61
第第第 第第第第

第十章 基因信息传递

  • Upload
    lucas

  • View
    67

  • Download
    4

Embed Size (px)

DESCRIPTION

第十章 基因信息传递. 遗传信息传递的中心法则. 转录. 翻译. 复制. DNA. RNA. 蛋白质. 逆转录. 翻译. 复制. RNA. 蛋白质. Reverse transcription. 第一节 DNA 的生物合成(复制) 第二节 RNA 的生物合成(转录) 第三节蛋白质的生物合成(翻译). 四、 DNA 损伤(突变)与修复 DNA Damage (Mutation) and Repair. (一) DNA 的损伤. 复制差错和化学和物理因素造成体内 DNA 损伤或突变或致死 - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: 第十章 基因信息传递

第十章

基因信息传递

Page 2: 第十章 基因信息传递

遗传信息传递的中心法则

DNA复制 RNA转录

蛋白质翻译

RNA

逆转录

复制 蛋白质翻译

Page 3: 第十章 基因信息传递

Reverse transcription

Page 4: 第十章 基因信息传递

第一节 第一节 DNADNA 的生物合成(复制)的生物合成(复制)

第二节 第二节 RNARNA 的生物合成(转录)的生物合成(转录)

第三节蛋白质的生物合成(翻译)第三节蛋白质的生物合成(翻译)

Page 5: 第十章 基因信息传递

四、 DNA 损伤(突变)与修复 DNA Damage (Mutation) and Repair

Page 6: 第十章 基因信息传递

• 复制差错和化学和物理因素造成体内 DNA 损伤或突变或致死

突变( mutation ):指一种遗传状态,可以通过复制而遗传的 DNA 结构的任何永久性改变。携带突变基因的生物称为突变体,未突变的称为野生型。

• 损伤原因也可以说是损伤原因也可以说是遗传信息突变的来源

(一)(一) DNADNA 的损伤的损伤

Page 7: 第十章 基因信息传递

DNADNA 复制产生误差;复制产生误差; 物理(紫外、高能射线、电离辐射)或物理(紫外、高能射线、电离辐射)或化学(烷基化试化学(烷基化试

剂、亚硝酸盐、碱基类似物)损伤;剂、亚硝酸盐、碱基类似物)损伤; 生物因素(碱基对置换、碱基的插入生物因素(碱基对置换、碱基的插入 / / 缺失造成移码)。缺失造成移码)。

1. DNA1. DNA 的损伤的原因的损伤的原因

Page 8: 第十章 基因信息传递

• DNA 分子的自发性损伤

①DNA 复制中的错误

②DNA 自发性化学变化(碱基异构的互变、碱基的脱氨基作用、脱嘌呤与脱嘧啶、碱基修饰与链断裂)

Page 9: 第十章 基因信息传递

• 物理因素引起的 DNA 损伤主要指紫外线和各种辐射,如紫外线可引起 DNA链上相邻的两个嘧啶碱基发生共价结合,生成嘧啶二聚体;

① 紫外线引起的 DNA 损伤

② 电离辐射引起的 DNA 损伤(碱基变化、脱氧核糖变化、 DNA 断裂、交联)

Page 10: 第十章 基因信息传递

嘧啶二聚体的形成与解聚

主要是同一条 DNA 链上相邻的嘧啶以共价键连成二聚体,相邻的两个 T 、或两个 C 与 T 间都可以环丁基环连成二聚体,其中最容易形成的是 TT 二聚体。

Page 11: 第十章 基因信息传递

• 化学因素引起的 DNA 损伤

① 烷化剂对 DNA 的损伤(碱基烷基化、碱基脱落、断裂、交联)

② 碱基类似物、修饰剂对 DNA 的损伤

化工原料、化工产品和副产品,各种工业的排放物、农药、食品防腐剂或添加剂,以至汽车排放的废气。

Page 12: 第十章 基因信息传递

•点突变( point mutation )•错配 (mismatch)•缺失 (deletion)•插入 (insertion)•重排 (rearrangement)

