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Aislamiento de especies bacterianas productoras de antibióticos y antifúngicos a partir de muestras de suelo Elena Hidalgo Cardeñoso y Marta Pérez Rodríguez INTRODUCCIÓN En las úl(mas décadas el uso indiscriminado de an(bió(cos ha desencadenado la selección de bacterias mul(rresistentes frente a la mayoría de los an(bió(cos descubiertos hasta ahora. El alarmante aumento de bacterias resistentes contrasta con un importante declive en el descubrimiento de nuevos an(bió(cos. Esto supone un problema de salud pública que es responsable de 700.000 muertes anuales a nivel global, cifra que según la OMS podría aumentar a 10.000.000 en 2050 si siguen sin descubrirse nuevas terapias an(microbianas. De entre los 12 grupos de bacterias que la OMS ha clasificado como peligrosas por esta causa, las seis principales se agrupan en el acrónimo ESKAPE: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa y Enterobacter spp. Este trabajo ha sido realizado gracias a la par(cipación del IES Gonzalo Torrente Ballester (San Sebas(án de los Reyes) en el marco del proyecto SWI@UCM, con los estudiantes de Ciencias de 4º de ESO la supervisados por la profesora Mar Ruiz, con la colaboración de nuestras compañeras Alicia Sanz Olivié, Sandra Mar(n Muñoz, Alba Nieto Vicente, Marta Carballo de la Cal y la tutorización del Dr. Víctor Jiménez Cid en la Facultad de Farmacia UCM. PROCEDIMIENTO CARACTERIZACIÓN DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA CARACTERIZACIÓN DE LOS AISLAMIENTOS POSITIVOS MEDIANTE TINCION GRAM Y PRUEBAS BIOQUÍMICAS CONCLUSIONES VERIFICACIÓN DEL EFECTO DE ANTIBIOSIS Y ENSAYO DEL ESPECTRO E.coli Enterobacter S. aureus Saccharomyces cerevisiae En estría perpendicular la mayoría de los aislamientos confirmaron su capacidad para inhibir a Staphylococcus, así como el efecto an(fúngico observado (cuadro). Observamos que de los 12 microorganismos posi(vos, 5 tenían el mismo aspecto y comportamiento y procedían de una misma muestra original. La producción de pigmento ciánico nos hizo sospechar que se trataba de un Pseudomonas. Para salir de dudas, se realizaron una serie de ensayos para la iden(ficación. Se observó un halo de inhibición en 12 colonias, sobre todo sobre Staphylococcus, así como un aislamiento capaz de inhibir a la levadura, lo que indica que posee bioac;vidad an;fúngica. 29 alumnos recogieron asép;camente 14 muestras de suelo en diversas localizaciones Se sembraron en medio de cul;vo TSA 10 diluciones seriadas 1/10 de cada muestra, hasta 10 5 Se seleccionaron y reaislaron 1625 colonias diferentes de cada muestra Se enfrentaron a tres microorganismos tes;go: dos similares a ESKAPE (Staphylococcus epidermidis y Escherichia coli) y a la levadura Saccharomyces cerevisiae Staphylococcus epidermidis como representante de las bacterias Gram + Escherichia coli como representante de bacterias Gram – Saccharomyces cerevisae para la búsqueda de bacterias productoras de an(fúngicos Posi;vos en an;biosis Nega;vos en an;biosis Bacilo Gram – Oxidasa + Catalasa + Bacilo Gram – Oxidasa Catalasa + Bacilo Gram + Oxidasa Catalasa + Bacilo Gram – Oxidasa Catalasa + Bacilo Gram + Oxidasa Catalasa + Coco Gram + Oxidasa Catalasa + Bacilo Gram + Ramificado: Posible estreptomiceto Se u(lizó agar King para confirmar la producción de pigmentos por los aislamientos 3/3, 10/25, 7/8, 10/13 y 2/11. Tras incubación 24 h se observa la aparición de color por la presencia de piocianina (pigmento caracterís(co de Pseudomonas aeruginosa) Pseudomonas aeruginosa es uno de los ESKAPE, el de mayor incidencia en nuestros hospitales. Realizamos un an(biograma para estudiar su perfil de resistencia a an(bió(cos AM ampicilina OX oxacilina VA vancomicina TC (carcilina AN amikacina IPM imipenem CAZ Cemazidima Se han aislado unas 280 colonias de bacterias procedentes de 14 muestras dis(ntas de suelo. Doce de ellas, correspondientes a 7 bacterias diferentes mostraron fenómenos de an(biosis frente a Staphylococcus aureus, como se observó mediante inhibición del crecimiento sobre agar tanto en césped como en línea. El espectro de los posibles an(bió(cos producidos no es amplio, pues otras especies bacterianas no resultaron inhibidas por estos aislamientos. El microorganismo 7/25 inhibe el crecimiento de Saccharomyces cerevisiae. Cinco de los aislamientos obtenidos correspondían al mismo microorganismo, que iden(ficamos como Pseudomonas aeruginosa resistente a vancomicina, (carcilina y beta lactámicos y productor de una betalactamasa inducible. Constatamos que uno de los microorganismos ESKAPE con alto nivel de resistencia está presente en uno de los suelos analizados. Constatamos, además que existe un fenómeno de an(biosis entre el Pseudomonas aeruginosa aislado y Staphylococcus. El aislamiento solo es sensible a amikacina y a imipenem. Es resistente a todos los demás an(bió(cos. La deformación del halo de inhibición de la cemazidima en presencia de imipinem indica un mecanismo de resistencia: la inducción de βlactamasas. 7/6 12/3 8/23 11/9 7/25 6/1 5/9 Acinetobacter E. carotovora Pseudomonas B. sub:lis 3/3 12/13 10/23 8/23 10/25 7/6 6/1 5/9 7/6 5/9 7/8 2/11 7/25 12/13 8/23 11/9 10/23 3/3 2/11 7/8 7/25 6/11 10/25 Small World Ini(a(ve es un proyecto internacional de inves(gación y divulgación en el que se explora la diversidad bacteriana de los suelos en busca de bioac(vidades an(microbianas Sin embargo, frente a los otros ESKAPE y otros tes(gos (Erwinia carotovora como patógeno de plantas y Bacillus sub?lis como bacilo Gram +) no se observó inhibición.

