82
Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás Új trendek 1990-2012 Semmelweis Egyetem, Gyógyszerészi Kémiai Intézet Szakgyógyszerészképzés, I. évf. 2012. május 19. Kökösi József SE GyKI

Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás Új trendek 1990-2012

Embed Size (px)

DESCRIPTION

Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás Új trendek 1990-2012. Semmelweis Egyetem, Gyógyszerészi Kémiai Intézet. Szakgyógyszerészképzés, I. évf. 2012. május 19. Kökösi József SE GyKI. Áttekintés. - PowerPoint PPT Presentation

Citation preview

Page 1: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás

Új trendek 1990-2012

Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás

Új trendek 1990-2012

Semmelweis Egyetem, Gyógyszerészi Kémiai Intézet

Szakgyógyszerészképzés, I. évf. 2012. május 19.

Kökösi József SE GyKI

Page 2: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

• Gyógyszeripar: globalizáció, átrendezödések, biotechnológia, „high tech”,

innováció, „me-too drug”

• Gyógyszerkutatási és fejlesztési folyamatSruktúraváltás, kooperáció, Generikumok, technológia

• Számítógépes (Informatikai) közelítések

• Kémiai-informatika– QSAR– Virtuális kombinatorikus kémia– Molekuláris Diverzitás Analizis– Virtuális Screening

ÁttekintésÁttekintés

Page 3: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Egészségügyi költségek folyamatos növekedése

Diede ML, et al. Managed Care. 2002;11:24-33.

USA Egészségügyi ráfordítások, Per Capita

• Egészségügyi kiadások 44%-al növekedtek 2006-ig

• Egy négytagú családban 2006-ig, 2500 $-al növekedett az éves gyógyszer kiadás

• A klinikusokat fokozottan támogatják az egészségügyi költségek kontrollálásában

Kórházi

Orvosi

Egyéb

Felirt gyógyszerek

Idös otthon

Házi ellátás

2001 2002 2003 2004 2005 2006

Év

$0

$500

$1000

$1500

$2000

$2500

Page 4: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

GSK7%

Merck5%

AstraZeneca4%

BMS4%

J&J4%

Aventis4%

Other55%

AHP3%

Novartis4%

Pharmacia3%

Pfizer7%

Chrysler14%

Other34%

GM28%

Ford24%

AutAutóiparóiparGyógyszeriparGyógyszeripar

Piaci részesedés & verseny

Page 5: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

GlobalizációGlobalizáció

Page 6: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A gyógyszeripar világpiaci áttekintésben

•Globális gazdaság

Page 7: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Ázsia emelkedőben

Source – FT

Page 8: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Sources: Goldman Sachs 2007

5 vezető ország Globális Gyógyszer piaca 2020

Sorrend Ország Méret

1.

2.

3.

4.

5.

USA

Kina

Japán

Franciaország

India

$ 475 mrd.

$ 125 m.

$ 61 m.

$ 51m

$ 43m

Page 9: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Földrajzi és szerkezeti átrendezödés

Földrajzi és szerkezeti átrendezödés

• Távol-keleti országok – - nagy gyártó kapacitások áttelepítése, ill. kialakítása

– környezeti kémiai kiszorításKina, India a hatóanyag beszállítókKina, India, (Brazilia, Oroszország) dinamikus piacbövülés

• Kiszerelö és formuláló üzemek világhálózata

• Generikus készítmények növekvö gazdasági súlya

• Kutatási profil átstrukturálódása – 30% formulálás, nanotechnológia

• Kutatási kapacitások koncentrálása és külső mikro-kooperáció

• Szigorodó környezetvédelemi és energia kibocsátási elöirások

Page 10: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Ázsiai verseny a prosperitásért

Page 11: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Termelési előnyök

India Elöny- hátrány USA India Elöny- hátrány USA

1 vegyész Jobb oktatás x 1.3 1 vegyész 1 vegyész Jobb oktatás x 1.3 1 vegyész

70 óra/hét Hosszabb munkaidő x 1.3 50 óra/hét 70 óra/hét Hosszabb munkaidő x 1.3 50 óra/hét

$ 800 /hónap Alacsonyabb költség x 20 $ 12,000 /hónap $ 800 /hónap Alacsonyabb költség x 20 $ 12,000 /hónap

Sources: IPHMR Conferences, New Delhi August 2004

Page 12: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Generikus trendekGenerikus trendek

