NOROVIRUS

Dominique GENDREL

NOROVIRUS

La cause la plus fréquente des GEA

de l’adulte et de l’enfant reste trop mal connue

probablement car les infections à norovirus sont

peu hospitalisées et insuffisamment diagnostiquées

Virus classiques

Rotavirus groupe A

Norovirus

Astrovirus

Adénovirus 40/41

Sapovirus

Les autres

Aichi virus (Picornaviridae)

Entérovirus (parechovirus)

Rotavirusgroupe B groupe C

Coronavirus

Torovirus

Picobirnavirus

Les virus sont responsables de plus de 80% des gastro-entérites aiguës chez l’homme

Le principal est le NOROVIRUS

OMS 2008 Mortalité : 8 795 000 enfants < 5 ans

Lancet, Mai 201049% des morts < 5 ans surviennent

dans 5 pays, Inde, Nigeria, Zaïre, Pakistan, Chine

Diarrhées 1 336 000 morts < 5 ansdont 500 000 dues au rotavirus

et 50 000 à 100 000 dues au norovirus

OMS , données 2008 Lancet, Mai 2010

Mortalité infantile et accès aux soins

Population Nombre de décès < 5 ans

parDiarrhée

parPneumonie

parMéningite

France

Maroc

62 M

35 M

3090

23591

24

2917

50

4063

42

319

Rep DemCongo

68 M 555 000 103 000 113 000 10 500

Norovirus : appartiennent à la famille des CalicivirusVirus à ARN monocaténaire, non enveloppés, non cultivables

L’homme est le seul réservoir des norovirus humains,l’infection humaine par les calicivirus animaux semble exceptionnelle (recombinaisons possibles ?)

Famille CALICIVIRIDAEGenre NOROVIRUS

Norovirus : 5 génogroupesSeuls les génogroupes I, II et IVconcernent l’homme

Les génogroupes I et II , les plus importants,comportent 20 génotypes

C’est la commercialisation du vaccin anti-rotavirus qui a provoqué les études sur les norovirus !

1995 Essais Rotashield et nouvelles PCR norovirusPub Med 1981-1999 : 5 à 40 articles par an

2000-2014 : 79 à 410 articles par an80% des études pédiatriques sur NoV publiées depuis 2005

Les principales différencesROTAVIRUS

• Mortalité importante uniquement avant 2 ans

• Pas de culture possible• Pas de modèle animal

• Epidémiologie facile car TDR très fiable

NOROVIRUS

• Mortalité faible, morbidité importante, à tous âges mais peu d’hospitalisations

• Pas de culture possible• Pas de modèle animal

• Epidémiologie difficile car pas de TDR fiable

Epidémies de NoV aux USA(1995 : nouvelles PCR)

Apparition annuelle en Europe de nouveaux mutantsde NoV GII.4 à l’origine de 80% des épidémies

Variations fréquentes des génotypes et génogroupes de NoVdes différentes épidémies et mutations constantes des GII.4

donc pas de TDR fiables car variations des protéines de capsidereconnues en ELISA ou immunochromatographie

Sensibilité des tests rapides pour Norovirus : 40 à 60 %

Les PCR restent indispensables

Balay, Rougemont, Pothier, 2013

VP6 : groupe A (rotavirus humains)(B et C : rotavirus animaux)

Groupe A reconnu par les TDR

VP7 type G14 génotypes

VP4 type P23 génotypes

Norovirus Rotavirus

Région hypervariableriche en antigènes

(capside et ligands)

Quel est le poids réel des infections à Norovirus

Chez l’enfant et chez l’adulte ?

En mortalité et en morbidité ?Tenir compte des difficultés du diagnostic

On peut estimer que les NOROVIRUS sont cause de 20 à 30% des GEA simples avant 2 ans40 à 60% des GEA simples entre 2 et 10 ans60 à 70 % des GEA simples de l’adolescent et de l’adulte

Une épidémiologie uniquement hospitalièresous-estime les norovirus

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 180

10

20

30

40

50

rotavirusbact & viro negsalmonelles

Age (mois)

Hospitalisation pour gastroentérite aigue communautaire

St Vincent de Paul 1/1/1997-31/12/2001

18m-3ans > 3 ansne figurent pas sur le graphique :

8 Shigelles et 21 Campylobacter jejuni

936 explorés / 955 hospitalisésRotavirus : 50.9 %

combien de norovirus ?

