GLOSARIO DE TERMINOS

COMUNMENTE USADOS EN BIOTECNOLOGIA

Editado bajo los auspicios de Sociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria,

Universidad Autonoma Metropolitana ILSI de Mexico, A.C.

ILSI

International Life SciencesI N S T I T U T E

ILSI de Mexico, A.C.

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GLOSARIO DE TERMINOSCOMUNMENTE USADOS EN

BIOTECNOLOGIA

Editado bajo los auspicios de Sociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria,

Universidad Autonoma Metropolitana ILSI de Mexico, A.C.

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International Life SciencesI N S T I T U T E

ILSI de Mexico, A.C.

© 2000 International Life Sciences Institute

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Impreso en Mexico

ISBN 1-57881-089-2

PROLOGO

La biotecnologia, sin duda la revolucion cientifica-tecnologica mas importante de fin de siglo, esta transformando no solo nuestra vision de la vida misma en el planeta, sino esta creando un debate en el que no solamente participan los cientificos. La biotecnologia es ahora un tema de los economistas, de los abogados, de los sociologos, de los legisladores, de los periodistas, del ciudadano comun. Desafortunadamente, las bases cientificas de la biotecnologia, asi como sus indudables logros y potenciales riesgos, son manejados y publicitados por los no especialistas en una forma cada vez mas inexacta y parcial. Aunque en muchos casos esto se debe a consignas especificas, un factor que ha contribuido a la desinformacion en este campo ha sido que no se ha difundido suficientemente el lenguaje tecnico basico de la biotecnologia entre los actores del debate actual. Este Glosario de terminos comunmente usados en Biotecnologia pretende contribuir a llenar, aunque sea modestamente, ese vacio de information.

Este Glosario fue construido usando las bases de datos electronicas mas importantes y con particular enfasis en los terminos mas relevantes para lo que se ha denominado la tercera generation de la biotecnologia, esto es, aquella que involucra las tecnicas de ADN recombinante. Sin embargo, no debemos olvidar que la biotecnologia ha sido una aliada del hombre desde tiempos inmemoriales y que todos nos hemos beneficiado, de una u otra forma, de los numerosos productos biotecnologicos que estan en el mercado, incluso mucho antes de que la palabra “transgenico” llamara nuestra atencion.

La Sociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria A.C., con la generosa colaboracion de ILSI de Mexico A.C., se complace en presentar esta obra, esperando contribuir a que los no biotecnologos interesados en la biotecnologia, tengan un marco de referenda comun, al menos en lo que se refiere a sus terminos tecnicos.

Enrique Galindo Fentanes PresidenteSociedad Mexicana de Biotecnologia y Bioingenieria, A.C.

GLOSARIO DE TERMINOS COMUNMENTE USADOS ENBIOTECNOLOGIA

Introduction

La Biotecnologia se define como el conjunto de procedimientos, sustentados en la ciencia y la tecnologla, que permiten producir en forma rapida y eficiente una gran cantidad de bienes y servicios, mediante el uso de la materia viva y sus derivados inmediatos. Por ejemplo: la produccion de catalizadores biologicos o enzimas, de antibioticos, de vitaminas, de aminoacidos, de semillas mejoradas portecnicas de biologia molecular, entre otros.

La Biotecnologla tradicional, o de Primera Generacion, habia estado circunscrita al campo de las fermentaciones y de los productos agropecuarios tradicionales hasta que, a principios del siglo XX, la Primera Guerra Mundial forzo a los cientlficos e ingenieros de Alemania y Gran Bretana a producir nuevas materias primas, usando procedimientos mejorados de la fermentacion industrial. Por ejemplo: la produccion de glicerina por la segunda fermentacion de Neuberg de los azucares, la produccion industrial de levaduras para alimentar a los polios y los cerdos y la fermentacion aceto-butilica para producir acetona. Durante esta primera etapa se utilizaron tecnicas tradicionales de la fermentacion, mejoradas por la ingenierla quimica, pero no se desarrollaron cultivos asepticos a partir de cepas seleccionadas de microorganismos. Durante la Segunda Guerra Mundial, se desarrollaron las fermentaciones especializadas a partir de organismos mejorados por selection genetica aleatoria, sin manipulation directa del acido desoxirribonucleico (ADN) y esta epoca corresponde a la produccion industrial de los antibioticos, los aminoacidos y las hormonas esteroidales. A este tipo se la ha dado en llamar Biotecnologia de Segunda Generacion. Pero a fines del siglo XX, fue posible manipular en forma reproducible y muy bien dirigida, la herencia codificada en el ADN, merced a los avances de la biologia molecular y esto permitio expresar genes de muy diverso origen en organismos de uso industrial. El primer ejemplo demostrativo fue la expresion de la proteina de un sapo (Xenopus levis) en una bacteria (Escherichia coli), gracias al uso de las llamadas enzimas de restriction que permiten construir estructuras llamadas plasmidos, que pueden servir para insertar material genetico extraho en las celulas de gran variedad de organismos vivos. Esta ultima se denomino Biotecnologia Contemporanea o de Tercera Generacion.

La Biotecnologia actual ha permitido el desarrollo de numerosas patentes que han sido registradas en muchos palses, usando el lenguaje tecnico de la Biologia Molecular, que es la el estudio de los procesos biologicos, explicados por los cambios en los acidos nuclelcos y en las protelnas producidas a partir del codigo genetico. Este lenguaje se ha desarrollado en forma acelerada, a partir de la sexta decada del siglo XX, de modo que hay muchos neologismos utilizados en el lenguaje utilizado para reinvindicar patentes y marcas de uso comercial. Por tal razon, la Sociedad Mexicana Biotecnologia y Bioingenierla,

A.C (SMByB) propuso al capitulo mexicano del International Life Science Institute (ILSI de Mexico A.C.) que se construyera un glosario de los terminos de mayor uso en las patentes de circulacion internacional. Este glosario fue construido en la Universidad Autonoma Metropolitana, Iztapalapa, merced a un donativo de ILSI de Mexico, a la gestion y supervision de la SMByB y al trabajo del Maestro en Biotecnologia, Sergio de Jesus Romero Gomez, bajo la direccion del Dr. Gustavo Viniegra Gonzalez y el Maestro en Ciencias, Mariano Garcia Garibay.

Metodologia

Para construir dicho glosario se siguio la siguiente metodologia

a) Selection previa de terminos (200) por su presencia frecuente en libros de texto de Biologia Molecular (Molecular Biology of the Cell, Albertis; Maniatis) en bases bibliograficas de datos (www.CSA.com, www.kfinder.com) y un libro multimedia de Biologia Molecular (Molecular Biology Textbook).

b) Se hicieron histogramas de frecuencia de citas de cada uno de esos terminos en la bases de datos de patentes de la Comunidad Economica Europea (www.european-patent-office.org) y la de Estados Unidos de America (www.uspto.gov/patft/index.html) y con ellos se seleccionaron los 136 terminos en idioma ingles que fueron encontrados en un mayor numero de patentes diferentes.

c) Se construyo una base de datos en el programa Excel y con ella se construyeron dos indices, uno en ingles y otro en espanol, usando los libros de texto anteriormente citados, ademas se utilizaron: Bioquimica Voet y Voet; Bioquimica Leningher y Current protocols in Molecular Biology y Molecular Biology de Maniatis.

d) Se editaron los dos glosarios (ingles y espanol) con sendos indices alfabeticos

Indice Alfabetico

1. Activador2. AMP ciclico3. Amplificacion4. Anticodon5. Antisentido6. Apareamiento7. ATP8. Auxotrofo9. Bacteriofago10. Banco de secuencias11. Biblioteca genomica12.Biologia molecular13. Blotting14.Caja TATA15. Cap16.Cebador17.Cepa18. Cion19.Clonacion por expresion20.Clonacion21.Codigo genetico22. Codon23. Complementacion24.Composicion de bases25.Conjugacion26. Control genetico27.Cosmido28.Cromosoma29.Degeneracion30.Delecion31. Desnaturalizacion32. Diferenciacion33. Diploide34. DNA complementario35. DNA genomico36.DNA polimerasa37. DNA38. Dominante39. Dominio40. Downstream41.Enzima42. Edition de RNA (splicing)43.Electroforesis44. Electroporation45. Enzima de restriccion

