja, simulacija, vizualizacije i analize podataka.


HPC u biomedicini

RadioterapijaUporaba superračunala za optimizaciju plana liječenja uporabom dinamične adaptivne radioterapije gdje se radijacija, na osnovu brzog proračuna pacijentove geometrije tumora, usmjerava na tumor značajno smanjujući količinu radijacije na zdravo tkivo.

fMRI analiza na višejezgrenimCPU i mnogojezgrenim GPUfMRI podaci su sve više i više računalno zahtijevniji kako se povećava veličina i kvaliteta rezolucije, javna dostupnost setova podataka te metodološka poboljšanja kao što su linearna prostorna normalizacija, neparametrijski permutacijski testovi i BMCMC metode.

MikrokirurgijaStvaranje 3D slika mikrostruktura i tkiva u realnom vremenu, koje se nalaze izvan vidljivog dosega kirurga, omogućuju bolje sagledavanje trenutnog stanja čime se omogućuju trenutne reakcije, a stoga i smanjenje rizika za vrijeme operacije.


HPC u biomediciniMapiranje genomaSuperračunala omogućuju uštedu vremena korištenjem paralelnog procesiranja razlaganjem kompleksnih problema na manje zadatke koji se izvode simultano što dovodi do mogućnosti interakcije sa podacima u skoro realnom vremenu.

Ubrzanje istraživanja HIVKorištenje superačunala za izvođenje all-atom HIVsimulacije poradi utvrđivanja precizne kemijske strukture i razvoja lijekova koji ciljano djeluju na virus.

Sprječavanje potencijalne pandemijeIzvođenje velikog broja naprednih simulacija, u što kraćem vremenu, omogućuje uvid kako mutacije mogu uzrokovati promjene u kemijskoj i biološkoj strukturi i u ponašanje ključnog enzima virusa kako bi se odredilo zašto je virus otporan na postojeće antiviremike.

Prof. dr. sc. Zlatan Car

6


HPC u biomedicini

Virtualna anatomijaRačunalna obrada, korištenjem naprednih algoritama, velike količine visoko rezolucijskih 3D slika nastalih na CT, ultrazvuku i MRI skenerima, u što kraćem vremenu, omogućuje realističan 3D pogled prema pojedinom organu pacijenta poradi brže i kvalitetnije dijagnostike, za potrebe forenzike, ali i korištenja u obrazovanju studenata (3D naočale).

Napredna dijagnostikaAnaliza ogromne količine nestrukturiranih podataka (Big Data) iz velikog broja senzora od aktivnosti u realnom vremenu (nosivi uređaji), biometrijskih podataka do kartona pacijenata poradi što bržeg i kvalitetnijeg odabira liječenja


Translacijska i sistemska medicine

3.000 m2

200+ radnih mjesta5 stalno zaposlenih

STeP 1



Znanstveno-tehnološki park II STePRi2

Mlaka zapad3,42 Ha

Mlaka sjever2,01 Ha

Mlaka centarZona zahvata

8,06 HaMlaka istok1,55 Ha


Znanstveno-tehnološki park II STePRi2


STEP-2.0-MLAKA


STEP-2.0-MLAKA


STEP-2.0-MLAKA


8,06 Ha

STePRi2 2020.



STEP-2.0-MLAKA


8,06 Ha

Marine biotechnologyBiopolymersRenewable energyPharma industryAdriatic monitoring – high throuput analytsics


STEP-2.0-MLAKA


8,06 Ha


Zdravstvena industrija

Hvala na paž[email protected]


Documents

Riječko superračunalo BURA i STeP 2