La Diagnosi

Colture appropriate devono essere sempre ottenute prima di iniziare la terapia antibiotica.Per ottimizzare l'identificazione degli organismi che causano l'infezione, devono essere prelevate almeno due emocolture di cui una per via percutanea ed una prelevata attraverso ciascun catetere vascolare. E’ raccomandato il prelievo prima della terapia antibiotica e secondo quanto richiesto dalla clinica, di colture da altri siti come urina, fluido cerebrospinale, ferite, secrezioni delle vie respiratorie o altri fluidi corporei.La modifica della terapia, da empirica a mirata, è raccomandata appena si ottiene l’isolamento del microrganismo dal sangue o dalla sorgente d’infezione (urina, mat.respiratorio, liquor, ferita, mat.addominale... )

Percorso diagnostico sepsi attuale

Paziente “settico”

Esecuzione dei prelievi

Invio al laboratorio

Incubazione

Emocoltura positiva

Crescita su piastra

Identificazione ed antibiogramma

Risultato diagnostico

Colorazione di Gram

Mediamente 72-96 ore

Mediamente 48 h prima del risultato diagnostico

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

0 8 16 24 32 40 48 56 64 72Incubation time (hrs)

% P

osi

tive

sam

ple

s

BACTEC 9240

BacT/Alert

Urinocoltura e/o altri materiali positivi

Oggetto e scopo...................................................................................................................... 2 Indicatori applicabili: ................................................................................................................ 2 Responsabilità:........................................................................................................................ 2 Premessa................................................................................................................................ 2 Suggerimenti per una corretta esecuzione dell’esame ............................................................ 3 Modalità di esecuzione dell’emocoltura ................................................................................... 4 Preparazione dell’operatore e del paziente.............................................................................. 5 Tipologia di flaconi da utilizzare............................................................................................... 7 Volumi raccomandati ............................................................................................................... 7 Invio e Conservazione ............................................................................................................. 8 Protocolli di prelievo ................................................................................................................ 8 Protocollo. 1 = Pazienti Neutropenici /Oncologici ....................................................................8 Protocollo .2 = Unità Intensiva .................................................................................................8 Protocollo 3 = Pazienti Oncologici ........................................................................................... 8 Protocollo 4 = Malattie Infettive ............................................................................................... 8 Protocollo 5 = Chirurgia Trapianti ............................................................................................ 8 Protocollo 6 = Nefrologia ........................................................................................................ 8 Protocollo 7 = Nido-Neonatologia. ........................................................................................... 8 Protocollo 8 =Tab riepilogo......................................................................................................8 Principali modalità diverse dalla routine................................................................................... 8 Trasmissione dei risultati .........................................................................................................8 Interpretazione dei risultati (criteri per escludere i contaminanti) ............................................. 8

Procedura per la gestione delle emocolture dal paziente al laboratorio

Lab di Microbiologia LG01-M Rev.07

Appropriatezza

Emocolture dal 2005 al 2010: Emocolture dal 2005 al 2010: Indicatori Indicatori

N° SET % Set POS N° Pz con emo POS

% contaminanti *

2005 9117 14,6% 1003 N.R

2006 8691 13,6% 927 N.R

2007 9674 13,3% 899 N.R

2008 9162 14,4% 971 1,2%

2009 8450 14,9% 936 0,9%

2010 10 mesi

7723 15,3% 872 1,6%

* < 3% : standard di accettabilità

Osservatorio microbiologico

• prevenzione e controllo delle infezioni, in collaborazione con la Direzione Sanitaria e nell’ambito del Comitato Infezioni Ospedaliere mediante :

• realizzazione di un osservatorio microbiologico • monitoraggio della diffusione delle resistenze batteriche• segnalazione informatica dell’isolamento di microrganismi ad alta

pericolosità  (alert) ai Reparti e al Gruppo Operativo del Servizio di Prevenzione e Sorveglianza Infezioni

• tipizzazione molecolare dei batteri responsabili di infezione• elaborazione delle informazioni archiviate (risultati delle indagini

microbiologiche) per monitorare nel tempo la circolazione dei patogeni e dei pattern di antibiotico resistenza