46. Escherichia coli47. Exon48. Expresion genetica49. Factor de elongacion50. Factor de iniciacion51. Factor de transcripcion52. Fenotipo53. Footprinting54. Fosforilacion55.Fragmentos de restriccion56. Frame Shift57. Gen estructural58. Gen regulador59. Gene60.Genotipo61.GTP62.Haploide63. Heterologo64.Hibridacion in situ65.Hibridacion66. Homologo67. Inactivador 68.lnduccion 69.lngenieria genetica70. Integracion 71.lntron72. Isoformas73. Knock Out (interrupcion)74. Levadura75.Ligasa76. Locus77.Maduracion78.Mapa de restriccion79.Mapa genetico80. Molde81.Mutacion82.Mutante83. Northern blotting84. Nucleosido85.Nucleotido 86.0ligomero 87.0perador 88.0peron89. ORF90. PCR

91. Pirimidina92. Plasmido93. PoliA94. Procesamiento de RNA95. Promotor96. Proteina97. Purina98. Recesivo99. Region codificadora100. Regulacion CIS101. Regulacion TRANS102. Replicacion103. Replicon104. Resistencia105. Respuesta a choque termico106. Reticulo endoplasmico107. Retrovirus108. Revertante109. Ribonucleasas110. RNA polimerasa111. RNA ribosomal112. RNA113. RNA mensajero

114. Secrecion115. Secuencia palindromica116. Secuencia silenciadora117. Secuencia118. Sitio Activo119. Sitio de restriccion120. Sonda121. Southern blotting122. Sustitucion123. Traduccion124. Transcripcion125. Transduccion126. Transfeccion127. Transformacion128. Transformante129. Transgenico130. Trifosfato131. Upstream132. UV133. Vector de clonacion134. Virus135. Western Blotting136. YAC's

Debido a que muchas de estas tecnicas han sido desarrolladas o reportadas en idioma ingles, algunos terminos resultan intraducibles o simplemente son mas conocidos por su nombre original, estos terminos se escriben en el texto en italicas, en algunos casos se sugiere una posible traduccion.

1. Activador: Mensajero o segundo mensajero que promueve la expresion de un gen bajo ciertas condiciones.

2. AMP ciclico: Molecula que en algunos microorganismos es un segundo mensajero. Se produce en respuesta a la estimulacion de ciertos receptores. El AMP ciclico activa algunas cinasas las cuales a su vez fosforilan a su molecula bianco, produciendo la respuesta necesaria.

3. Amplificacion: Proceso por el cual fragmentos de DNA pueden ser multiplicados. Los procesos normales involucran tecnicas como PCR o clonacion en organismos de reproduccion rapida.

4. Anticodon: Secuencia de tres nucleotidos presentes en un RNA de transferencia, que son complementarios a un codon de un RNA mensajero. Durante la sintesis de proteinas, las bases de un codon y un anticodon, se aparean alineando el RNA de transferencia que acarrea el aminoacido correspondiente, el cual se une a la cadena polipeptidica codificada por el RNA mensajero.

5. Antisentido (antisense): Secuencia de DNA que codifica un RNA mensajero, este RNA se aparea con un RNA mensajero funcional impidiendo su expresion.

6. Apareamiento: Union de un DNAc o RNA-DNA de acuerdo con las reglas de Watson y Crick, se une una adenina a una timina y una citosina a una guanina.

7. ATP (adenosin 5 '-trifosfato): Nucleotido que contiene dos enlaces fosfoanhidros de alta energia cuando se hidrolizan o transfieren, se libera una gran cantidad de energia de aproximadamente 7 Kcalorias por mol, esta es la molecula mas importante en la captura y transferencia de energia libre en todas las celulas.

8. Auxotrofo: Celula o microorganismo que requiere un nutriente o metabolito especifico para crecer, que no es requerido por el tipo silvestre; comunmente una cepa de microorganismos mutantes que no puede sintetizar un metabolito esencial que puede localizarse por su incapacidad para crecer en medio minimo.

9. Bacteriofago: Virus que infectan celulas bacterianas. Algunos bacteriofagos son muy usados como vectores de clonacion.

10. Banco de secuencias: Base de datos que contiene una o mas secuencias de DNA, RNA o proteinas. Varios de estos bancos son publicos y pueden ser consultados en Internet.

11. Biblioteca genomica: Coleccion de DNA clonado en fragmentos de una genoma total (biblioteca genomica) o de copias de DNA de todos los RNA m producidos por una celula (biblioteca de DNA complementario) insertados en un vector adecuado.

12. Biologia molecular: Conjunto de tecnicas que permiten el estudio de moleculas de nucleotidos, asi, como la modificacion de la expresion de proteinas y metabolitos.

13. Blotting-. Tecnica bioqulmica usada para detectar la presencia de macromoleculas especificas (proteina, RNA o DNA) en una mezcla. La muestra es separada en gel de agarosa o poliacrilamida generalmente en condiciones desnaturalizantes, el componente ya separado es transferido (blotted) a una membrana de nylon o nitrocelulosa, esta membrana es expuesta a una sonda que se une especlficamente a la molecula de interes, despues se localiza su ubicacion por autorradiografla, quimioluminiscencia o anticuerpos.

14. Caja TATA: Secuencia conservada presente en muchos genes eucarioticos que codifican proteinas, que permiten la union del factor de transcripcion general y permite la union de complejo de iniciacion- transcripcion, el cual contiene la RNA polimerasa. La caja TATA esta compuesta tlpicamente por 25 a 35 pare de bases antes del sitio de inicio de la transcripcion.

15. CAP: Estructura que se afiade a los RNA mensajeros de eucariotes que consiste de un residuo 7-metilguanosina. este residuo define el sitio de inicio de transcripcion en eucariotes.

16. Cebador: Oligonucleotido que contiene un grupo extremo 3'libre que es complementario con una cadena molde de DNA y funciona como punto de inicio para la adicion de nucleotidos para copiar la cadena molde en el PCR.

17. Cepa: Organismo que presenta un fenotipo caracteristico reproducible de una generation a la otra.

18. Cion: Poblacion de celulas o moleculas de DNA identicas que descienden de un solo progenitor. Tambien se usa en virus u organismo que son geneticamente identicos.

19. Clonacion por expresion: Tecnica de DNA recombinante, para el aislamiento del DNAc o segmento genomico, basado en las propiedades funcionales de la proteina codificada, no requiere la purification previa de la proteina.

20. Clonacion: Introduction de DNA recombinante en una celula receptora.

21. Codigo genetico: Reglas por las cuales los tripletes (codones) del RNA codifican para un aminoacido especifico en las proteinas.

22. Codon: Secuencia de tres nucleotidos en el DNA o RNA que codifica para un aminoacido durante la transcripcion o traduction, tambien se le conoce

como triplete. De los 64 posibles codones, tres de ello son codones de alto que no son especlficos para ningun aminoacido. Los aminoacidos correspondientes para cada codon son casi iguales en todos los organismos, a esto se conoce como codigo genetico universal

23. Complementacion: La restauracion del fenotipo silvestre en diploides heterocigoticas generados a partir de haploides que presenta auxotrofias en genes diferentes que codifican proteinas que sean requeridas para la misma ruta bioquimica.

24. Composicion de bases: Frecuencia en que se presentan los residuos de adenina, guanina, citocina, timina o uracilo dentro de la secuencia de los acidos nucleicos.

25. Conjugation: Intercambio de DNA entre dos celulas bacterianas F+ y F-, El DNA pasa a traves de un puente celular que une a ambas celulas.

26. Control genetico: Mecanismo involucrados en la regulation de la expresion genetica. Estos mecanismos pueden operar a varios niveles moleculares incluyendo la transcription, el procesamiento del RNA, estabilizacion del RNA y traduction.

27. Cosmido: Vector de donation que se utiliza para clonar grandes fragmentos de DNA. Presenta un sitio COS que se usa para empaquetar secuencias de hasta 49 Kbps de DNA dentro de fagos lambda que se pueden utilizar para transferir ese DNA a celula bacteriana, fuera del sitio COS de solo14 bps el cosmido no presenta DNA de fago.

