NOROVIRUS
Dominique GENDREL
NOROVIRUS
La cause la plus fréquente des GEA
de l’adulte et de l’enfant reste trop mal connue
probablement car les infections à norovirus sont
peu hospitalisées et insuffisamment diagnostiquées
Virus classiques
Rotavirus groupe A
Norovirus
Astrovirus
Adénovirus 40/41
Sapovirus
Les autres
Aichi virus (Picornaviridae)
Entérovirus (parechovirus)
Rotavirusgroupe B groupe C
Coronavirus
Torovirus
Picobirnavirus
Les virus sont responsables de plus de 80% des gastro-entérites aiguës chez l’homme
Le principal est le NOROVIRUS
OMS 2008 Mortalité : 8 795 000 enfants < 5 ans
Lancet, Mai 201049% des morts < 5 ans surviennent
dans 5 pays, Inde, Nigeria, Zaïre, Pakistan, Chine
Diarrhées 1 336 000 morts < 5 ansdont 500 000 dues au rotavirus
et 50 000 à 100 000 dues au norovirus
OMS , données 2008 Lancet, Mai 2010
Mortalité infantile et accès aux soins
Population Nombre de décès < 5 ans
parDiarrhée
parPneumonie
parMéningite
France
Maroc
62 M
35 M
3090
23591
24
2917
50
4063
42
319
Rep DemCongo
68 M 555 000 103 000 113 000 10 500
Norovirus : appartiennent à la famille des CalicivirusVirus à ARN monocaténaire, non enveloppés, non cultivables
L’homme est le seul réservoir des norovirus humains,l’infection humaine par les calicivirus animaux semble exceptionnelle (recombinaisons possibles ?)
Famille CALICIVIRIDAEGenre NOROVIRUS
Norovirus : 5 génogroupesSeuls les génogroupes I, II et IVconcernent l’homme
Les génogroupes I et II , les plus importants,comportent 20 génotypes
C’est la commercialisation du vaccin anti-rotavirus qui a provoqué les études sur les norovirus !
1995 Essais Rotashield et nouvelles PCR norovirusPub Med 1981-1999 : 5 à 40 articles par an
2000-2014 : 79 à 410 articles par an80% des études pédiatriques sur NoV publiées depuis 2005
Les principales différencesROTAVIRUS
• Mortalité importante uniquement avant 2 ans
• Pas de culture possible• Pas de modèle animal
• Epidémiologie facile car TDR très fiable
NOROVIRUS
• Mortalité faible, morbidité importante, à tous âges mais peu d’hospitalisations
• Pas de culture possible• Pas de modèle animal
• Epidémiologie difficile car pas de TDR fiable
Epidémies de NoV aux USA(1995 : nouvelles PCR)
Apparition annuelle en Europe de nouveaux mutantsde NoV GII.4 à l’origine de 80% des épidémies
Variations fréquentes des génotypes et génogroupes de NoVdes différentes épidémies et mutations constantes des GII.4
donc pas de TDR fiables car variations des protéines de capsidereconnues en ELISA ou immunochromatographie
Sensibilité des tests rapides pour Norovirus : 40 à 60 %
Les PCR restent indispensables
Balay, Rougemont, Pothier, 2013
VP6 : groupe A (rotavirus humains)(B et C : rotavirus animaux)
Groupe A reconnu par les TDR
VP7 type G14 génotypes
VP4 type P23 génotypes
Norovirus Rotavirus
Région hypervariableriche en antigènes
(capside et ligands)
Quel est le poids réel des infections à Norovirus
Chez l’enfant et chez l’adulte ?
En mortalité et en morbidité ?Tenir compte des difficultés du diagnostic
On peut estimer que les NOROVIRUS sont cause de 20 à 30% des GEA simples avant 2 ans40 à 60% des GEA simples entre 2 et 10 ans60 à 70 % des GEA simples de l’adolescent et de l’adulte
Une épidémiologie uniquement hospitalièresous-estime les norovirus
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 180
10
20
30
40
50
rotavirusbact & viro negsalmonelles
Age (mois)
Hospitalisation pour gastroentérite aigue communautaire
St Vincent de Paul 1/1/1997-31/12/2001
18m-3ans > 3 ansne figurent pas sur le graphique :
8 Shigelles et 21 Campylobacter jejuni
936 explorés / 955 hospitalisésRotavirus : 50.9 %
combien de norovirus ?