2. DNA 损伤的后果DNA 损伤最终导致 DNA 分子结构的变化,这种DNA 分子水平的突变( mutation )是整体遗传突变的基础。

Page 13: 第十章 基因信息传递

•致死性•丧失某些功能;•改变基因型而不改变表现型•发生了有利于物种生存的结果、使生物进化

后果

Page 14: 第十章 基因信息传递

镰形红细胞贫血病人 Hb (HbS) β 亚基

N-val · his · leu · thr · pro · val · glu · · · · · · C

肽链CAC GTG基因

正常成人 Hb (HbA)β 亚基

N-val · his · leu · thr · pro · glu · glu · · · · · · C

肽链CTC GAG基因

Page 15: 第十章 基因信息传递

谷 酪 蛋 丝

5’ ……G C A G U A C A U G U C ……

丙 缬 组 缬正常

5’ ……G A G U A C A U G U C ……缺失 C

缺失引起框移突变

Page 16: 第十章 基因信息传递

( 二 ) DNA 损伤的修复( DNA repairing )

• 修复是指细胞对 DNA 受损伤后的一种反应,这种反应可能使 DNA 结构恢复原样,重新执行它原来的功能。也可以说,针对已发生了的缺陷而施行的补救机制。

• 修复的主要类型:① 光修复 (light repairing)

② 切除修复 (excision repairing)

③ 重组修复 (recombination repairing)

④SOS 修复

Page 17: 第十章 基因信息传递

光修复• 紫外光照射可使相邻的两个 T 形成二聚体• 光修复酶可使二聚体解聚为单体状态, DNA 完全恢

复正常。光修复酶的激活需 300-600μm 波长的光。

N

N

CH3

O

O

R

H

P

H

R

O

O

CH3

N

N

N

N

CH3

O

O

R

H

HN

N

CH3

O

O

R

PUV

TT¹âÐÞ¸´Ã¸

Page 18: 第十章 基因信息传递

切除修复( excision repair )• 参与的酶有 核酸内切酶, polⅠ  ,DNA 连接酶

ÌØÒìºËËáÄÚÇÐø pol ¢ñ

DNAÁ¬½Óø

Page 19: 第十章 基因信息传递

E.Coli 的切除修复方式

UvrA UvrBUvrC

OH P

DNA 聚合酶ⅠOH P

DNA 连接酶 ATP

Page 20: 第十章 基因信息传递

重组修复( recombination repair )

• 又称复制后修复( postreplication repair )• 受损伤的 DNA在进行复制时,跳过损伤部位,在

子代 DNA 链与损伤相对应部位出现缺口。通过分子间重组,从完整的母链上将相应的碱基顺序片段移至子链的缺口处,然后再用合成的多核苷酸来补上母链的空缺,此过程即重复修复。并非完全校正。

Page 21: 第十章 基因信息传递

SOS 修复

• 指 DNA 受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种 DNA 修复方式,修复结果只是能维持基因组的完整性,提高细胞的生成率,但留下的错误较多,又称倾错性修复( Error-Prone Repair )。

Page 22: 第十章 基因信息传递

五、逆转录和其他复制方式Reverse Transcription and Other DNA R

eplication Ways

Page 23: 第十章 基因信息传递

逆转录酶 (reverse transcriptase)

逆转录

逆转录酶

(一)逆转录病毒和逆转录酶

逆转录

Page 24: 第十章 基因信息传递

1 )逆转录

• 在逆转录酶的作用下以 RNA 为模板合成DNA 的过程。此过程中,核酸合成与转录( DNA→RNA )过程遗传信息的流动方向相反( RNA→DNA ),故称为逆转录( reverse transcription) 。

Page 25: 第十章 基因信息传递

2 )逆转录酶• 能催化以单链 RNA 为模板合成双链 DNA 的反

应的酶称为逆转录酶( reverse transcriptase) 。• 它兼有三种酶的活性: RNA 指导的 DNA 聚合

酶, DNA 指导的 DNA 聚合酶和 RNase H 活性。• 所谓 RNase H 活性是指除去杂合分子中的 RNA 。

它可以从 5′→3′ 和 3′→5′ 两个方向水解 DNA-RNA 。

• 逆转录酶和其他 DNA 聚合酶一样,合成 DNA

的方向为 5′→3',并且不能从头合成 DNA ,也需要引物,是病毒本身的一种 tRNA 。

Page 26: 第十章 基因信息传递

(二)逆转录过程

1.以单链 RNA 的基因组为模板,在逆转录酶 (RN

A 指导的 DNA 聚合酶 ) 的催化下,合成一条单链DNA ;

2.产物与模板生成 RNA DNA∶ 杂化双链,杂化双链中的 RNA被逆转录酶 (RNase H) 水解;