28. Cromosoma: Unidad estructural del material genetico, consiste de una sola cadena doble de DNA la cual se asocia a proteinas, en procariontes se trata de una sola cadena de DNA doble la cual constituye casi todo el material genetico.

29. Degeneration: Con respecto al codigo genetico, se refiere a la correspondencia de mas de un codon para un aminoacido

30. Deletion: Perdida de un segmento en la secuencia de DNA.

31. Desnaturalizacion: En proteinas es el rompimiento de enlaces no covalentes que resultan en el desplegamiento de la cadena polipeptidica, en acidos nucleicos, se refiere al rompimiento de enlace de hidrogeno entre bases, lo que provoca que las dobles cadenas se separen en moleculas de cadena sencilla. El calentamiento o la exposition a ciertos quimicos produce la desnaturalizacion, normalmente esto Neva a la perdida de la funcion biologica.

32. Diferenciacion: Proceso que involucra cambios en la expresion genetica por medio de la cual una celula precursor llega ser una celula especializada.

33. Diploide: Organismo que presenta dos juegos completos de material genetico, presenta juegos completos de cromosomas homologos y por ende de alelos. Las celulas somaticas contienen el numero diploide de cromosomas (2N) que definen el numero normal de una especie.

34.DNA complementario (DNAc): Molecula de DNA, copiada de un RNA mensajero por medio de la transcriptasa inversa, debido a esto carece de los intrones presentes en el DNA genomico. La secuencia del DNA complementario permite que el orden de aminoacidos de una protelna sea deducida; la expresion del DNAc en una celula recombinante puede ser usada para producir grandes cantidades de esta proteina in vitro.

35. DNA genomico: Secuencia de DNA que compone todo el genoma de una celula o un organismo.

36. DNA polimerasa: Enzima que copia la cadena molde de DNA para hacer la cadena complementaria. De acuerdo a las reglas de Watson y Crick, los desoxoribonucleotidos se anaden uno la vez usando como sustrato desoxiribonucleotidos trifosfatados y liberando pirofosfato.

37. DNA: Polimero compuesto de normalmente por 4 tipos de desoxirribonucleotidos unidos por enlaces fosfodiester, el cual codifica la informacion genetica. En estado nativo, el DNA es una doble helice formada por dos cadenas antiparalelas.

38. Dominante: Alelo que se expresa en el fenotipo de un organismo heterocigoto, el alelo no expresado Neva el nombre de recesivo. Tambien se refiere al fenotipo asociado con alelos dominantes.

39.Dominio: Region de una proteina con una estructura terciaria distintiva y actividad caracteristica; Encontrar dominios homologos en proteinas diferentes es bastante comun.

40 .Downstream-. Direccion en la que se mueve la RNA polimerasa durante la transcripcion y al movimiento de los ribosomas durante la traduccion, el cual es hacia el residuo final 3' hidroxilo. Por convencion la posicion +1 de un gen es el primer nucleotido transcrito.

41. Enzima: Macromolecula que actua como catalizador biologico, la mayoria de las enzimas son proteinas pero algunos RNA llamados ribozimas tambien presentan actividad catalitica.

42.Edicion de RNA (splicing): proceso que resulta en la remocion de intrones y en la union de los exones del RNAm. La edicion en el RNA mensajero de

eucariontes superiores ocurre en grandes complejos ribonucleoproteinicos llamados spliciosomas.

43. Electroforesis: Separation de un grupo de moleculas por medio de su migration a traves de una matriz polimerica, por medio de la aplicacion de un campo electrico.

44.Electroporacion: Sistema de donation en el cual el DNA extrano se introduce a la celula huesped a traves de poros en la membrana generados por la aplicacion de una carga electrica.

45.Enzima de restriccion: Enzima que reconoce y rompe secuencias pequenas especificas dentro de la molecula de doble cadena del DNA (sitio de restriccion). Estas enzimas estan ampliamente distribuidas en bacterias y se usan en tecnicas de biologia molecular.

46 .Escherichia coli: Especie bacteriana que ha sido ampliamente utilizada como modelo en biologia celular y molecular.

47. Exon: Segmento de un gene eucariotico (o del transcrito primario de RNAm) que alcanza el citoplasma como parte del RNAm, RNAr o RNAt funcional.

48.Expresion genetica: Proceso por el cual la information codificada en los genes se convierte en un fenotipo resultante.

49. Factor de elongation: Proteina ribosomales involucradas en la traduccion de RNA mensajeros posterior a la iniciacion de la traduccion. Sus funciones incluyen la union del conjugado aminoacido-RNA de transferencia, al ribosoma y la liberation del RNA de transferencia despues de la adicion del aminoacido al polipeptido en desarrollo.

50. Factor de iniciacion: Grupo de proteinas que promueve la asociacion apropiada del ribosoma y el RNA mensajero y que se necesita para la iniciacion de la sintesis de proteinas.

51. Factor de transcripcion: Termino general para una proteina requerida para iniciar o regular la transcripcion en celulas eucarioticas. Los factores requeridos para la transcripcion de todos los genes participan en la formation del complejo de iniciacion de la transcripcion. Factores especificos estimulan o reprimen la transcripcion de genes particulares cuando se unen a secuencias regulatorias.

52. Fenotipo: Caracteristicas observables de una celula u organismo como resultado de la expresion de su genoma.

53.Footprinting: Tecnica que se usa para la identification de regiones del DNA que permiten la union de proteinas, esta tecnica consiste en la digestion de

un segmento de DNA con DNAsa en presencia o ausencia de una proteina que se une a DNA, posteriormente se somete a la muestra a una elctroforesis, las regiones de DNA unidas a proteinas son protegidas de la digestion, esto hace que los fragmentos protegidos o no presentan una velocidad de migracion en el gel que es diferente, permitiendo localizar las secciones protegidas por la union de la proteina.

54. Fosforilacion: Reaccion e la cual un grupo fosfato se une covalentemente a otra molecula, la actividad de muchas proteinas se regula por la fosforilacion de residuos que contienen grupos hidroxilo como la serina, treonina y tirosina por cinasas.

55. Fragmentos de restriccion: Fragmentos resultantes del rompimiento de una molecula de DNA con enzimas de restriccion. Estos fragmentos se utilizan en la produccion de moleculas de DNA recombinante, clonacion de genes e identificacion de especies.

56.Frame Shift: Lectura alternativa del RNAm, donde el ORF puede ser cambiado en una o dos bases dando como resultado diferentes proteinas a partir de una misma secuencia de DNA.

57. Gen estructural: Secuencia de DNA que codifica una proteina funcional.

58. Gen regulador: Gen que generalmente codifica una proteina de regulation ya sea un inhibidor o un promotor, Puede tratarse tambien de secuencias que permiten la union de proteinas reguladoras, actuan activando, disminuyendo o modulando la transcription de otros genes.

59. Gene: Unidad flsica y funcional de la herencia, que Neva information de una generation a la siguiente. En termino moleculares un gen es la secuencia de DNA necesaria para la slntesis de un polipeptido funcional o una molecula de RNA. Ademas de las secuencias codificadoras muchos genes tambien contienen secuencias no codifcables como los intrones y los reguladores.

60.Genotipo: Constitution genetica total de una celula o un organismo. Tambien se denomina as! a los alelos de uno o mas loci especlficos.

61.GTP (Guanosina 5'-trifosfato): Un nucleotido que es precursor en la slntesis de DNA y RNA, juega un papel especial en la slntesis de proteinas, rutas de transduction de senales y ensamble de microtubulos.

62. Flaploide: Organismo que presenta solo un miembro del par de cromosomas homologos, y por tanto solo una copia (alelo) de cada gen o locus genetico. Los gametos y las celulas bacterianas son normalmente haploides.

63. Heterologo: DNA que es insertado dentro de un organismo de especie diferente a la del organismo de origen.

64.Hibridacion in situ: Tecnica que se utiliza para la localizacion de secuencias especificas de RNA dentro de un tejido o celula, consiste en la introduction de una sonda de DNA especifica para dicha secuencia, seguida por su detection, La hibridacion in situ se utiliza tambien para la localizacion espacial de genes dentro de un cromosoma.

65. Hibridacion: Union de dos cadenas de dos cadenas de acido nucleico complementarias para formar una molecula de doble cadena, estas cadenas pueden contener dos moleculas de DNA, dos moleculas de RNA, una molecula de DNA y una de RNA.