Page 13: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Generikumok – API-k

USA DMF filings by India % Share of USA DMF filings

India Kina 2004 27% 9% 2005 37% 10% 2006 44% 14%

Q1’07 48% 17%

Source: US FDA / J P Morgan, 2 may 2007

Source: US FDA, Credit Suisse

India Kina 2004 187 48 2005 252 87 2006 357 128

Source: US FDA / J P Morgan, 6th August 2006

Page 14: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Sources: AXA Framlington

Cég Lejárat2010

Lejárat2012

Lejárat2011

Pfizer Aricept - $800m Lipitor - $12.1mrd

Xalatan - $1.6 mrd

Viagra - $1.7mrd

Detrol - $860m

Geodon - $1.1mrd

Astra Zeneca Arimidex - $2.2mrd Seroquel - $4.7mrd Symbicort - $3.7mrd

Sanofi-Aventis Taxotere - $2mrd US Plavix - $3.8mrd

Avapro - $2.1mrd

Lovenox - $3.1mrd

BMS US Plavix - $4.8mrd

Avapro - $1.3mrd

Abilify - $2.1mrd

GSK Advair - $3.8mrd Avandia - $2.5mrd

Szabadalmak lejárati dátumai

41%

38%

34%

30%

23%

% at Risk

Page 15: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Befektetések Ázsiában (ex-Japán) 2007-ben

Ország Száma Összege - $mKina 103 1489

India 90 1369

Hong Kong 5 186

Australia 26 71

Taiwan 6 33

Dél-Korea 30 29

Thaiföld 2 29

Singapur 4 16

Új- Zéland 9 3

Total 278 3233Sources: Thomson Financial

Page 16: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Demográfia• Egyre elterjedtebb és növekvö neuropszichológiai betegségek:

- Schizophrenia (3 millió)

- Parkinson kór (1.5 millió)

- Alzheimer kór (4 millió)

- Pánikbetegség (>> 5 millió)

- Depresszió (> 20 millió)

- Stroke (3 millió)

- Traumatikus agykárosodások (2.5 millió)

- Fájdalom (#1 Páciens panaszok)

Page 17: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A GDP és a várható életkor

A GDP és a várható életkor

Page 18: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Várható életkor Mo.-EU

Várható életkor Mo.-EU

Page 19: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Magyar gyógyszeripar jellemzöi

–Jelentös és növekvő termelés (2004-ben 400 Mrd Ft)

–Jelentös foglalkoztatás (15000 fö)

–Magas K+F ráfordítás (30%)

–Magas exporthányad

–Magas hozzáadott érték

–Sok diplomás alkalmazott

–Intenziv kapcsolatok alapkutatással, oktatással

De:

–Bizonytalan, kevéssé támogató gazdasági környezet

Rossz pályázati rendszerek

Spinoff kultúra hiánya

Brain drain

–Kicsiny tökekoncentráció

Page 20: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

–SE GyKI

Gyógyszerkutatás 2000

Gyógyszerfejlesztés után

Page 21: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A gyógyszerkutatási szempontok

1. A társadalom szempontjai

–A betegek érdekei

- Egészségmegörzés (prevenció)

–Gyógyulás / tünetek enyhítése

–Betegre szabott terápia

-A gazdaság érdekei

- Prosperáló ipar

-Egészségügyi költségek csökkentése

2. A gyártó szempontjai

-Piac megörzése, kiterjesztése

-Vállalat arculatának javítása

-Profitabilitás és függetlenség megörzése

3. A kutató szempontjai

- Biztos munkahely, érdekes feladatok

- Szellemi értékek hasznosulása

Page 22: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

GYÓGYSZERKUTATÁS

originális

generikus

Módszerek, stratégiák:

- 1960 hagyományos (tapasztalati) módszerek

1960 – 1990 racionális gyógyszertervezés

QSAR, CADD

1990 – 2003 HTS, kombinatorikus kémia

2003 - posztgenomika korszaka

Page 23: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Új gyógyszer fejlesztési költségeinek növekedéseÚj gyógyszer fejlesztési

költségeinek növekedése

Page 24: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszerkutatási folyamatIdő és pénz

Gyógyszerkutatási folyamatIdő és pénz

12 - 24 év

1 gyógyszer

50,000 - 5,000,000 vegyületet kell gyakran screenelni,hogy egy gyógyszert találjunk

500 - >2000 millió $

>1,000 “találat”

12 “vezér”

6 gyógyszerjelölt

Felfedezés és preklinikai fázis Klinikai fázis: Fásis I, : Fásis II, : Fásis III

Page 25: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Kutatás FEJLESZTÉS BEVEZETÉS