• ricerca dei portatori o colonizzati di microrganismi di rilevanza epidemiologica

• mantenimento di ceppo-teca per ricostruire "a posteriori" eventi epidemici e tipizzazione ceppi

12,3%

45,7%7,5%

20,2%

3,4%

3,2%2,8%2,6%2,1%TOT 4605

Trend % MRSA emocolture Pz/annoTrend % MRSA emocolture Pz/anno

Numero di pazienti con infezioni invasive (sangue e liquor) di Escherichia coli e frequenza di resistenza a fluorchinoloni e cefalosporine di III gen

Regione Emilia-Romagna 2005-2008

29,731,8

34,4

38,9

11,714,6 15,4

21,7

1.5561.457

1.158

1.882

0

10

20

30

40

50

60

2005 2006 2007 2008

Prev

alen

za R

+I

(%)

0

500

1000

1500

2000

N. d

i paz

ient

i

Resistenza a fluorochinoloni Resistenza a cefalosporine III gen. N. pazienti con infez. invasive

 RER 2009ESAMI RESISTENTI INTERMEDI

N. N. % N. %

Emocolture 416 129 31,01 0 0,00

Klebsiella pneumoniae: numero di pazienti con infezioni invasive e frequenza di resistenza a fluorochinoloni e cefalosporine di III gen.

(Regione Emilia-Romagna 2005-2008)

16,4 16,0

27,729,9

26,6 25,2

30,8 31,3

424

214

294315

0

10

20

30

40

50

60

70

80

2005 2006 2007 2008

Anno

Pre

vale

nza

R+I

(%)

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

N. d

i paz

ient

i

Resistenza a fluorochinoloni Resistenza a cefalosporine III gen. N. pazienti con infez. invasive

RER 2009 ESAMI RESISTENTI INTERMEDI

N. N. % N. %

Emocolture 416 65 15,63 10 2,40

P. aeruginosa, Acinetobacter, altri GNNF, Enterobacteriaceae P. aeruginosa, Acinetobacter, altri GNNF, Enterobacteriaceae

VIM-1 a 18IMP-1 a 23

METALLO-BETA-LATTAMASI: UN PROBLEMA GLOBALE

Acinetobacter SIM-1

P. aeruginosaP. aeruginosa

SPM-1GIM-1

P. aeruginosaAIM-1

KHM-1 Citrobacter freundii

Emocolture: diagramma di flusso: punti di miglioramento

Paziente “settico”

Esecuzione dei prelievi

Invio al laboratorio

Incubazione

Emocoltura positiva

Crescita su piastra

Identificazione ed antibiogramma

Risultato diagnostico

Colorazione di Gram

Mediamente 24-48 ore

Mediamente 48 h prima del risultato diagnostico

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

0 8 16 24 32 40 48 56 64 72Incubation time (hrs)

% P

osi

tive

sam

ple

s

BACTEC 9240

BacT/Alert

Urinocoltura e/o altri materiali positivi

1 pre-analitica modalità prelievo:riduzione contaminanti

4 Postazione incubatore/lettore satellite alle urgenze del Lab Chimico-Clinico: 24

H

2 Maldi-Toff: Identificazione rapida in 15 min di batteri /miceti da emocoltura

positiva

5 Microscopia PNA-FISH

6 Ricerca DNA da sangue : casi concordati con il Clinico

3 Up-date al software per l’epidemiologia

7 Identificazione rapida delle beta-lattamasi da colonia con microarray

Innovazione nel Work-flow identificazione –

antibiogramma-epidemiologia

VITEK MSVITEK MS

Laboratory Laboratory Information Information

SystemSystem

VIGIguardVIGIguard

Risultati ID Risultati ID

Risultati ASTRisultati AST

OppureOppure

VILINKVILINK

(Assistenza (Assistenza

da remoto)da remoto)

SmartSmartCarrierCarrierSystemSystem

Lettura barcode:Lettura barcode:• CampioniCampioni• Card AST VTK2Card AST VTK2• Piastrina VTK MSPiastrina VTK MS

ID/AST Prep stationID/AST Prep station

VTK MS VTK MS PCPC

VITEK 2 VITEK 2 (V2S v 5.01)