66. Homologo: Fragmento de DNA que es clonado dentro de un organismo de la misma especie del organismo origen.

67.lnactivador: inhibidor que se une irreversiblemente a una enzima o secuencia reguladora de DNA.

68. Induction: Incremento en la sintesis de una enzima o grupo de enzimas como respuesta a la presencia de una molecula especifica que puede ser el sustrato de la enzima.

69.lngenieria genetica: Grupos de tecnicas de biologia molecular usadas para sintetizar o controlar la production de un metabolito.

70. Integration: Insertion de una molecula de DNA dentro de otra, La integration ocurre durante el ciclo de vida lisogenico del bacteriofago lambda, infection por retrovirus y la transposition de elementos moviles del DNA, incluyendo transposones y retrotransposones.

71. Intron: Parte de un transcripto primario o del DNA codificante que es removido durante el procesamiento del RNAm. Tambien son llamadas secuencias intermedias.

72. Isoformas: Formas multiples de una misma proteina que comparten secuencias de aminoacidos que pueden ser iguales o que cambian muy poco, presentan actividades muy parecidas. Pueden producirse por maduracion alternativa del RNAm del mismo gen o ser codificadas por diferentes genes.

73. Knock Out (interruption): Interruption de un gen por medio de la integration de otro fragmento de DNA, esta tecnica se usa para estudiar la expresion de genes clonados in la interferencia del gen nativo.

74. Levadura: Nombre comun a varias especies del genero Saccharomyces, estos organismos se utilizan en biologla molecular como receptores de DNA foraneo y permiten la donation y expresion de moleculas de DNA muy largas arregladas en complejos llamados YAC's.

75.Ligasa: Enzima que une el final 3'de una cadena de acido nucleico con el extremo 5' de otra cadena, formando una cadena continua.

76. Locus'. Sitio especifico de localization de un gene dentro del cromosoma. Todos los alelos de un gen en particular ocupan el mismo locus.

77. Maduracion: Modification postracripcional que se lleva en el reticulo endoplasmico, consiste en el corte selectivo, glucosilacion, fosforilacion y estabilizacion de la proteina a ser secretada.

78.Mapa de restriction: Tecnica que permite encontrar la secuencia de genes dentro de una molecula de DNA, la molecula de DNA se fragmenta con enzimas de restriction, cada fragmento es secuenciado, despues la molecula completa es fragmentada con otras enzimas de restriction y secuenciada nuevamente, las secuencias obtenidas en ambos casos se compara entre si, de tal manera que la secuencia total de genes puede ser determinada.

79.Mapa genetico: representation fisica del orden en el que los genes estan presentes en los cromosomas.

80.Molde: Secuencia de DNA que sirve como guia para la sintesis de moleculas de DNAc o RNA, durante la replication o la transcription.

81. Mutation: Cambio en la secuencia en la secuencia de DNA de un organismo, usualmente en un solo gen que lleva a un cambio en o la perdida de su funcion normal.

82.Mutante: Organismo que presenta una modification en reconocible dentro de su genoma.

83. Northern blotting: Tecnica empleada para detectar secuencias especificas de RNA por hibridacion con una sonda de DNA en una membrana.

84.Nucleosido: Molecula compuesta por una purina o pirimidina unidas a una pentosa que normalmente puede ser ribosa o desoxirribosa.

85.Nucleotido: Molecula compuesta por una purina o pirimidina unidas a una pentosa y a uno o mas grupos fosfatos unidos por un enlace ester al residuo de azucar. El DNA y RNA son polimeros de nucleotidos.

86.0ligomero: Termino que se utiliza para denominar a pequenos polimeros de aminoacidos (oligopeptido) o acidos nucleicos (oligonucleotidos) o azucares (oligosacaridos).

87.0perador: Secuencia de DNA en un genoma bacterial o viral que permite la union de una proteina represora o activadora y controla transcripcion del o los genes adyacentes.

88.0peron: grupo de genes contiguos en el genoma bacteriano, que se transcriben regulados por un solo promotor dando origen a un RNAm policistronico.

89. ORF (Open Read Frame): Secuencia de codones o tripletes que van de un codon de iniciacion especifico hasta un codon de termination, y que da origen aun RNAm especifico. Algunos RNAm pueden ser traducidos como diferentes polipeptidos al ser leldos de acuerdo a diferentes ORF.

90. PCR (Reaction en Cadena de la Polimerasa): Tecnica para la amplification especifica de un segmento de DNA dentro de una mezcla compleja por medio de varios ciclos de sintesis de DNA por la DNA polimerasa de Thermophilus a partir de pequenos cebadores de DNA. Seguidos por calentamiento para separa las cadenas complementarias y llevar a cabo un nuevo ciclo de sintesis.

91. Pirimidina: Molecula formada por un anillo heterociclico que se encuentra en loas acidos nucleicos, las pirimidinas que normalmente se encuentran en el DNA son adenina y timina en el RNA esta ultima es reemplazada por uracilo.

92.Plasmido: Molecula de DNA circular extracromosomal capaz de auto replicarse dentro de una celula, comunmente utilizado como vector de donation.

93.PoliA: Cadena de adeninas unida al extremo 3'del RNAm, se utiliza para dar mas resistencia contra las proteasas y como sistema de regulation, al ser mas larga la cadena de PoliA mas veces se puede traducir un RNAm.

94. Procesamiento de RNA: Modificaciones que se llevan a cabo en moleculas de RNA iniciales producidas por transcripcion. Casi todas las moleculas de RNA son procesadas para dar origen a una molecula funcional.

95. Promotor: Secuencia regulatoria del DNA eucariotico (raramente se encuentra en el DNA procariotico) esta puede estar localizado a una gran distancia ya sea antes o despues del sitio de inicio de la transcripcion del gene que controla. La union de proteinas especificas al promotor estimula o inhibe el indice de transcripcion de los genes asociados.

96. Proteina: Polimero lineal de aminoacidos unidos entre si por enlaces peptidicos en una secuencia especifica, comunmente contiene mas de 50 residuos. Las proteinas son las macromoleculas mas abundantes en las celulas, cumplen con funciones como enzimas, elementos estructurales, anticuerpos, hormonas, transportadores, etc. y estan relacionadas con casi todas las fusiones celulares.

97. Purina: Compuesto basico que contiene dos anillos heterociclicos unidos y que se presenta en los acidos nucleicos, las purinas normalmente encontradas en DNA y NA son adenina y guanina.

98. Recesivo: Alelo que no se expresa en un organismo heterocigoto, tambien se refiere al fenotipo que solo se expresa en organismos homocigoticos.

99. Region codificadora: Secuencia del DNA que codifica la secuencia de aminoacidos de parte o toda una proteina, es diferente de las secuencias reguladoras o de la regiones no codificantes como intrones y espaciadores.

100. Regulation CIS: Secuencia reguladora del DNA (por ejemplo, un operador o un promotor) que solo puede controlar un gen que se encuentre en el mismo cromosoma. En bacterias el elemento de regulation CIS se encuentra adyacente al gen o genes que controla, mientras que en eucariontes los genes pueden encontrarse lejos.

101. Regulation TRANS: Secuencia de DNA que codifica proteinas que difunden a traves de las membranas nucleares y que actuan como represores o activadores del mismo o diferente cromosomas.

102. Replication: Copia de una molecula de polinucleotidos por medio de una polimerasa

103. Replicon: cuerpo de replication formado por la DNA polimerasa y otras enzimas accesorias unidas a la molecula de DNA.

104. Resistencia: En biologia molecular, es un sistema que permite la selection de organismos que contienen el plasmido o vector de expresion que se desea, consiste en la inclusion de los genes que codifican para las proteinas de resistencia a un antibiotico dentro del vector de clonacion a fin de facilitar la selection de los organismos portadores del vector y asegurar su expresion.

105. Respuesta a cheque termico: Expresion incrementada de un grupo de genes (hsp) en respuesta a un aumento de la temperatura o de otros

tratamientos extremos, esta respuesta va acompanada de la disminucion de la transcription de otros RNAm. Esto ayuda al organismo a resistir las condiciones de cultivo y esta muy difundida en celulas eucarioticas y procarioticas.