TERMELÉS

KoncepcióSzintézisBiológiai

vizsgálatok

OptimalizálásAktivitás

SzelektivitásOrális abszorpció

Hatástartam

Preklinikaivizsgálatok

in vitroállatkísérletek

MéretnövelésFizikai-kémiai

vizsgálatokAnalitikaStabilitás

FarmakokinetikaFormulálás

TörzskönyvezésHumán klinikai vizsgálatok

Fázis I

Fázis II

Fázis III

2-4 év

5-10 000

molekula

1-2 év

50

6-8 év

10 3 1

1-2 év

A GYÓGYSZERKUTATÁS FOLYAMATA

Page 26: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Technológia trend a gyógyszerkutatásbanTechnológia trend a

gyógyszerkutatásban

–Humán Genom Projekt Post-Genom időszak

Géninformáció Protein információ

Protein funkciók Új gyógyszer célpontok

-Nagy teljesítményű technológiák

Nagy áteresztő képességű tesztek Teszt eredmények

Kombinatorikus kémia Kémiai könytárak

ADME/Tox (Abszorpció, Megoszlás, Metabolizmus, Kiválasztás, Toxicitás)

-Számítógépes Technológiák, Bioinformatika

Genomika Informatika, Proteomika Informatika, Kémiai Informatika,

Metabolikus Informatika Informatikai rendszer integráció

Komputeres gyógyszertervezés és optimalizáció

Page 27: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Jelenlegi gyógyszercélpontok biokémiai osztályai

Jelenlegi gyógyszercélpontok biokémiai osztályai

–Receptorok

–Enzimek

–Hormonok és faktorok 10%

–DNS 2%

–Nukleár receptorok 2%

–Ioncsatornák 5%

–Ismeretlen 7%

45%

28%

–A közel 500 célpont a humán genomika fejlödésével 10000-re növekszik

Page 28: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Genomika története• 1900 DNS kromoszóma elmélet• 1953 DNS szerkezetének megfejtése• 1980

– Az elsö komplett orgamizmus genom szekvencia – FX174 - 5,386 bázis pár, kilenc proteint kódol. (~5Kb)

• 1995 – Haemophilus influenzea genom szekvencia (flu bacteria,

1.8 Mb)• 1996

– Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast, 12.1 Mb) • 1997

– E. coli (4.7 Mbp) • 2000

– Pseudomonas aeruginosa (6.3 Mbp) – A. thaliana genom (100 Mb) – D. melanogaster genom (180Mb)

2001-2003 The Big One (3 Gb) humán genom2009 okt. 3D humán genom – aktiv gének kölcsönhatásai

Page 29: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A humán genom számokban

A humán genom számokban

• • 2 méter DNS; • • 23 pár kromoszóma;• • 3,000,000,000 bp;• • 35 M (férfi 27M, nöi 44M);• • 23,000-25,000 gén (Genom 2%-a, 40% aktiv)• 100.000 protein• 1,000,000 különféle humán antitest

(exon,intron)1cMorgan = 1 millió bázispár (1Mb)

Page 30: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Genetikai térkép és müködési biokémiai gráf

modell

Genetikai térkép és müködési biokémiai gráf

modell

Page 31: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gene FunctionsGene FunctionsHumán genom funkcionális feltérképezése

Page 32: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Posztgenom korszakPosztgenom korszak

– Komparativ Genomika

Genom összehasonlító analizise– Funkcionális Genomika

Génfunkciók feltérképezése– Strukturális Genomika

Teljes genom müködési mechanizmus

Proteomika (PROTEin és genOM)

Genom által kódolt fehérjék

Kvalitativ és kvantitativ vizsgálata

Page 33: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszerészeti Biotechnológia

Szövetkulturák, élő sejtek vagy a sejtek enzimeinek felhasználása olyan termékek elöállítására, amelyeket diagnosztikus, terápiás és gyógyszer célból alkalmazunk.