Virus 66,7 % :
Rotavirus 240 (52,5%) Norovirus 55 (12,03%) Adénovirus 16 (3,5%) Astrovirus 7 (1,5%) Aïchivirus 4 (0,9%) Sapovirus 2 (0,4%)
Bactéries 6,8% :
Salmonelles 13 Campylobacter 13 Shigelles 4 Shig + salm 1
CoinfectionsVirus – virus 16Virus-Bactérie 6Bactérie-Bactérie 1
Eur J Clin Microb Inf Dis2011, 3 : 361-8
Norovirus à l’origine des hospitalisations
en pédiatrie pour GEA( Allemagne, Turquie , Pays-Bas,
Angleterre, Slovénie, etc …)
10 à 18%
Réduire le nombre d’hospitalisations pour diarrhée sévère :Cibler le rotavirus
90% sont de génogroupe GII (la moitié GII4)
335 enfants hospitalisés ou aux urgences hospitalières en 2011 pour GEA dans 4 centres marocains
Norovirus : 16,1% des prélèvement positifs (NoV 78% GII, 22% GI)
Enfants avec GEA à Norovirus hospitalisés à St Vincent de PaulLecarpentier, Arch Ped 2010
14 Norovirus en 2 ans
9/14 GII.4
4 diarrhées sanglantestoutes dues à GII4
Une épidémiologie uniquement hospitalièresous-estime les norovirus
PIDJ 2015
Pays-BasEnfants de < 4 ans en crèche
Agents retrouvés ROTA 11% NORO 10% ASTRO 7%Giardia 8% Cryptosporidium 3%
PIDJ 2015
Enfants < 5 ans , 27 pays de l’union Européenne
Norovirus 5,7 millions GEA53 000 hospitalisations
102 décès annuelsNiveau de revenus pour la Banque Mondiale
Groupe 1 24 pays 39 décèsGroupe 2 3 pays 63 décès Roumanie 40
Bulgarie 14Hongrie 9
Emerg Inf Dis 2013
Le poids annuel des NoVaux USA
Estimation CDCEssentiellement > 70 ans
en maison de retraite
Norovirus isoléGII.4 var 2006
4 décès
Rondy M., Koopmans M., Rotsaert C., van Loon T., Beljaars B.,van Dijk G.,Siebenga J., Svraka S., Rossen J., Teunis P., van Pelt W., Verhoef LESCAIDE (ECDC) 2009
70% des NoV retrouvéschez les enfants hospitalisés
sont des GII4
Surveillance NoVau Malawi
Enfants au MalawiNorovirus cause d’hospitalisation pour GEA : 11,4%
Mixte Rota/NoV : 1,5%
Saito et al , CID 2014
Diarrhées à NorovirusSuivi de 291 enfants < 2 ans
71 % ont eu au moins un épisode de diarrhée à NoV1 hospitalisé / 206
Génotypes des Norovirus18 génotypes différents, GI ou GII
45% des souches GII4
Bill and Melinda Gates Foundation, Lancet 2013
Pathogènes majeurs :Rotavirus, Shigella, ST-enteropathogenic E coliTypical enteropathogenic E coliCryptosporidium
Diarrhées sévères hospitaliséesenfants < 5 ans
4 centres en Afrique3 centres en Asie
Dans les pays en développement, cibler ces 5 principaux pathogènes peut réduire le nombre d’hospitalisations pour diarrhée sévère
Pays en développement : Le norovirus est rarement cause de diarrhées sévères avec hospitalisationMortalité annuelle mondiale < 5 ans : Rotavirus 500 000, Norovirus 50 000 (?)
NoV chez les immunodéprimés
Norovirus : le plus fréquent des pathogènes digestifs chez les immunodéprimésmais seulement 50% des porteurs ont une diarrhée
EXCRETION PROLONGEE 58% encore positifs au 9ème mois
JID 2010
JPGN 2009
Surveillance des Norovirus
8 des enfants avec maladie inflammatoire digestive infectés par norovirus ont eu une diarrhée sanglante
Les norovirus seraient sous-estimés parmi les causes d’aggravationdes maladies inflammatoires digestives
NOROVIRUS
Génogroupes III et Vuniquement chez l’animal
Epidémies humainesFormes sévèresGII.4 et variants
Transmission alimentaire : GI (Norwalk-virus était G1)
R Glass NEJM 2013
% de NoVParmi les Nov
% de GIParmi les Nov
% de GII
Paris1 centre, 4 ans
EJCMID 2011
12.03 % 10% 89%
Maroc4 centres, 1 an
BMC Inf Dis 2014
16.1% 21.8% 77.8%
Malawi1 centre, 10 ans
J Med Virol 2013
11.3% 17.2% 82.8%
Enfants hospitalisés pour diarrhée aigue
Les norovirus GII (épidémies) donnent des GEA plus sévèresavec hospitalisations plus fréquentes
que les GI (alimentation, GEA bénignes)
NOROVIRUS CDC
Norovirus : nombreuses épidémies de GEA d’origine alimentaire
Norovirus outbreak on Royal’s Carribean Voyager’s on the SeaNew York Times , Nov 2012
Hospitalisations for severe diarrhea in young travelers (St Vincent de Paul, Paris)
1997-2000 2002-2004Total diarrheas 706 457Returning traveler (
Norovirus : Faut-il rechercher les norovirus en routine dans les GEA ?
Non actuellement car absence de tests rapides fiables (sensibilité 60%)Les PCR restent nécessaires
Des études faites au Marocont déjà indiqué
les données épidémiologiques
16% des GEA hospitaliséeschiffre proche des pourcentages attendus
Tout examen biologique n’est qu’une aide à la clinique
Il ne donne qu’une réponse à une question
Encore faut-il que celle-ci soit posée correctement …