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Aislamiento de especies bacterianas productoras de antibióticos y antifúngicos a

partir de muestras de suelo    

Elena Hidalgo Cardeñoso y Marta Pérez Rodríguez

INTRODUCCIÓN En   las   úl(mas   décadas   el   uso   indiscriminado   de   an(bió(cos   ha   desencadenado   la   selección   de   bacterias  mul(rresistentes   frente   a   la   mayoría   de   los   an(bió(cos   descubiertos   hasta   ahora.   El   alarmante   aumento   de  bacterias   resistentes   contrasta   con   un   importante   declive   en   el   descubrimiento   de   nuevos   an(bió(cos.   Esto  supone  un  problema  de  salud  pública  que  es  responsable  de  700.000  muertes  anuales  a  nivel  global,  cifra  que  según  la  OMS  podría  aumentar  a  10.000.000  en  2050  si  siguen  sin  descubrirse  nuevas  terapias  an(microbianas.    De  entre  los  12  grupos  de  bacterias  que  la  OMS  ha  clasificado  como  peligrosas  por  esta  causa,  las  seis  principales  se   agrupan   en   el   acrónimo   ESKAPE:   Enterococcus   faecium,   Staphylococcus   aureus,   Klebsiella   pneumoniae,  Acinetobacter  baumannii,  Pseudomonas  aeruginosa  y  Enterobacter  spp.  

Este  trabajo  ha  sido  realizado  gracias  a  la  par(cipación  del    IES  Gonzalo  Torrente   Ballester   (San   Sebas(án   de   los   Reyes)   en   el   marco   del  proyecto  SWI@UCM,  con   los  estudiantes  de  Ciencias  de  4º  de  ESO   la  supervisados   por   la   profesora   Mar   Ruiz,   con   la   colaboración   de  nuestras   compañeras   Alicia   Sanz   Olivié,   Sandra   Mar(n   Muñoz,   Alba  Nieto  Vicente,  Marta  Carballo  de  la  Cal  y  la  tutorización  del  Dr.  Víctor  Jiménez  Cid  en  la  Facultad  de  Farmacia  UCM.    

PROCEDIMIENTO

CARACTERIZACIÓN DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA                      

CARACTERIZACIÓN DE LOS AISLAMIENTOS POSITIVOS MEDIANTE TINCION GRAM Y PRUEBAS BIOQUÍMICAS

CONCLUSIONES            

VERIFICACIÓN DEL EFECTO DE ANTIBIOSIS Y ENSAYO DEL ESPECTRO

E.coli  Enterobacter  

S.  aureus   Saccharomyces  cerevisiae  

En   estría   perpendicular   la   mayoría   de   los   aislamientos   confirmaron   su   capacidad   para  inhibir  a  Staphylococcus,  así  como  el  efecto  an(fúngico  observado  (cuadro).    Observamos   que   de   los   12   microorganismos   posi(vos,   5   tenían   el   mismo   aspecto   y  comportamiento  y  procedían  de  una  misma  muestra  original.  La  producción  de  pigmento  ciánico   nos   hizo   sospechar   que   se   trataba   de   un  Pseudomonas.   Para   salir   de   dudas,   se  realizaron  una  serie  de  ensayos  para  la  iden(ficación.    

Se  observó  un  halo  de  inhibición  en  12  colonias,  sobre  todo  sobre  Staphylococcus,  así  como  un  aislamiento  capaz  de  inhibir  a  la  levadura,  lo  que  indica  que  posee  bioac;vidad  an;fúngica.    