Van Noordwijk

Page 34: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Fő biotechnológiai technikák

Rekombináns DNS technológia (klónozás)Polimeráz láncreakció (PCR)Monoklonális antitestekNukleotid blokád (antiszensz, iRNS)Gén terápiaGenomikaOligonukleotid kémia Szénhidrát kémia Kombinatorikus kémiaProtein engineeringMolekula modellezésKis-molekulás kémia

Page 35: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Biotechnológiai Medicinák/Vakcinák a fejlesztésben Terápiás kategoriák szerint

29

13

19

22

28

5

39

26

3

11

3

11

7

175

9

19

19

Others Diseases

Transplantation

Skin Disorders

Respiratory Diseases

Neurological Disorders

Infertility

Infectious Diseases

Heart Diseases

Growth Disorders

Genetic Disorders

Eye Conditions

Digestive Disorders

Diabetes

Cancer

Blood Disorders

Autoimmune Disorders

AIDS/HIV Infection

Page 36: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

83

98

4

4

14

59

6

12

5

5

17

25

3

3

6

16

9

Others

Vaccines

Signaling

Recombinant Soluble Receptors

Recombinant Human Proteins

Monoclonal Antibodies

Interleukins

Interferons

Immune-based Therapy

Human Growth Hormones

Growth Factors

Gene Therapy

Erythropoietins

Colony Stimulating Factors

Angiogenesis Inhibitors

Cellular Therapy

Antisense

Biotechnológiai Medicinák/Vakcinák a fejlesztésben Termék kategoriák szerint

Page 37: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Biotech Gyógyszerfejlesztés 2005

371 biotechnológiai medicina áll fejlesztés alatt közel

200 betegség új kezelésére

250 millió beteg kezelésében használnak már biotechnológiai úton kifejlesztett gyógyszert és vakcinát.

Page 38: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Hagyományos gyógyszerfejlesztés

Könyvtár

Assay

Adat

Gyógyszer jelöltek

*Screening*

Kutatás kiterjesztés

*Adat Analizis*

Kémiai kutatás

Page 39: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

– A gyógyszerkutatás fejlödése és a “paradigma váltás”

–1960-1970 Protein röntgenkrisztallográfia– Molekulagrafika– Hansch-féle modern prediktiv kemo-információs módszerek–1970-1980 Protein Data Bank– Enzim-ligand kölcsönhatás jellemzése (kötödés, affinitás)– Molekuláris és kvantummechanikai módszerek– 3D farmakofor – 3D szerkezetek és tulajdonságok számítása–1980-1990 Szerkezet alapú racionális tervezési módszerek– Új vizualizációs technikák, és analizisek– Nagyhatékonyságú adatbázis és információ kezelõ computerizáció– Géntechnológia - receptorok, receptor aktiv kötöhelyek peptid fragmenseinek elöállítása– - olcsó biokémiai gyorstesztek, a farmakologiai screnelés felgyorsulása– - HTS technológia automatizált rendszerének kialakitása– -Uj biotechnológiai ipar kialakulása (Inzulin, interferonok, antibiotikumok)– Automatizált analitikai rendszerek szerkezet felderítésre; aktivitás in vitro tesztelése– - Röntgendiffrakció - komputeres kiértékelés– - Multidimenzionális NMR technika -3D szerkezet gyors felderítése– - Nagy érzékenységü fluorimetriás módszerek izolálási feladatokra– - Rádióaktiv jelzési technika – - Speciális diagnosztikai technikák a kóros folyamatok vizsgálatában– Computer tomográf, MRI, PET– Molekuláris biológia – új gyógyszer célpontok– Assay fehérjék, peptidek– Biokémiai utak és mechanizmusok feltérképezése Kombinatorikus kémia- Keverék könyvtárak– Paralell szintézisek– Dekonvoluciós és jelzett technikák– De novo design

Page 40: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

–1990- 2000 Az “agy évtizede”

–Neuropeptidek, neurotranszmitterek, neuromodulátorok

– Virtuális screening

–Célpont-orientált technológiák

– Farmakofor és receptor kötödési koncepciók, modellek

– 4D, 5D bázisú tervezési technológiák

– Fragmens bázisú közelitések ( ab initio, semiempirikus)

–Generáló és dokkoló programok

–Homológia modellezés

–Kriokristallográfia

–Receptor és receptor-szubsztrát komplex térképezési technikák

–2000- Humán genomika, proteomika, (génmüködés, génszabályozás, génterápia)

–Antitestek biotransformációja terápiás célokra

–DNA-vaccinák kifejlesztése autoimmun betegségekre

–Nem-naturális peptidek és peptidfragmensek

–Nagyszámú új terápiás célpont azonosítása és hitelesítése

–Gének és betegségtipusok, betegséghajlamok feltérképezése

–DNS-mint emberi értékek és hibák prediktiv bázisa

–A gyógyszerkutatás fejlödése és a “paradigma váltás”

Page 41: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszerkutatási szerkezeti és információs rendszer

Page 42: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012
Page 43: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Az új stratégia a gyakorlatban

2002-ben felmérés: 9 vezető gyógyszergyárnál,

hogyan jutnak a „lead” molekulákhoz?