106. Reticulo endoplasmico: Red de membranas interconectadas dentro del citoplasma de celulas eucarioticas. Citologicamente se pueden distinguir dos formas que son: el reticulo endoplasmico rugoso que esta asociado con ribosomas, funciona en la sintesis y procesamiento de proteinas y membranas de secretion; por otro lado se encuentra el reticulo endoplasmico liso que carece de ribosomas y esta relacionado con la sintesis de lipidos.

107. Retrovirus: Virus que afecta a las celulas eucarioticas que contiene un genoma de RNA y que se replica haciendo primero una copia de DNA a partir de su RNA (transcription reversa). Este DNA proviral, es insertado en el DNA cromosomal y da origen a varios RNA genomicos asi como a RNAm de proteinas virales y finalmente a nuevos virus.

108. Revertante: Mutantes que espontaneamente pierden el fenotipo de mutante y regresan al fenotipo silvestre.

109. Ribonucleasas: Enzima que corta o hidroliza completamente cadenas de RNA formando ribonucleotidos.

110. RNA polimerasa: Enzima que copia una cadena de DNA, para formar una cadena de RNA complementaria, usando las reglas de apareamiento de Watson y Crick los ribonucleotidos son anadidos uno a la vez usando como substrato ribonucleotidos trifosfatos y liberando pirofosfato.

111. RNA ribosomal (RNAr): Moleculas de RNA que forman parte estructural y funcional del ribosoma.

112. RNA mensajero: RNA que codifica el orden de los aminoacidos de una proteina. Se produce por la transcription del DNA por la RNA polimerasa y en algunos virus a partir de RNA.

113. RNA: polimero de ribonucleotidos unidos por enlaces fosfodiester, se forman por la transcription del DNA o en algunos virus por la copia de una RNA molde. Existen tres tipos de RNA celulares RNA ribosomal, RNA mensajero y RNA de transferencia cumplen diferentes funciones en la sintesis de proteinas.

114. Secretion: Proceso coordinado que permiten la maduracion y salida de proteinas funcionales de la celula.

115. Secuencia palindromica: Secuencia de nucleotidos que es identica a su secuencia complementaria cuando es leida en la misma direccion (3'a 5'). Muchos sitios de reconocimiento de enzimas de restriccion son secuencias palindromicas.

116. Secuencia silenciadora: Secuencia dentro del DNA genomico donde el represor se une al promotor inhibiendo la transcripcion de uno o mas genes.

117. Secuencia: Orden linear de monomeros dentro de moleculas polimericas, especialmente proteinas o acidos nucleicos. Varias tecnicas de secuenciacion se utilizan para determinar la identidad y posicion de cada monomero dentro de estos polimeros.

118. Sitio Activo: Region en la superficie de una enzima donde se une el sustrato y sufre una transformacion catalitica; El sitio activo contiene residual de aminoacidos involucrados en la union del sustrato y otros involucrados en catalisis.

119. Sitio de restriccion: Secuencia especifica del DNA que es reconocida para ser cortada por enzimas de restriccion. Muchas de estas secuencias son palindromicas.

120. Sonda: Fragmento de DNA, RNA o anticuerpo marcado quimica o radioactivamente, se usa para localizar secuencias de nucleotidos o aminoacidos por hibridacion.

121. Southern blotting: Tecnica basada en el apareamiento especifico de secuencias de DNA con una sonda unida a una membrana de nylon o nitrocelulosa, esto permite aislar y detectar secuencias especificas de DNA dentro de una mezcla compleja.

122. Sustitucion: Cambio en la secuencia del DNA en la cual una base es substituida por otra sin modificacion en el numero de bases de la molecula

123. Traduccion: Produccion de un polipeptido mediante un la accion delos ribosomas donde la secuencia de aminoacidos esta especificada por la secuencia de codones del RNAm.

124. Transcripcion: Proceso por el cual una molecula de DNA es usadacomo molde para la sintesis de RNA complementario, la RNA polimerasa yotras moleculas llamadas factores de transcripcion intervienen en este proceso

125. Transduccion: Recombinacion de genomas bacterianos mediada porla accion de fagos.

126. Transfection: Introduction experimental de DNA extrano dentro de las celulas en un cultivo, usualmente seguido por la expresion de genes del DNA introducido.

127. Transformation: Alteration del fenotipo de un organismo como resultado de la inclusion de DNA foraneo. Tambien se refiere a la conversion de ceiulas de mamiferos normales en un cultivo de tejidos a una celula inmortal y/o division celular incontrolada, normal mente inducida por tratamiento con virus o agentes cancerigenos.

128. Transformante: Organismo que presenta alteraciones permanentes y heredables en sus celulas como resultado del ingreso e incorporation de DNA extrano.

129. Transgenico: Organismo que contiene genes clonados que son introducidos e incorporados de manera que pueden ser heredados a generaciones posteriores.

130. Trifosfato: Molecula de alta energia que presenta tres grupos fosfato unidos por enlaces fosfodiester.

131. Upstream: Direction opuesta a la de lectura normal del DNA por la RNA polimerasa durante la transcription. Pro convention la position +1 en un gen es la primera base transcrita, los nucleotidos en position upstream se denominan -1 , -2, -3, etc.

132. UV: Radiation ionizante localizada en la parte superior del espectro visible de 400 a 200 nm, es ampliamente usada como agente mutagenico.

133. Vector de donation: Elemento genetico que se replica dentro del organismo huesped, usado para introducir un DNAc o DNA genomico dentro de una celula huesped con proposito de clonar este gen. Los vectores mas usados son plasmidos, cosmidos, YAC's y genomas de bacteriofagos modificados.

134. Virus: Pequeho parasito celular, que consiste de acidos nucleicos (DNA o RNA) envueltos en una cubierta proteica denominada capside, que puede replicarse solo dentro de una celula huesped susceptible. Los virus exhiben ciclos de crecimiento litico y lisogenico. Los virus son ampliamente usados en biologia molecular.

135. Western Blotting: Tecnica para detection de proteinas especificas en una mezcla, despues de la separation de las proteinas en un gel de elctroforesis, estan son transferidas a un papel filtro y unidas a anticuerpos marcados especificos.

136. YAC's (cromosoma artificial de levadura): Segmento lineal de DNA que contiene todo el aparato molecular requerido para su replication en levaduras. UN sitio de replication (conocido como secuencia de replication autonoma, ARS), un centraremos y telomeros, este sistema completo actua como un cromosoma que se expresa y duplica de manera independiente en levadura, este sistema permite la donation y expresion de fragmentos de DNA muy grandes.

1. Activator2. Active Site3. Amplification4. Anticodon5. Antisense6. ATP7. Auxotroph8. Bacteriophage9. Base10. Blotting11. CAP12.Cis Active13.Clone14. Cloning Vector:15.Cloning16. Coding Region17.Codon18. Complementary DNA19. Complementation20. Conjugation21.Cosmid22. Cyclic AMP23. Chromosome24. Degeneration25. Deletion26. Denaturation27. Differentiation28. Diploid29. DNA library30. DNA Polymerase31.DNA32. Domain33. Dominant34. Downstream35. Electrophoresis36. Electroporation37. Elongation Factor38. Endoplasmic Reticulum39. Enhancer40. Enzyme41. Escherichia coli42 .Exon43. Expression Cloning44. Footprinting45. Frame Shift91. Purine92. Pyrimidine

46. Gene Expression47. Gene48. Genetic Code49. Genetic Engineering50. Genetic Map51. Genomic DNA52. Genotype:53.GTP54. Haploid55. Fleat Shock Response56. Fleterologous57. Flomologous58. Hybridization59. In Situ Hybridization60. Inactivator61. Induction62. Initiation Factor63. Integration64. Intron65. Isoforms66. Knock Out67.Ligase68. Locus69. Maturation70. Messenger RNA71. Molecular Biology72. Mutant73. Mutation74. Northern Blotting75. Nucleoside76. Nucleotide77. Oligomer78. Operator:79.0peron80. ORF81. Pairing82. Palindromic sequence83.PCR84. Phenotype85. Phosphorilation86. Plasmid87. Poly A88. Primer89. Probe90. Protein93. Recessive94. Replication

95. Replicon 115. Structural Gene96. Resistance 116. Substitution97. Restriction Enzyme 117. TATA Box98. Restriction Fragment 118. Template99. Restriction Map: 119. Trans Active100. Restriction site 120. Transcription Factor101. Retrovirus 121. Transcription102. Revertant 122. Transduction103. Ribonuclease 123. Transfection104. Ribosomal RNA 124. Transformant105. RNA polymerase 125. Transformation106. RNA Processing 126. Transgenic107. RNA Splicing 127. Translation108. RNA 128. Triphosphate109. Secretion 129. Upstream110. Sequence Database 130. UV111. Sequence 131. Virus112. Silencer sequence 132. Western Blotting113. Southern Blotting 133. YAC's114. Strain 134. Yeast

Activator: Molecule that acts as a messenger or second messenger activating the expression of a gene under certain conditions.