29  alumnos  recogieron  asép;camente  14  muestras  de  suelo  

en  diversas  localizaciones  

Se  sembraron  en  medio  de  cul;vo  TSA  10  diluciones  seriadas  1/10  de  

cada  muestra,  hasta  10-­‐5  

           

Se  seleccionaron  y  reaislaron  16-­‐25  colonias  diferentes  de  cada  muestra  

                   

Se  enfrentaron  a  tres  microorganismos  tes;go:  dos  similares  a  ESKAPE  (Staphylococcus  epidermidis  y  Escherichia  coli)  y  a  la  levadura  Saccharomyces  cerevisiae                    

Staphylococcus  epidermidis  como  

representante  de  las  bacterias  Gram  +  

Escherichia  coli  como  representante  de  bacterias  Gram  –    

Saccharomyces  cerevisae  para  la  búsqueda  de  bacterias  

productoras  de  an(fúngicos  

Posi;vos  en  an;biosis   Nega;vos  en  an;biosis  

Bacilo  Gram  –  Oxidasa  +  Catalasa  +  

Bacilo  Gram  –  Oxidasa  -­‐  Catalasa  +  

Bacilo  Gram  +  Oxidasa  -­‐  Catalasa  +  

Bacilo  Gram  –  Oxidasa  -­‐  Catalasa  +  

Bacilo  Gram  +  Oxidasa  -­‐  Catalasa  +  

Coco  Gram  +  Oxidasa  -­‐  Catalasa  +  

Bacilo  Gram  +  Ramificado:  

Posible  estreptomiceto  

Se   u(lizó   agar   King   para   confirmar   la  producción   de   pigmentos   por   los  aislamientos  3/3,  10/25,  7/8,  10/13  y  2/11.  Tras   incubación   24   h   se   observa   la  aparición   de   color   por   la   presencia   de  piocianina   (pigmento   caracterís(co   de  Pseudomonas  aeruginosa)    

Pseudomonas   aeruginosa   es  uno   de   los   ESKAPE,   el   de  mayor  incidencia  en  nuestros  hospitales.   Realizamos   un  an(biograma   para   estudiar  su   perfil   de   resistencia   a  an(bió(cos  

AM  ampicilina  OX  oxacilina  VA  vancomicina  TC  (carcilina    AN  amikacina  IPM  imipenem  CAZ  Cemazidima  

Se   han   aislado   unas   280   colonias   de   bacterias   procedentes   de   14  muestras   dis(ntas   de  suelo.  Doce  de  ellas,   correspondientes  a  7  bacterias  diferentes  mostraron   fenómenos  de  an(biosis   frente   a   Staphylococcus   aureus,   como   se   observó   mediante   inhibición   del  crecimiento   sobre   agar   tanto   en   césped   como   en   línea.   El   espectro   de   los   posibles  an(bió(cos   producidos   no   es   amplio,   pues   otras   especies   bacterianas   no   resultaron  inhibidas  por  estos  aislamientos.    El  microorganismo  7/25  inhibe  el  crecimiento  de  Saccharomyces  cerevisiae.  

Cinco   de   los   aislamientos   obtenidos   correspondían   al   mismo   microorganismo,   que  iden(ficamos  como  Pseudomonas  aeruginosa  resistente  a  vancomicina,  (carcilina  y  beta-­‐lactámicos   y   productor   de   una   beta-­‐lactamasa   inducible.   Constatamos   que   uno   de   los  microorganismos  ESKAPE  con  alto  nivel  de  resistencia  está  presente  en  uno  de   los  suelos  analizados.    Constatamos,   además   que   existe   un   fenómeno   de   an(biosis   entre   el   Pseudomonas  aeruginosa  aislado  y  Staphylococcus.  

El  aislamiento  solo  es  sensible  a    amikacina  y  a  imipenem.  Es  resistente  a  todos  los  demás  an(bió(cos.    La  deformación  del  halo  de  inhibición  de  la  cemazidima  en  presencia  de  imipinem  indica  un  mecanismo  de  resistencia:  la  inducción  de  β-­‐lactamasas.    

7/6   12/3  8/23  

11/9  

7/25  6/1  5/9  

Acinetobacter  

E.  carotovora  

Pseudomonas   B.  sub:lis  

3/3   12/13  10/23  

8/23  10/25  

7/6  6/1  

5/9  7/6  5/9  

7/8  

2/11  

7/25  

12/13  

8/23  

11/9  10/23  

3/3  2/11  

7/8  

7/25  

6/11  

10/25  

Small  World  Ini(a(ve  es  un  proyecto  internacional  de  inves(gación  y  divulgación  en  el  que  se  explora  la  diversidad  bacteriana  de  los  suelos  en  busca  de  bioac(vidades  an(microbianas  

Sin  embargo,   frente  a   los  otros  ESKAPE  y  otros   tes(gos   (Erwinia  carotovora  como  patógeno   de   plantas   y   Bacillus   sub?lis   como   bacilo   Gram   +)   no   se   observó  inhibición.