Virus 66,7 % :

Rotavirus 240 (52,5%) Norovirus 55 (12,03%) Adénovirus 16 (3,5%) Astrovirus 7 (1,5%) Aïchivirus 4 (0,9%) Sapovirus 2 (0,4%)

Bactéries 6,8% :

Salmonelles 13 Campylobacter 13 Shigelles 4 Shig + salm 1

CoinfectionsVirus – virus 16Virus-Bactérie 6Bactérie-Bactérie 1

Eur J Clin Microb Inf Dis2011, 3 : 361-8

Norovirus à l’origine des hospitalisations

en pédiatrie pour GEA( Allemagne, Turquie , Pays-Bas,

Angleterre, Slovénie, etc …)

10 à 18%

Réduire le nombre d’hospitalisations pour diarrhée sévère :Cibler le rotavirus

90% sont de génogroupe GII (la moitié GII4)

335 enfants hospitalisés ou aux urgences hospitalières en 2011 pour GEA dans 4 centres marocains

Norovirus : 16,1% des prélèvement positifs (NoV 78% GII, 22% GI)

Enfants avec GEA à Norovirus hospitalisés à St Vincent de PaulLecarpentier, Arch Ped 2010

14 Norovirus en 2 ans

9/14 GII.4

4 diarrhées sanglantestoutes dues à GII4

Une épidémiologie uniquement hospitalièresous-estime les norovirus

PIDJ 2015

Pays-BasEnfants de < 4 ans en crèche

Agents retrouvés ROTA 11% NORO 10% ASTRO 7%Giardia 8% Cryptosporidium 3%

PIDJ 2015

Enfants < 5 ans , 27 pays de l’union Européenne

Norovirus 5,7 millions GEA53 000 hospitalisations

102 décès annuelsNiveau de revenus pour la Banque Mondiale

Groupe 1 24 pays 39 décèsGroupe 2 3 pays 63 décès Roumanie 40

Bulgarie 14Hongrie 9

Emerg Inf Dis 2013

Le poids annuel des NoVaux USA

Estimation CDCEssentiellement > 70 ans

en maison de retraite

Norovirus isoléGII.4 var 2006

4 décès

Rondy M., Koopmans M., Rotsaert C., van Loon T., Beljaars B.,van Dijk G.,Siebenga J., Svraka S., Rossen J., Teunis P., van Pelt W., Verhoef LESCAIDE (ECDC) 2009

70% des NoV retrouvéschez les enfants hospitalisés

sont des GII4

Surveillance NoVau Malawi

Enfants au MalawiNorovirus cause d’hospitalisation pour GEA : 11,4%

Mixte Rota/NoV : 1,5%

Saito et al , CID 2014

Diarrhées à NorovirusSuivi de 291 enfants < 2 ans

71 % ont eu au moins un épisode de diarrhée à NoV1 hospitalisé / 206

Génotypes des Norovirus18 génotypes différents, GI ou GII

45% des souches GII4

Bill and Melinda Gates Foundation, Lancet 2013

Pathogènes majeurs :Rotavirus, Shigella, ST-enteropathogenic E coliTypical enteropathogenic E coliCryptosporidium

Diarrhées sévères hospitaliséesenfants < 5 ans

4 centres en Afrique3 centres en Asie

Dans les pays en développement, cibler ces 5 principaux pathogènes peut réduire le nombre d’hospitalisations pour diarrhée sévère

Pays en développement : Le norovirus est rarement cause de diarrhées sévères avec hospitalisationMortalité annuelle mondiale < 5 ans : Rotavirus 500 000, Norovirus 50 000 (?)

NoV chez les immunodéprimés

Norovirus : le plus fréquent des pathogènes digestifs chez les immunodéprimésmais seulement 50% des porteurs ont une diarrhée

EXCRETION PROLONGEE 58% encore positifs au 9ème mois

JID 2010

JPGN 2009

Surveillance des Norovirus

8 des enfants avec maladie inflammatoire digestive infectés par norovirus ont eu une diarrhée sanglante

Les norovirus seraient sous-estimés parmi les causes d’aggravationdes maladies inflammatoires digestives

NOROVIRUS

Génogroupes III et Vuniquement chez l’animal

Epidémies humainesFormes sévèresGII.4 et variants

Transmission alimentaire : GI (Norwalk-virus était G1)

R Glass NEJM 2013

% de NoVParmi les Nov

% de GIParmi les Nov

% de GII

Paris1 centre, 4 ans

EJCMID 2011

12.03 % 10% 89%

Maroc4 centres, 1 an

BMC Inf Dis 2014

16.1% 21.8% 77.8%

Malawi1 centre, 10 ans

J Med Virol 2013

11.3% 17.2% 82.8%

Enfants hospitalisés pour diarrhée aigue

Les norovirus GII (épidémies) donnent des GEA plus sévèresavec hospitalisations plus fréquentes

que les GI (alimentation, GEA bénignes)

NOROVIRUS CDC

Norovirus : nombreuses épidémies de GEA d’origine alimentaire

Norovirus outbreak on Royal’s Carribean Voyager’s on the SeaNew York Times , Nov 2012

Hospitalisations for severe diarrhea in young travelers (St Vincent de Paul, Paris)

1997-2000 2002-2004Total diarrheas 706 457Returning traveler (

Norovirus : Faut-il rechercher les norovirus en routine dans les GEA ?

Non actuellement car absence de tests rapides fiables (sensibilité 60%)Les PCR restent nécessaires

Des études faites au Marocont déjà indiqué

les données épidémiologiques

16% des GEA hospitaliséeschiffre proche des pourcentages attendus

Tout examen biologique n’est qu’une aide à la clinique

Il ne donne qu’une réponse à une question

Encore faut-il que celle-ci soit posée correctement …