3.以新合成的单链 DNA 为模板,逆转录酶 (DNA

指导的 DNA 聚合酶 )催化合成第二链的 DNA 。

Page 27: 第十章 基因信息传递

逆转录病毒细胞内的逆转录现象

RNA 模板逆转录酶

DNA-RNA 杂化双链

RNA 酶

单链 DNA逆转录酶

双链 DNA

Page 28: 第十章 基因信息传递

(三)逆转录酶和逆转录现象的生物学意义

1)逆转录酶和逆转录现象是分子生物学研究中的重大发现 ;

• RNA 同样兼有遗传信息传代与表达功能。 2 )对逆转录病毒的研究,拓宽了病毒致癌理论;3)分子生物学研究应用逆转录酶( cDNA 法 ) ,

作为获取基因工程目的基因的重要方法之一。

Page 29: 第十章 基因信息传递

第二节 第二节

RNA 的生物合成(转录)

RNA Biosynthesis, Transcription

Page 30: 第十章 基因信息传递

定义 DNA 指导下的 RNA 合成( synthesis of RN

A guided by DNA )即 DNA携带的遗传信息(基因)传递给 RNA 分子的过程称转录。或生物体以 DNA

为模板合成 RNA 的过程 。转录

RNADNA

一、转录的概念

Page 31: 第十章 基因信息传递

1 、复制和转录的共同点

DNA 模板依赖 DNA 的聚合酶碱基配对规律生成磷酸二酯键链延长方向 5'→3'

Page 32: 第十章 基因信息传递

2、复制和转录的区别

A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对

mRNA,tRNA,rRNA子代双链DNA

(半保留复制)产物

RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶酶

NTPdNTP原料

模板链转录(不对称转录)两股链均复制模板

转录复制

A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对

mRNA,tRNA,rRNA子代双链DNA

(半保留复制)产物

RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶酶

NTPdNTP原料

模板链转录(不对称转录)两股链均复制模板

转录复制

Page 33: 第十章 基因信息传递

3、转录基本特点

反应体系: DNA模板 ,NTP,酶,Mg2+,Mn2+,合成方向 5‘→3’。连接方式 -- 3‘ , 5’磷酸二酯键;转录特点:不对称转录 --DNA片段转录时,双链 DNA中只有一条链作为转录的模板,这种转录方式称作不对称转录;

原料:四种磷酸核苷 NTP,DNA 中的 T在 RNA 合成中变为 U

合成过程 : 连续

Page 34: 第十章 基因信息传递

4、参与转录的物质

原料 : NTP (ATP, UTP, GTP, CTP)

模板 : DNA

酶 : RNA 聚合酶 (RNA polymerase, RNA-pol)

其他蛋白质因子

Page 35: 第十章 基因信息传递

在生物界, RNA 合成有两种方式:一是 DNA 指导的 RNA 合成,为生物体内的主要合成方式另一种是 RNA 指导的 RNA合成,此种方式常见于病毒。

转录产生的初级转录本是 RNA前体( RNA precursor ),需经加工过程( processing )方具有生物学活性。

Page 36: 第十章 基因信息传递
Page 37: 第十章 基因信息传递

二、模板和酶Templates and Enzymes

Page 38: 第十章 基因信息传递

(一)转录模板

• 结构基因 (structural gene) :DNA 分子上能作为模板转录出 RNA 的区段。•模板链 (template strand) 有意义链或 Watson 链DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成 RNA

的一股单链。•编码链 (coding strand) 反义链或 Crick 链DNA双链中碱基序列与 RNA 一致的一股链。

沃森 (① 姓氏 ② James Dewey, 1928-, 美国生物学家 , 曾获 1962 年诺贝尔生理学 - 医学奖 )

克里克 (①姓氏 ② Francis Harry Compton, 1916-, 英国生物物理学家 , 曾获 1962 年诺贝尔生理学 - 医学奖 )

Page 39: 第十章 基因信息传递

5′···GCAGTACATGTC ···3′

3′··· c g t g a t g t a c a g ···5′

5′···GCAGUACAUGUC ···3′

N······Ala · Val · His · Val ······C

编码链模板链

mRNA

蛋白质

转录

翻译

•以编码链 ( 反义链 ) 为模板合成的 RNA ,称为反义RNA 。其序列与模板链一致,能抑制mRNA 的表达。

Page 40: 第十章 基因信息传递

5

3

3

5

模板链编码链编码链模板链

结构基因

不对称转录

• 在 DNA 分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录 。• 模板链并非永远在同一条单链上。