Active Site: Region of the surface of an enzyme where the substrate binds and undergoes a catalyzed reaction. The active site contains residues involved in substrate binding and others involved in catalysis.

Amplification: Process by which a fragment of DNA can be multiplied several times. The normal processes are PCR or cloning in a fast reproduction organism.

Anticodon: Sequence of three nucleotides in a transfer RNA (tRNA) that is complementary to a codon in a messenger RNA (mRNA). During protein synthesis, base pairing between a codon and anticodon aligns the tRNA carrying the corresponding amino acid for addition to the growing peptide chain.

Antisense: DNA sequence that encodes for a mRNA, that pair with a functional mRNA inhibits its expression.

ATP (adenosine 5'-triphosphate): A nucleotide containing two-high energyphosphoanhydride bonds whose hydrolysis or transfer is each accompanied by a large free energy change (deltaG) of approximate 7 Kcal/mol. It is the most important moiecule for capturing and transfer free energy in all cells.

Auxotroph: A cell or microorganism that grows only when the medium contains a specific nutrient or metabolite that is not required by the wild type; commonly, a microbial mutant strain that cannot synthesize an essential metabolite as judged by its inability to grow on a minimal medium.

Bacteriophage: Any virus that infects bacterial cells. Some bacteriophage are widely used as cloning vector.

Base: Composition: Frequency of Adenine(A), guanosine(G), Cytosine(C) Thymine(T), or Uracil (U) in a nucleic acid.

Blotting: Widely used biochemical technique for detecting the presence of specific macromolecules (protein, mRNA or DNA sequence) in a mixture. A sample first is separated on an agarose or polyacrilamide gel usually under denaturing conditions; the separated components are transferred (blotted) to a nitrocellulose sheet, which is exposed to a radiolabeled molecule that specifically binds to the macromolecule of interest and then subject to a autoradiography.

CAP: Eukariotic mRNA present a enzymatically appended structure consisting of a 7-methylguanosine residue joined to the transcript’s nucleoside defines the eukariotic the star site

Cis Active: referring to a DNA regulatory sequence (e.g., enhancer, promoter or operator) that can control a gene only ion the same chromosome. In bacteria, Cis-active elements are adjacent or proximal to the gene (s) they control, whereas in eukaryots they may also be far away.

Clone: A population of identical cells or DNA molecules descended from a single progenitor. Also viruses or organisms that are genetically identical and descended from a single progenitor

Cloning Vector: An autonomously replicating genetic element used to carry a cDNA or fragment of genomic DNA into a host cell for the purpose of gene cloning. The most commonly used vectors are bacterial plasmids and modified bacteriophage genomes; yeast artificial chromosomes (YACs) have been used as vectors for very large fragments of genomic DNA.

Cloning: Introduction of recombinant DNA into appropriate cells.

Coding Region: Sequences in DNA that encode the amino acid sequence of all or a part of a protein, as a distinct from regulatory sequences, which control transcription and translation, and other non-transcribed or non-translated regions of a gene such as introns and spacers.

Codon: Sequence of three nucleotides in DNA or RNA that specifies a particular amino acid during protein synthesis, also called triplet. Of the 64 possible codons, three are stop codons, which do not specify amino acids. The amino acids corresponding to each codon is the same in nearly all organisms; the set of all codons constitutes the genetic code.

Complementary DNA (cDNA): DNA molecule copied from an messenger RNA molecule by reverse transcriptase and therefore lacking they introns present in genomic DNA. Sequencing of a cDNA permits the amino acid sequence of the encoded protein to be deduced; expression of cDNA in recombinant cells can be used to produce large quantities of given proteins in-vitro.

Complementation: In genetics, the restoration of a wild-type function (e.g. ability to grow on galactose) in diploid heterozygotes generated from haploids each of which carries a mutation on different gene whose encoded protein is required for the same biochemical pathway. Complementation analysis of a set of mutants exhibits the same mutant phenotype can be used to determine if mutations are in the same or different genes.

Conjugation: Exchange DNA between two bacterias one F+ and the other f-, DNA pass trough a cellular bridge that is formed between the two cells.

Cosmid: A type of cloning vector used to clone large DNA fragments. It has a cos site that is needed to pack as long as 49 Kb DNA sequences inside lambda phages and late to a cell, outside of the cos site (14 bps) it has no phage DNA.

Cyclic AMP: A second messenger, produced in response to hormonal stimulation of certain receptors, that activates cAMP-dependent protein kinase.

Chromosome: In eukaryotes, the structural unit of the genetic material consisting of a single, liner double stranded DNA molecule and associated proteins. In prokaryotes, a single double -stranded DNA molecule constitutes the bulk of the genetic material.

Degeneration: In reference to the genetic code, having more than one codon specifying a particular amino acid.

Deletion: Loose of segment in the DNA sequence.

Denaturation: In proteins, disruption of various non-covalent bonds resulting in unfolding of the polypeptide chain; in nucleic acids, disruption of hydrogen bond between nucleotides converting double-stranded molecules or portions of molecules into single-stranded ones. Heating or exposure to certain chemicals can cause denaturation which usually results in loss of biological function.

Differentiation: Process usually involving changes in gen expression by which a precursor cell become a distinct specialized cell type.

Diploid: Referring to a organism or cell having two full sets of homologouschromosomes and hence two copies (alleles) of each gene or genetic locus. Somatic cells contain the diploid number of chromosomes (2n) characteristic of a species.

DNA library: Collection of cloned DNA molecules consisting of fragments of the entire genome (genomic library) or of DNA copies of all the mRNAs produced by all a cell type (cDNA library) inserted into a suitable cloning vector.

DNA Polymerase: An enzyme that copies one strand of DNA (the template strand) to make the complementary strand. Using rules of Watson-Crick base pairing, deoxyribonucleotides are added one-at-a-time, using as substrates deoxyribonucleotides triphosphates and releasing pyrophosphate.

DNA: Long polymer, composed of four kinds of deoxyribose nucleotides linked by phosphodiester bonds, that is the carrier of genetic information. In its native state , DNA is a double helix of two antiparallel strands.

Domain: Region of a protein with a distinct tertiary structure and characteristic activity; homologous domains may occur in different proteins.

Dominant: In genetics, referring to that allele of a gene expressed in the phenotype of a heterozygote, the non-expressed allele is recessive, also referring to the phenotype associated with a dominant allele.

Downstream: For a gene, in the direction RNA polymerase moves duringtranscription and ribosomes move during translation, which is toward the end of a DNA strand with 3'Hydroxi! group. By convention, the +1 position of a gene is the first transcribed nucleotide; nucleotides downstreaO from +1 position are designated +2, +3, etc.

Electrophoresis: Migration of charged molecules (proteins, RNA or DNA) trough a polymer in a electric field.

Electroporation: Cloning system in which the foraneous DNA is introduced to the host cell by application of a electric charge to made porous on the membrane.

Elongation Factor: One of a group of non ribosomal proteins involved in translation of mRNA following initiation. Functions include regulation of binding of an amino acid-tRNA to a ribosome and release of tRNA after addition of an amino acid to the growing peptide chain.

Endoplasmic Reticulum: Network of interconnected membranous structures within the cytoplasm of eukaryotic cells. Two forms can be distinguished cytologically: Rough ER, which is associated with ribosomes and functions in the synthesis and processing of secretory and membrane proteins, and smooth ER, which lacks ribosomes and is involved in synthesis of lipids.