CombiChem. + HTS

others

external collaboration

natural product

66%23%

9% 4%

2 multinál 100%-ban CC+HTS

Page 44: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Standard Vezérmolekula közelítés

Standard Vezérmolekula közelítés

• Cél azonosítása (enzim, receptor, ion csatorna, transzporter)

• DNS és protein szekvencia meghatározása

• Protein szerkezet és funkció tisztázása

• Terápiás koncepció bizonyítása állatokon (“knock-outs”)

• Nagyteljesítményű molekula screen assay kifejlesztése

• Tömeges screening és/vagy célzott szintézis program

• Egy vagy több vezérmolekula kiválasztása

Page 45: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszercélpontok és hatásmechanismusok

Gyógyszercélpontok és hatásmechanismusok

• Enzimek – inhibitorok (reversibilis, irreversibilis)

• Receptorok – agonisták és antagonisták

• Ion Csatornák – blokkolók

• Transporterek – uptake inhibitorok

• DNA – interkalációs ágensek, antiszensz hatóanyagok

Page 46: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszerjelölt gyógyszerszerü tulajdonságait már korai fázisban

figyelembe kell venni

Gyógyszerjelölt gyógyszerszerü tulajdonságait már korai fázisban

figyelembe kell venniSzigorú ADME követelmények:

• Kisérletes szabályok– Lipinski szabály (MW, cLogP, #HD, #HA)

• Gyógyszerszerűség– Ajay & Murcko (J Med Chem, 1998, 41, 3314-3324) – Sadowski & Kubinyi (J Med Chem, 1998 , 41, 3325-

3329)

Page 47: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Vegyületek kihullása a fejlesztésből

Vegyületek kihullása a fejlesztésből

• Elégtelen biofarmáciai tulajdonságok, 39%

• Hatékonyság hiánya, 29%

• Toxicitás, 21%

• Piaci szempontok, 6%

Page 48: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Lipinski “5-ös szabály” (1)

MoleMolekulasúlykulasúly 500 (opt = ~350) 500 (opt = ~350) # H# Hiidrogdrogéénnkötéskötés A Akkceptorceptorokok 10 (opt = ~5)10 (opt = ~5) # H# Hiidrogdrogéénnkötéskötés Donor Donorokok 5 (opt = ~2) 5 (opt = ~2) -2 < cLog P < 5 (opt = ~3.0)-2 < cLog P < 5 (opt = ~3.0) # Rot# Rotálóáló kötések számakötések száma 5 5

1: C. Lipinski et al, Adv. Drug. Del. Rev, 23, 3-25 (1997)1: C. Lipinski et al, Adv. Drug. Del. Rev, 23, 3-25 (1997)

Gyógyszerszerű viselkedés

Gyógyszerjelölt gyógyszerszerü tulajdonságait már a fejlesztés korai fázisában figyelembe kell venni !

Page 49: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Ha a cél-receptor 3D struktúráját

Receptor-alapú tervezés

Zárba illeszthető kulcs készítése és megtalálása

Alap Modellezési Strategiák

Ismerjük

Page 50: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Homológia Modellezés

Ismert protein 3D strukturája

Cél-proteinModellezett3D szerkezete

Kialakítjuk a zárat, aztán keressük a kulcsot

Ha a cél-receptor 3D strukturáját

Alap Modellezési Strategiák

Nem ismerjük

Page 51: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Alap Modellezési Strategiák

Ha a cél-receptor 3D strukturáját

Ligand-alapú molekulatervezés

Kulcsok variálásával következtetünk a zárra

Kötőzseb kikövetkeztetése

Nem ismerjük

Page 52: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Keminformatika alkalmazása

Keminformatika alkalmazása

PredikcióPredikció

QSAR• MLR• PLS• ANN

3D-QSAR• CoMFA• Catalyst

OsztályozásOsztályozás

Ellenőrizetlen tanulás• Fökomponens Analizis• Halmaz Analizis

Felülvizsgált tanulás• legközelebbi szomszéd• SIMCA• Neuronális hálózat (ANN)