Page 41: 第十章 基因信息传递

( 二 ) RNA 聚合酶

定义:以 DNA 为模板,催化三磷酸核苷( NTP) 聚合形成 RNA 的酶。作用特点:1. DNA 为模板2. 不需引物,游离 NTP能与 RNA 链或另一 NTP

聚合 .3. 3'-OH 与 5'-P聚合形成磷酸二酯键。4. 方向: 5'→3'。

Page 42: 第十章 基因信息传递

( 1)原核生物的 RNA 聚合酶

36512 决定哪些基因被转录

150618 催化功能

155613 结合DNA模板

70263 辨认起始点

亚基 分子量 功 能

Page 43: 第十章 基因信息传递

全酶由 5 种亚基 α2ββ’σ 组成, σ 因子与其它部分的结合不是十分紧密,它易于与 β’βα2 分离,没有 σ 、 亚基的酶称为核心酶——只催化链的延长,对起始无作用。

五种亚基的功能分别为: α 亚基:与启动子结合功能。 β 亚基:含催化部位,起催化作用,催化形 成磷

酸二酯键。 亚基:在全酶中存在,功能不清楚。 β’ 亚基:与 DNA模板结合功能。 σ 亚基:识别起始位点。

大肠杆菌的 RNA 聚合酶

Page 44: 第十章 基因信息传递

核心酶 (core enzyme) 全酶 (holoenzyme)

•核心酶 : 转录延长 ; 全酶:转录起始。

•σ 70 是辨认典型转录起始点的蛋白质。

•σ 32 是辨认热休克蛋白 (Hsp) 转录起始点的蛋白质。

Page 45: 第十章 基因信息传递

( 2)真核生物的 RNA 聚合酶 种类 Ⅰ Ⅱ Ⅲ

对鹅膏蕈碱的反应

45S-rRNA hnRNA 5S-rRNA

tRNA

snRNA

耐受 极敏感 中度敏感

转录产物

45S-rRNA , 5S-rRNA : 核糖体 RNA 成分。 hnRNA : mRNA 的前体。 snRNA : 参与 mRNA剪切。

Page 46: 第十章 基因信息传递

两个大亚基:分子量>100 KDa,催化亚基, 与原核 β, β'亚基有同源性。50 kDa亚基:分子量 50 kDa,与原核 α亚基相似。 小亚基: 10, 7, 11个。羧基末端结构域 (CTD) : (YSPTSPS)n: Y: Tyr;S : Ser; P: Pro; T: ThrRNA-polⅡ大亚基 C末端磷酸化,使转录进入链的延长阶段。

RNA 聚合酶结构特点

Page 47: 第十章 基因信息传递

(3)模板与酶的辨认、结合

操纵子 (operon): 原核生物的一个转录单位,包括若干个结构基因及其上游 (upstream) 的调控序列

53

35

结构基因调控序列

RNA-pol

启动子 (promoter): RNA 聚合酶结合模板 DN

A 的部位。

Page 48: 第十章 基因信息传递

三、转录过程The Process of Transcription

Page 49: 第十章 基因信息传递

转录起始需解决两个问题:

①RNA 聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。

②DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。

(一)原核生物的转录过程

1. 起始位点的识别

Page 50: 第十章 基因信息传递

3’

5’

+1

转录起始点

AACTGT ATATTA

TTGACA TATAAT5’

3’

- 35 序列

Sextama 框

- 10 序列

Pribnow 框

•σ 识别正确的启动位点,启动子的结构至少由三部分组成: -35 序列提供了 RNA 聚合酶全酶识别的信号; -10序列是酶的紧密结合位点(富含 AT碱基,利于双链打开);第三部分是 RNA 合成的起始点。

Page 51: 第十章 基因信息传递

加入的第一个核苷三磷酸常是 GTP 或 ATP 。所形成的启动子、全酶和核苷三磷酸复合物称为三元起始复合物,第一个核苷三磷酸一旦掺入到转录起始点, σ 亚基就会被释放脱离核心酶。

2. 2. 转录起始转录起始

-35 -10 pppG 或 pppA

5‘

5‘

3‘

3‘模板链

E

Page 52: 第十章 基因信息传递

以 NTP 为原料和能量 ,DNA 模板链为模板,靠核心酶的催化,核苷酸间通过 3´,5´- 磷酸二酯键成核糖核酸链 (RNA)