Enhancer: A type of regulatory sequence in eukaryotic DNA (rarely in prokaryotic DNA) That may be located at a great distance either upstream or downstream from the transcription start site of the gene it controls. Binding of specific proteins an enhancer either stimulates or decreases the rate of transcription of the associated gene.

Enzyme: A biological macromolecule that acts as a catalyst. Most enzymes are proteins, but certain RNAs, called ribozymes, also have catalytic activity.

Escherichia coli: Bacterial specie that has been widely used as model organism on molecular biology.

Exon: Segments of a eukaryotic gene (or of the primary transcript of that gene) That reaches the cytoplasm as part of a functional, mature, mRNA, rRNA, or tRNA molecule.

Expression Cloning: Recombinant DNA techniques for isolating a cDNA orgenomic segment based on functional properties of the encoded protein and without prior purification of the protein.

Footprinting: Technique for identifying DNA regions that bind protein by digesting a radiolabeled DNA sample with DNAse in the presence or absence of a DNA- binding protein and then subjecting the samples to gel electrophoresis. Because regions of DNA with bound protein are protected from digestion, the fragment bands from protected and unprotected samples will differ, permitting identification of the protein-binding regions of DNA.

Frame Shift: Alternative reading of a mRNA , where the ORF can be changed in one or two bases, it gives different mRNA. from the same DNA sequence.

Gene Expression: Overall process by which the information encoded a gene is converted into a observable phenotype, most commonly production of a protein.

Gene: Functional and physical unit of heredity, which carries information from one generation to the next.. In molecular terms a gene is a entire DNA sequence necessary for the synthesis of a functional polypeptide or a RNA molecule. In addition to coding regions most genes also contain non coding intervening sequences (introns) and transcription-control regions.

Genetic Code: The set of rules whereby nucleotides triplets (codons) in RNA specify amino acids in proteins.

Genetic Control: All of the mechanisms involved in regulating gene expression. These mechanism can operate at several molecular steps including transcription, RNA processing, RNA stabilization, and translation.

Genetic Engineering: Group of techniques of molecular biology that are used to produces or enhance the production of a metabolite.

Genetic Map: Order in which genes are presented in the chromosomes.

Genomic DNA: All the sequence composing the genome of a cell or organism.

Genotype: Entire genetic constitution of an individual cell or organism.; also, the alleles at one or more specific loci.

GTP (guanosine 5'-triphosphate): A nucleotide that is precursor in RNA synthesis and also plays a special role in protein synthesis, signal-transduction pathways, and in microtubule assembly.

Haploid: Referring to an organism or cell having only one member of each pair of homologous chromosomes and hence only one copy (allele) of each gene or genetic locus. Gametes and bacterial cells are haploids.

Heat Shock Response: Increased expression of a specific group of genes (hsp genes) in response to elevated temperature or other stressful treatment accompanied by decreased transcription of other mRNAs. This response is very widespread among both prokaryotic and eukaryotic organism, and helps the organism to survive the stress.

Heterologous: DNA that is inserted into a organism of different specie than the donor organism

Homologous: DNA fragment that is cloned in a organism that is of the same specie of the donor organism.

Hybridization: Association of two complementary nucleic acid strands to formdouble-stranded molecules. Hybrids can contain two DNA strands, two RNA strands or one DNA and one RNA strand.

In Situ Hybridization: Is a technique for determining the location of specific RNA sequence within a tissue or cell by treatment with a labeled single-stranded nucleic acids probe followed by detection. In situ hybridization is also used to map the location of genes to specific chromosomal locations.

Inactivator: Inhibitor that binds irreversibly to a enzyme or regulation DNA sequence.

Induction: An increase in the synthesis of an enzyme or series of enzymes mediated by a specific molecule.

Initiation Factor: One of a group of proteins that promote the proper association of ribosomes and mRNA and are required for initiation of the protein synthesis.

Integration: The insertion of one DNA molecule into another, integration occurs during the lysogenic cycle life of bacteriophage lambda, infection by retroviruses and the transposition of mobile DNA elements, including transposons, and retrotransposons.

Intron: Part of a primary transcript (or the DNA encoding it) that is removed by splicing during RNA processing and is not included in the mature functional mRNA, rRNA ortRNA, also called intervening sequences.

Isoforms: Multiple forms of the same protein whose amino acid sequences differ slightly but whose general activity is identical. They may be produced by alternative splicing of RNA transcripts from the same gene or be encoded by different genes.

Knock Out: Interruption of a gen by means of the integration of another DNAfragment, this technique is used to study the expression of cloned gen without the interference of the native gen.

Ligase: An enzyme that links together the 3"end of the nucleic acid strand with the 5'end of another, forming a continuos strand

Locus: In genetics, the specific site of a gene on a chromosome. All the alleles of a particular gene occupy the same locus.

Maturation: Postranslational processes that are given on the endoplasmicreticulum, consist on the selective cutting, glycosilation, phosphorilation and stabilization of the secreting proteins.

Messenger RNA (mRNA): An y RNA that specifies the order of amino acids in protein synthesis. It is produced by transcription of DNA by RNA polymerase and, in RNA viruses by transcription of viral RNA: In eukaryots the initial RNA product (primary transcript) undergoes RNA processing to yield functional mRNA, which is transported to the cytoplasm.

Molecular Biology: Set of techniques that allow the study and modification of the nucleotide molecules and it expression.

Mutant: Organism that presents a recognizable mutation.

Mutation: In genetics, a change in the nucleotide sequence of a chromosome, usually in a single gene, which leads to a change in or loss of its normal function.

Northern Blotting: Technique for detecting specific mRNA sequence by its hybridization with a DNA attached to a membrane.

Nucleoside: A small molecule composed of a purine or pyrimidine base linked to a pentose (either ribose or desoxiribose).

Nucleotide: A small molecule composed of a purine or a pyrimidine base linked to a pentose (either ribose or deoxyribose) and a one or more phosphate groups linked via an ester bond to the sugar moiety. DNA and RNA are polymers of nucleotides.

Oligomer: General term for a short polymer most commonly consisting of amino acids (oligopeptides), nucleic acids (oligonucleotides), or sugars (oligosaccharides).

Operator: Short DNA sequence in a bacterial or viral genome that binds a repressor protein and controls transcription of an adjacent gene.

Operon: In bacterial DNA, a cluster of contiguous genes transcribed from one promoter that gives rise to a polycistronic mRNA.

ORF: The sequence of nucleotide triplets (codons) that runs from a specific translation start codon in an mRNA to a stop codon. Some mRNA can be translated into different polypeptides by reading in two different reading frames.

Pairing: union of to complementary DNA or DNA-RNA molecules, according with the Watson-Crick rules, a adenine to thymine and citosine to guanine.

Palindromic sequence: Nucleotide sequence that is identical to tits complementary sequence when is read in the same direction (e.g. 5-'3'). Many sites recognized by restriction enzymes rare palindromes.

PCR: Technique for amplifying a specific DNA segment in a complex mixture by multiple cycles of DNA synthesis from a short oligonucleotide primers followed by brief heat treatment to separate the complementary strands.

Phenotype: The observable characteristics of a cell or organism as distinct from its genotype.

Phosphorilation: Reaction in which a phosphate group becomes covalently linked to another molecule. The activity of many proteins is regulated by phosphorilation of hydroxyl-containing residues (serine, threonine, tyrosine) by various protein kinases

Plasmid: Small, circular extrachromosomal DNA molecule capable of autonomous replication in a cell. Commonly used as a cloning vector.

Poly A: Several adenines are joined to the mRNA to gives more resistance from RNAses and as regulatory system, the longer the poly A chain more translations can be do of a given mRNA.

Primer: A short nucleic acid sequence containing a free 3' hydroxyl group that forms base pairs with a complementary template strand and functions as the starting point for addition of nucleotides to copy the template strand.

Probe: Defined DNA or RNA fragment, radioactively or chemically labeled, that is used to locate specific nucleic acid sequences by hybridization.

Protein: A linear polymer of amino acids linked together in a specific sequence and usually containing more than 50 residues. Proteins-most abundant macromolecules in cells- serve as enzymes, structural elements, antibodies, hormones, electron carriers, etc., and are involved in near all cellular activities..

Purine: A basic compound, containing two fused heterocyclic rings, that occurs in nucleic acids. The purine commonly found in DNA and RNA are adenine and guanine.