ScreenelésScreenelés

• Szubstruktúra keresés • Hasonlósági leválogatás

• Farmakofór illesztés

Page 53: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

QSAR és gyógyszertervezés

QSAR és gyógyszertervezés

Új vegyület kedvezöbb biológiai aktivitással

Vegyületek + biológiai aktivitás

QSAR

Page 54: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Kvantitativ Szerkezet-hatás összefüggés(QSAR) Modellek

Vegyületkészlet

Activitási adatok (Y) Molekuláris Descriptorok (Xi)

QSARY = f(Xi)

InterpretálásPredikció

Page 55: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Molekuláris Descriptorok Típusai

*

O

CH2 CH2

O

NH CH CH2

O

O

O

O

CH2 O

CH2

OH

CH2 *n

Felépítés, Topológia

2-D szerkezeti formula

Elektrosztatikus

Geometriai

3-D forma és szerkezet

Kvantumkémiai

Termodinamikai

Page 56: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Descriptorok képzése és tabulázása

Compound Activity (pKi)

"Y"Descriptors (X

i)

Mol. Vol. (Å3) LogP Dipole Mom ()

1 2.34 420 2.8 0.972 1.89 332 4.6 2.233 0.23 198 -0.3 3.364 3.67 467 3.7 0.455 2.55 359 -1.5 1.77

etc. etc. etc. etc. etc.

Kvantitativ Szerkezet-hatás összefüggés (QSAR) Modellek

Page 57: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

QSAR Modellek felépítése

Töbszörös Lineáris Regresszió (MLR)

pKi = ao + a1 (Mol Voli) + a2 (logP) + a3 (i) + ...

Hansch, 1969

Legkisebb négyzetek (PLS) módszere

pKi = ao + a1 (PC1) + a2 (PC2) + a3 (PC3) + ...

Wold, et al. 1984

(kis.tulajdonság/ aktivitás) (molekula descriptorok)

Y = f(Xi)Egyszerü(Univariáns) Lineáris Regresszió Hammett, 1939

pKi = ao + a1 (Mol Voli)

független változó

Függő változó “legjobban-illeszkedő” konstansok

Page 58: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Nem-tesztelt vegyületek aktivitásának predikciója

QSAR modellek,mint prediktív ezközök használata

Új vezérmolekula:

descriptorok

képzése

Új vezérmolekula prediktált aktivitása

Validált QSAR modell: pKi = 0.52 (Vi) + 0.27 (logPi) - 0.38 (i)

V logP HO

OH

Page 59: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Gyógyszerkutatási Stratégia Gyógyszerkutatási Stratégia

Vezérmolekula keresési könyvtárak:Vezérmolekula keresési könyvtárak: nagynagy kémiaikémiai diverzit diverzitásás

valódi és virtuális molekula adatbásisok kutatása

VezérmolekulaVezérmolekula optimalizációs könyvtár: nagy hasonlóság

nagyteljesítményű kombinatorikus kémia alkalmazása

Gyógyszer-szerű karakter fontosabb mint a szintetikus hozzáférhetöség Gyógyszerkémia fontossága és ismert szűrőinek

alkalmazása

Page 60: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Új vezérmolekula kereséseStrukturális Adatbázisok átbányászása

- Maybridge Database -NCI Database - ACD Database - WDI Database ~ 118,000 chemicals ~ 60,000 chemicals ~ 230,000 chemicals ~ 100,000 chemicals

… de hogyan találunk egy új ” vezérmolekulát”?

Adatbázis

Találatok

Page 61: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Strukturális adatbázisok screeneléseStrukturális adatbázisok screenelése

1. (Szub)struktúra keresés

OH

NH2

2. Farmakofór illesztés

HO

OH11 Å

3. Optimális tulajdoságok

(pl., Vol, SA, , … több ezer)

4. Lipinski’s “5-ös szabály”(C. A. Lipinski, et al., Advanced Drug Delivery Reviews (1997), 23, 3-25)

1) Maximum 5 H-kötés donor (OH, NH)2) Maximum of 10 H-kötés akceptor (O:, N:)3) Molekula súly < 5004) LogP < 55) Rotáló kötések <5

5. QSAR Modellek alkalmazása

Page 62: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Virtuális Screenelés

• Nagyszámú tesztelni kívánt molekula esetén meg kell adni a proritásokat

• A szürés emelkedö finomitási szintje maximálja a potenciális vezérmolekulák számát – “Gyógyszerszerüségi” megfontolások– Hasonlósági keresés( 2D és 3D) kezdeti

gyenge vezérmolekulák felhasználásával– 3D szubstruktúra keresés egy lehetséges

farmakofór séma azonosítására – Dokkoltatás az ismert biologiai célpont

3D struktúrájához

Page 63: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Representativ vegyületek szelektálásaVirtuális könyvtárakból