3.链的延伸

Page 53: 第十章 基因信息传递

转录终止信号有两种情况 弱终止子:依赖ρ因子(终止因子, terminators )的终止 NusA 蛋白识别 DNA 链上的终止信号,在ρ因子帮助终止。 强终止子( 1)在终止点之前具有一段富含 G-C 的回文区域。

( 2)富含 G-C 的区域之后是一连串的 dA碱基序列,它们转录的 RNA 链的末端为一连串 U(连续 6个)。

4. 转录终止

Page 54: 第十章 基因信息传递

1. 转录因子:参与 RNA 聚合酶进行转录活动的辅助因子,为 蛋白质。

2.启动子:指 RNA 聚合酶的识别、结合和开始转录的一段DNA 。

在 RNA 转录起点的上游,约 40 bp 。—— TATA box

3. 终止子:提供转录停止信号的 DNA序列 (片段 ) 。一般含有回文顺序,转录到此会形成发夹结构。

4. 终止因子 :有的终止子要因子的帮助才能终止 RNA 合成。E. coli 的因子以六聚体形式存在,具有 DNA-RNA 解螺旋酶和 ATPase 活性。

(四 ) 转录过程

Page 55: 第十章 基因信息传递

(a)RNA 聚合酶与 DNA 模板链的结合 (b) 转录起始

(c)RNA 链的延长 (d) 转录终止

模板链合成方向

RNA 链的延长

RNA 释放 聚合酶脱离

Transcription

Page 56: 第十章 基因信息传递

1. 与原核生物 RNA 合成不同之处• 转录产物有三种: mRNA 、 tRNA 、 rRNA

对 -鹅膏蕈碱反应• RNA 聚合酶有三种: I 转录 18S 、 5.8S 、 28S rRNA 不敏感 II 转录 hnRNA (mRNA前体 ) 强烈抑制 III 转录 tRNA 、 5S rRNA 高浓度时抑制

四、真核生物 mRNA 合成

Page 57: 第十章 基因信息传递

酶类 分布 产物 活性 分子量(KDa)

反应条件

ⅡⅢ

核仁

核质核质

rRNA ( 5.8S 、18S 、 28S )

mRNA

tRNA 、 5S rRNA

50~ 70%

20~ 40%

10%

500

~ 700

~ 700

低离子强度要求Mg2+ 或Mn2+

高离子强度高Mn2+浓度

2. 真核 RNA 聚合酶

Page 58: 第十章 基因信息传递

真核 RNA 转录基本过程与原核类似,但其产生的 mRNA 为“单顺反子”,只编码一条肽链。

3. 转录

Page 59: 第十章 基因信息传递

五、转录产物的“加工”(成熟过程)五、转录产物的“加工”(成熟过程)

在细胞内,由 RNA 聚合酶合成的原初转录物( primary transcript )往往需要一系列的变化,包括链的裂解、 5 和 3末端的切除和特殊结构的形成、核苷的修饰、以及拼接和编辑等过程,才转变为成熟的 RNA 分子。此过程总称为 RNA 的成熟或称为 RNA 的转录后加工。

原核生物的 mRNA 转录后一般不需要加工,转录的同时即进行翻译(半寿期短)。

Page 60: 第十章 基因信息传递

六、 RNA 的复制合成 某些 RNA 病毒可以以自身 RNA 为模板进行复制; 不同的 RNA 病毒复制方式不同噬菌体 Qβ 的 RNA 复制两阶段

( 1 )其单链 RNA 可充当mRNA ,利用寄主中的核糖体合成外壳蛋白和 RNA 复制酶的 β 亚基。

( 2 )复制酶的 β 亚基可与来自寄主细胞的亚基 αδ 自动装配成 RNA 复制酶,可进行 RNA 的复制,以分子中单链 RNA 为模板(正链),复制出一条新的 RNA 链(负链),再复制出正链,与外壳蛋白组装成新的噬菌体颗粒。

Page 61: 第十章 基因信息传递

5 RNA-

5 3

3 RNA+

释放 释放

3 5 3 3 5

5

RNA+ RNA+

RNA-

RNA-及 RNA+的合成方向均为 5‘ 3’

( RNA 指导的 RNA 合成)