Как стареют белки у C.elegans и R.norvegicus?Д Оргунова1*, В Шиманский1*, Д Северинов1*, О Дикан1*, Т Забродская1*, И Тимофеев1*, П Синицын1

1 Летняя школа по биоинформатике 2019, Долгопрудный, Россия* Эти авторы внесли одинаковый вклад в эту статью

2

C.elegans: эксперимент

● WT - 1, 6, 12, 17 и 22 дней● DAF16 mutant - 1, 6, 12 и 17 дней● DAF2 mutant - 1, 6, 12, 17, 22 и 27 дней

3

C.elegans: Дисперсия экспрессии и возраст

4

C.elegans: Воспроизводимость результатов

Обнаружено 5607 белков.

5

C.elegans: PCA plot

6

C.elegans: aging clock and approximation

7

C.elegans: heatmap+clusterization+GOenrichment

8

R.norvegicus:

9

http://dx.doi.org/10.1016/j.cels.2015.08.012Ori et al.

R.norvegicus: PCA RNAseq vs RIBOseq

Technology component

Tissue component

- Brain RNA

- Brain RIBO

- Liver RNA

- Liver RIBO

Technology component

Tissue component

- Brain Prot

- Brain RIBO

- Liver Prot

- Liver RIBO

R.norvegicus: PCA Transctiptomic vs Proteomic

- Brain RNA

- Liver RNA

R.norvegicus: multiple scatter plot

12

Brain 24 month

0.902Brain

24m and 6m

0.0797

Brain and Liver 6m

0.871

R.norvegicus: tissue specific expression

13

Brain Liver

R.norvegicus: PCA

14Tissue component

Age component

6 month

- Brain

- Liver

24 month

6 month

24 month

R.norvegicus: age specific expression

15

24 month 6 month

Memasik suda vstav’

16