Az összes molekulából választunk egy diverz alkészletet

REPRESENTATIV MOLEKULA VÁLOGATÁS

NAGYTELJESITMÉNYŰ SCREENING KIVÁLASZTOTT CÉLPONTON

Page 64: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Kémiai térKémiai tér

• Szállitó A: biborSzállitó A: bibor• Szállitó B: sárgaSzállitó B: sárga• Szállitó C: zöldSzállitó C: zöld• Szállitó D: pirosSzállitó D: piros

FÓKUSZÁLT KÖNYVTÁR1. Gyógyszerszerüség

2. Strukturális Diversitás

Descriptor-1

Descri

pto

r-2

Descriptor-3

Page 65: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

HO2CCO2H

HO2C CO2H

HO2CCO2H

HO2CCO2H

HO2CCO2H

HO2C O CO2H

HO2CCO2H

HO2C OO CO2H

3-Methyl-Adipic Acid

Diglycolic AcidGlutaric Acid

Sebacic Acid

Adipic Acid

Suberic Acid Dioxaoctanedioic Acid

Succinic Acid

C

O

OHYC

O

HO

Kombinatorikus könyvtárak Exponenciális növekedése

OH OH

OH OH

OH

OO

OH

OH

OH

OH

OH

OH

HO CH2

C

C

O

NH CH CH2

O

OR

OH

Isopropanol

Benzyl Alcohol

Butanol

Hexanol

iso-Butanol

2-(2-Ethoxyethoxy)ethanol

sec-ButanolEthanolMethanol

Dodecanol

Octanol

n=1,2

n

diacid component

diphenol component

R

O

C

C NH OO CH2CH2C

O

CH2

O

CHC

O

Y

O

25 100

400

2500

0

500

1000

1500

2000

2500

5 10 20 50 Y or R

Siz

e o

f lib

rary

Kombinatorikus Robbanás!!!

Page 66: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

O

CH2

CH2

O

NH

CH

CH2 O

O

O

O

CH2

OH

CH2

OH

CH2

Dipól

Molekula térfogat

Rotaló kötések

Kettös kötések

Tehetetlen-ségi

nyomaték

Sürüség

Aktuális értékek

Pre

dik

tált

ért

éke

k

Szintésis -> Biol. teszt-> QSPR modell

Kellö diverzitás

Csekélydiverzitás

Page 67: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

HO2CCO2H

HO2C CO2H

HO2CCO2H

HO2CCO2H

HO2CCO2H

HO2C O CO2H

HO2CCO2H

HO2C OO CO2H

3-Methyl-Adipic Acid

Diglycolic AcidGlutaric Acid

Sebacic Acid

Adipic Acid

Suberic Acid Dioxaoctanedioic Acid

Succinic Acid

C

O

OHYC

O

HO

OH OH

OH OH

OH

OO

OH

OH

OH

OH

OH

OH

HO CH2

C

C

O

NH CH CH2

O

OR

OH

Isopropanol

Benzyl Alcohol

Butanol

Hexanol

iso-Butanol

2-(2-Ethoxyethoxy)ethanol

sec-ButanolEthanolMethanol

Dodecanol

Octanol

n=1,2

n

diacid component

diphenol component

R

OC

C NH OO CH2CH2CO

CH2

O

CHCO

YO

From QSPR models, select those molecular features that are associated with optimal performance property

Synthesize known molecules within cluster

Design and synthesize new scaffolds within cluster

1

2

3

A Modelltől a Racionális tervezésig és szintézisig

Page 68: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Köszönöm a figyelmet!

Page 69: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Királis váltás („chiral switch”):

Enantiomerek keverékét (racém elegyet) tartalmazó gyógyszerek

újbóli kifejlesztése és engedélyeztetése egyetlen enantiomert

(az eutomert) tartalmazó gyógyszerré.