Pyrimidine: A basic compound, containing one heterocyclic ring, that occurs innucleic acids. The purines commonly found in DNA are cytosine and thymine; in RNA uracyl replaces thymine.

Recessive: In genetics, referring to that allele of a gene that is not expressed in the phenotype when that dominant allele is present; also refers to the phenotype of an individual (homozygote) carrying two recessive alleles.

Recessive: Generally a gene that does not encode for a protein, instead it plays a roll on the genetic regulation as, enhancing translation, activation or repression of another gen, etc.

Replication: Copy of a molecule of nucleotides by polymerases using another molecule as a template.

Replicon: Enzymatic replication body formed by the DNA polymerase and accessory enzymes that replicate the DNA molecule.

Resistance: System that allows the selection of a specific organism that carries a desirable recombinant DNA fragment.

Restriction Enzyme (Endonuclease): Any enzyme that recognizes and cleaves a specific short sequence, the restriction site, in double stranded DNA molecules. These enzymes are widespread in bacteria and are used extensively in recombinant DNA technology.

Restriction Fragment: A defined DNA fragment resulting from cleavage with a restriction enzyme. These fragments are used on the production of recombinant DNA molecules and gene cloning.

Restriction Map: Technique that allowed to find the sequence of genes over a DNA molecule, The DNA molecule is fragmented with a restriction enzyme and fragment are sequenced, after that DNA molecule is fragmented with another restriction enzyme and the sequenced fragments are compared with the previous ones, on that way the total order of the chromosomes are found.

Restriction site: DNA sequence that is recognized for cutting by endonucleases.

Retrovirus: A type of eukaryotic virus containing an RNA genome that replicates in cells by first making a DNA copy of the RNA, a process termed reverse transcription. This proviral DNA is inserted into cellular chromosomal DNA and gives rise to further genomic RNA as well as the mRNA for viral proteins.

Revertant: Referring to genetics, mutant that spontaneously get back to the wild type phenotype.

Ribonuclease: An enzyme that cuts an RNA strand or completely hydrolyzes an RNA, forming ribonucleotides.

Ribosomal RNA (rRNA): Any one of several large RNA molecules that are structural and functional components of ribosomes.

RNA polymerase: An enzyme that copies one strand of DNA or RNA (the template strand) to make the complementary RNA strand. Using rules of Watson-Crick base pairing, ribonucleotides re added one-at-a-time, using as substrates ribonucleotides triphosphates and releasing pyrophosphate.

RNA Processing: Various modifications that occur to the initial RNA molecules produced by transcription. Many but all RNAs undergo processing to yield functional molecules. RNA processing is more complex in eukaryots than in prokaryotes.

RNA Splicing: A process that results in removal of introns and joining of exons in RNAs. Splicing in the pre-mRNA of higher eukaryots occurs in large ribonucleoprotein complexes called spliceosomes.

RNA: Long, linear, single-stranded polymer, composed of ribose nucleotides linked by phosphodiester bonds; is formed by transcription of DNA or, in some viruses, by copying of RNA. The three types of cellular RNA

Secretion: Coordinated events which allows the exit of proteinous material of the cell.

Sequence Database: Database that contains the sequence of one or several DNA molecules or protein deduced codons, several of this databases are public and can be consulted on the WWW.

Sequence: The linear order of monomers in polymeric molecules, especially proteins and nucleic acids, various techniques, collectively termed sequencing, are used to determine the identity and position of each monomer in a polymer.

Silencer sequence: A sequence in eukaryotic DNA where repressor bind and inhibits transcription from promoters within several hundred base pairs

Southern Blotting: Technique for detecting specific DNA sequences by hybridization whit DNA probe attached to a membrane.

Strain: Organism that present reproducible phenotypic characteristics from one generation to the other.

Structural Gene: DNA sequence that encodes a functional protein.

Substitution: Change on the DNA sequence in which a base is changed by another without modification in the long of the molecule.

TATA Box: A conserved sequence in the promoter of many eukaryotic protein- coding genes that binds the general transcription factor, thereby beginning formation of the transcription-initiation complex, which contains RNA polymerase,. The TATA box is typically 25-35 base pairs upstream from the transcription start site.

Template: A molecular “mold” that dictates the structure of another molecule; most commonly, one strand of DNA that directs synthesis of a complementary DNA strand during DNA replication or of a RNA during transcription.

Trans Active: Referring to DNA sequence that encode diffusible proteins (e.g. repressor and transcription factors) that control genes on the same or different chromosomes.

Transcription Factor: General term for any protein, other than RNA polymerase, required to initiate or regulate transcription in eukaryotic cells. General factors, required for transcription of all genes, participate in formation of the transcription-initiation complex near the start site. Specific factors stimulates (or repress) transcription of particular genes by binding to their regulatory sequences.

Transcription: Process whereby one strand of a DNA molecule is used as a template for synthesis of a complementary RNA. RNA polymerase and various accessory proteins called transcription factors form a complex that initiates transcription.

Transduction: Bacterial phage-mediated recombination process.

Transfection: Experimental introduction of foreign DNA into cells in culture, usually followed by expression of genes in the introduced DNA.

Transformant: Any organism that has permanent and heritable alterations in its cells resulting from the uptake and incorporation of foreign DNA.

Transformation: Permanent, heritable alteration in a cell resulting from the uptake and incorporation of foreign DNA. Also, conversion of a “normal” mammalian cell in tissue culture to a cell characterized by immortality and/or uncontrolled cell division usually induced by treatment with a virus or other cancer-causing agent.

Transgenic: referring to any organism carrying a cloned gene that is introduced and stably incorporated into it and is passed on to successive generations.

Translation: The ribosome-mediated production of a polypeptide whose amino acid sequence is specified by the codon sequence in an mRNA.

Triphosphate: Molecule that presents three phosphate groups joined by two high energy phosphodiester binds.

Upstream: The direction on a DNA opposite to the direction RNA polymerase moves during transcription. By convention, the +1 position in a gene is the first transcribed base; nucleotides upstream from +1 position are designated - 1,-2, etc.

UV: Radiation localized on the upper side of the visible spectra (400-200 nm), are widely used as mutagenic agent

Virus: A small parasite consisting of nucleic acid (RNA or DNA) enclosed in a protein coat (capsid) that can replicate only within a susceptible host cell. Bacterial viruses exhibit either a lytic cycle or a lysogenic cycle of growth. Viruses are widely used on cell biology research.

Western Blotting: Technique for detecting specific proteins in a mixture. After separation of the proteins by gel electrophoresis, proteins are blotted to a filter paper and specific ones detected by labeled antibodies.

YAC's: Linear DNA segment that contains all the molecular system required for replication in yeast: a replication origin (Known as autonomously replication sequence ARS) a centromere and telomere, this complete systems acts as yeast's self replicating independent chromosome

Yeast: Common name of a variety of Saccharomyces species, those organisms are used commonly in molecular biology as receptors of foreign DNA and allow the cloning and expression of very long DNA molecules called YACs.

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ILSI

El International Life Sciences Institute (ILSI) es una organization cientifica, no lucrativa, establecida en 1978 para avanzar en el conocim iento de tem as cientlficos relativos a la nutricion, calidad sanitaria de los alimentos, toxicologia, evaluacion de riesgos y la seguridad ambiental.

M ediante el trabajo cooperativo y la in teraction de los cientlficos de la Academia, el Gobiem o, la Industria y el publico en general, ILSI prom ueve el entendimiento hacia la reso lu tion de problem as de interes comun para el bienestar de la poblacion.

Su sede se ubica en W ashington, D.C., E.U.A., pero ILSI esta afiliado a la Organizacion M undial de la Salud como institu tion no gubem am ental y mantiene un reconocim iento como ente consultivo especializado ante la Organizacion de las Naciones Unidas para la A gricultura y la A lim entation (FAO).

ILSI cuenta con oficinas en Africa del Norte y Region del Golfo, Africa del Sur, Argentina, Australasia, Brasil, Corea, China, Europa, la India, Japon, Mexico, Norteamerica, Region Norandina, Region Surandina, Singapur y Tailandia, ademas de sus institutos. Es a traves de todas estas entidades que ILSI realiza su labor y se ven reflejados sus logros.

ISBN 1-57881-089-2

979157881089400000