Enantiomer:

azonos összegképletűek

tükörképi pár molekulák,

fedésbe nem hozhatók

eutomer: a hatásos izomer

disztomer: a kevébé hatásos; hatástalan vagy toxikus izomer

Page 70: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Jövedelmezőség - Ráforditások

Jövedelmezőség - Ráforditások

Page 71: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Szerkezet alapú gyógyszertervezés

Gyógyszer célpont kiválasztása

A célpont tiszta preparálása oldatban

Szerkezet: röntgenkristallogafia, NMR

Lehetséges inhibitor kötöhelyek meghatározása

Adatbázisok komponenseinek dokkoltatása és értékelése a választott kötöhelyen

Vegyületek rangsorolása és optimalizálása a kötödés és a szelektivitás alapján

Vezérmolekula szintézise és biokémiai tesztelése

A lead mikromolosinhibitor oldatban

Kötött lead receptor szerkezet meghatározása

Lead-receptor kölcsönhatás analizálása

A lead nanomolosinhibitor oldatban

Lead biohozzáférhetöségi tulajdonságainak optimálása és a potenciális aktivitás tesztelése

Toxicitási és biztonsági vizsgálatok

Klinikai vizsgálatok

Kereskedelmi gyógyszerforma kialakitása

Homológia modellezés:Ismert hasonló szerkezetekés módosított szekvenciákparaméterei alapján

Következö leadanalizise és optimálása

Nem

Igen

Nem

Igen

Nem

Igen

A lead módosithatóvagy optimálható-e

Lead in silicooptimalizálása

Page 72: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Szürő program

Page 73: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Új gyógyszerek

1992: 20% tiszta enantiomer

2002: már 75% ilyen

Gyógyszerkutatás:

● „de novo” fejlesztés: a hatékony enantiomert

● királis váltás: egy racém gyógyszert a szabadalmi oltalom lejárta előtt az eutomer követ

pl. (R,S) - omeprazol (LOSEC) (S) (-) esmoprazol (NEXIUM)

(R,S) - ofloxacin (TARIVID) (S) (-) levofloxacin (CRAVIT)

Ez új tendencia

Page 74: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

enantiomerek:

nincs köztük hatásbeli különbség

hatáserősségbeli differencia van

a két antipód eltérő biológiai hatású

a disztomer hatástalan

a disztomer toxikus

Miért jó ez?

az enantiomereket a szervezet eltérő ágensként ismeri fel

(„chiral discrimination”)

a receptorok királisak

Page 75: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Az enantiomerek azonos hatásúak

NHSO2CH3

N CH3

CH3

H

OH

NHSO2CH3

N CH3

CH3

H

OH

(R,S)-ibutilid (CORVERT)

K+-antagonista hatású antiaritmiás szer

S-ibutilid R-ibutilid

Page 76: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

CH2NH2

OH

H

CH2NH2

H

CHO

HO

CHO

HO

HO

R - norepinefrin S - norepinefrin

Az enantiomerek eltérő hatáserősségűek

Norepinefrin

Page 77: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

( 5. domén )

OH

NH

H

H

HH

H

O

O

H

H

O

O

Asp

+

-

( 3. domén )

H-híd

ionos kötés

Ser O

H

Ser O

H

Phe

( 6. domén )

R-Norepinefrin kötődése a receptorhoz

Page 78: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Az enantiomerek különböző biológiai hatásúak

R,S-fluoxetin

(PROSAC, FLOXET, DEPREXIN, PORTAL, etc.)

R-fluoxetin S-fluoxetin

antidepresszáns migrén ellenes

O N

F3C

CH3

F3C

O NCH3H

HH

H

Page 79: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

Az enantiomerek egymás hatását kedvezően kiegészítik

(R,S)-tramadol

(CONTRAMAL, ADAMON, TRAMADOLOR, TRAMALGIC)

OCH3

H

NCH3

CH3

OH

(+) izomer: μ receptor agonista

major analgetikus

1/3800 morfin hatás

(-) izomer: SRI és NERI

antidepresszív

1/20 imipramin hatás

Page 80: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A disztomer hatástalan

(+) S -deprenil (JUMEX)

(+) S - deprenil (-) R -deprenil

MAO-gátló hatástalan

CH3

NN

CH3

CH3 CH3

H

H

CHCH

Page 81: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

A disztomer toxikus

talidomid

(+) R-talidomid (-) S-talidomid

szedatív teratogén

N

O

O

NO

ON

O

O

NO

O

H

H

H

H

Page 82: Gyógyszeripar, Gyógyszerkutatás  Új trendek 1990-2012

ÖSSZEGZÉS

racém gyógyszerek kora lejárt

az eutomert kell használni

de alaposan ki kell vizsgálni a disztomer hatását is

mindez fejlett technológiát igényel

enantiomer-szelektív szintézis

rezolválási technikák

enantiomer-tisztaság vizsgálat (HPLC, CD)